MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 plasmid pCP301

Total Repeats: 3479

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_004851	CAG	2	6	101332	101337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983628
1502	NC_004851	TGT	2	6	101348	101353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983628
1503	NC_004851	GTTT	2	8	101379	101386	0 %	75 %	25 %	0 %	31983628
1504	NC_004851	TCG	2	6	101387	101392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983628
1505	NC_004851	T	6	6	101793	101798	0 %	100 %	0 %	0 %	31983607
1506	NC_004851	CTG	2	6	101823	101828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983607
1507	NC_004851	CAGC	2	8	101898	101905	25 %	0 %	25 %	50 %	31983607
1508	NC_004851	ACCTT	2	10	102016	102025	20 %	40 %	0 %	40 %	31983607
1509	NC_004851	GA	3	6	102059	102064	50 %	0 %	50 %	0 %	31983607
1510	NC_004851	ACA	2	6	102164	102169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31983607
1511	NC_004851	CG	3	6	102173	102178	0 %	0 %	50 %	50 %	31983607
1512	NC_004851	CAC	2	6	102182	102187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31983607
1513	NC_004851	AAG	2	6	102190	102195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31983607
1514	NC_004851	ACA	2	6	102260	102265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31983607
1515	NC_004851	GTC	2	6	102347	102352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983607
1516	NC_004851	CGAAC	2	10	102365	102374	40 %	0 %	20 %	40 %	31983607
1517	NC_004851	GCTCCT	2	12	102380	102391	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	31983607
1518	NC_004851	GA	4	8	102400	102407	50 %	0 %	50 %	0 %	31983607
1519	NC_004851	GAAT	2	8	102410	102417	50 %	25 %	25 %	0 %	31983607
1520	NC_004851	GCGA	2	8	102465	102472	25 %	0 %	50 %	25 %	31983607
1521	NC_004851	CAG	2	6	102557	102562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983607
1522	NC_004851	GGC	2	6	102580	102585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31983607
1523	NC_004851	AAC	2	6	104073	104078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56404014
1524	NC_004851	GTTAT	2	10	104114	104123	20 %	60 %	20 %	0 %	56404014
1525	NC_004851	AT	3	6	104158	104163	50 %	50 %	0 %	0 %	56404014
1526	NC_004851	TCA	2	6	104170	104175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56404014
1527	NC_004851	GTT	2	6	104217	104222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56404014
1528	NC_004851	T	6	6	104221	104226	0 %	100 %	0 %	0 %	56404014
1529	NC_004851	TGC	2	6	104278	104283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56404014
1530	NC_004851	TAA	2	6	104391	104396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56404014
1531	NC_004851	ATA	2	6	104430	104435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56404014
1532	NC_004851	CTT	2	6	104486	104491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56404014
1533	NC_004851	GAA	2	6	104513	104518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56404014
1534	NC_004851	T	6	6	104526	104531	0 %	100 %	0 %	0 %	56404014
1535	NC_004851	TTTA	2	8	104546	104553	25 %	75 %	0 %	0 %	56404014
1536	NC_004851	TTA	2	6	104570	104575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56404014
1537	NC_004851	TCT	2	6	104618	104623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56404014
1538	NC_004851	ATT	2	6	104736	104741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56404014
1539	NC_004851	AAG	3	9	104770	104778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56404014
1540	NC_004851	TC	3	6	105844	105849	0 %	50 %	0 %	50 %	31983531
1541	NC_004851	TGTTT	2	10	105855	105864	0 %	80 %	20 %	0 %	31983531
1542	NC_004851	TGTT	2	8	105893	105900	0 %	75 %	25 %	0 %	31983531
1543	NC_004851	TCTTT	2	10	105907	105916	0 %	80 %	0 %	20 %	31983531
1544	NC_004851	AAAT	2	8	105941	105948	75 %	25 %	0 %	0 %	31983531
1545	NC_004851	ATG	2	6	106000	106005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983531
1546	NC_004851	T	6	6	106017	106022	0 %	100 %	0 %	0 %	31983531
1547	NC_004851	AT	3	6	106023	106028	50 %	50 %	0 %	0 %	31983531
1548	NC_004851	TTC	2	6	106062	106067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983531
1549	NC_004851	TAA	2	6	106123	106128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983531
1550	NC_004851	AAT	2	6	106132	106137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983531
1551	NC_004851	AAGTT	2	10	106153	106162	40 %	40 %	20 %	0 %	31983531
1552	NC_004851	ATT	2	6	106186	106191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983531
1553	NC_004851	TGC	2	6	106206	106211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983531
1554	NC_004851	CG	3	6	106233	106238	0 %	0 %	50 %	50 %	31983531
1555	NC_004851	T	6	6	106251	106256	0 %	100 %	0 %	0 %	31983531
1556	NC_004851	ATGCT	2	10	106321	106330	20 %	40 %	20 %	20 %	31983531
1557	NC_004851	AT	4	8	106379	106386	50 %	50 %	0 %	0 %	31983531
1558	NC_004851	AT	3	6	106422	106427	50 %	50 %	0 %	0 %	31983531
1559	NC_004851	GAA	2	6	106497	106502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31983531
1560	NC_004851	TTG	2	6	106503	106508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983531
1561	NC_004851	TTC	2	6	106542	106547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983531
1562	NC_004851	T	6	6	106577	106582	0 %	100 %	0 %	0 %	31983531
1563	NC_004851	TTA	2	6	106645	106650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983531
1564	NC_004851	CTTT	2	8	106670	106677	0 %	75 %	0 %	25 %	31983531
