MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 2457T

Total Repeats: 72410

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_004741	ATC	2	6	256127	256132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061803
4502	NC_004741	TTG	2	6	256145	256150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30061803
4503	NC_004741	ATT	2	6	256160	256165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30061803
4504	NC_004741	TGC	2	6	256182	256187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061803
4505	NC_004741	T	6	6	256201	256206	0 %	100 %	0 %	0 %	30061803
4506	NC_004741	TTC	2	6	256227	256232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30061803
4507	NC_004741	CTG	2	6	256289	256294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061803
4508	NC_004741	AGG	2	6	256300	256305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	30061803
4509	NC_004741	TGT	3	9	256314	256322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30061803
4510	NC_004741	TC	3	6	256334	256339	0 %	50 %	0 %	50 %	30061803
4511	NC_004741	GGT	2	6	256352	256357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061803
4512	NC_004741	A	7	7	256359	256365	100 %	0 %	0 %	0 %	30061803
4513	NC_004741	AGA	2	6	256556	256561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30061804
4514	NC_004741	GGTC	2	8	256571	256578	0 %	25 %	50 %	25 %	30061804
4515	NC_004741	CAA	2	6	256583	256588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30061804
4516	NC_004741	GGC	2	6	256593	256598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061804
4517	NC_004741	CGC	2	6	256611	256616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061804
4518	NC_004741	ACTG	2	8	256625	256632	25 %	25 %	25 %	25 %	30061804
4519	NC_004741	TCA	2	6	256673	256678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061804
4520	NC_004741	TGAG	2	8	256711	256718	25 %	25 %	50 %	0 %	30061804
4521	NC_004741	CAA	2	6	256742	256747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30061804
4522	NC_004741	CTGG	2	8	256749	256756	0 %	25 %	50 %	25 %	30061804
4523	NC_004741	CCT	2	6	256796	256801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	30061804
4524	NC_004741	CAA	2	6	256944	256949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30061804
4525	NC_004741	GCA	2	6	257152	257157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061804
4526	NC_004741	GCCTGT	2	12	257182	257193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061804
4527	NC_004741	GCC	3	9	257253	257261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061804
4528	NC_004741	AGC	2	6	257287	257292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061804
4529	NC_004741	CCA	2	6	257393	257398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061804
4530	NC_004741	GC	3	6	257516	257521	0 %	0 %	50 %	50 %	30061804
4531	NC_004741	T	7	7	257597	257603	0 %	100 %	0 %	0 %	30061804
4532	NC_004741	AGTG	2	8	257615	257622	25 %	25 %	50 %	0 %	30061804
4533	NC_004741	A	6	6	257658	257663	100 %	0 %	0 %	0 %	30061804
4534	NC_004741	GCC	2	6	257664	257669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061804
4535	NC_004741	CCCAT	2	10	257713	257722	20 %	20 %	0 %	60 %	30061804
4536	NC_004741	ATA	2	6	257737	257742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30061804
4537	NC_004741	T	6	6	257743	257748	0 %	100 %	0 %	0 %	30061804
4538	NC_004741	GCG	2	6	257779	257784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061804
4539	NC_004741	GCG	2	6	257802	257807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061804
4540	NC_004741	CCG	2	6	257812	257817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061804
4541	NC_004741	AGC	2	6	257838	257843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061804
4542	NC_004741	A	6	6	257967	257972	100 %	0 %	0 %	0 %	30061804
4543	NC_004741	CTT	2	6	258064	258069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30061805
4544	NC_004741	GCA	2	6	258081	258086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061805
4545	NC_004741	TCG	2	6	258095	258100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061805
4546	NC_004741	ATCA	2	8	258151	258158	50 %	25 %	0 %	25 %	30061805
4547	NC_004741	CA	3	6	258231	258236	50 %	0 %	0 %	50 %	30061805
4548	NC_004741	CTT	3	9	258249	258257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30061805
4549	NC_004741	AAC	2	6	258275	258280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30061805
4550	NC_004741	TGG	2	6	258792	258797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061806
4551	NC_004741	A	6	6	258834	258839	100 %	0 %	0 %	0 %	30061806
4552	NC_004741	TGC	2	6	258878	258883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061806
4553	NC_004741	TTGCG	2	10	258962	258971	0 %	40 %	40 %	20 %	30061806
4554	NC_004741	TGC	2	6	259118	259123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061806
4555	NC_004741	CAG	2	6	259166	259171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061806
4556	NC_004741	TTA	2	6	259235	259240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30061806
4557	NC_004741	CG	3	6	259247	259252	0 %	0 %	50 %	50 %	30061806
4558	NC_004741	GAA	2	6	259363	259368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30061806
