MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 2457T

Total Repeats: 72410

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_004741	CTG	2	6	109687	109692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061667
2003	NC_004741	CAG	2	6	109709	109714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061668
2004	NC_004741	CAC	2	6	109785	109790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061668
2005	NC_004741	GCA	2	6	109985	109990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061669
2006	NC_004741	GTTT	2	8	110035	110042	0 %	75 %	25 %	0 %	30061669
2007	NC_004741	GCC	2	6	110199	110204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061669
2008	NC_004741	CGCGG	2	10	110269	110278	0 %	0 %	60 %	40 %	30061669
2009	NC_004741	CCG	2	6	110294	110299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061669
2010	NC_004741	CTG	2	6	110307	110312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061669
2011	NC_004741	TGC	2	6	110377	110382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061669
2012	NC_004741	GC	3	6	110419	110424	0 %	0 %	50 %	50 %	30061669
2013	NC_004741	GAA	2	6	110457	110462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30061669
2014	NC_004741	GC	3	6	110468	110473	0 %	0 %	50 %	50 %	30061669
2015	NC_004741	T	6	6	110546	110551	0 %	100 %	0 %	0 %	30061669
2016	NC_004741	GTGC	2	8	110635	110642	0 %	25 %	50 %	25 %	30061670
2017	NC_004741	TTA	2	6	110682	110687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30061670
2018	NC_004741	CG	3	6	110722	110727	0 %	0 %	50 %	50 %	30061670
2019	NC_004741	AGC	2	6	110735	110740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061670
2020	NC_004741	CAT	2	6	110770	110775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061670
2021	NC_004741	CCA	3	9	110818	110826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061670
2022	NC_004741	T	6	6	110840	110845	0 %	100 %	0 %	0 %	30061670
2023	NC_004741	TTGC	2	8	110899	110906	0 %	50 %	25 %	25 %	30061670
2024	NC_004741	GCA	2	6	110944	110949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061670
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2051	NC_004741	CCA	3	9	112564	112572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061673
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2055	NC_004741	GCCA	2	8	112767	112774	25 %	0 %	25 %	50 %	30061673
2056	NC_004741	CT	3	6	112857	112862	0 %	50 %	0 %	50 %	30061673
2057	NC_004741	A	6	6	112872	112877	100 %	0 %	0 %	0 %	30061673
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2124	NC_004741	TGGC	2	8	117357	117364	0 %	25 %	50 %	25 %	30061677
2125	NC_004741	CGA	2	6	117400	117405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061677
2126	NC_004741	G	6	6	117490	117495	0 %	0 %	100 %	0 %	30061677
2127	NC_004741	CTGG	2	8	117550	117557	0 %	25 %	50 %	25 %	30061677
2128	NC_004741	CGC	2	6	117570	117575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061677
2129	NC_004741	ATC	2	6	117576	117581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061677
2130	NC_004741	TC	3	6	117756	117761	0 %	50 %	0 %	50 %	30061677
2131	NC_004741	GAA	2	6	117820	117825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30061677
2132	NC_004741	TCGT	2	8	117830	117837	0 %	50 %	25 %	25 %	30061677
2133	NC_004741	GTG	3	9	117842	117850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061677
2134	NC_004741	TCA	2	6	118036	118041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061678
2135	NC_004741	CCG	2	6	118057	118062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061678
2136	NC_004741	CAG	2	6	118070	118075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061678
2137	NC_004741	AGCAG	2	10	118101	118110	40 %	0 %	40 %	20 %	30061678
2138	NC_004741	ATC	2	6	118173	118178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061678
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2141	NC_004741	TGT	2	6	118353	118358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30061678
2142	NC_004741	TGT	2	6	118399	118404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30061678
2143	NC_004741	CAGT	2	8	118420	118427	25 %	25 %	25 %	25 %	30061678
2144	NC_004741	CGG	2	6	118501	118506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061678
2145	NC_004741	CTG	2	6	118627	118632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061678
2146	NC_004741	CCA	2	6	118642	118647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061678
2147	NC_004741	ACC	2	6	118655	118660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061678
2148	NC_004741	CAT	3	9	118682	118690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061678
2149	NC_004741	ACC	2	6	118721	118726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061678
2150	NC_004741	GCC	2	6	118760	118765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061678
2151	NC_004741	CAG	2	6	118778	118783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061678
2152	NC_004741	GCC	2	6	118787	118792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061678
2153	NC_004741	GAT	2	6	118796	118801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061678
2154	NC_004741	CTA	2	6	118807	118812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061678
2155	NC_004741	CAC	2	6	118892	118897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061678
2156	NC_004741	CGG	2	6	118906	118911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061678
2157	NC_004741	AGT	2	6	119005	119010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061678
2158	NC_004741	CCAG	2	8	119012	119019	25 %	0 %	25 %	50 %	30061678
2159	NC_004741	TTC	2	6	119084	119089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30061678
