MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 2457T

Total Repeats: 72410

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_004741	ACG	2	6	287462	287467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061836
5002	NC_004741	GACG	2	8	287470	287477	25 %	0 %	50 %	25 %	30061836
5003	NC_004741	TCA	2	6	287546	287551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061836
5004	NC_004741	CAG	2	6	287590	287595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061836
5005	NC_004741	GCC	2	6	287612	287617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061836
5006	NC_004741	TGC	2	6	287618	287623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061836
5007	NC_004741	GCA	2	6	287634	287639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061836
5008	NC_004741	GAA	2	6	287704	287709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30061836
5009	NC_004741	CAC	2	6	287722	287727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061836
5010	NC_004741	GCA	2	6	287859	287864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061836
5011	NC_004741	TAC	2	6	287878	287883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061836
5012	NC_004741	ACGC	2	8	287967	287974	25 %	0 %	25 %	50 %	30061836
5013	NC_004741	GCAGC	2	10	288027	288036	20 %	0 %	40 %	40 %	30061836
5014	NC_004741	CAG	2	6	288061	288066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061836
5015	NC_004741	CGG	2	6	288137	288142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061837
5016	NC_004741	GGCT	2	8	288192	288199	0 %	25 %	50 %	25 %	30061837
5017	NC_004741	ATGACC	2	12	288223	288234	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	30061837
5018	NC_004741	ATT	3	9	288235	288243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30061837
5019	NC_004741	CTG	2	6	288261	288266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061837
5020	NC_004741	ACCGCT	2	12	288322	288333	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	30061837
5021	NC_004741	CAG	2	6	288369	288374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061837
5022	NC_004741	TCA	2	6	288409	288414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061837
5023	NC_004741	GCA	2	6	288415	288420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061837
5024	NC_004741	ACCG	2	8	288489	288496	25 %	0 %	25 %	50 %	30061837
5025	NC_004741	TG	3	6	288521	288526	0 %	50 %	50 %	0 %	30061837
5026	NC_004741	GA	3	6	288631	288636	50 %	0 %	50 %	0 %	30061837
5027	NC_004741	GGACG	2	10	288698	288707	20 %	0 %	60 %	20 %	30061837
5028	NC_004741	GGGC	2	8	288715	288722	0 %	0 %	75 %	25 %	30061837
5029	NC_004741	AGC	2	6	288781	288786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061837
5030	NC_004741	GAA	2	6	288816	288821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30061837
5031	NC_004741	TAT	2	6	288849	288854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30061837
5032	NC_004741	GATC	2	8	288947	288954	25 %	25 %	25 %	25 %	30061837
5033	NC_004741	ATA	2	6	288988	288993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30061837
5034	NC_004741	ATT	2	6	289068	289073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30061837
5035	NC_004741	ATC	2	6	289075	289080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061837
5036	NC_004741	CAC	2	6	290135	290140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061838
5037	NC_004741	CCA	2	6	290199	290204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061838
5038	NC_004741	CGG	2	6	290244	290249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061838
5039	NC_004741	CG	3	6	290362	290367	0 %	0 %	50 %	50 %	30061838
5040	NC_004741	TGCC	2	8	290380	290387	0 %	25 %	25 %	50 %	30061838
5041	NC_004741	AG	3	6	290393	290398	50 %	0 %	50 %	0 %	30061838
5042	NC_004741	GCC	2	6	290605	290610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061838
5043	NC_004741	CTGC	2	8	290666	290673	0 %	25 %	25 %	50 %	30061838
5044	NC_004741	CTG	2	6	290689	290694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061838
5045	NC_004741	CGA	2	6	290737	290742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061838
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5047	NC_004741	TGC	2	6	290873	290878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061838
5048	NC_004741	ATG	2	6	291082	291087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061839
5049	NC_004741	CGC	2	6	291108	291113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061839
5050	NC_004741	CCA	2	6	291125	291130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061839
5051	NC_004741	GAT	2	6	291145	291150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061839
5052	NC_004741	AGC	2	6	291160	291165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061839
5053	NC_004741	ACC	2	6	291181	291186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061839
5054	NC_004741	TGA	2	6	291236	291241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061839
5055	NC_004741	TGA	2	6	291299	291304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061839
5056	NC_004741	TGA	2	6	291396	291401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061839
5057	NC_004741	AAT	2	6	291527	291532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30061839
5058	NC_004741	TCG	2	6	291621	291626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161486539
5059	NC_004741	TCA	2	6	291647	291652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161486539
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5062	NC_004741	TGA	2	6	291800	291805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161486539
5063	NC_004741	CGG	2	6	291813	291818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161486539
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5066	NC_004741	CAC	2	6	291994	291999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161486539
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5069	NC_004741	ACG	2	6	292207	292212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161486539
5070	NC_004741	GCC	2	6	292222	292227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161486539
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5072	NC_004741	TAG	2	6	292292	292297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161486539
