MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 2457T

Total Repeats: 72410

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_004741	ACTGG	2	10	227323	227332	20 %	20 %	40 %	20 %	30061765
4002	NC_004741	CT	3	6	227333	227338	0 %	50 %	0 %	50 %	30061765
4003	NC_004741	TTG	2	6	227339	227344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30061765
4004	NC_004741	TGC	2	6	227355	227360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061765
4005	NC_004741	AACA	2	8	227390	227397	75 %	0 %	0 %	25 %	30061765
4006	NC_004741	GGA	2	6	227399	227404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	30061765
4007	NC_004741	TTG	2	6	227451	227456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30061765
4008	NC_004741	CGC	2	6	227611	227616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061766
4009	NC_004741	TCA	2	6	227630	227635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061766
4010	NC_004741	CGTT	2	8	227639	227646	0 %	50 %	25 %	25 %	30061766
4011	NC_004741	CCCATT	2	12	227673	227684	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	30061766
4012	NC_004741	TGC	2	6	227693	227698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061766
4013	NC_004741	GCA	2	6	227705	227710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061766
4014	NC_004741	T	6	6	227735	227740	0 %	100 %	0 %	0 %	30061766
4015	NC_004741	T	6	6	227746	227751	0 %	100 %	0 %	0 %	30061766
4016	NC_004741	CTG	2	6	227754	227759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061766
4017	NC_004741	T	6	6	227773	227778	0 %	100 %	0 %	0 %	30061766
4018	NC_004741	GTT	2	6	227899	227904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30061766
4019	NC_004741	GGT	2	6	227905	227910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061766
4020	NC_004741	ACC	2	6	228140	228145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061767
4021	NC_004741	AGT	2	6	228208	228213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061767
4022	NC_004741	TGG	2	6	228267	228272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061767
4023	NC_004741	TGA	2	6	228304	228309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061767
4024	NC_004741	CGCGG	2	10	228368	228377	0 %	0 %	60 %	40 %	30061767
4025	NC_004741	AACG	2	8	228570	228577	50 %	0 %	25 %	25 %	30061767
4026	NC_004741	GGT	2	6	228635	228640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061767
4027	NC_004741	GA	3	6	228669	228674	50 %	0 %	50 %	0 %	30061767
4028	NC_004741	CAG	2	6	228677	228682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061767
4029	NC_004741	CAA	2	6	228683	228688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30061767
4030	NC_004741	CAA	2	6	228696	228701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30061767
4031	NC_004741	AAGT	2	8	228724	228731	50 %	25 %	25 %	0 %	30061767
4032	NC_004741	GTT	2	6	228737	228742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30061767
4033	NC_004741	GCA	2	6	228764	228769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061767
4034	NC_004741	A	6	6	228797	228802	100 %	0 %	0 %	0 %	30061767
4035	NC_004741	CAG	2	6	229193	229198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061768
4036	NC_004741	TTA	2	6	229216	229221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30061768
4037	NC_004741	GCA	2	6	229261	229266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061768
4038	NC_004741	GCT	2	6	229280	229285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061768
4039	NC_004741	CGT	2	6	229336	229341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061768
4040	NC_004741	TCC	2	6	229389	229394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	30061768
4041	NC_004741	TCTGC	2	10	229417	229426	0 %	40 %	20 %	40 %	30061768
4042	NC_004741	TGG	2	6	229450	229455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061768
4043	NC_004741	GCT	2	6	229465	229470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061768
4044	NC_004741	GTG	2	6	229500	229505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061768
4045	NC_004741	CAG	2	6	229532	229537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061768
4046	NC_004741	CTG	2	6	229615	229620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061768
4047	NC_004741	CG	3	6	229651	229656	0 %	0 %	50 %	50 %	30061768
4048	NC_004741	CCG	2	6	229705	229710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061768
4049	NC_004741	GCA	2	6	229761	229766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061768
4050	NC_004741	CGC	2	6	229823	229828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061768
4051	NC_004741	GCA	2	6	229851	229856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061768
4052	NC_004741	CGG	2	6	229861	229866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061768
