MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 2457T

Total Repeats: 72410

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_004741	ATG	2	6	82421	82426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161486551
1502	NC_004741	GTG	2	6	82439	82444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161486551
1503	NC_004741	TGGC	2	8	82478	82485	0 %	25 %	50 %	25 %	161486551
1504	NC_004741	AAAAC	2	10	82534	82543	80 %	0 %	0 %	20 %	161486551
1505	NC_004741	TC	3	6	82558	82563	0 %	50 %	0 %	50 %	161486551
1506	NC_004741	TGGA	2	8	82601	82608	25 %	25 %	50 %	0 %	161486551
1507	NC_004741	TGT	2	6	82964	82969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161486550
1508	NC_004741	GTC	2	6	82984	82989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161486550
1509	NC_004741	TGCAT	2	10	83061	83070	20 %	40 %	20 %	20 %	161486550
1510	NC_004741	GTGG	2	8	83074	83081	0 %	25 %	75 %	0 %	161486550
1511	NC_004741	GGC	2	6	83112	83117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161486550
1512	NC_004741	CGT	2	6	83163	83168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161486550
1513	NC_004741	ATTCC	2	10	83231	83240	20 %	40 %	0 %	40 %	161486550
1514	NC_004741	TGG	2	6	83309	83314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161486550
1515	NC_004741	GGT	2	6	83328	83333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161486550
1516	NC_004741	CTGG	2	8	83394	83401	0 %	25 %	50 %	25 %	161486550
1517	NC_004741	ACT	2	6	83518	83523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161486550
1518	NC_004741	A	7	7	83574	83580	100 %	0 %	0 %	0 %	161486550
1519	NC_004741	CAG	2	6	83626	83631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161486550
1520	NC_004741	GAAA	2	8	83634	83641	75 %	0 %	25 %	0 %	161486550
1521	NC_004741	GTT	2	6	83665	83670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161486550
1522	NC_004741	TGA	2	6	83805	83810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161486550
1523	NC_004741	ACG	2	6	83815	83820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161486550
1524	NC_004741	TGG	2	6	84004	84009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161486550
1525	NC_004741	CAG	2	6	84010	84015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161486550
1526	NC_004741	GC	3	6	84027	84032	0 %	0 %	50 %	50 %	161486550
1527	NC_004741	GCA	2	6	84144	84149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161486550
1528	NC_004741	TGC	2	6	84159	84164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161486550
1529	NC_004741	TAT	2	6	84169	84174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161486550
1530	NC_004741	CGG	2	6	84207	84212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161486550
1531	NC_004741	AGA	2	6	84270	84275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161486550
1532	NC_004741	TGG	2	6	84362	84367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161486550
1533	NC_004741	CGTC	2	8	84468	84475	0 %	25 %	25 %	50 %	161486550
1534	NC_004741	TC	3	6	84509	84514	0 %	50 %	0 %	50 %	161486550
1535	NC_004741	AAT	2	6	84565	84570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161486550
1536	NC_004741	TTG	2	6	84581	84586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161486550
1537	NC_004741	GA	3	6	84670	84675	50 %	0 %	50 %	0 %	161486550
1538	NC_004741	T	6	6	84748	84753	0 %	100 %	0 %	0 %	30061643
1539	NC_004741	ACA	2	6	84766	84771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30061643
1540	NC_004741	CGA	2	6	84797	84802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061643
1541	NC_004741	GTGA	2	8	84900	84907	25 %	25 %	50 %	0 %	30061643
1542	NC_004741	GC	3	6	84919	84924	0 %	0 %	50 %	50 %	30061643
1543	NC_004741	GCTC	2	8	85125	85132	0 %	25 %	25 %	50 %	30061643
1544	NC_004741	CG	3	6	85150	85155	0 %	0 %	50 %	50 %	30061643
1545	NC_004741	AAT	2	6	85163	85168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30061643
1546	NC_004741	TTA	2	6	85414	85419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30061645
1547	NC_004741	ACC	2	6	85495	85500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061645
1548	NC_004741	CTG	2	6	85635	85640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061645
1549	NC_004741	AGA	2	6	85652	85657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30061645
1550	NC_004741	ATT	2	6	85716	85721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30061645
1551	NC_004741	CGT	2	6	85729	85734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061645
1552	NC_004741	TGGT	2	8	85831	85838	0 %	50 %	50 %	0 %	30061645
1553	NC_004741	GAT	2	6	85848	85853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061645
1554	NC_004741	CCG	2	6	85888	85893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061645
1555	NC_004741	GC	3	6	85912	85917	0 %	0 %	50 %	50 %	30061645
1556	NC_004741	GAT	2	6	85974	85979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061645
1557	NC_004741	CG	3	6	85981	85986	0 %	0 %	50 %	50 %	30061645
1558	NC_004741	GGC	2	6	86024	86029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061645
1559	NC_004741	CGT	2	6	86089	86094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061645
1560	NC_004741	GTT	2	6	86099	86104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30061645
1561	NC_004741	GATG	2	8	86114	86121	25 %	25 %	50 %	0 %	30061645
1562	NC_004741	CTT	2	6	86195	86200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30061645
1563	NC_004741	CGC	2	6	86334	86339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061645
1564	NC_004741	TTCCAT	2	12	86488	86499	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	30061646
1565	NC_004741	TCCT	2	8	86506	86513	0 %	50 %	0 %	50 %	30061646
1566	NC_004741	GTG	2	6	86531	86536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061646
1567	NC_004741	A	6	6	86734	86739	100 %	0 %	0 %	0 %	30061646
1568	NC_004741	GTGAT	2	10	86780	86789	20 %	40 %	40 %	0 %	30061647
1569	NC_004741	GCTG	2	8	86846	86853	0 %	25 %	50 %	25 %	30061647
1570	NC_004741	GGA	2	6	86876	86881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	30061647
1571	NC_004741	TCT	2	6	86931	86936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30061647
1572	NC_004741	CTG	2	6	86941	86946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061647
1573	NC_004741	TGGC	2	8	86979	86986	0 %	25 %	50 %	25 %	30061647
