MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 plasmid pCP301

Total Repeats: 494

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004851	GCGA	2	8	244	251	25 %	0 %	50 %	25 %	31983709
2	NC_004851	GTCA	2	8	499	506	25 %	25 %	25 %	25 %	31983710
3	NC_004851	TCTA	2	8	1349	1356	25 %	50 %	0 %	25 %	31983559
4	NC_004851	ACAA	2	8	1658	1665	75 %	0 %	0 %	25 %	31983559
5	NC_004851	TCTT	2	8	1781	1788	0 %	75 %	0 %	25 %	31983559
6	NC_004851	CGCT	2	8	2560	2567	0 %	25 %	25 %	50 %	31983594
7	NC_004851	TTAT	2	8	2771	2778	25 %	75 %	0 %	0 %	31983594
8	NC_004851	TTGG	2	8	2855	2862	0 %	50 %	50 %	0 %	31983594
9	NC_004851	TAAG	2	8	3656	3663	50 %	25 %	25 %	0 %	31983555
10	NC_004851	TAAA	2	8	3753	3760	75 %	25 %	0 %	0 %	31983555
11	NC_004851	TTTA	2	8	4308	4315	25 %	75 %	0 %	0 %	31983555
12	NC_004851	GTAT	2	8	4398	4405	25 %	50 %	25 %	0 %	31983555
13	NC_004851	AAGT	2	8	4527	4534	50 %	25 %	25 %	0 %	31983555
14	NC_004851	CCGG	2	8	5548	5555	0 %	0 %	50 %	50 %	56403996
15	NC_004851	CGAC	2	8	5980	5987	25 %	0 %	25 %	50 %	31983711
16	NC_004851	TCTG	2	8	6857	6864	0 %	50 %	25 %	25 %	31983633
17	NC_004851	TATT	2	8	7455	7462	25 %	75 %	0 %	0 %	56403997
18	NC_004851	TGTT	2	8	8415	8422	0 %	75 %	25 %	0 %	56403997
19	NC_004851	AAAT	2	8	8759	8766	75 %	25 %	0 %	0 %	56403997
20	NC_004851	ACAT	2	8	8806	8813	50 %	25 %	0 %	25 %	56403997
21	NC_004851	TTTA	2	8	9130	9137	25 %	75 %	0 %	0 %	56403997
22	NC_004851	CATG	2	8	10033	10040	25 %	25 %	25 %	25 %	31983551
23	NC_004851	CCTG	2	8	10772	10779	0 %	25 %	25 %	50 %	31983712
24	NC_004851	TCAT	2	8	11382	11389	25 %	50 %	0 %	25 %	31983672
25	NC_004851	TCTT	2	8	11721	11728	0 %	75 %	0 %	25 %	31983672
26	NC_004851	CCAG	2	8	13170	13177	25 %	0 %	25 %	50 %	31983614
27	NC_004851	CAGT	2	8	13863	13870	25 %	25 %	25 %	25 %	31983625
28	NC_004851	ACTG	2	8	13877	13884	25 %	25 %	25 %	25 %	31983625
29	NC_004851	CGTC	2	8	14316	14323	0 %	25 %	25 %	50 %	31983625
30	NC_004851	GCCG	2	8	15574	15581	0 %	0 %	50 %	50 %	31983714
31	NC_004851	CTGG	2	8	15690	15697	0 %	25 %	50 %	25 %	31983613
32	NC_004851	TCCG	2	8	16398	16405	0 %	25 %	25 %	50 %	31983611
33	NC_004851	ATCC	2	8	16943	16950	25 %	25 %	0 %	50 %	31983611
34	NC_004851	TGCA	2	8	17082	17089	25 %	25 %	25 %	25 %	31983611
35	NC_004851	ATTC	2	8	17258	17265	25 %	50 %	0 %	25 %	31983611