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5075	NC_004741	CCAG	2	8	292350	292357	25 %	0 %	25 %	50 %	161486539
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5089	NC_004741	CG	3	6	292995	293000	0 %	0 %	50 %	50 %	161486539
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5119	NC_004741	TAAG	2	8	294830	294837	50 %	25 %	25 %	0 %	30061841
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5121	NC_004741	GGT	2	6	295260	295265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061842
5122	NC_004741	CGGT	2	8	295412	295419	0 %	25 %	50 %	25 %	30061842
5123	NC_004741	GCTG	2	8	295445	295452	0 %	25 %	50 %	25 %	30061842
5124	NC_004741	GGC	2	6	295497	295502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061842
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5126	NC_004741	TGC	2	6	295562	295567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061842
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5129	NC_004741	ATG	2	6	295700	295705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061842
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5133	NC_004741	AGT	2	6	295908	295913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061843
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5142	NC_004741	CTG	2	6	296447	296452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061843
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5159	NC_004741	TCG	2	6	297666	297671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061845
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5225	NC_004741	CTATTG	2	12	300937	300948	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	30061848
5226	NC_004741	G	6	6	300967	300972	0 %	0 %	100 %	0 %	30061848
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5228	NC_004741	CGTA	2	8	301010	301017	25 %	25 %	25 %	25 %	30061848
5229	NC_004741	AAG	2	6	301093	301098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30061848
5230	NC_004741	TCT	2	6	301120	301125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30061848
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5232	NC_004741	CGG	2	6	301417	301422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061848
5233	NC_004741	TCA	2	6	301613	301618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061848
5234	NC_004741	CGA	2	6	301730	301735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061848
5235	NC_004741	CAG	2	6	301740	301745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061848
5236	NC_004741	ACC	2	6	301746	301751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061848
5237	NC_004741	CG	3	6	301799	301804	0 %	0 %	50 %	50 %	30061848
5238	NC_004741	CGC	2	6	301821	301826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061848
5239	NC_004741	GGCG	2	8	301827	301834	0 %	0 %	75 %	25 %	30061848
5240	NC_004741	TGG	2	6	301846	301851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061848
5241	NC_004741	ATG	2	6	301907	301912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061848
5242	NC_004741	TTCT	2	8	302050	302057	0 %	75 %	0 %	25 %	30061849
5243	NC_004741	AAT	2	6	302058	302063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30061849
5244	NC_004741	TGCT	2	8	302116	302123	0 %	50 %	25 %	25 %	30061849
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5351	NC_004741	TCGCG	2	10	308203	308212	0 %	20 %	40 %	40 %	30061856
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5368	NC_004741	GTTG	2	8	309222	309229	0 %	50 %	50 %	0 %	30061858
5369	NC_004741	CAA	2	6	309240	309245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30061858
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5470	NC_004741	AT	3	6	315436	315441	50 %	50 %	0 %	0 %	30061864
5471	NC_004741	A	7	7	315443	315449	100 %	0 %	0 %	0 %	30061864
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5476	NC_004741	CA	3	6	315892	315897	50 %	0 %	0 %	50 %	30061865
5477	NC_004741	CCA	2	6	316045	316050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061865
5478	NC_004741	TAA	2	6	316213	316218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30061865
5479	NC_004741	CGT	2	6	316277	316282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061865
5480	NC_004741	ATC	2	6	316329	316334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061865
5481	NC_004741	GCT	2	6	316340	316345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061865
5482	NC_004741	A	7	7	316347	316353	100 %	0 %	0 %	0 %	30061865
5483	NC_004741	GAA	2	6	316427	316432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30061866
5484	NC_004741	GAT	2	6	316506	316511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061866
5485	NC_004741	ACT	2	6	316513	316518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061866
5486	NC_004741	AGG	2	6	316531	316536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	30061866
5487	NC_004741	GTG	2	6	316548	316553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061866
5488	NC_004741	GGC	2	6	316582	316587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061866
5489	NC_004741	CG	3	6	316611	316616	0 %	0 %	50 %	50 %	30061866
5490	NC_004741	CTG	2	6	316617	316622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061866
5491	NC_004741	AGC	2	6	316703	316708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061866
5492	NC_004741	GCT	2	6	316782	316787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061866
5493	NC_004741	CTG	2	6	317017	317022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061866
5494	NC_004741	TGA	2	6	317124	317129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061867
5495	NC_004741	TTG	2	6	317225	317230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30061867
5496	NC_004741	TAA	2	6	317264	317269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30061867
5497	NC_004741	ATG	2	6	317270	317275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061867
5498	NC_004741	GAT	2	6	317356	317361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061867
5499	NC_004741	GAAAC	2	10	317362	317371	60 %	0 %	20 %	20 %	30061867
5500	NC_004741	A	6	6	317385	317390	100 %	0 %	0 %	0 %	30061867

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