MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 2633

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004631	AGGTA	2	10	2553	2562	40 %	20 %	40 %	0 %	29140545
2	NC_004631	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	29140546
3	NC_004631	CGGCG	2	10	4144	4153	0 %	0 %	60 %	40 %	29140547
4	NC_004631	CCGCG	2	10	7184	7193	0 %	0 %	40 %	60 %	29140549
5	NC_004631	GCGTG	2	10	13991	14000	0 %	20 %	60 %	20 %	29140556
6	NC_004631	AATCA	2	10	15512	15521	60 %	20 %	0 %	20 %	29140557
7	NC_004631	GGCTG	2	10	18857	18866	0 %	20 %	60 %	20 %	29140561
8	NC_004631	CCTGA	2	10	19919	19928	20 %	20 %	20 %	40 %	29140561
9	NC_004631	CTTTT	2	10	23399	23408	0 %	80 %	0 %	20 %	29140564
10	NC_004631	CGGTA	2	10	24565	24574	20 %	20 %	40 %	20 %	29140565
11	NC_004631	CTGTT	2	10	24604	24613	0 %	60 %	20 %	20 %	29140565
12	NC_004631	ATCTG	2	10	30969	30978	20 %	40 %	20 %	20 %	29140570
13	NC_004631	TTACG	2	10	31024	31033	20 %	40 %	20 %	20 %	29140570
14	NC_004631	GGGCG	2	10	31793	31802	0 %	0 %	80 %	20 %	29140571
15	NC_004631	TGCGT	2	10	32172	32181	0 %	40 %	40 %	20 %	29140572
16	NC_004631	AAAAG	2	10	32566	32575	80 %	0 %	20 %	0 %	29140573
17	NC_004631	TATAA	2	10	34169	34178	60 %	40 %	0 %	0 %	29140574
18	NC_004631	AGCGA	2	10	35591	35600	40 %	0 %	40 %	20 %	29140576
19	NC_004631	TCCTG	2	10	35801	35810	0 %	40 %	20 %	40 %	29140576
20	NC_004631	GGTCA	2	10	38036	38045	20 %	20 %	40 %	20 %	29140577
21	NC_004631	TTCAT	2	10	39308	39317	20 %	60 %	0 %	20 %	29140578
22	NC_004631	TGAAA	2	10	40124	40133	60 %	20 %	20 %	0 %	29140579
23	NC_004631	ACGGC	2	10	44483	44492	20 %	0 %	40 %	40 %	29140582
24	NC_004631	GGGCT	2	10	46557	46566	0 %	20 %	60 %	20 %	29140583
25	NC_004631	GCGTA	2	10	48433	48442	20 %	20 %	40 %	20 %	29140585
26	NC_004631	GACCA	2	10	49038	49047	40 %	0 %	20 %	40 %	29140585
27	NC_004631	CAGAC	2	10	50370	50379	40 %	0 %	20 %	40 %	29140585
28	NC_004631	GTTTG	2	10	54526	54535	0 %	60 %	40 %	0 %	29140590
29	NC_004631	GTTTG	2	10	55454	55463	0 %	60 %	40 %	0 %	29140590
30	NC_004631	CACTA	2	10	56585	56594	40 %	20 %	0 %	40 %	29140590
31	NC_004631	TTCAC	2	10	57378	57387	20 %	40 %	0 %	40 %	29140592
32	NC_004631	AAAAT	2	10	58949	58958	80 %	20 %	0 %	0 %	29140594
33	NC_004631	GGAAA	2	10	59736	59745	60 %	0 %	40 %	0 %	29140594
34	NC_004631	CGCTG	2	10	60226	60235	0 %	20 %	40 %	40 %	29140595
35	NC_004631	CGGCG	2	10	63991	64000	0 %	0 %	60 %	40 %	29140598
36	NC_004631	GCGCG	2	10	64938	64947	0 %	0 %	60 %	40 %	29140599
37	NC_004631	ACGGC	2	10	69539	69548	20 %	0 %	40 %	40 %	29140602
38	NC_004631	CGTGC	2	10	71360	71369	0 %	20 %	40 %	40 %	29140605
39	NC_004631	TTGAT	2	10	71530	71539	20 %	60 %	20 %	0 %	29140605
40	NC_004631	ACCGC	2	10	72090	72099	20 %	0 %	20 %	60 %	29140605
41	NC_004631	CGATG	2	10	77560	77569	20 %	20 %	40 %	20 %	29140610
42	NC_004631	GCGAA	2	10	78501	78510	40 %	0 %	40 %	20 %	29140610
43	NC_004631	TTGCC	2	10	81028	81037	0 %	40 %	20 %	40 %	29140612
44	NC_004631	TGGCG	2	10	83076	83085	0 %	20 %	60 %	20 %	29140614
45	NC_004631	TCAGC	2	10	84259	84268	20 %	20 %	20 %	40 %	29140615
46	NC_004631	GTACG	2	10	86978	86987	20 %	20 %	40 %	20 %	29140617