36	NC_004851	AATA	2	8	18903	18910	75 %	25 %	0 %	0 %	31983554
37	NC_004851	TTTC	2	8	19073	19080	0 %	75 %	0 %	25 %	31983554
38	NC_004851	CAGA	2	8	19505	19512	50 %	0 %	25 %	25 %	31983554
39	NC_004851	AAAT	2	8	20807	20814	75 %	25 %	0 %	0 %	56404000
40	NC_004851	GCCT	2	8	21795	21802	0 %	25 %	25 %	50 %	31983608
41	NC_004851	GGCT	2	8	21893	21900	0 %	25 %	50 %	25 %	31983608
42	NC_004851	TCGC	2	8	23358	23365	0 %	25 %	25 %	50 %	31983605
43	NC_004851	CATT	2	8	23412	23419	25 %	50 %	0 %	25 %	31983605
44	NC_004851	CTTT	2	8	24352	24359	0 %	75 %	0 %	25 %	56404001
45	NC_004851	GGGA	2	8	24704	24711	25 %	0 %	75 %	0 %	56404001
46	NC_004851	CATC	2	8	24929	24936	25 %	25 %	0 %	50 %	56404001
47	NC_004851	GCTG	2	8	25235	25242	0 %	25 %	50 %	25 %	56404002
48	NC_004851	CTCA	2	8	25730	25737	25 %	25 %	0 %	50 %	31983610
49	NC_004851	TCAG	2	8	25981	25988	25 %	25 %	25 %	25 %	31983610
50	NC_004851	CAGA	2	8	26180	26187	50 %	0 %	25 %	25 %	31983610
51	NC_004851	TAAG	2	8	26974	26981	50 %	25 %	25 %	0 %	31983549
52	NC_004851	GGAT	2	8	27854	27861	25 %	25 %	50 %	0 %	31983549
53	NC_004851	ACCG	2	8	28170	28177	25 %	0 %	25 %	50 %	31983548
54	NC_004851	ACAG	2	8	28351	28358	50 %	0 %	25 %	25 %	31983548
55	NC_004851	ACGT	2	8	29032	29039	25 %	25 %	25 %	25 %	31983548
56	NC_004851	CTGG	2	8	29509	29516	0 %	25 %	50 %	25 %	56404003
57	NC_004851	GGTT	2	8	29769	29776	0 %	50 %	50 %	0 %	56404004
58	NC_004851	AATG	2	8	31434	31441	50 %	25 %	25 %	0 %	31983773
59	NC_004851	CAGT	2	8	31597	31604	25 %	25 %	25 %	25 %	31983774
60	NC_004851	CCAC	2	8	32191	32198	25 %	0 %	0 %	75 %	31983598
61	NC_004851	ATAC	2	8	32371	32378	50 %	25 %	0 %	25 %	31983598
62	NC_004851	GTAA	2	8	32558	32565	50 %	25 %	25 %	0 %	31983598
63	NC_004851	CCAC	2	8	32572	32579	25 %	0 %	0 %	75 %	31983598
64	NC_004851	CCCG	2	8	33979	33986	0 %	0 %	25 %	75 %	31983673
65	NC_004851	TCCT	2	8	34023	34030	0 %	50 %	0 %	50 %	31983673
66	NC_004851	GCGG	2	8	34035	34042	0 %	0 %	75 %	25 %	31983673
67	NC_004851	TGCC	2	8	34178	34185	0 %	25 %	25 %	50 %	31983673
68	NC_004851	CGGC	2	8	34684	34691	0 %	0 %	50 %	50 %	31983673
69	NC_004851	GGAT	2	8	34966	34973	25 %	25 %	50 %	0 %	31983673
70	NC_004851	AGCA	2	8	35811	35818	50 %	0 %	25 %	25 %	31983636
71	NC_004851	CTCA	2	8	36351	36358	25 %	25 %	0 %	50 %	31983722
72	NC_004851	TCTT	2	8	36847	36854	0 %	75 %	0 %	25 %	56404005
