MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 plasmid pCP301

Total Repeats: 3479

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_004851	GGT	2	6	69251	69256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31983644
1002	NC_004851	CTT	2	6	69269	69274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983644
1003	NC_004851	CTGT	2	8	69284	69291	0 %	50 %	25 %	25 %	31983644
1004	NC_004851	ATT	2	6	69347	69352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983644
1005	NC_004851	TTA	2	6	69353	69358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983644
1006	NC_004851	AAG	2	6	69489	69494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31983644
1007	NC_004851	TTG	2	6	69549	69554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983644
1008	NC_004851	TTG	2	6	69573	69578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983644
1009	NC_004851	G	6	6	69594	69599	0 %	0 %	100 %	0 %	31983644
1010	NC_004851	CTG	2	6	69624	69629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983644
1011	NC_004851	CAT	2	6	69637	69642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983644
1012	NC_004851	TGA	2	6	69651	69656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983644
1013	NC_004851	ATTT	2	8	69727	69734	25 %	75 %	0 %	0 %	31983730
1014	NC_004851	T	6	6	69732	69737	0 %	100 %	0 %	0 %	31983730
1015	NC_004851	CT	3	6	70221	70226	0 %	50 %	0 %	50 %	31983652
1016	NC_004851	CCAA	2	8	70339	70346	50 %	0 %	0 %	50 %	31983652
1017	NC_004851	AACAT	2	10	70358	70367	60 %	20 %	0 %	20 %	31983652
1018	NC_004851	TTG	2	6	70478	70483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983652
1019	NC_004851	AAAG	2	8	70599	70606	75 %	0 %	25 %	0 %	31983652
1020	NC_004851	ACACC	2	10	70652	70661	40 %	0 %	0 %	60 %	31983652
1021	NC_004851	CAG	2	6	70794	70799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983652
1022	NC_004851	CAATC	2	10	70860	70869	40 %	20 %	0 %	40 %	31983652
1023	NC_004851	A	6	6	70911	70916	100 %	0 %	0 %	0 %	31983652
1024	NC_004851	CAC	2	6	70942	70947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31983652
1025	NC_004851	AACT	2	8	70998	71005	50 %	25 %	0 %	25 %	31983652
1026	NC_004851	AAC	2	6	71030	71035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31983652
1027	NC_004851	GAA	2	6	71068	71073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31983652
1028	NC_004851	AGC	2	6	71131	71136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983652
1029	NC_004851	TGC	2	6	71156	71161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983652
1030	NC_004851	ACTC	2	8	71333	71340	25 %	25 %	0 %	50 %	31983652
1031	NC_004851	CA	3	6	71373	71378	50 %	0 %	0 %	50 %	31983652
1032	NC_004851	TC	3	6	71409	71414	0 %	50 %	0 %	50 %	31983649
1033	NC_004851	TGAG	2	8	71420	71427	25 %	25 %	50 %	0 %	31983649
1034	NC_004851	GCT	2	6	71441	71446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983649
1035	NC_004851	CCG	2	6	71498	71503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31983649
1036	NC_004851	TGA	2	6	71542	71547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983649
1037	NC_004851	TTC	2	6	71559	71564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983649
1038	NC_004851	ATG	2	6	71572	71577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983649
1039	NC_004851	CAC	2	6	71629	71634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31983731
1040	NC_004851	AGG	2	6	71645	71650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	31983731
1041	NC_004851	CAG	2	6	71755	71760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983731
1042	NC_004851	CAC	2	6	71763	71768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31983731
1043	NC_004851	CGC	2	6	71772	71777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31983731
1044	NC_004851	GAA	2	6	71791	71796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31983731
1045	NC_004851	TTTC	2	8	71806	71813	0 %	75 %	0 %	25 %	31983731
1046	NC_004851	TCCGCC	2	12	71855	71866	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	31983731
1047	NC_004851	TCA	2	6	71873	71878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983731
1048	NC_004851	TAA	2	6	71882	71887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983731
1049	NC_004851	T	6	6	71941	71946	0 %	100 %	0 %	0 %	31983731
1050	NC_004851	TTC	2	6	71960	71965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983731
1051	NC_004851	CCA	2	6	71967	71972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31983731
1052	NC_004851	GCT	2	6	72009	72014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983731
1053	NC_004851	ACTCTG	2	12	72030	72041	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	31983731
1054	NC_004851	CTT	2	6	72096	72101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983731
1055	NC_004851	CGCA	2	8	72109	72116	25 %	0 %	25 %	50 %	31983731
1056	NC_004851	CGGG	2	8	72149	72156	0 %	0 %	75 %	25 %	31983602
1057	NC_004851	ATC	2	6	72226	72231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983602
1058	NC_004851	ATA	2	6	72247	72252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983602
1059	NC_004851	GGA	2	6	72271	72276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	31983602
1060	NC_004851	TCG	2	6	72300	72305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983602
1061	NC_004851	CCAC	2	8	72320	72327	25 %	0 %	0 %	75 %	31983602
1062	NC_004851	TG	3	6	72484	72489	0 %	50 %	50 %	0 %	31983602
1063	NC_004851	ATAC	2	8	72500	72507	50 %	25 %	0 %	25 %	31983602
1064	NC_004851	ATG	2	6	72646	72651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983602
1065	NC_004851	GTAA	2	8	72687	72694	50 %	25 %	25 %	0 %	31983602
1066	NC_004851	CCAC	2	8	72701	72708	25 %	0 %	0 %	75 %	31983602
1067	NC_004851	AAC	2	6	72877	72882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31983602
