MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 plasmid pCP301

Total Repeats: 3479

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_004851	TCA	2	6	190199	190204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983664
3002	NC_004851	CAT	2	6	190215	190220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983664
3003	NC_004851	TGA	2	6	190247	190252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983664
3004	NC_004851	TCC	2	6	190334	190339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	31983664
3005	NC_004851	CTC	2	6	190435	190440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	31983664
3006	NC_004851	GCG	2	6	190466	190471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31983664
3007	NC_004851	GAAA	2	8	190565	190572	75 %	0 %	25 %	0 %	31983664
3008	NC_004851	AG	3	6	190614	190619	50 %	0 %	50 %	0 %	31983664
3009	NC_004851	CCA	2	6	190632	190637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31983664
3010	NC_004851	CAG	2	6	190671	190676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983664
3011	NC_004851	T	6	6	190686	190691	0 %	100 %	0 %	0 %	31983664
3012	NC_004851	CCG	2	6	190719	190724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31983664
3013	NC_004851	CAA	2	6	190728	190733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31983664
3014	NC_004851	CTG	2	6	190765	190770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983664
3015	NC_004851	ATC	3	9	190771	190779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983664
3016	NC_004851	GTT	3	9	190875	190883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983664
3017	NC_004851	TCA	2	6	190895	190900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983664
3018	NC_004851	CAC	2	6	190903	190908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31983664
3019	NC_004851	GAA	2	6	190917	190922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31983664
3020	NC_004851	AT	3	6	190952	190957	50 %	50 %	0 %	0 %	31983664
3021	NC_004851	T	6	6	191107	191112	0 %	100 %	0 %	0 %	31983664
3022	NC_004851	CGT	2	6	191177	191182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983664
3023	NC_004851	A	6	6	191185	191190	100 %	0 %	0 %	0 %	31983664
3024	NC_004851	AAC	2	6	191222	191227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31983664
3025	NC_004851	ATC	2	6	191764	191769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983663
3026	NC_004851	GTCA	2	8	191772	191779	25 %	25 %	25 %	25 %	31983663
3027	NC_004851	AAC	2	6	191844	191849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31983663
3028	NC_004851	TCA	2	6	191862	191867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983663
3029	NC_004851	T	7	7	191880	191886	0 %	100 %	0 %	0 %	31983663
3030	NC_004851	TGA	2	6	191930	191935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983663
3031	NC_004851	TTA	2	6	191970	191975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983663
3032	NC_004851	T	7	7	192001	192007	0 %	100 %	0 %	0 %	31983663
3033	NC_004851	TCTGG	2	10	192150	192159	0 %	40 %	40 %	20 %	31983663
3034	NC_004851	AGTTC	2	10	192205	192214	20 %	40 %	20 %	20 %	31983663
3035	NC_004851	GAA	2	6	192219	192224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31983663
3036	NC_004851	TTG	2	6	192249	192254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983663
3037	NC_004851	GA	3	6	192260	192265	50 %	0 %	50 %	0 %	31983663
3038	NC_004851	GAAA	2	8	192272	192279	75 %	0 %	25 %	0 %	31983663
3039	NC_004851	TTA	2	6	192320	192325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983663
3040	NC_004851	GAA	2	6	192351	192356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31983663
3041	NC_004851	TAT	2	6	192366	192371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983663
3042	NC_004851	TA	3	6	192373	192378	50 %	50 %	0 %	0 %	31983663
3043	NC_004851	AGAA	2	8	192383	192390	75 %	0 %	25 %	0 %	31983663
3044	NC_004851	GAAT	2	8	192391	192398	50 %	25 %	25 %	0 %	31983663
3045	NC_004851	GAA	2	6	192427	192432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31983663
3046	NC_004851	GAC	2	6	192472	192477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983663
3047	NC_004851	T	6	6	192478	192483	0 %	100 %	0 %	0 %	31983663
3048	NC_004851	T	7	7	192498	192504	0 %	100 %	0 %	0 %	31983663
3049	NC_004851	GAT	2	6	192543	192548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983663
3050	NC_004851	TAA	2	6	192549	192554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983663
3051	NC_004851	ATC	2	6	192574	192579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983662
3052	NC_004851	GGT	2	6	192590	192595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31983662
3053	NC_004851	GAA	2	6	192631	192636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31983662
3054	NC_004851	TTG	2	6	192831	192836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983662
3055	NC_004851	T	6	6	192915	192920	0 %	100 %	0 %	0 %	31983662
3056	NC_004851	AGGA	2	8	192984	192991	50 %	0 %	50 %	0 %	31983662
3057	NC_004851	TGT	2	6	193009	193014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983662
3058	NC_004851	TTCT	2	8	193077	193084	0 %	75 %	0 %	25 %	31983662
3059	NC_004851	TGGC	2	8	193085	193092	0 %	25 %	50 %	25 %	31983662
3060	NC_004851	GAC	2	6	193194	193199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983662
3061	NC_004851	GTTG	2	8	193206	193213	0 %	50 %	50 %	0 %	31983662
3062	NC_004851	GCAT	2	8	193275	193282	25 %	25 %	25 %	25 %	31983662
3063	NC_004851	GAT	2	6	193283	193288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983662
3064	NC_004851	GCC	2	6	193316	193321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31983662
3065	NC_004851	TGG	2	6	193344	193349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31983662
3066	NC_004851	TGGTA	2	10	193375	193384	20 %	40 %	40 %	0 %	31983662
3067	NC_004851	TGG	2	6	193432	193437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31983662
3068	NC_004851	CAG	2	6	193482	193487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983662
