MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 plasmid pCP301

Total Repeats: 3479

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_004851	GAC	2	6	155646	155651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56404025
2502	NC_004851	GAT	2	6	155653	155658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56404025
2503	NC_004851	CTG	3	9	155711	155719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56404025
2504	NC_004851	GAG	2	6	155724	155729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56404025
2505	NC_004851	TGA	2	6	155736	155741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56404025
2506	NC_004851	CAG	2	6	155749	155754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56404025
2507	NC_004851	ATT	3	9	155767	155775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56404025
2508	NC_004851	GGA	2	6	155884	155889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56404025
2509	NC_004851	ATA	2	6	155921	155926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56404025
2510	NC_004851	A	6	6	155926	155931	100 %	0 %	0 %	0 %	56404025
2511	NC_004851	AGA	2	6	156111	156116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56404025
2512	NC_004851	TGT	2	6	156342	156347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56404025
2513	NC_004851	GTG	2	6	156350	156355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56404025
2514	NC_004851	AG	3	6	156375	156380	50 %	0 %	50 %	0 %	56404025
2515	NC_004851	GTA	2	6	156433	156438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56404025
2516	NC_004851	AAG	2	6	156458	156463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56404025
2517	NC_004851	A	6	6	156547	156552	100 %	0 %	0 %	0 %	56404025
2518	NC_004851	A	6	6	156601	156606	100 %	0 %	0 %	0 %	56404025
2519	NC_004851	ACA	2	6	156616	156621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56404025
2520	NC_004851	TGG	2	6	156639	156644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56404025
2521	NC_004851	ATA	2	6	156665	156670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56404025
2522	NC_004851	AT	3	6	156720	156725	50 %	50 %	0 %	0 %	56404025
2523	NC_004851	TGC	2	6	156747	156752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56404025
2524	NC_004851	ATC	2	6	156804	156809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983783
2525	NC_004851	T	6	6	156815	156820	0 %	100 %	0 %	0 %	31983783
2526	NC_004851	AGT	2	6	156847	156852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983783
2527	NC_004851	GTT	2	6	156914	156919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983783
2528	NC_004851	GTA	2	6	157313	157318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983615
2529	NC_004851	CTT	2	6	157569	157574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983615
2530	NC_004851	TGC	2	6	157599	157604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983615
2531	NC_004851	ACA	2	6	157694	157699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31983750
2532	NC_004851	G	6	6	157788	157793	0 %	0 %	100 %	0 %	31983750
2533	NC_004851	CGC	2	6	157800	157805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31983750
2534	NC_004851	GCG	2	6	157809	157814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31983750
2535	NC_004851	CAC	2	6	157888	157893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31983750
2536	NC_004851	ATG	2	6	157909	157914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983750
2537	NC_004851	ATC	2	6	157948	157953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983750
2538	NC_004851	AAG	2	6	157955	157960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31983750
2539	NC_004851	CCA	2	6	157977	157982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31983750
2540	NC_004851	CAG	2	6	157997	158002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983750
2541	NC_004851	ACC	2	6	158161	158166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31983750
2542	NC_004851	TGCC	2	8	158295	158302	0 %	25 %	25 %	50 %	31983750
2543	NC_004851	TTAC	2	8	158351	158358	25 %	50 %	0 %	25 %	31983750
2544	NC_004851	CAG	2	6	158382	158387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983750
2545	NC_004851	TCC	2	6	158388	158393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	31983750
2546	NC_004851	GCC	2	6	158417	158422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31983750
2547	NC_004851	GTG	2	6	158647	158652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31983751
2548	NC_004851	CAT	2	6	159145	159150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983547
2549	NC_004851	ATG	2	6	159163	159168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983547
2550	NC_004851	ACA	2	6	159171	159176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31983547
2551	NC_004851	TAC	2	6	159189	159194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983547
2552	NC_004851	ATT	2	6	159227	159232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983547
2553	NC_004851	CCA	2	6	159240	159245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31983547
2554	NC_004851	AGT	2	6	159351	159356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983547
2555	NC_004851	GTGGC	2	10	159358	159367	0 %	20 %	60 %	20 %	31983547
2556	NC_004851	CTG	2	6	159379	159384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983547
2557	NC_004851	TTGG	2	8	159598	159605	0 %	50 %	50 %	0 %	31983547
2558	NC_004851	AAAT	2	8	159628	159635	75 %	25 %	0 %	0 %	31983547
2559	NC_004851	CAG	2	6	159683	159688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983547
2560	NC_004851	GCA	2	6	159726	159731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983547
2561	NC_004851	TTG	2	6	159736	159741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983547
2562	NC_004851	A	6	6	159828	159833	100 %	0 %	0 %	0 %	31983547
2563	NC_004851	GCG	2	6	160099	160104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31983680
2564	NC_004851	GCC	2	6	160116	160121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31983680
2565	NC_004851	GC	3	6	160259	160264	0 %	0 %	50 %	50 %	31983680