4053	NC_004741	GGAT	2	8	229893	229900	25 %	25 %	50 %	0 %	30061768
4054	NC_004741	CAG	2	6	229931	229936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061768
4055	NC_004741	CTG	2	6	229970	229975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061768
4056	NC_004741	GCAGC	2	10	229982	229991	20 %	0 %	40 %	40 %	30061768
4057	NC_004741	TGC	2	6	230017	230022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061768
4058	NC_004741	CAG	2	6	230027	230032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061768
4059	NC_004741	CTT	2	6	230104	230109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30061768
4060	NC_004741	GCG	2	6	230118	230123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061768
4061	NC_004741	CAG	3	9	230132	230140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061768
4062	NC_004741	CCG	2	6	230182	230187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061768
4063	NC_004741	GTG	2	6	230239	230244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061769
4064	NC_004741	GCC	2	6	230290	230295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061769
4065	NC_004741	CCG	2	6	230689	230694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061770
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4069	NC_004741	ACGCC	2	10	230975	230984	20 %	0 %	20 %	60 %	30061771
4070	NC_004741	AGT	2	6	230993	230998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061771
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4073	NC_004741	GCC	2	6	231121	231126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061771
4074	NC_004741	GCCAT	2	10	231186	231195	20 %	20 %	20 %	40 %	30061771
4075	NC_004741	GCG	2	6	231219	231224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061771
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4077	NC_004741	CGCC	2	8	231249	231256	0 %	0 %	25 %	75 %	30061771
4078	NC_004741	GTGATG	2	12	231341	231352	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	30061771
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4084	NC_004741	CGT	2	6	231646	231651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061771
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4088	NC_004741	CGCCA	2	10	231790	231799	20 %	0 %	20 %	60 %	30061771
4089	NC_004741	A	6	6	231842	231847	100 %	0 %	0 %	0 %	30061771
4090	NC_004741	GCA	2	6	231879	231884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061771
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4092	NC_004741	GC	3	6	231981	231986	0 %	0 %	50 %	50 %	30061771
4093	NC_004741	GCCA	2	8	232006	232013	25 %	0 %	25 %	50 %	30061771
4094	NC_004741	CTC	2	6	232066	232071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	30061771
4095	NC_004741	CTGA	2	8	232111	232118	25 %	25 %	25 %	25 %	30061771
4096	NC_004741	GCAGG	2	10	232194	232203	20 %	0 %	60 %	20 %	30061771
4097	NC_004741	GCG	2	6	232217	232222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061771
4098	NC_004741	GCT	2	6	232270	232275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061771
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4100	NC_004741	CG	3	6	232332	232337	0 %	0 %	50 %	50 %	30061771
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4102	NC_004741	CAG	2	6	232441	232446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061771
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4104	NC_004741	GCG	2	6	232574	232579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061771
4105	NC_004741	GGC	2	6	232594	232599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061771
4106	NC_004741	GTA	2	6	232642	232647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061771
4107	NC_004741	A	7	7	232686	232692	100 %	0 %	0 %	0 %	30061772
4108	NC_004741	GC	3	6	232719	232724	0 %	0 %	50 %	50 %	30061772
4109	NC_004741	CGC	2	6	232767	232772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061772
4110	NC_004741	GGC	2	6	232806	232811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061772
4111	NC_004741	GAT	2	6	232828	232833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061772
4112	NC_004741	GGC	2	6	232940	232945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061772
4113	NC_004741	GCA	2	6	232988	232993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061772
4114	NC_004741	ATC	2	6	232999	233004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061772
4115	NC_004741	CGG	2	6	233042	233047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061772
4116	NC_004741	CGT	2	6	233109	233114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061772
4117	NC_004741	CA	3	6	233115	233120	50 %	0 %	0 %	50 %	30061772
4118	NC_004741	GCA	2	6	233139	233144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061772