1068	NC_004851	CAT	2	6	73094	73099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983648
1069	NC_004851	T	6	6	73099	73104	0 %	100 %	0 %	0 %	31983648
1070	NC_004851	GCG	2	6	73168	73173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31983648
1071	NC_004851	GGT	2	6	73222	73227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31983648
1072	NC_004851	GAA	2	6	73701	73706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31983606
1073	NC_004851	TCA	2	6	73718	73723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983606
1074	NC_004851	CGG	2	6	73762	73767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31983606
1075	NC_004851	CTCA	2	8	73838	73845	25 %	25 %	0 %	50 %	31983606
1076	NC_004851	CAG	3	9	73966	73974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983606
1077	NC_004851	ACG	2	6	74022	74027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983606
1078	NC_004851	C	6	6	74047	74052	0 %	0 %	0 %	100 %	31983606
1079	NC_004851	TCA	2	6	74059	74064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983606
1080	NC_004851	TGA	2	6	74066	74071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983606
1081	NC_004851	TCAG	2	8	74089	74096	25 %	25 %	25 %	25 %	31983606
1082	NC_004851	GAA	2	6	74097	74102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31983606
1083	NC_004851	TTC	2	6	74112	74117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983606
1084	NC_004851	GCA	2	6	74208	74213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983606
1085	NC_004851	TCAAA	2	10	74261	74270	60 %	20 %	0 %	20 %	31983606
1086	NC_004851	CAGA	2	8	74288	74295	50 %	0 %	25 %	25 %	31983606
1087	NC_004851	CAG	2	6	74730	74735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983732
1088	NC_004851	CG	3	6	74746	74751	0 %	0 %	50 %	50 %	31983732
1089	NC_004851	TTC	2	6	74755	74760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983732
1090	NC_004851	CGG	2	6	74791	74796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31983732
1091	NC_004851	GCC	2	6	74808	74813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31983732
1092	NC_004851	ATCC	2	8	74898	74905	25 %	25 %	0 %	50 %	31983732
1093	NC_004851	TC	3	6	74933	74938	0 %	50 %	0 %	50 %	31983732
1094	NC_004851	CA	3	6	74939	74944	50 %	0 %	0 %	50 %	31983732
1095	NC_004851	A	6	6	74982	74987	100 %	0 %	0 %	0 %	31983732
1096	NC_004851	GA	3	6	75039	75044	50 %	0 %	50 %	0 %	31983732
1097	NC_004851	TG	3	6	75075	75080	0 %	50 %	50 %	0 %	31983653
1098	NC_004851	GAGT	2	8	75113	75120	25 %	25 %	50 %	0 %	31983653
1099	NC_004851	AGC	2	6	75291	75296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983653
1100	NC_004851	GCT	2	6	75317	75322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983653
1101	NC_004851	TTC	2	6	75380	75385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983653
1102	NC_004851	GTT	2	6	75418	75423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983653
1103	NC_004851	AGTT	2	8	75448	75455	25 %	50 %	25 %	0 %	31983653
1104	NC_004851	GTG	2	6	75506	75511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31983653
1105	NC_004851	T	6	6	75537	75542	0 %	100 %	0 %	0 %	31983653
1106	NC_004851	GATTG	2	10	75584	75593	20 %	40 %	40 %	0 %	31983653
1107	NC_004851	GGTGT	2	10	75792	75801	0 %	40 %	60 %	0 %	31983653
1108	NC_004851	CTTT	2	8	75847	75854	0 %	75 %	0 %	25 %	31983653
1109	NC_004851	CAA	2	6	75970	75975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31983653
1110	NC_004851	ATGTT	2	10	76086	76095	20 %	60 %	20 %	0 %	31983653
1111	NC_004851	TTGG	2	8	76107	76114	0 %	50 %	50 %	0 %	31983653
1112	NC_004851	AG	3	6	76227	76232	50 %	0 %	50 %	0 %	31983653
1113	NC_004851	CTTAA	2	10	76322	76331	40 %	40 %	0 %	20 %	31983676
1114	NC_004851	TCA	2	6	76359	76364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983676
1115	NC_004851	CGG	2	6	76469	76474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31983676
1116	NC_004851	CTT	2	6	76475	76480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983676
1117	NC_004851	GC	3	6	76499	76504	0 %	0 %	50 %	50 %	31983676
1118	NC_004851	TCC	2	6	76510	76515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	31983676
1119	NC_004851	GCCG	2	8	76517	76524	0 %	0 %	50 %	50 %	31983676
1120	NC_004851	T	7	7	76525	76531	0 %	100 %	0 %	0 %	31983676
1121	NC_004851	TCC	2	6	76556	76561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	31983676
1122	NC_004851	CGT	2	6	76595	76600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983676
1123	NC_004851	GAC	2	6	76783	76788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983676
1124	NC_004851	AGA	2	6	76810	76815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31983676
1125	NC_004851	GGC	2	6	76841	76846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31983676
1126	NC_004851	CAG	2	6	76850	76855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983676
1127	NC_004851	CAG	2	6	76886	76891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983676
1128	NC_004851	T	6	6	77007	77012	0 %	100 %	0 %	0 %	31983676
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1130	NC_004851	CCGC	2	8	77166	77173	0 %	0 %	25 %	75 %	31983676
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1389	NC_004851	CTGGT	2	10	94222	94231	0 %	40 %	40 %	20 %	31983697
1390	NC_004851	TCAG	2	8	94245	94252	25 %	25 %	25 %	25 %	31983697
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1392	NC_004851	TCA	2	6	94284	94289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983697
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1499	NC_004851	GCTG	2	8	101315	101322	0 %	25 %	50 %	25 %	31983628
1500	NC_004851	CAA	2	6	101325	101330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31983628

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