4559	NC_004741	GTTCGA	2	12	259395	259406	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	30061806
4560	NC_004741	GTG	2	6	259693	259698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061806
4561	NC_004741	AC	3	6	259712	259717	50 %	0 %	0 %	50 %	30061806
4562	NC_004741	GTAT	2	8	259739	259746	25 %	50 %	25 %	0 %	30061806
4563	NC_004741	TTGA	2	8	259798	259805	25 %	50 %	25 %	0 %	30061806
4564	NC_004741	TTC	2	6	259899	259904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30061807
4565	NC_004741	CGA	3	9	259909	259917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061807
4566	NC_004741	GCCA	2	8	259930	259937	25 %	0 %	25 %	50 %	30061807
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4569	NC_004741	TAG	2	6	260053	260058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061807
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4572	NC_004741	AAC	2	6	260136	260141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30061807
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4574	NC_004741	ATT	2	6	260170	260175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30061807
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4579	NC_004741	CGC	2	6	261049	261054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061809
4580	NC_004741	ACTG	2	8	261062	261069	25 %	25 %	25 %	25 %	30061809
4581	NC_004741	CCAG	2	8	261101	261108	25 %	0 %	25 %	50 %	30061809
4582	NC_004741	CGC	2	6	261190	261195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061809
4583	NC_004741	GATTT	2	10	261432	261441	20 %	60 %	20 %	0 %	30061809
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4588	NC_004741	ACG	2	6	261690	261695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061809
4589	NC_004741	ACT	2	6	261746	261751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061809
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4591	NC_004741	AGAT	2	8	261791	261798	50 %	25 %	25 %	0 %	30061809
4592	NC_004741	CG	3	6	261805	261810	0 %	0 %	50 %	50 %	30061809
4593	NC_004741	TAGA	2	8	261900	261907	50 %	25 %	25 %	0 %	30061810
4594	NC_004741	TCAAC	2	10	261910	261919	40 %	20 %	0 %	40 %	30061810
4595	NC_004741	TCA	2	6	261991	261996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061810
4596	NC_004741	CAA	2	6	262018	262023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30061810
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4598	NC_004741	CG	4	8	262169	262176	0 %	0 %	50 %	50 %	30061810
4599	NC_004741	GGC	2	6	262214	262219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061810
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4603	NC_004741	GTT	2	6	262580	262585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30061810
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4606	NC_004741	CCA	2	6	262741	262746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061810
4607	NC_004741	GTA	2	6	262856	262861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061810
4608	NC_004741	A	6	6	262867	262872	100 %	0 %	0 %	0 %	30061810
4609	NC_004741	CG	3	6	262896	262901	0 %	0 %	50 %	50 %	30061810
4610	NC_004741	AGA	2	6	262969	262974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30061810
4611	NC_004741	CAAT	2	8	262981	262988	50 %	25 %	0 %	25 %	30061810
4612	NC_004741	CAAA	2	8	262992	262999	75 %	0 %	0 %	25 %	30061810
4613	NC_004741	GA	3	6	263004	263009	50 %	0 %	50 %	0 %	30061810
4614	NC_004741	A	6	6	263009	263014	100 %	0 %	0 %	0 %	30061810
4615	NC_004741	A	6	6	263031	263036	100 %	0 %	0 %	0 %	30061810
4616	NC_004741	T	6	6	263415	263420	0 %	100 %	0 %	0 %	30061811
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4620	NC_004741	GTT	2	6	263558	263563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30061811
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4625	NC_004741	GTT	2	6	264013	264018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30061811
4626	NC_004741	CCAT	2	8	264034	264041	25 %	25 %	0 %	50 %	30061811
4627	NC_004741	ACC	2	6	264056	264061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061811
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4629	NC_004741	GGC	2	6	264136	264141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061811
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4655	NC_004741	CTGTC	2	10	266418	266427	0 %	40 %	20 %	40 %	30061812
4656	NC_004741	GCT	2	6	266462	266467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061812
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4865	NC_004741	AT	3	6	279356	279361	50 %	50 %	0 %	0 %	30061828
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4995	NC_004741	GAC	2	6	287122	287127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061836
4996	NC_004741	ATG	2	6	287210	287215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061836
4997	NC_004741	CAG	2	6	287254	287259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061836
4998	NC_004741	AGC	2	6	287293	287298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061836
4999	NC_004741	GC	3	6	287356	287361	0 %	0 %	50 %	50 %	30061836
5000	NC_004741	GCAACG	2	12	287429	287440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061836

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