47	NC_004631	CAGAA	2	10	87691	87700	60 %	0 %	20 %	20 %	29140617
48	NC_004631	CCGCA	2	10	89810	89819	20 %	0 %	20 %	60 %	29140619
49	NC_004631	CGGTT	2	10	90315	90324	0 %	40 %	40 %	20 %	29140620
50	NC_004631	TGGCG	2	10	92096	92105	0 %	20 %	60 %	20 %	29140622
51	NC_004631	GTGGC	2	10	96576	96585	0 %	20 %	60 %	20 %	29140628
52	NC_004631	TGCAC	2	10	98492	98501	20 %	20 %	20 %	40 %	29140630
53	NC_004631	TGGCA	2	10	98561	98570	20 %	20 %	40 %	20 %	29140630
54	NC_004631	TCTGT	2	10	98887	98896	0 %	60 %	20 %	20 %	29140631
55	NC_004631	GCGCT	2	10	99197	99206	0 %	20 %	40 %	40 %	29140631
56	NC_004631	GGCGC	2	10	99611	99620	0 %	0 %	60 %	40 %	29140631
57	NC_004631	GCGAC	2	10	99924	99933	20 %	0 %	40 %	40 %	29140631
58	NC_004631	TCTGT	2	10	100216	100225	0 %	60 %	20 %	20 %	29140631
59	NC_004631	AACGT	2	10	102371	102380	40 %	20 %	20 %	20 %	29140634
60	NC_004631	CCCAA	2	10	104521	104530	40 %	0 %	0 %	60 %	29140637
61	NC_004631	TTGTT	2	10	105228	105237	0 %	80 %	20 %	0 %	29140637
62	NC_004631	GCTTC	2	10	106602	106611	0 %	40 %	20 %	40 %	29140638
63	NC_004631	TGCGT	2	10	106889	106898	0 %	40 %	40 %	20 %	29140638
64	NC_004631	TGATC	2	10	108589	108598	20 %	40 %	20 %	20 %	29140639
65	NC_004631	TGGCG	2	10	111749	111758	0 %	20 %	60 %	20 %	29140641
66	NC_004631	AGCGC	2	10	112309	112318	20 %	0 %	40 %	40 %	29140641
67	NC_004631	CCGCG	2	10	113394	113403	0 %	0 %	40 %	60 %	29140642
68	NC_004631	GGGGT	2	10	114790	114799	0 %	20 %	80 %	0 %	29140642
69	NC_004631	ACGGT	2	10	116619	116628	20 %	20 %	40 %	20 %	29140644
70	NC_004631	TGGCG	2	10	116987	116996	0 %	20 %	60 %	20 %	29140644
71	NC_004631	ACAGA	2	10	118338	118347	60 %	0 %	20 %	20 %	29140645
72	NC_004631	CAGCG	2	10	119513	119522	20 %	0 %	40 %	40 %	29140647
73	NC_004631	GCCGG	2	10	119813	119822	0 %	0 %	60 %	40 %	29140647
74	NC_004631	CGAGC	2	10	119938	119947	20 %	0 %	40 %	40 %	29140647
75	NC_004631	ATTTG	2	10	120381	120390	20 %	60 %	20 %	0 %	29140647
76	NC_004631	TTGCC	2	10	124885	124894	0 %	40 %	20 %	40 %	29140651
77	NC_004631	AGTTT	2	10	127792	127801	20 %	60 %	20 %	0 %	29140653
78	NC_004631	TCGAT	2	10	129640	129649	20 %	40 %	20 %	20 %	29140654
79	NC_004631	CGTTT	2	10	132412	132421	0 %	60 %	20 %	20 %	29140656
80	NC_004631	ATTCC	2	10	137514	137523	20 %	40 %	0 %	40 %	29140661
81	NC_004631	AAAGC	2	10	139811	139820	60 %	0 %	20 %	20 %	29140663
82	NC_004631	CCGCA	2	10	140344	140353	20 %	0 %	20 %	60 %	29140663
83	NC_004631	AGTTC	2	10	142715	142724	20 %	40 %	20 %	20 %	29140665
84	NC_004631	TGCCT	2	10	142815	142824	0 %	40 %	20 %	40 %	29140666
85	NC_004631	AAGCG	2	10	147468	147477	40 %	0 %	40 %	20 %	29140669
86	NC_004631	GTTTG	2	10	149371	149380	0 %	60 %	40 %	0 %	29140671
87	NC_004631	CGTAT	2	10	150842	150851	20 %	40 %	20 %	20 %	29140672
88	NC_004631	ATGGC	2	10	152095	152104	20 %	20 %	40 %	20 %	29140673
89	NC_004631	ATCAG	2	10	152678	152687	40 %	20 %	20 %	20 %	29140674
90	NC_004631	CTGCC	2	10	154687	154696	0 %	20 %	20 %	60 %	29140675
91	NC_004631	CGGCG	2	10	157417	157426	0 %	0 %	60 %	40 %	29140678
92	NC_004631	CCGGC	2	10	160773	160782	0 %	0 %	40 %	60 %	29140681
93	NC_004631	CGCTG	2	10	161665	161674	0 %	20 %	40 %	40 %	29140681