3069	NC_004851	TAA	2	6	193489	193494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983662
3070	NC_004851	T	7	7	193522	193528	0 %	100 %	0 %	0 %	31983662
3071	NC_004851	AGA	2	6	193579	193584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31983662
3072	NC_004851	TAA	2	6	193597	193602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983662
3073	NC_004851	GTAA	2	8	193656	193663	50 %	25 %	25 %	0 %	31983528
3074	NC_004851	T	6	6	193696	193701	0 %	100 %	0 %	0 %	31983528
3075	NC_004851	ATT	2	6	193795	193800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983528
3076	NC_004851	G	6	6	193890	193895	0 %	0 %	100 %	0 %	31983528
3077	NC_004851	AT	3	6	193916	193921	50 %	50 %	0 %	0 %	31983528
3078	NC_004851	TGT	2	6	194080	194085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983528
3079	NC_004851	AC	3	6	194150	194155	50 %	0 %	0 %	50 %	31983528
3080	NC_004851	ATT	2	6	194205	194210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983528
3081	NC_004851	ATT	2	6	194253	194258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983528
3082	NC_004851	TGA	2	6	194278	194283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983528
3083	NC_004851	CAGT	2	8	194311	194318	25 %	25 %	25 %	25 %	31983528
3084	NC_004851	TTG	2	6	194374	194379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983528
3085	NC_004851	GGT	2	6	194450	194455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31983528
3086	NC_004851	A	6	6	194484	194489	100 %	0 %	0 %	0 %	31983528
3087	NC_004851	A	6	6	194665	194670	100 %	0 %	0 %	0 %	31983572
3088	NC_004851	TTCA	2	8	194778	194785	25 %	50 %	0 %	25 %	31983572
3089	NC_004851	TGGG	2	8	194815	194822	0 %	25 %	75 %	0 %	31983572
3090	NC_004851	TCG	2	6	194841	194846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983572
3091	NC_004851	CGA	2	6	194852	194857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983572
3092	NC_004851	AAT	2	6	194904	194909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983572
3093	NC_004851	TGA	2	6	194948	194953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983572
3094	NC_004851	A	6	6	195119	195124	100 %	0 %	0 %	0 %	31983572
3095	NC_004851	GCC	2	6	195127	195132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31983572
3096	NC_004851	TCA	2	6	195138	195143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983572
3097	NC_004851	TGAT	2	8	195158	195165	25 %	50 %	25 %	0 %	31983572
3098	NC_004851	G	6	6	195196	195201	0 %	0 %	100 %	0 %	31983572
3099	NC_004851	GGA	2	6	195216	195221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	31983572
3100	NC_004851	TCAG	2	8	195240	195247	25 %	25 %	25 %	25 %	31983572
3101	NC_004851	T	7	7	195318	195324	0 %	100 %	0 %	0 %	31983572
3102	NC_004851	ATT	2	6	195349	195354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983572
3103	NC_004851	TGA	2	6	195362	195367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983572
3104	NC_004851	TCAG	2	8	195371	195378	25 %	25 %	25 %	25 %	31983572
3105	NC_004851	ATG	2	6	195407	195412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983572
3106	NC_004851	A	8	8	195413	195420	100 %	0 %	0 %	0 %	31983572
3107	NC_004851	CCA	2	6	195445	195450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31983572
3108	NC_004851	ATGC	2	8	195455	195462	25 %	25 %	25 %	25 %	31983572
3109	NC_004851	TGG	2	6	195521	195526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31983572
3110	NC_004851	T	6	6	195826	195831	0 %	100 %	0 %	0 %	31983619
3111	NC_004851	TGA	2	6	195857	195862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983619
3112	NC_004851	TGCC	2	8	195886	195893	0 %	25 %	25 %	50 %	31983619
3113	NC_004851	CAGC	2	8	195967	195974	25 %	0 %	25 %	50 %	31983619
3114	NC_004851	ACG	2	6	196036	196041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983619
3115	NC_004851	CAG	2	6	196063	196068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983619
3116	NC_004851	TGA	2	6	196071	196076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983619
3117	NC_004851	GCC	2	6	196099	196104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31983619
3118	NC_004851	ATA	2	6	196150	196155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983619
3119	NC_004851	ACC	2	6	196178	196183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31983619
3120	NC_004851	CTTCAT	2	12	196245	196256	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	31983619
3121	NC_004851	TGC	2	6	196303	196308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983619
3122	NC_004851	CA	3	6	196364	196369	50 %	0 %	0 %	50 %	31983619
3123	NC_004851	GCG	2	6	196390	196395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31983619
3124	NC_004851	CAG	2	6	196447	196452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983619
3125	NC_004851	GCA	2	6	196636	196641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983619
3126	NC_004851	T	7	7	197627	197633	0 %	100 %	0 %	0 %	31983693
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3231	NC_004851	CCGT	2	8	203639	203646	0 %	25 %	25 %	50 %	31983654
3232	NC_004851	G	6	6	203680	203685	0 %	0 %	100 %	0 %	31983654
3233	NC_004851	ACA	2	6	203695	203700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31983654
3234	NC_004851	CCAG	2	8	203705	203712	25 %	0 %	25 %	50 %	31983654
3235	NC_004851	CCG	2	6	203777	203782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31983654
3236	NC_004851	ACCTG	2	10	203834	203843	20 %	20 %	20 %	40 %	31983654
3237	NC_004851	TGC	2	6	203998	204003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983654
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3241	NC_004851	TCTGG	2	10	204171	204180	0 %	40 %	40 %	20 %	56404032
3242	NC_004851	ATC	2	6	204199	204204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56404032
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3245	NC_004851	ATT	2	6	204388	204393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56404032
3246	NC_004851	GGC	2	6	204462	204467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56404032
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