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2163	NC_004741	CCAA	2	8	119863	119870	50 %	0 %	0 %	50 %	30061679
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2166	NC_004741	CGAAG	2	10	120016	120025	40 %	0 %	40 %	20 %	30061679
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2181	NC_004741	TGC	2	6	120423	120428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061679
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2185	NC_004741	GCATC	2	10	120500	120509	20 %	20 %	20 %	40 %	30061679
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2189	NC_004741	CGT	2	6	120581	120586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061679
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2193	NC_004741	CTGGAA	2	12	120993	121004	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	30061680
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2217	NC_004741	AGAGC	2	10	122228	122237	40 %	0 %	40 %	20 %	30061680
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2229	NC_004741	CGG	2	6	122642	122647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061680
2230	NC_004741	ACC	2	6	122661	122666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061680
2231	NC_004741	GCA	2	6	122684	122689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061680
2232	NC_004741	GCTTAC	2	12	122751	122762	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	30061680
2233	NC_004741	TAC	3	9	122826	122834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061680
2234	NC_004741	GCT	2	6	122951	122956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061680
2235	NC_004741	CCT	2	6	123046	123051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	30061680
2236	NC_004741	TGC	2	6	123097	123102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061680
2237	NC_004741	CG	3	6	123118	123123	0 %	0 %	50 %	50 %	30061680
2238	NC_004741	TGA	2	6	123142	123147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061680
2239	NC_004741	ACG	2	6	123148	123153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061680
2240	NC_004741	GAC	2	6	123222	123227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061680
2241	NC_004741	CAC	2	6	123285	123290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061680
2242	NC_004741	CTT	2	6	123304	123309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30061680
2243	NC_004741	GCG	2	6	123321	123326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061680
2244	NC_004741	AAT	2	6	123442	123447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30061681
2245	NC_004741	TGA	2	6	123481	123486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061681
2246	NC_004741	CCG	2	6	123672	123677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061681
2247	NC_004741	GCA	2	6	123683	123688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061681
2248	NC_004741	AGA	2	6	123709	123714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30061681
2249	NC_004741	GAA	2	6	123715	123720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30061681
2250	NC_004741	AGC	2	6	123724	123729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061681
2251	NC_004741	GCA	3	9	123734	123742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061681
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2253	NC_004741	CGA	2	6	123790	123795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061681
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2351	NC_004741	TCTGG	2	10	130886	130895	0 %	40 %	40 %	20 %	30061683
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2362	NC_004741	GCT	2	6	131320	131325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061683
2363	NC_004741	TG	3	6	131397	131402	0 %	50 %	50 %	0 %	30061683
2364	NC_004741	CGA	2	6	131458	131463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061683
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2368	NC_004741	CTA	2	6	131608	131613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061683
2369	NC_004741	GGT	2	6	131704	131709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061683
2370	NC_004741	GGC	2	6	131782	131787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061683
2371	NC_004741	GCG	2	6	131792	131797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061683
2372	NC_004741	TAA	2	6	131948	131953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30061683
2373	NC_004741	GAAA	2	8	132220	132227	75 %	0 %	25 %	0 %	161486548
2374	NC_004741	CTTG	2	8	132235	132242	0 %	50 %	25 %	25 %	161486548
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2392	NC_004741	ACC	2	6	133003	133008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061685
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2401	NC_004741	CGT	2	6	133481	133486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061686
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2490	NC_004741	GGC	2	6	138082	138087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061689
2491	NC_004741	GCT	2	6	138186	138191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061689
2492	NC_004741	CTT	2	6	138219	138224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30061689
2493	NC_004741	GTG	2	6	138261	138266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061689
2494	NC_004741	ACC	2	6	138409	138414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061689
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2498	NC_004741	AGC	2	6	138590	138595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061689
2499	NC_004741	GCGCG	2	10	138615	138624	0 %	0 %	60 %	40 %	30061689
2500	NC_004741	GTA	2	6	138679	138684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061689

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