MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 2457T

Total Repeats: 72410

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_004741	GCC	2	6	138691	138696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061689
2502	NC_004741	CCAG	2	8	138705	138712	25 %	0 %	25 %	50 %	30061689
2503	NC_004741	TCG	2	6	138778	138783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061689
2504	NC_004741	GTC	2	6	139077	139082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161486547
2505	NC_004741	TGG	2	6	139125	139130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161486547
2506	NC_004741	CTG	2	6	139133	139138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161486547
2507	NC_004741	TTTATG	2	12	139148	139159	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	161486547
2508	NC_004741	CCA	2	6	139236	139241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161486547
2509	NC_004741	TTG	2	6	139302	139307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161486547
2510	NC_004741	ATC	2	6	139313	139318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161486547
2511	NC_004741	GCT	2	6	139393	139398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161486547
2512	NC_004741	CCGTC	2	10	139406	139415	0 %	20 %	20 %	60 %	161486547
2513	NC_004741	GTGAA	2	10	139416	139425	40 %	20 %	40 %	0 %	161486547
2514	NC_004741	TGG	2	6	139470	139475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161486547
2515	NC_004741	CTG	2	6	139535	139540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161486547
2516	NC_004741	TGG	2	6	139664	139669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061691
2517	NC_004741	GCA	2	6	139688	139693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061691
2518	NC_004741	CGT	2	6	139697	139702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061691
2519	NC_004741	TGG	2	6	139766	139771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061691
2520	NC_004741	GTTCA	2	10	139803	139812	20 %	40 %	20 %	20 %	30061691
2521	NC_004741	CA	3	6	139811	139816	50 %	0 %	0 %	50 %	30061691
2522	NC_004741	GCA	2	6	139889	139894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061691
2523	NC_004741	GTT	2	6	139899	139904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30061691
2524	NC_004741	CGG	2	6	139931	139936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061691
2525	NC_004741	CGC	3	9	139943	139951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061691
2526	NC_004741	ATA	2	6	139969	139974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30061691
2527	NC_004741	ATCCA	2	10	140129	140138	40 %	20 %	0 %	40 %	30061691
2528	NC_004741	A	6	6	140175	140180	100 %	0 %	0 %	0 %	30061691
2529	NC_004741	CCA	2	6	140195	140200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061691
2530	NC_004741	TTG	2	6	140221	140226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30061691
2531	NC_004741	TGA	2	6	140228	140233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061691
2532	NC_004741	A	8	8	140391	140398	100 %	0 %	0 %	0 %	30061692
2533	NC_004741	GGC	2	6	140406	140411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061692
2534	NC_004741	TAT	2	6	140507	140512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30061692
2535	NC_004741	CT	3	6	140516	140521	0 %	50 %	0 %	50 %	30061692
2536	NC_004741	TAAA	2	8	140524	140531	75 %	25 %	0 %	0 %	30061692
2537	NC_004741	CGGG	2	8	140537	140544	0 %	0 %	75 %	25 %	30061692
2538	NC_004741	GCA	2	6	140645	140650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061692
2539	NC_004741	CAGG	2	8	140664	140671	25 %	0 %	50 %	25 %	30061692
2540	NC_004741	TAC	2	6	140673	140678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061692
2541	NC_004741	AGC	2	6	140725	140730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061692
2542	NC_004741	AACG	2	8	140751	140758	50 %	0 %	25 %	25 %	30061692
2543	NC_004741	ACT	2	6	140828	140833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061692
2544	NC_004741	CGA	2	6	140840	140845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061692
2545	NC_004741	ACCG	2	8	140846	140853	25 %	0 %	25 %	50 %	30061692
2546	NC_004741	CGC	2	6	140874	140879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061692
2547	NC_004741	CAC	2	6	140918	140923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061692
2548	NC_004741	CAT	2	6	140924	140929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061692
2549	NC_004741	CA	3	6	140936	140941	50 %	0 %	0 %	50 %	30061692
2550	NC_004741	GAA	2	6	140949	140954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30061692
2551	NC_004741	ATT	2	6	140982	140987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30061692
2552	NC_004741	TGG	2	6	141001	141006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061692
2553	NC_004741	GCT	2	6	141026	141031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061692
2554	NC_004741	TGTT	2	8	141244	141251	0 %	75 %	25 %	0 %	30061692
2555	NC_004741	ATG	2	6	141284	141289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061692
2556	NC_004741	GCC	2	6	141370	141375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061693
2557	NC_004741	TCA	2	6	141378	141383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061693
2558	NC_004741	CTTTA	2	10	141392	141401	20 %	60 %	0 %	20 %	30061693
2559	NC_004741	ATG	2	6	141485	141490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061693
2560	NC_004741	TCA	2	6	141524	141529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061693
2561	NC_004741	T	6	6	141530	141535	0 %	100 %	0 %	0 %	30061693
2562	NC_004741	GCT	2	6	141565	141570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061693
2563	NC_004741	ATT	2	6	141596	141601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30061693
2564	NC_004741	CGG	2	6	141613	141618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061693
2565	NC_004741	TGGCG	2	10	141619	141628	0 %	20 %	60 %	20 %	30061693
2566	NC_004741	TGTT	2	8	141636	141643	0 %	75 %	25 %	0 %	30061693
2567	NC_004741	T	6	6	141671	141676	0 %	100 %	0 %	0 %	30061693
2568	NC_004741	CGG	2	6	141729	141734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061693
2569	NC_004741	GCC	2	6	141865	141870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061693
2570	NC_004741	ATG	2	6	141948	141953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061693
