MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 2457T

Total Repeats: 72410

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004741	CCG	2	6	30116	30121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061601
502	NC_004741	GAA	2	6	30140	30145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30061601
503	NC_004741	CG	3	6	30161	30166	0 %	0 %	50 %	50 %	30061601
504	NC_004741	CA	3	6	30178	30183	50 %	0 %	0 %	50 %	30061601
505	NC_004741	GAA	2	6	30189	30194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30061601
506	NC_004741	GCTG	2	8	30197	30204	0 %	25 %	50 %	25 %	30061601
507	NC_004741	ATT	2	6	30231	30236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30061601
508	NC_004741	GCG	3	9	30262	30270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061601
509	NC_004741	GAA	2	6	30297	30302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30061601
510	NC_004741	TC	4	8	30323	30330	0 %	50 %	0 %	50 %	30061601
511	NC_004741	TGAT	2	8	30346	30353	25 %	50 %	25 %	0 %	30061601
512	NC_004741	GTG	2	6	30390	30395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061601
513	NC_004741	CAT	2	6	30416	30421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061601
514	NC_004741	TGC	2	6	30544	30549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061601
515	NC_004741	GGT	2	6	30570	30575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061601
516	NC_004741	TTC	2	6	30650	30655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30061601
517	NC_004741	GGC	2	6	30698	30703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061601
518	NC_004741	TGA	2	6	30736	30741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061601
519	NC_004741	CCT	2	6	30769	30774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	30061601
520	NC_004741	CGCA	2	8	30897	30904	25 %	0 %	25 %	50 %	30061601
521	NC_004741	CG	3	6	31062	31067	0 %	0 %	50 %	50 %	30061601
522	NC_004741	CTGT	2	8	31071	31078	0 %	50 %	25 %	25 %	30061601
523	NC_004741	GAA	2	6	31131	31136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30061601
524	NC_004741	GC	3	6	31230	31235	0 %	0 %	50 %	50 %	30061601
525	NC_004741	GGCG	2	8	31247	31254	0 %	0 %	75 %	25 %	30061601
526	NC_004741	GAA	2	6	31374	31379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30061601
527	NC_004741	GCGAA	2	10	31384	31393	40 %	0 %	40 %	20 %	30061601
528	NC_004741	ACCG	2	8	31401	31408	25 %	0 %	25 %	50 %	30061601
529	NC_004741	A	6	6	31411	31416	100 %	0 %	0 %	0 %	30061601
530	NC_004741	GGC	2	6	31428	31433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061601
531	NC_004741	ACT	2	6	31468	31473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061601
532	NC_004741	CGG	2	6	31658	31663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061601
533	NC_004741	CTGAAA	2	12	31785	31796	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	30061601
534	NC_004741	TGG	2	6	31867	31872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061601
535	NC_004741	CGTC	2	8	31875	31882	0 %	25 %	25 %	50 %	30061601
536	NC_004741	CGG	2	6	31892	31897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061601
537	NC_004741	CGG	2	6	31951	31956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061601
538	NC_004741	TGA	2	6	32000	32005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061601
539	NC_004741	GGC	2	6	32058	32063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061601
540	NC_004741	CAG	2	6	32163	32168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061601
541	NC_004741	TGA	2	6	32206	32211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061601
542	NC_004741	AAC	2	6	32232	32237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30061601
543	NC_004741	GCG	2	6	32268	32273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061601
544	NC_004741	GGC	2	6	32324	32329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061601
545	NC_004741	TGGC	2	8	32338	32345	0 %	25 %	50 %	25 %	30061601
546	NC_004741	GCTG	2	8	32351	32358	0 %	25 %	50 %	25 %	30061601
547	NC_004741	AAG	2	6	32374	32379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30061601
548	NC_004741	CCG	2	6	32385	32390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061601
549	NC_004741	TAC	2	6	32391	32396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061601
550	NC_004741	GTG	2	6	32409	32414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061601
551	NC_004741	GCA	2	6	32533	32538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061601
552	NC_004741	CCA	2	6	32542	32547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061601
553	NC_004741	GAA	2	6	32549	32554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30061601
554	NC_004741	GCT	2	6	32567	32572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061601
555	NC_004741	GTG	2	6	32601	32606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061601
556	NC_004741	GGC	2	6	32612	32617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061601
557	NC_004741	CTG	2	6	32622	32627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061601
558	NC_004741	CACGG	2	10	32655	32664	20 %	0 %	40 %	40 %	30061601
559	NC_004741	CAT	2	6	32768	32773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061601
560	NC_004741	ACC	2	6	32778	32783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061601
561	NC_004741	CGT	2	6	32790	32795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061601
562	NC_004741	ACC	2	6	32856	32861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061601
563	NC_004741	GGT	2	6	32868	32873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061601
