MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 plasmid pCP301

Total Repeats: 3479

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004851	GC	3	6	34704	34709	0 %	0 %	50 %	50 %	31983673
502	NC_004851	GAA	2	6	34727	34732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31983673
503	NC_004851	GCC	2	6	34733	34738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31983673
504	NC_004851	T	6	6	34884	34889	0 %	100 %	0 %	0 %	31983673
505	NC_004851	GT	3	6	34926	34931	0 %	50 %	50 %	0 %	31983673
506	NC_004851	GA	3	6	34933	34938	50 %	0 %	50 %	0 %	31983673
507	NC_004851	GGAT	2	8	34966	34973	25 %	25 %	50 %	0 %	31983673
508	NC_004851	TG	3	6	35053	35058	0 %	50 %	50 %	0 %	31983673
509	NC_004851	CCG	2	6	35075	35080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31983673
510	NC_004851	GAA	2	6	35111	35116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31983673
511	NC_004851	CG	3	6	35120	35125	0 %	0 %	50 %	50 %	31983673
512	NC_004851	CTG	2	6	35136	35141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983673
513	NC_004851	T	6	6	35599	35604	0 %	100 %	0 %	0 %	31983636
514	NC_004851	GC	3	6	35744	35749	0 %	0 %	50 %	50 %	31983636
515	NC_004851	AGCA	2	8	35811	35818	50 %	0 %	25 %	25 %	31983636
516	NC_004851	AGC	3	9	35826	35834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983636
517	NC_004851	TGC	2	6	35851	35856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983636
518	NC_004851	GAT	2	6	36003	36008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983636
519	NC_004851	CAT	2	6	36017	36022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983636
520	NC_004851	AGT	2	6	36024	36029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983636
521	NC_004851	AGT	2	6	36032	36037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983636
522	NC_004851	AGCGC	2	10	36136	36145	20 %	0 %	40 %	40 %	31983722
523	NC_004851	GAA	2	6	36214	36219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31983722
524	NC_004851	TCA	2	6	36231	36236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983722
525	NC_004851	CGG	2	6	36275	36280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31983722
526	NC_004851	CTCA	2	8	36351	36358	25 %	25 %	0 %	50 %	31983722
527	NC_004851	T	6	6	36455	36460	0 %	100 %	0 %	0 %	31983722
528	NC_004851	ATA	2	6	36494	36499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983722
529	NC_004851	CAT	2	6	36556	36561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56404005
530	NC_004851	TGC	2	6	36593	36598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56404005
531	NC_004851	ATG	2	6	36599	36604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56404005
532	NC_004851	AAG	2	6	36617	36622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56404005
533	NC_004851	TTG	2	6	36626	36631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56404005
534	NC_004851	TCT	2	6	36718	36723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56404005
535	NC_004851	T	7	7	36729	36735	0 %	100 %	0 %	0 %	56404005
536	NC_004851	CAA	2	6	36736	36741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56404005
537	NC_004851	AGA	2	6	36770	36775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56404005
538	NC_004851	TATCGA	2	12	36779	36790	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	56404005
539	NC_004851	TA	3	6	36793	36798	50 %	50 %	0 %	0 %	56404005
540	NC_004851	TCA	2	6	36807	36812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56404005
541	NC_004851	TCTT	2	8	36847	36854	0 %	75 %	0 %	25 %	56404005
542	NC_004851	CCT	3	9	36901	36909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56404005
543	NC_004851	AG	3	6	36911	36916	50 %	0 %	50 %	0 %	56404005
544	NC_004851	T	7	7	36925	36931	0 %	100 %	0 %	0 %	56404005
545	NC_004851	ATT	2	6	36987	36992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56404005
546	NC_004851	TAA	2	6	36994	36999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56404005
547	NC_004851	TAA	3	9	37004	37012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56404005
548	NC_004851	T	7	7	37058	37064	0 %	100 %	0 %	0 %	56404005
549	NC_004851	ATA	2	6	37176	37181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56404005
550	NC_004851	CAT	2	6	37232	37237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56404005
551	NC_004851	AG	3	6	37831	37836	50 %	0 %	50 %	0 %	31983705
552	NC_004851	ACG	2	6	37855	37860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983705
553	NC_004851	CAGT	2	8	37862	37869	25 %	25 %	25 %	25 %	31983705
554	NC_004851	GAAG	2	8	37914	37921	50 %	0 %	50 %	0 %	31983705
555	NC_004851	TC	3	6	38022	38027	0 %	50 %	0 %	50 %	31983705
556	NC_004851	ATC	2	6	38297	38302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157042767
557	NC_004851	TAT	3	9	38322	38330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157042767
558	NC_004851	TAC	2	6	38341	38346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157042767
559	NC_004851	A	6	6	38369	38374	100 %	0 %	0 %	0 %	157042767
560	NC_004851	TA	3	6	38380	38385	50 %	50 %	0 %	0 %	157042767
561	NC_004851	CTG	2	6	38400	38405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157042767
562	NC_004851	TGA	2	6	38479	38484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157042767
563	NC_004851	AG	3	6	38619	38624	50 %	0 %	50 %	0 %	56404006
564	NC_004851	TGC	2	6	38655	38660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56404006
565	NC_004851	ATG	2	6	38680	38685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56404006
566	NC_004851	TTCCAT	2	12	38710	38721	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	56404006
567	NC_004851	TCCT	2	8	38728	38735	0 %	50 %	0 %	50 %	56404006