2566	NC_004851	TGC	2	6	160311	160316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983680
2567	NC_004851	CCG	2	6	160451	160456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31983683
2568	NC_004851	T	7	7	160498	160504	0 %	100 %	0 %	0 %	31983683
2569	NC_004851	CGG	2	6	160511	160516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31983683
2570	NC_004851	ATA	2	6	160612	160617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983683
2571	NC_004851	TGA	2	6	160736	160741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983683
2572	NC_004851	GTG	2	6	160775	160780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31983683
2573	NC_004851	AGG	2	6	160791	160796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	31983683
2574	NC_004851	TGA	2	6	160808	160813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983683
2575	NC_004851	GAT	2	6	160891	160896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56404026
2576	NC_004851	AGA	2	6	160936	160941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56404026
2577	NC_004851	ACAGT	2	10	160962	160971	40 %	20 %	20 %	20 %	56404026
2578	NC_004851	GGC	2	6	160979	160984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56404026
2579	NC_004851	GCTTT	2	10	161000	161009	0 %	60 %	20 %	20 %	56404026
2580	NC_004851	CTG	2	6	161022	161027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56404026
2581	NC_004851	TAA	2	6	161094	161099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56404026
2582	NC_004851	GCG	2	6	161105	161110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56404026
2583	NC_004851	TCA	2	6	161201	161206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56404026
2584	NC_004851	ATC	3	9	161238	161246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56404026
2585	NC_004851	TC	3	6	161276	161281	0 %	50 %	0 %	50 %	56404026
2586	NC_004851	TTA	2	6	161456	161461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983536
2587	NC_004851	T	7	7	161462	161468	0 %	100 %	0 %	0 %	31983536
2588	NC_004851	TTC	2	6	161495	161500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983536
2589	NC_004851	ATC	2	6	161504	161509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983536
2590	NC_004851	CT	3	6	161523	161528	0 %	50 %	0 %	50 %	31983536
2591	NC_004851	ATG	2	6	161553	161558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983536
2592	NC_004851	T	6	6	161559	161564	0 %	100 %	0 %	0 %	31983536
2593	NC_004851	AC	3	6	161566	161571	50 %	0 %	0 %	50 %	31983536
2594	NC_004851	GATGTG	2	12	161583	161594	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	31983536
2595	NC_004851	TGT	2	6	161600	161605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983536
2596	NC_004851	A	7	7	161652	161658	100 %	0 %	0 %	0 %	31983536
2597	NC_004851	G	6	6	161680	161685	0 %	0 %	100 %	0 %	31983536
2598	NC_004851	GCT	2	6	161700	161705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983536
2599	NC_004851	GA	3	6	161753	161758	50 %	0 %	50 %	0 %	31983536
2600	NC_004851	TTGT	2	8	161764	161771	0 %	75 %	25 %	0 %	31983536
2601	NC_004851	CTTT	3	12	161821	161832	0 %	75 %	0 %	25 %	31983536
2602	NC_004851	T	8	8	161830	161837	0 %	100 %	0 %	0 %	31983536
2603	NC_004851	CTC	2	6	161958	161963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	31983537
2604	NC_004851	CCTG	2	8	162009	162016	0 %	25 %	25 %	50 %	31983537
2605	NC_004851	T	6	6	162065	162070	0 %	100 %	0 %	0 %	31983537
2606	NC_004851	CAT	2	6	162081	162086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983537
2607	NC_004851	TTA	2	6	162087	162092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983537
2608	NC_004851	T	6	6	162122	162127	0 %	100 %	0 %	0 %	31983537
2609	NC_004851	TCA	2	6	162134	162139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983537
2610	NC_004851	AATAA	2	10	162142	162151	80 %	20 %	0 %	0 %	31983537
2611	NC_004851	TCC	2	6	162286	162291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	31983537
2612	NC_004851	GTTT	2	8	162318	162325	0 %	75 %	25 %	0 %	31983537
2613	NC_004851	T	7	7	162334	162340	0 %	100 %	0 %	0 %	31983537
2614	NC_004851	CATTA	2	10	162373	162382	40 %	40 %	0 %	20 %	31983537
2615	NC_004851	T	6	6	162385	162390	0 %	100 %	0 %	0 %	31983537
2616	NC_004851	T	6	6	162443	162448	0 %	100 %	0 %	0 %	31983537
2617	NC_004851	TTCT	2	8	162456	162463	0 %	75 %	0 %	25 %	31983537
2618	NC_004851	CAG	2	6	162550	162555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983537
2619	NC_004851	ATG	2	6	162559	162564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983537
2620	NC_004851	TGG	2	6	162579	162584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31983537
2621	NC_004851	TGT	2	6	162607	162612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983537
2622	NC_004851	CAG	2	6	162621	162626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983537
2623	NC_004851	T	8	8	162649	162656	0 %	100 %	0 %	0 %	31983537
2624	NC_004851	ACG	2	6	162662	162667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983537
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2977	NC_004851	A	7	7	188712	188718	100 %	0 %	0 %	0 %	31983664
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2982	NC_004851	GCC	2	6	188921	188926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31983664
2983	NC_004851	CAC	2	6	188958	188963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31983664
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2994	NC_004851	CCT	2	6	189729	189734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	31983664
2995	NC_004851	GCG	2	6	189750	189755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31983664
2996	NC_004851	CAGTG	2	10	189979	189988	20 %	20 %	40 %	20 %	31983664
2997	NC_004851	GTG	2	6	189991	189996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31983664
2998	NC_004851	TGC	2	6	190049	190054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983664
2999	NC_004851	CAC	2	6	190119	190124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31983664
3000	NC_004851	CAGTTG	2	12	190165	190176	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	31983664

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