564	NC_004741	GCAC	2	8	32936	32943	25 %	0 %	25 %	50 %	30061601
565	NC_004741	ATA	2	6	32951	32956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30061601
566	NC_004741	TG	3	6	33217	33222	0 %	50 %	50 %	0 %	161486554
567	NC_004741	GAT	2	6	33266	33271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161486554
568	NC_004741	GGTG	2	8	33283	33290	0 %	25 %	75 %	0 %	161486554
569	NC_004741	AG	3	6	33297	33302	50 %	0 %	50 %	0 %	161486554
570	NC_004741	GAT	2	6	33395	33400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161486554
571	NC_004741	TAA	2	6	33404	33409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161486554
572	NC_004741	CG	3	6	33476	33481	0 %	0 %	50 %	50 %	161486554
573	NC_004741	AAGA	2	8	33518	33525	75 %	0 %	25 %	0 %	161486554
574	NC_004741	GAT	2	6	33581	33586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161486554
575	NC_004741	CGT	2	6	33603	33608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161486554
576	NC_004741	CGT	2	6	33718	33723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061603
577	NC_004741	TCC	2	6	33746	33751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	30061603
578	NC_004741	TCG	2	6	33845	33850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061603
579	NC_004741	CAA	2	6	33889	33894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30061603
580	NC_004741	CAA	2	6	33942	33947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30061603
581	NC_004741	CT	3	6	33950	33955	0 %	50 %	0 %	50 %	30061603
582	NC_004741	CCAT	2	8	33971	33978	25 %	25 %	0 %	50 %	30061603
583	NC_004741	CA	3	6	34018	34023	50 %	0 %	0 %	50 %	30061603
584	NC_004741	CAC	2	6	34152	34157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061603
585	NC_004741	ACC	2	6	34250	34255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061603
586	NC_004741	GTT	2	6	34289	34294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30061603
587	NC_004741	CGC	2	6	34391	34396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061604
588	NC_004741	CTT	2	6	34415	34420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30061604
589	NC_004741	TGG	2	6	34436	34441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061604
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591	NC_004741	TCA	2	6	34598	34603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061604
592	NC_004741	GGC	2	6	34624	34629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061604
593	NC_004741	GCA	2	6	34646	34651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061604
594	NC_004741	CCG	2	6	34654	34659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061604
595	NC_004741	GCC	2	6	34732	34737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061604
596	NC_004741	CCG	2	6	34753	34758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061604
597	NC_004741	ACC	2	6	34830	34835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061604
598	NC_004741	CTG	2	6	34868	34873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061604
599	NC_004741	TC	3	6	34907	34912	0 %	50 %	0 %	50 %	30061604
600	NC_004741	TAA	2	6	34922	34927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30061604
601	NC_004741	T	6	6	35098	35103	0 %	100 %	0 %	0 %	30061604
602	NC_004741	GAC	2	6	35107	35112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061604
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605	NC_004741	ATTT	2	8	35185	35192	25 %	75 %	0 %	0 %	30061604
606	NC_004741	TTCT	2	8	35197	35204	0 %	75 %	0 %	25 %	30061605
607	NC_004741	ATT	2	6	35206	35211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30061605
608	NC_004741	A	6	6	35298	35303	100 %	0 %	0 %	0 %	30061605
609	NC_004741	TTCA	2	8	35328	35335	25 %	50 %	0 %	25 %	30061605
610	NC_004741	CAC	2	6	35337	35342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061605
611	NC_004741	CGAAT	2	10	35365	35374	40 %	20 %	20 %	20 %	30061605
612	NC_004741	GAT	2	6	35421	35426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061605
613	NC_004741	GCG	2	6	35481	35486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061605
614	NC_004741	CGA	2	6	35489	35494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061605
615	NC_004741	A	7	7	35498	35504	100 %	0 %	0 %	0 %	30061605
616	NC_004741	CTT	2	6	35507	35512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30061605
617	NC_004741	AGCC	2	8	35542	35549	25 %	0 %	25 %	50 %	30061605
618	NC_004741	TCG	2	6	35674	35679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061605
619	NC_004741	CCCG	2	8	35704	35711	0 %	0 %	25 %	75 %	30061605
620	NC_004741	CGT	2	6	35728	35733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061605
621	NC_004741	GGC	2	6	35899	35904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061605
622	NC_004741	ATC	3	9	35923	35931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061605
623	NC_004741	TGG	2	6	35948	35953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061605
624	NC_004741	CGC	2	6	36033	36038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061605
625	NC_004741	CGC	2	6	36042	36047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061605
626	NC_004741	CAC	2	6	36165	36170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061605
627	NC_004741	TCGG	2	8	36176	36183	0 %	25 %	50 %	25 %	30061605
628	NC_004741	GGT	2	6	36186	36191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061605
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630	NC_004741	GCG	2	6	36233	36238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061605
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