MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 2457T

Total Repeats: 72410

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_004741	CACC	2	8	55250	55257	25 %	0 %	0 %	75 %	30061621
1003	NC_004741	TTC	2	6	55335	55340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30061621
1004	NC_004741	AAT	2	6	55350	55355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30061621
1005	NC_004741	CTAC	2	8	55360	55367	25 %	25 %	0 %	50 %	30061621
1006	NC_004741	AGG	2	6	55397	55402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	30061621
1007	NC_004741	GTT	2	6	55445	55450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30061621
1008	NC_004741	TCA	2	6	55451	55456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061621
1009	NC_004741	CCA	2	6	55484	55489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061621
1010	NC_004741	TCG	2	6	55573	55578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061621
1011	NC_004741	GTAC	2	8	55606	55613	25 %	25 %	25 %	25 %	30061621
1012	NC_004741	TCG	2	6	55657	55662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061621
1013	NC_004741	TGG	2	6	55880	55885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061621
1014	NC_004741	T	6	6	55905	55910	0 %	100 %	0 %	0 %	30061621
1015	NC_004741	AT	3	6	56164	56169	50 %	50 %	0 %	0 %	30061622
1016	NC_004741	CGTGGC	2	12	56194	56205	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	30061622
1017	NC_004741	GCG	2	6	56217	56222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061622
1018	NC_004741	T	6	6	56327	56332	0 %	100 %	0 %	0 %	30061622
1019	NC_004741	CCA	2	6	56334	56339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061622
1020	NC_004741	GCCA	2	8	56405	56412	25 %	0 %	25 %	50 %	30061622
1021	NC_004741	GCG	2	6	56453	56458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061622
1022	NC_004741	GGC	2	6	56581	56586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061622
1023	NC_004741	GAA	2	6	56642	56647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30061622
1024	NC_004741	ATG	2	6	56687	56692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061622
1025	NC_004741	GGC	2	6	56711	56716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061622
1026	NC_004741	CAG	2	6	56723	56728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061622
1027	NC_004741	GGT	2	6	56738	56743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061622
1028	NC_004741	GCA	2	6	56749	56754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061622
1029	NC_004741	GAT	2	6	56813	56818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061622
1030	NC_004741	ACC	2	6	56822	56827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061622
1031	NC_004741	TGA	2	6	56850	56855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061622
1032	NC_004741	TGG	2	6	56877	56882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061622
1033	NC_004741	GCC	2	6	56893	56898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061622
1034	NC_004741	GAT	2	6	56902	56907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061622
1035	NC_004741	CAG	2	6	56939	56944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061622
1036	NC_004741	AGC	2	6	56961	56966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061622
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1039	NC_004741	CCA	2	6	57333	57338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061623
1040	NC_004741	CCA	2	6	57426	57431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061623
1041	NC_004741	GATG	2	8	57446	57453	25 %	25 %	50 %	0 %	30061623
1042	NC_004741	GCTCGC	2	12	57486	57497	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	30061623
1043	NC_004741	CGC	2	6	57552	57557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061623
1044	NC_004741	CTGC	2	8	57588	57595	0 %	25 %	25 %	50 %	30061623
1045	NC_004741	TCA	2	6	57618	57623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061623
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1047	NC_004741	ACA	2	6	57660	57665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30061623
1048	NC_004741	TTG	2	6	57677	57682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30061623
1049	NC_004741	ACC	2	6	57683	57688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061623
1050	NC_004741	ATA	2	6	57689	57694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30061623
1051	NC_004741	AACC	2	8	57715	57722	50 %	0 %	0 %	50 %	30061623
1052	NC_004741	CCTG	2	8	57817	57824	0 %	25 %	25 %	50 %	30061624
1053	NC_004741	CTG	2	6	57843	57848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061624
1054	NC_004741	TCG	2	6	57874	57879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061624
1055	NC_004741	TCG	2	6	57943	57948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061624
1056	NC_004741	ATCA	2	8	57966	57973	50 %	25 %	0 %	25 %	30061624
1057	NC_004741	CTG	2	6	58032	58037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061624
1058	NC_004741	TGC	2	6	58055	58060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061624
1059	NC_004741	GCC	2	6	58117	58122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061624
1060	NC_004741	GTT	2	6	58125	58130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30061624
1061	NC_004741	CAG	2	6	58143	58148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061624
1062	NC_004741	CCA	2	6	58229	58234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061624
1063	NC_004741	TACC	2	8	58241	58248	25 %	25 %	0 %	50 %	30061624
1064	NC_004741	T	6	6	58261	58266	0 %	100 %	0 %	0 %	30061624
1065	NC_004741	TGC	2	6	58280	58285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061624
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1067	NC_004741	GGTGAT	2	12	58392	58403	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	30061624
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1069	NC_004741	CGC	2	6	58475	58480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061624
1070	NC_004741	TGAT	2	8	58489	58496	25 %	50 %	25 %	0 %	30061624
1071	NC_004741	ATA	2	6	58501	58506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30061624
1072	NC_004741	CAG	2	6	58611	58616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061624
1073	NC_004741	GAC	2	6	58889	58894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061624
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1080	NC_004741	TCGCTG	2	12	59497	59508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061624
1081	NC_004741	TGC	2	6	59511	59516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061624
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1084	NC_004741	CAG	2	6	59685	59690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061624
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1092	NC_004741	AG	3	6	60087	60092	50 %	0 %	50 %	0 %	30061624
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1094	NC_004741	CAGC	2	8	60149	60156	25 %	0 %	25 %	50 %	30061624
1095	NC_004741	CG	3	6	60161	60166	0 %	0 %	50 %	50 %	30061624
1096	NC_004741	GGC	2	6	60173	60178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061624
1097	NC_004741	CAT	2	6	60185	60190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061624
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1104	NC_004741	TGG	2	6	60991	60996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061625
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1107	NC_004741	CTG	2	6	61244	61249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061625
1108	NC_004741	CTG	2	6	61253	61258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061625
1109	NC_004741	GCG	2	6	61264	61269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061625
1110	NC_004741	GCT	2	6	61312	61317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061625
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1112	NC_004741	GTT	2	6	61441	61446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30061625
1113	NC_004741	CCA	2	6	61463	61468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061625
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1115	NC_004741	CGC	2	6	61505	61510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061625
1116	NC_004741	CTT	2	6	61513	61518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30061625
1117	NC_004741	AGTCG	2	10	61547	61556	20 %	20 %	40 %	20 %	30061625
1118	NC_004741	TCAA	2	8	61590	61597	50 %	25 %	0 %	25 %	30061625
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1120	NC_004741	CGA	2	6	61640	61645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061625
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1124	NC_004741	GGCA	2	8	61794	61801	25 %	0 %	50 %	25 %	30061625
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1126	NC_004741	GAT	2	6	61910	61915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061625
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