568	NC_004851	GTG	2	6	38753	38758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56404006
569	NC_004851	A	6	6	38956	38961	100 %	0 %	0 %	0 %	56404007
570	NC_004851	GTGAT	2	10	39002	39011	20 %	40 %	40 %	0 %	31983640
571	NC_004851	GCTG	2	8	39068	39075	0 %	25 %	50 %	25 %	31983640
572	NC_004851	GGA	2	6	39098	39103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	31983640
573	NC_004851	TCT	2	6	39153	39158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983640
574	NC_004851	CTG	2	6	39163	39168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983640
575	NC_004851	AATCTG	2	12	39283	39294	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	31983640
576	NC_004851	ACA	2	6	39297	39302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31983640
577	NC_004851	TAT	2	6	41235	41240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983584
578	NC_004851	ACA	2	6	41252	41257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31983584
579	NC_004851	ATT	2	6	41315	41320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983584
580	NC_004851	AAC	2	6	41475	41480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31983584
581	NC_004851	A	6	6	41493	41498	100 %	0 %	0 %	0 %	31983584
582	NC_004851	ACC	2	6	41523	41528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31983584
583	NC_004851	AGA	2	6	41595	41600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31983584
584	NC_004851	TTC	2	6	41639	41644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983584
585	NC_004851	ATA	2	6	41672	41677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983584
586	NC_004851	C	6	6	41755	41760	0 %	0 %	0 %	100 %	31983584
587	NC_004851	CTGGCT	2	12	41782	41793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983584
588	NC_004851	AAT	2	6	41794	41799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983584
589	NC_004851	AAC	2	6	41807	41812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31983584
590	NC_004851	AAT	3	9	41854	41862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983584
591	NC_004851	ACA	2	6	41866	41871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31983584
592	NC_004851	ACA	2	6	41958	41963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31983584
593	NC_004851	ACC	2	6	41968	41973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31983584
594	NC_004851	ATT	2	6	41981	41986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983584
595	NC_004851	ACAA	2	8	42083	42090	75 %	0 %	0 %	25 %	31983584
596	NC_004851	CAG	2	6	42259	42264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983584
597	NC_004851	TGC	2	6	42276	42281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983584
598	NC_004851	CCT	2	6	42342	42347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	31983584
599	NC_004851	GCTCT	2	10	42391	42400	0 %	40 %	20 %	40 %	31983584
600	NC_004851	GGA	2	6	42435	42440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	31983584
601	NC_004851	CT	3	6	42532	42537	0 %	50 %	0 %	50 %	31983584
602	NC_004851	GAAT	2	8	42630	42637	50 %	25 %	25 %	0 %	31983584
603	NC_004851	GCAG	2	8	42708	42715	25 %	0 %	50 %	25 %	31983584
604	NC_004851	GATGCG	2	12	42796	42807	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	31983584
605	NC_004851	CAG	2	6	42847	42852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983584
606	NC_004851	TGAC	2	8	42866	42873	25 %	25 %	25 %	25 %	31983584
607	NC_004851	CAC	2	6	43134	43139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31983634
608	NC_004851	A	6	6	43258	43263	100 %	0 %	0 %	0 %	31983634
609	NC_004851	GTT	2	6	43480	43485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983599
610	NC_004851	TTAC	2	8	43668	43675	25 %	50 %	0 %	25 %	31983599
611	NC_004851	TCA	2	6	43710	43715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983599
612	NC_004851	GTAT	2	8	43855	43862	25 %	50 %	25 %	0 %	31983599
613	NC_004851	AC	3	6	43872	43877	50 %	0 %	0 %	50 %	31983599
614	NC_004851	GTGG	2	8	44035	44042	0 %	25 %	75 %	0 %	31983599
615	NC_004851	CGA	2	6	44057	44062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983599
616	NC_004851	GCAGAA	2	12	44093	44104	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	31983599
617	NC_004851	TTA	2	6	44110	44115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983599
618	NC_004851	GAT	2	6	44132	44137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983599
619	NC_004851	CGA	2	6	44194	44199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983725
620	NC_004851	GCC	2	6	44230	44235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31983725
621	NC_004851	TCA	2	6	44295	44300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983725
622	NC_004851	TCTG	2	8	44309	44316	0 %	50 %	25 %	25 %	31983725
623	NC_004851	TAA	2	6	44340	44345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31983725
624	NC_004851	T	7	7	44458	44464	0 %	100 %	0 %	0 %	31983622
625	NC_004851	AT	3	6	44466	44471	50 %	50 %	0 %	0 %	31983622
626	NC_004851	GCG	2	6	44573	44578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31983622
627	NC_004851	CGGCTT	2	12	44667	44678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983622
628	NC_004851	ATT	2	6	44714	44719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983622
629	NC_004851	CTCAGA	2	12	44776	44787	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	31983659
630	NC_004851	ACTG	2	8	44817	44824	25 %	25 %	25 %	25 %	31983659
631	NC_004851	CAAAAC	2	12	44827	44838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31983659
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763	NC_004851	GTG	2	6	52319	52324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31983694
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