73	NC_004851	CAGT	2	8	37862	37869	25 %	25 %	25 %	25 %	31983705
74	NC_004851	GAAG	2	8	37914	37921	50 %	0 %	50 %	0 %	31983705
75	NC_004851	TCCT	2	8	38728	38735	0 %	50 %	0 %	50 %	56404006
76	NC_004851	GCTG	2	8	39068	39075	0 %	25 %	50 %	25 %	31983640
77	NC_004851	ACAA	2	8	42083	42090	75 %	0 %	0 %	25 %	31983584
78	NC_004851	GAAT	2	8	42630	42637	50 %	25 %	25 %	0 %	31983584
79	NC_004851	GCAG	2	8	42708	42715	25 %	0 %	50 %	25 %	31983584
80	NC_004851	TGAC	2	8	42866	42873	25 %	25 %	25 %	25 %	31983584
81	NC_004851	TTAC	2	8	43668	43675	25 %	50 %	0 %	25 %	31983599
82	NC_004851	GTAT	2	8	43855	43862	25 %	50 %	25 %	0 %	31983599
83	NC_004851	GTGG	2	8	44035	44042	0 %	25 %	75 %	0 %	31983599
84	NC_004851	TCTG	2	8	44309	44316	0 %	50 %	25 %	25 %	31983725
85	NC_004851	ACTG	2	8	44817	44824	25 %	25 %	25 %	25 %	31983659
86	NC_004851	AACG	2	8	45122	45129	50 %	0 %	25 %	25 %	31983659
87	NC_004851	ATTT	2	8	45254	45261	25 %	75 %	0 %	0 %	31983659
88	NC_004851	CGTT	2	8	45347	45354	0 %	50 %	25 %	25 %	56404008
89	NC_004851	CAAC	2	8	46135	46142	50 %	0 %	0 %	50 %	31983674
90	NC_004851	TCCT	2	8	46155	46162	0 %	50 %	0 %	50 %	31983674
91	NC_004851	GCGG	2	8	46167	46174	0 %	0 %	75 %	25 %	31983674
92	NC_004851	TGCC	2	8	46310	46317	0 %	25 %	25 %	50 %	31983674
93	NC_004851	CGGC	2	8	46816	46823	0 %	0 %	50 %	50 %	31983674
94	NC_004851	GGAT	2	8	47098	47105	25 %	25 %	50 %	0 %	31983674
95	NC_004851	TAAA	2	8	48028	48035	75 %	25 %	0 %	0 %	31983556
96	NC_004851	TTTA	2	8	48583	48590	25 %	75 %	0 %	0 %	31983556
97	NC_004851	ATTT	2	8	49123	49130	25 %	75 %	0 %	0 %	31983556
98	NC_004851	TCCT	2	8	49612	49619	0 %	50 %	0 %	50 %	31983727
99	NC_004851	GCTG	2	8	49952	49959	0 %	25 %	50 %	25 %	31983631
100	NC_004851	TTAC	2	8	50995	51002	25 %	50 %	0 %	25 %	31983600
101	NC_004851	GTAT	2	8	51182	51189	25 %	50 %	25 %	0 %	31983600
102	NC_004851	GTGG	2	8	51362	51369	0 %	25 %	75 %	0 %	31983600
103	NC_004851	TGAA	2	8	51560	51567	50 %	25 %	25 %	0 %	31983728
104	NC_004851	GTCT	2	8	51721	51728	0 %	50 %	25 %	25 %	31983728
105	NC_004851	ATAA	2	8	51923	51930	75 %	25 %	0 %	0 %	31983728
106	NC_004851	TTCA	2	8	52049	52056	25 %	50 %	0 %	25 %	31983694
107	NC_004851	CCAC	2	8	53334	53341	25 %	0 %	0 %	75 %	31983545
108	NC_004851	TAAA	2	8	53410	53417	75 %	25 %	0 %	0 %	31983545