1574	NC_004741	AATCTG	2	12	87061	87072	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	30061647
1575	NC_004741	ACA	2	6	87075	87080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30061647
1576	NC_004741	GCT	2	6	87813	87818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061648
1577	NC_004741	TCA	2	6	87858	87863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061648
1578	NC_004741	CTG	2	6	87871	87876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061648
1579	NC_004741	CCTG	2	8	87885	87892	0 %	25 %	25 %	50 %	30061648
1580	NC_004741	GATG	2	8	87993	88000	25 %	25 %	50 %	0 %	30061648
1581	NC_004741	AAG	2	6	88055	88060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30061648
1582	NC_004741	CAA	2	6	88080	88085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30061648
1583	NC_004741	AAC	2	6	88104	88109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30061648
1584	NC_004741	ATG	2	6	88199	88204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061649
1585	NC_004741	TAC	2	6	88219	88224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061649
1586	NC_004741	TGC	2	6	88227	88232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061649
1587	NC_004741	GGT	2	6	88301	88306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061649
1588	NC_004741	CGAT	2	8	88356	88363	25 %	25 %	25 %	25 %	30061649
1589	NC_004741	TGA	2	6	88399	88404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061649
1590	NC_004741	CAT	2	6	88417	88422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061649
1591	NC_004741	TGA	2	6	88525	88530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061649
1592	NC_004741	AGA	2	6	88627	88632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30061649
1593	NC_004741	GCT	2	6	88760	88765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061649
1594	NC_004741	GGA	2	6	88846	88851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	30061649
1595	NC_004741	GCTC	2	8	88872	88879	0 %	25 %	25 %	50 %	30061649
1596	NC_004741	GGC	2	6	88899	88904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061649
1597	NC_004741	ATC	2	6	88910	88915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061649
1598	NC_004741	AGC	2	6	89010	89015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061649
1599	NC_004741	A	6	6	89018	89023	100 %	0 %	0 %	0 %	30061649
1600	NC_004741	GAA	2	6	89069	89074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30061649
1601	NC_004741	AGTTC	2	10	89102	89111	20 %	40 %	20 %	20 %	30061649
1602	NC_004741	AG	3	6	89122	89127	50 %	0 %	50 %	0 %	30061649
1603	NC_004741	CAG	2	6	89142	89147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061650
1604	NC_004741	ATT	2	6	89272	89277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30061650
1605	NC_004741	CGG	2	6	89282	89287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061650
1606	NC_004741	AAC	2	6	89339	89344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30061650
1607	NC_004741	GCA	2	6	89457	89462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061650
1608	NC_004741	AGC	2	6	89523	89528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061651
1609	NC_004741	GAA	2	6	89557	89562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30061651
1610	NC_004741	GTT	2	6	89592	89597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30061651
1611	NC_004741	AAG	2	6	89804	89809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30061651
1612	NC_004741	TTTA	2	8	89923	89930	25 %	75 %	0 %	0 %	30061651
1613	NC_004741	A	6	6	89971	89976	100 %	0 %	0 %	0 %	30061651
1614	NC_004741	TCCG	2	8	90024	90031	0 %	25 %	25 %	50 %	30061651
1615	NC_004741	TCT	2	6	90181	90186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30061651
1616	NC_004741	TGA	2	6	90225	90230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061651
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1620	NC_004741	TGA	2	6	90458	90463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061651
1621	NC_004741	CGTGG	2	10	90475	90484	0 %	20 %	60 %	20 %	30061651
1622	NC_004741	TAG	2	6	90644	90649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061651
1623	NC_004741	TACT	2	8	90651	90658	25 %	50 %	0 %	25 %	30061651
1624	NC_004741	GGT	2	6	90734	90739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061651
1625	NC_004741	AG	3	6	90747	90752	50 %	0 %	50 %	0 %	30061651
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1627	NC_004741	GTG	2	6	90916	90921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061651
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1632	NC_004741	AATA	2	8	91042	91049	75 %	25 %	0 %	0 %	30061651
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1877	NC_004741	GCGCA	2	10	103096	103105	20 %	0 %	40 %	40 %	30061661
1878	NC_004741	GC	3	6	103162	103167	0 %	0 %	50 %	50 %	30061661
1879	NC_004741	TAT	2	6	103209	103214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30061661
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1882	NC_004741	GCG	4	12	103465	103476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061662
1883	NC_004741	TTC	2	6	103524	103529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30061662
1884	NC_004741	GGCGCT	2	12	103614	103625	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	30061662
1885	NC_004741	TGA	2	6	103652	103657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061662
1886	NC_004741	TGCG	2	8	103672	103679	0 %	25 %	50 %	25 %	30061662
1887	NC_004741	TGC	2	6	103709	103714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061662
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1894	NC_004741	CTG	2	6	103911	103916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061662
1895	NC_004741	CTG	2	6	103941	103946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061662
1896	NC_004741	TGA	2	6	104023	104028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061662
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1996	NC_004741	CTGG	2	8	109400	109407	0 %	25 %	50 %	25 %	30061666
1997	NC_004741	AAG	2	6	109438	109443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30061666
1998	NC_004741	GGTC	2	8	109469	109476	0 %	25 %	50 %	25 %	30061666
1999	NC_004741	GAT	2	6	109485	109490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061666
2000	NC_004741	GCCA	2	8	109496	109503	25 %	0 %	25 %	50 %	30061666

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