4119	NC_004741	TG	3	6	233381	233386	0 %	50 %	50 %	0 %	30061773
4120	NC_004741	AT	3	6	233491	233496	50 %	50 %	0 %	0 %	30061773
4121	NC_004741	CCGC	2	8	233500	233507	0 %	0 %	25 %	75 %	30061773
4122	NC_004741	ACCGG	2	10	233521	233530	20 %	0 %	40 %	40 %	30061773
4123	NC_004741	GTCGCT	2	12	233538	233549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061773
4124	NC_004741	GCC	2	6	233565	233570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061773
4125	NC_004741	GC	3	6	233606	233611	0 %	0 %	50 %	50 %	30061773
4126	NC_004741	CAC	2	6	233642	233647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061773
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4128	NC_004741	TCC	2	6	233677	233682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	30061773
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4130	NC_004741	GGC	2	6	233882	233887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061773
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4136	NC_004741	TGT	2	6	234020	234025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30061774
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4143	NC_004741	TGA	2	6	234659	234664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061775
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4145	NC_004741	CCA	2	6	234721	234726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061775
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4154	NC_004741	CTG	2	6	235179	235184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061776
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4156	NC_004741	GTT	2	6	235202	235207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30061776
4157	NC_004741	TGC	2	6	235222	235227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061776
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4162	NC_004741	GCC	2	6	235448	235453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061777
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4233	NC_004741	GCCCA	2	10	241200	241209	20 %	0 %	20 %	60 %	30061786
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4244	NC_004741	GTT	2	6	242284	242289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30061788
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4246	NC_004741	CGA	2	6	242364	242369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061788
4247	NC_004741	ATC	2	6	242383	242388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061788
4248	NC_004741	CAT	2	6	242390	242395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061788
4249	NC_004741	GA	4	8	242407	242414	50 %	0 %	50 %	0 %	30061788
4250	NC_004741	GGAT	2	8	242528	242535	25 %	25 %	50 %	0 %	30061788
4251	NC_004741	TGG	2	6	242572	242577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061788
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4253	NC_004741	GAAA	2	8	242622	242629	75 %	0 %	25 %	0 %	30061788
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4255	NC_004741	ATG	2	6	242696	242701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061788
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4357	NC_004741	TGA	2	6	247626	247631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061793
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4368	NC_004741	GT	3	6	248431	248436	0 %	50 %	50 %	0 %	30061795
4369	NC_004741	GGC	2	6	248437	248442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061795
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4486	NC_004741	AG	3	6	254681	254686	50 %	0 %	50 %	0 %	30061800
4487	NC_004741	CAC	2	6	255020	255025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061801
4488	NC_004741	A	6	6	255144	255149	100 %	0 %	0 %	0 %	30061801
4489	NC_004741	TTAC	2	8	255553	255560	25 %	50 %	0 %	25 %	30061802
4490	NC_004741	TCA	2	6	255595	255600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061802
4491	NC_004741	GTAT	2	8	255740	255747	25 %	50 %	25 %	0 %	30061802
4492	NC_004741	AC	3	6	255757	255762	50 %	0 %	0 %	50 %	30061802
4493	NC_004741	GTGG	2	8	255920	255927	0 %	25 %	75 %	0 %	30061802
4494	NC_004741	CGA	2	6	255942	255947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061802
4495	NC_004741	GCAGAA	2	12	255978	255989	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	30061802
4496	NC_004741	TTA	2	6	255995	256000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30061802
4497	NC_004741	GAT	2	6	256017	256022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061802
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4499	NC_004741	AGGC	2	8	256101	256108	25 %	0 %	50 %	25 %	30061803
4500	NC_004741	TTA	2	6	256119	256124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30061803

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