1565	NC_004851	CCTT	2	8	106681	106688	0 %	50 %	0 %	50 %	31983531
1566	NC_004851	CCA	2	6	106715	106720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31983531
1567	NC_004851	TAA	2	6	106988	106993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983788
1568	NC_004851	AGAGAA	2	12	107062	107073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31983788
1569	NC_004851	TTC	2	6	107103	107108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983788
1570	NC_004851	ATA	2	6	107153	107158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983788
1571	NC_004851	T	6	6	107159	107164	0 %	100 %	0 %	0 %	31983788
1572	NC_004851	TGC	2	6	107232	107237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983589
1573	NC_004851	TA	4	8	107240	107247	50 %	50 %	0 %	0 %	31983589
1574	NC_004851	T	6	6	107278	107283	0 %	100 %	0 %	0 %	31983589
1575	NC_004851	AT	3	6	107291	107296	50 %	50 %	0 %	0 %	31983589
1576	NC_004851	GTAA	2	8	107302	107309	50 %	25 %	25 %	0 %	31983589
1577	NC_004851	CTT	2	6	107363	107368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983589
1578	NC_004851	TGT	2	6	107462	107467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983589
1579	NC_004851	TGT	2	6	107481	107486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983589
1580	NC_004851	GA	3	6	107553	107558	50 %	0 %	50 %	0 %	31983589
1581	NC_004851	T	7	7	107586	107592	0 %	100 %	0 %	0 %	31983589
1582	NC_004851	A	6	6	107644	107649	100 %	0 %	0 %	0 %	31983589
1583	NC_004851	TGA	2	6	107745	107750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983589
1584	NC_004851	G	7	7	107788	107794	0 %	0 %	100 %	0 %	31983589
1585	NC_004851	AG	3	6	107839	107844	50 %	0 %	50 %	0 %	31983589
1586	NC_004851	TCTT	2	8	107856	107863	0 %	75 %	0 %	25 %	31983589
1587	NC_004851	ACT	2	6	107865	107870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983589
1588	NC_004851	ATT	2	6	107943	107948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983589
1589	NC_004851	ATA	2	6	108050	108055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983589
1590	NC_004851	CAT	2	6	108086	108091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983589
1591	NC_004851	TGT	2	6	108128	108133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983589
1592	NC_004851	TAT	2	6	108143	108148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983589
1593	NC_004851	TAT	2	6	108158	108163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983589
1594	NC_004851	ATT	2	6	108165	108170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983589
1595	NC_004851	TCT	2	6	108292	108297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983589
1596	NC_004851	ATC	2	6	108456	108461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983589
1597	NC_004851	GA	3	6	108468	108473	50 %	0 %	50 %	0 %	31983589
1598	NC_004851	ATT	2	6	108513	108518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983589
1599	NC_004851	ATG	2	6	108527	108532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983589
1600	NC_004851	GAG	2	6	108546	108551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	31983589
1601	NC_004851	TG	3	6	108582	108587	0 %	50 %	50 %	0 %	31983589
1602	NC_004851	TTG	2	6	108588	108593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983589
1603	NC_004851	T	6	6	108728	108733	0 %	100 %	0 %	0 %	31983589
1604	NC_004851	CATT	2	8	108827	108834	25 %	50 %	0 %	25 %	31983589
1605	NC_004851	CTT	2	6	108850	108855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983589
1606	NC_004851	TCT	2	6	108862	108867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983589
1607	NC_004851	GAA	2	6	108877	108882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31983589
1608	NC_004851	A	6	6	108886	108891	100 %	0 %	0 %	0 %	31983589
1609	NC_004851	TGA	2	6	109017	109022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983589
1610	NC_004851	TA	3	6	109037	109042	50 %	50 %	0 %	0 %	31983589
1611	NC_004851	TAT	2	6	109061	109066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983589
1612	NC_004851	TATCTG	2	12	109108	109119	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	31983586
1613	NC_004851	TAC	2	6	109135	109140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983586
1614	NC_004851	ATT	2	6	109208	109213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983586
1615	NC_004851	ACA	2	6	109350	109355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31983586
1616	NC_004851	T	7	7	109365	109371	0 %	100 %	0 %	0 %	31983586
1617	NC_004851	ATTT	2	8	109411	109418	25 %	75 %	0 %	0 %	31983586
1618	NC_004851	TAT	2	6	109438	109443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983586
1619	NC_004851	TTC	2	6	109484	109489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983586
1620	NC_004851	CGT	2	6	109534	109539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983586
1621	NC_004851	GA	3	6	109549	109554	50 %	0 %	50 %	0 %	31983586
1622	NC_004851	CTT	2	6	109726	109731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983586
1623	NC_004851	TAA	2	6	109745	109750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983586
1624	NC_004851	TTA	2	6	109764	109769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983586
1625	NC_004851	ATTT	2	8	109813	109820	25 %	75 %	0 %	0 %	31983586
1626	NC_004851	TCT	2	6	109857	109862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983586
1627	NC_004851	T	6	6	109882	109887	0 %	100 %	0 %	0 %	31983586
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