MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 2457T

Total Repeats: 72410

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_004741	TGC	2	6	317398	317403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061867
5502	NC_004741	GTA	2	6	317418	317423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061867
5503	NC_004741	TA	3	6	318309	318314	50 %	50 %	0 %	0 %	30061868
5504	NC_004741	ATAA	2	8	318377	318384	75 %	25 %	0 %	0 %	30061868
5505	NC_004741	TTC	2	6	318423	318428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30061868
5506	NC_004741	ATT	2	6	318458	318463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30061868
5507	NC_004741	GTG	2	6	318500	318505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061868
5508	NC_004741	ATA	2	6	318506	318511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30061868
5509	NC_004741	ACT	2	6	318532	318537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061868
5510	NC_004741	AGT	2	6	318596	318601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061868
5511	NC_004741	A	6	6	318661	318666	100 %	0 %	0 %	0 %	30061868
5512	NC_004741	ACAT	2	8	318690	318697	50 %	25 %	0 %	25 %	30061868
5513	NC_004741	ACC	2	6	318714	318719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061868
5514	NC_004741	ACA	2	6	318795	318800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30061868
5515	NC_004741	TAT	2	6	318874	318879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30061868
5516	NC_004741	AT	3	6	318937	318942	50 %	50 %	0 %	0 %	30061868
5517	NC_004741	TA	4	8	318962	318969	50 %	50 %	0 %	0 %	30061868
5518	NC_004741	TAT	2	6	319000	319005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30061868
5519	NC_004741	T	8	8	319088	319095	0 %	100 %	0 %	0 %	30061868
5520	NC_004741	A	7	7	319102	319108	100 %	0 %	0 %	0 %	30061868
5521	NC_004741	CAG	2	6	319110	319115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061868
5522	NC_004741	CCCAA	2	10	319172	319181	40 %	0 %	0 %	60 %	30061868
5523	NC_004741	AT	3	6	319192	319197	50 %	50 %	0 %	0 %	30061868
5524	NC_004741	TTA	2	6	319268	319273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30061868
5525	NC_004741	TGCC	2	8	319730	319737	0 %	25 %	25 %	50 %	30061869
5526	NC_004741	T	6	6	319755	319760	0 %	100 %	0 %	0 %	30061869
5527	NC_004741	ATT	2	6	319804	319809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30061869
5528	NC_004741	CTG	3	9	319814	319822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061869
5529	NC_004741	TCTCTT	2	12	319840	319851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30061869
5530	NC_004741	ATAAA	2	10	319895	319904	80 %	20 %	0 %	0 %	30061869
5531	NC_004741	CTGT	2	8	319914	319921	0 %	50 %	25 %	25 %	30061869
5532	NC_004741	TAA	2	6	319926	319931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30061869
5533	NC_004741	ATG	2	6	319978	319983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061869
5534	NC_004741	GTG	2	6	319998	320003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061869
5535	NC_004741	CCT	2	6	320064	320069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	30061869
5536	NC_004741	TGA	2	6	320093	320098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061869
5537	NC_004741	A	9	9	320115	320123	100 %	0 %	0 %	0 %	30061869
5538	NC_004741	GTT	2	6	320188	320193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30061869
5539	NC_004741	GGGAT	2	10	320247	320256	20 %	20 %	60 %	0 %	30061869
5540	NC_004741	G	6	6	320273	320278	0 %	0 %	100 %	0 %	30061869
5541	NC_004741	A	6	6	320383	320388	100 %	0 %	0 %	0 %	30061869
5542	NC_004741	CAA	2	6	320477	320482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30061869
5543	NC_004741	GCAG	2	8	320503	320510	25 %	0 %	50 %	25 %	30061869
5544	NC_004741	A	7	7	320554	320560	100 %	0 %	0 %	0 %	30061869
5545	NC_004741	GAA	2	6	320579	320584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30061869
5546	NC_004741	A	6	6	320612	320617	100 %	0 %	0 %	0 %	30061869
5547	NC_004741	A	6	6	320779	320784	100 %	0 %	0 %	0 %	30061869
5548	NC_004741	GCTG	2	8	320808	320815	0 %	25 %	50 %	25 %	30061869
5549	NC_004741	ACG	2	6	320847	320852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061869
5550	NC_004741	TGA	2	6	320917	320922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061869
5551	NC_004741	T	6	6	321333	321338	0 %	100 %	0 %	0 %	30061870
5552	NC_004741	TAT	2	6	321351	321356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30061870
5553	NC_004741	ATTT	2	8	321366	321373	25 %	75 %	0 %	0 %	30061870
5554	NC_004741	TCT	2	6	321428	321433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30061870
5555	NC_004741	CCA	2	6	321511	321516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061870
5556	NC_004741	A	8	8	321524	321531	100 %	0 %	0 %	0 %	30061870
5557	NC_004741	AT	8	16	321588	321603	50 %	50 %	0 %	0 %	30061870
5558	NC_004741	TTTG	2	8	321625	321632	0 %	75 %	25 %	0 %	30061870
5559	NC_004741	ATA	2	6	321730	321735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30061870
5560	NC_004741	A	8	8	321739	321746	100 %	0 %	0 %	0 %	30061870
5561	NC_004741	CTA	2	6	321806	321811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061870
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5563	NC_004741	CAA	3	9	321851	321859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30061870
5564	NC_004741	TA	3	6	321879	321884	50 %	50 %	0 %	0 %	30061870
5565	NC_004741	TGAT	2	8	321893	321900	25 %	50 %	25 %	0 %	30061870
5566	NC_004741	AAAT	2	8	321907	321914	75 %	25 %	0 %	0 %	30061870
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5573	NC_004741	AAT	2	6	322260	322265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30061870
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5575	NC_004741	T	7	7	322339	322345	0 %	100 %	0 %	0 %	30061870
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5581	NC_004741	A	6	6	322594	322599	100 %	0 %	0 %	0 %	30061870
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5590	NC_004741	TA	3	6	322838	322843	50 %	50 %	0 %	0 %	30061871
5591	NC_004741	AGGG	2	8	322905	322912	25 %	0 %	75 %	0 %	30061871
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5599	NC_004741	CCTG	2	8	323361	323368	0 %	25 %	25 %	50 %	30061871
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5609	NC_004741	ACC	2	6	323990	323995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061872
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5625	NC_004741	CAG	2	6	325237	325242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061874
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5627	NC_004741	GAT	2	6	325357	325362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061874
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5871	NC_004741	GCA	2	6	341008	341013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061892
5872	NC_004741	CAAAC	2	10	341082	341091	60 %	0 %	0 %	40 %	30061892
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5998	NC_004741	AGC	2	6	347222	347227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061896
5999	NC_004741	GAT	2	6	347373	347378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061896
6000	NC_004741	GTT	2	6	347386	347391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30061896

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