94	NC_004631	GAACC	2	10	164632	164641	40 %	0 %	20 %	40 %	29140684
95	NC_004631	GATCA	2	10	165820	165829	40 %	20 %	20 %	20 %	29140686
96	NC_004631	ATCCC	2	10	168266	168275	20 %	20 %	0 %	60 %	29140689
97	NC_004631	AGCGC	2	10	168974	168983	20 %	0 %	40 %	40 %	29140689
98	NC_004631	TGAGC	2	10	170823	170832	20 %	20 %	40 %	20 %	29140690
99	NC_004631	CGCAT	2	10	171085	171094	20 %	20 %	20 %	40 %	29140691
100	NC_004631	CGAAC	2	10	171814	171823	40 %	0 %	20 %	40 %	29140692
101	NC_004631	GTTCA	2	10	172080	172089	20 %	40 %	20 %	20 %	29140692
102	NC_004631	ATGAC	2	10	173046	173055	40 %	20 %	20 %	20 %	29140693
103	NC_004631	ACTGG	2	10	173635	173644	20 %	20 %	40 %	20 %	29140694
104	NC_004631	CAGAA	2	10	175755	175764	60 %	0 %	20 %	20 %	29140696
105	NC_004631	CGAAG	2	10	178626	178635	40 %	0 %	40 %	20 %	29140698
106	NC_004631	GACTG	2	10	180427	180436	20 %	20 %	40 %	20 %	29140699
107	NC_004631	GGCAT	2	10	185907	185916	20 %	20 %	40 %	20 %	29140702
108	NC_004631	GGCCA	2	10	186329	186338	20 %	0 %	40 %	40 %	29140703
109	NC_004631	CGTTT	2	10	186844	186853	0 %	60 %	20 %	20 %	29140703
110	NC_004631	GGGGA	2	10	186896	186905	20 %	0 %	80 %	0 %	29140703
111	NC_004631	TCTGG	2	10	190529	190538	0 %	40 %	40 %	20 %	29140705
112	NC_004631	CGGCG	2	10	192512	192521	0 %	0 %	60 %	40 %	29140707
113	NC_004631	CCGCT	2	10	193219	193228	0 %	20 %	20 %	60 %	29140707
114	NC_004631	GCCCA	2	10	195771	195780	20 %	0 %	20 %	60 %	29140710
115	NC_004631	GCGCA	2	10	196176	196185	20 %	0 %	40 %	40 %	29140710
116	NC_004631	ATCGG	2	10	197567	197576	20 %	20 %	40 %	20 %	29140712
117	NC_004631	GCCGC	2	10	198777	198786	0 %	0 %	40 %	60 %	29140714
118	NC_004631	CAAAC	2	10	200803	200812	60 %	0 %	0 %	40 %	29140715
119	NC_004631	ATCCA	2	10	204127	204136	40 %	20 %	0 %	40 %	29140717
120	NC_004631	CGGCG	2	10	206360	206369	0 %	0 %	60 %	40 %	29140720
121	NC_004631	TGGGC	2	10	206931	206940	0 %	20 %	60 %	20 %	409994449
122	NC_004631	TTCGG	2	10	207240	207249	0 %	40 %	40 %	20 %	409994449
123	NC_004631	CTTGC	2	10	208249	208258	0 %	40 %	20 %	40 %	29140722
124	NC_004631	TGAGC	2	10	208661	208670	20 %	20 %	40 %	20 %	29140723
125	NC_004631	GGCGT	2	10	209864	209873	0 %	20 %	60 %	20 %	29140724
126	NC_004631	TTTTA	2	10	212440	212449	20 %	80 %	0 %	0 %	29140727
127	NC_004631	GTTGC	2	10	213333	213342	0 %	40 %	40 %	20 %	29140729
128	NC_004631	TTCAC	2	10	214763	214772	20 %	40 %	0 %	40 %	29140729
129	NC_004631	GAGTT	2	10	216098	216107	20 %	40 %	40 %	0 %	29140730
130	NC_004631	CGCGG	2	10	218286	218295	0 %	0 %	60 %	40 %	29140733
131	NC_004631	CGCGG	2	10	218470	218479	0 %	0 %	60 %	40 %	29140733
132	NC_004631	GCCAG	2	10	220454	220463	20 %	0 %	40 %	40 %	29140734
133	NC_004631	GCGCG	2	10	221020	221029	0 %	0 %	60 %	40 %	29140735
134	NC_004631	CGGGG	2	10	222838	222847	0 %	0 %	80 %	20 %	161486817
135	NC_004631	CAGCG	2	10	225021	225030	20 %	0 %	40 %	40 %	161486817
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263	NC_004631	AGTTG	2	10	454515	454524	20 %	40 %	40 %	0 %	29140907
264	NC_004631	TTTTA	2	10	455337	455346	20 %	80 %	0 %	0 %	29140908
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