109	NC_004851	CATT	2	8	53506	53513	25 %	50 %	0 %	25 %	31983545
110	NC_004851	AAGG	2	8	53591	53598	50 %	0 %	50 %	0 %	31983545
111	NC_004851	CTGG	2	8	53814	53821	0 %	25 %	50 %	25 %	31983545
112	NC_004851	CTGG	2	8	54800	54807	0 %	25 %	50 %	25 %	31983545
113	NC_004851	GGCT	2	8	54987	54994	0 %	25 %	50 %	25 %	31983545
114	NC_004851	CTTT	2	8	55783	55790	0 %	75 %	0 %	25 %	31983545
115	NC_004851	TAGT	2	8	55962	55969	25 %	50 %	25 %	0 %	31983545
116	NC_004851	AGGC	2	8	56489	56496	25 %	0 %	50 %	25 %	31983545
117	NC_004851	CCCG	2	8	57458	57465	0 %	0 %	25 %	75 %	31983675
118	NC_004851	TCCT	2	8	57502	57509	0 %	50 %	0 %	50 %	31983675
119	NC_004851	GCGG	2	8	57514	57521	0 %	0 %	75 %	25 %	31983675
120	NC_004851	TGCC	2	8	57657	57664	0 %	25 %	25 %	50 %	31983675
121	NC_004851	CGGC	2	8	58163	58170	0 %	0 %	50 %	50 %	31983675
122	NC_004851	GGAT	2	8	58445	58452	25 %	25 %	50 %	0 %	31983675
123	NC_004851	ACGA	2	8	59802	59809	50 %	0 %	25 %	25 %	31983620
124	NC_004851	CCAT	2	8	59826	59833	25 %	25 %	0 %	50 %	31983620
125	NC_004851	GACT	2	8	59862	59869	25 %	25 %	25 %	25 %	31983620
126	NC_004851	GCTG	2	8	60591	60598	0 %	25 %	50 %	25 %	31983620
127	NC_004851	GGCA	2	8	60672	60679	25 %	0 %	50 %	25 %	31983620
128	NC_004851	CTGA	2	8	62304	62311	25 %	25 %	25 %	25 %	31983582
129	NC_004851	CTGC	2	8	62496	62503	0 %	25 %	25 %	50 %	31983582
130	NC_004851	GTTC	2	8	62583	62590	0 %	50 %	25 %	25 %	31983582
131	NC_004851	ACAA	2	8	63067	63074	75 %	0 %	0 %	25 %	31983582
132	NC_004851	GAAT	2	8	63614	63621	50 %	25 %	25 %	0 %	31983582
133	NC_004851	GCAG	2	8	63692	63699	25 %	0 %	50 %	25 %	31983582
134	NC_004851	TGAC	2	8	63850	63857	25 %	25 %	25 %	25 %	31983582
135	NC_004851	TTCA	2	8	64725	64732	25 %	50 %	0 %	25 %	31983583
136	NC_004851	AGGT	2	8	64964	64971	25 %	25 %	50 %	0 %	31983583
137	NC_004851	ACAA	2	8	65258	65265	75 %	0 %	0 %	25 %	31983583
138	NC_004851	GAAT	2	8	65805	65812	50 %	25 %	25 %	0 %	31983583
139	NC_004851	GCAG	2	8	65883	65890	25 %	0 %	50 %	25 %	31983583
140	NC_004851	TGAC	2	8	66041	66048	25 %	25 %	25 %	25 %	31983583
141	NC_004851	TTAC	2	8	66843	66850	25 %	50 %	0 %	25 %	31983601
142	NC_004851	GTAT	2	8	67030	67037	25 %	50 %	25 %	0 %	31983601
143	NC_004851	GTGG	2	8	67210	67217	0 %	25 %	75 %	0 %	31983601
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