2571	NC_004741	TGG	2	6	141981	141986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061693
2572	NC_004741	ACGTGG	2	12	142030	142041	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	30061693
2573	NC_004741	A	6	6	142222	142227	100 %	0 %	0 %	0 %	30061694
2574	NC_004741	CTT	2	6	142237	142242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30061694
2575	NC_004741	ATG	2	6	142297	142302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061694
2576	NC_004741	TCT	2	6	142343	142348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30061694
2577	NC_004741	ATT	2	6	142389	142394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30061694
2578	NC_004741	GAT	2	6	142455	142460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061694
2579	NC_004741	TGGG	2	8	142514	142521	0 %	25 %	75 %	0 %	30061694
2580	NC_004741	AGT	2	6	142531	142536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061694
2581	NC_004741	CAA	3	9	142546	142554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30061694
2582	NC_004741	A	7	7	142553	142559	100 %	0 %	0 %	0 %	30061694
2583	NC_004741	CTG	2	6	142687	142692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061695
2584	NC_004741	TGC	2	6	142755	142760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061695
2585	NC_004741	TTA	2	6	142848	142853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30061695
2586	NC_004741	GAC	2	6	142916	142921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061695
2587	NC_004741	CAA	2	6	142950	142955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30061695
2588	NC_004741	GC	3	6	143141	143146	0 %	0 %	50 %	50 %	30061695
2589	NC_004741	CGA	2	6	143202	143207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061695
2590	NC_004741	CGA	2	6	143234	143239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061695
2591	NC_004741	GAA	2	6	143331	143336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30061695
2592	NC_004741	GGT	2	6	143361	143366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061695
2593	NC_004741	TGA	2	6	143376	143381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061695
2594	NC_004741	T	6	6	143571	143576	0 %	100 %	0 %	0 %	30061695
2595	NC_004741	CGC	2	6	143656	143661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061695
2596	NC_004741	GGC	2	6	143710	143715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061695
2597	NC_004741	GCA	2	6	143737	143742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061695
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2599	NC_004741	TTTCA	2	10	143932	143941	20 %	60 %	0 %	20 %	30061696
2600	NC_004741	CTT	2	6	143985	143990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30061696
2601	NC_004741	GAT	2	6	144016	144021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061696
2602	NC_004741	GCC	2	6	144050	144055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061696
2603	NC_004741	AAT	2	6	144070	144075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30061696
2604	NC_004741	GCA	2	6	144258	144263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061696
2605	NC_004741	GATG	2	8	144549	144556	25 %	25 %	50 %	0 %	30061697
2606	NC_004741	ATGC	2	8	144601	144608	25 %	25 %	25 %	25 %	30061697
2607	NC_004741	TGT	2	6	144780	144785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30061697
2608	NC_004741	AAGC	2	8	144798	144805	50 %	0 %	25 %	25 %	30061697
2609	NC_004741	ATG	2	6	144829	144834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061697
2610	NC_004741	TGC	2	6	144846	144851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061697
2611	NC_004741	TGG	2	6	144893	144898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061697
2612	NC_004741	TGG	2	6	145013	145018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061697
2613	NC_004741	CGG	2	6	145057	145062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061697
2614	NC_004741	ACT	2	6	145077	145082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061697
2615	NC_004741	AGTT	2	8	145169	145176	25 %	50 %	25 %	0 %	30061697
2616	NC_004741	TGC	2	6	145193	145198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061697
2617	NC_004741	GA	3	6	145242	145247	50 %	0 %	50 %	0 %	30061697
2618	NC_004741	GGGA	2	8	145257	145264	25 %	0 %	75 %	0 %	30061697
2619	NC_004741	ATG	2	6	145270	145275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061697
2620	NC_004741	CAG	2	6	145321	145326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061697
2621	NC_004741	AGG	2	6	145334	145339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	30061697
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2623	NC_004741	TGT	2	6	145546	145551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30061698
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2730	NC_004741	AGCC	2	8	151420	151427	25 %	0 %	25 %	50 %	30061705
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2745	NC_004741	GCA	2	6	152212	152217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061706
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2988	NC_004741	GCG	2	6	163791	163796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061713
2989	NC_004741	TGT	2	6	163800	163805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30061713
2990	NC_004741	TGG	3	9	163815	163823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061713
2991	NC_004741	GGC	2	6	163915	163920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061713
2992	NC_004741	TAT	2	6	163957	163962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30061713
2993	NC_004741	CGGCG	2	10	164017	164026	0 %	0 %	60 %	40 %	30061713
2994	NC_004741	TGGTG	2	10	164029	164038	0 %	40 %	60 %	0 %	30061713
2995	NC_004741	GTT	2	6	164077	164082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30061713
2996	NC_004741	GCAG	2	8	164087	164094	25 %	0 %	50 %	25 %	30061713
2997	NC_004741	GCG	2	6	164102	164107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061713
2998	NC_004741	CGC	2	6	164131	164136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061713
2999	NC_004741	TGA	2	6	164211	164216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061713
3000	NC_004741	GTG	2	6	164229	164234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061713

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