MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 83562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_004631	CTT	2	6	85753	85758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140616
1503	NC_004631	CCGA	2	8	85784	85791	25 %	0 %	25 %	50 %	29140616
1504	NC_004631	CGT	2	6	85816	85821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140616
1505	NC_004631	CAG	2	6	85836	85841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140616
1506	NC_004631	TTG	2	6	85872	85877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140616
1507	NC_004631	TC	3	6	85947	85952	0 %	50 %	0 %	50 %	29140616
1508	NC_004631	ACA	2	6	86197	86202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140616
1509	NC_004631	GC	3	6	86212	86217	0 %	0 %	50 %	50 %	29140616
1510	NC_004631	TCCA	2	8	86232	86239	25 %	25 %	0 %	50 %	29140616
1511	NC_004631	CGG	2	6	86242	86247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140616
1512	NC_004631	CCG	2	6	86274	86279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140616
1513	NC_004631	TTC	2	6	86282	86287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140616
1514	NC_004631	CAG	2	6	86294	86299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140616
1515	NC_004631	TAA	2	6	86525	86530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29140617
1516	NC_004631	GAA	2	6	86556	86561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140617
1517	NC_004631	TCC	2	6	86571	86576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29140617
1518	NC_004631	ACCC	2	8	86606	86613	25 %	0 %	0 %	75 %	29140617
1519	NC_004631	CAG	2	6	86619	86624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140617
1520	NC_004631	GAT	2	6	86634	86639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140617
1521	NC_004631	GGC	2	6	86677	86682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140617
1522	NC_004631	GAA	2	6	86775	86780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140617
1523	NC_004631	TGG	2	6	86789	86794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140617
1524	NC_004631	GC	4	8	86833	86840	0 %	0 %	50 %	50 %	29140617
1525	NC_004631	CAG	3	9	86892	86900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140617
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1527	NC_004631	CAC	2	6	87040	87045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140617
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1532	NC_004631	ATG	3	9	87304	87312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140617
1533	NC_004631	CCA	2	6	87416	87421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140617
1534	NC_004631	CGA	2	6	87434	87439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140617
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1539	NC_004631	CGG	2	6	87651	87656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140617
1540	NC_004631	TAG	3	9	87667	87675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140617
1541	NC_004631	CAGAA	2	10	87691	87700	60 %	0 %	20 %	20 %	29140617
1542	NC_004631	AGG	2	6	87716	87721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29140617
1543	NC_004631	CAT	2	6	87726	87731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140617
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1553	NC_004631	GGC	2	6	88677	88682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140618
1554	NC_004631	CT	3	6	88719	88724	0 %	50 %	0 %	50 %	29140618
1555	NC_004631	TGA	2	6	88733	88738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140618
1556	NC_004631	AC	3	6	88784	88789	50 %	0 %	0 %	50 %	29140618
1557	NC_004631	GCC	2	6	88803	88808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140618
1558	NC_004631	GCG	2	6	88809	88814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140618
1559	NC_004631	GCG	2	6	88843	88848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140618
1560	NC_004631	TTC	2	6	88853	88858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140618
1561	NC_004631	CAG	2	6	88872	88877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140618
1562	NC_004631	TGG	2	6	88888	88893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140618
1563	NC_004631	CT	4	8	88938	88945	0 %	50 %	0 %	50 %	29140618
1564	NC_004631	CGG	2	6	89014	89019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140618
1565	NC_004631	GCG	2	6	89082	89087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140618
1566	NC_004631	A	6	6	89088	89093	100 %	0 %	0 %	0 %	29140618
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1609	NC_004631	GAAT	2	8	91121	91128	50 %	25 %	25 %	0 %	29140620
1610	NC_004631	TGG	2	6	91142	91147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140620
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1614	NC_004631	CG	4	8	91425	91432	0 %	0 %	50 %	50 %	29140620
1615	NC_004631	A	7	7	91474	91480	100 %	0 %	0 %	0 %	29140620
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1625	NC_004631	GAC	2	6	92007	92012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140622
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1627	NC_004631	GCG	2	6	92056	92061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140622
1628	NC_004631	TGGCG	2	10	92096	92105	0 %	20 %	60 %	20 %	29140622
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1631	NC_004631	GC	3	6	92152	92157	0 %	0 %	50 %	50 %	29140622
1632	NC_004631	GTT	2	6	92198	92203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140622
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1741	NC_004631	GCGCT	2	10	99197	99206	0 %	20 %	40 %	40 %	29140631
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1743	NC_004631	GGCG	2	8	99322	99329	0 %	0 %	75 %	25 %	29140631
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1750	NC_004631	TTG	2	6	99476	99481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140631
1751	NC_004631	TTA	2	6	99572	99577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140631
1752	NC_004631	GGCGC	2	10	99611	99620	0 %	0 %	60 %	40 %	29140631
1753	NC_004631	GGC	2	6	99685	99690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140631
1754	NC_004631	TGC	2	6	99708	99713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140631
1755	NC_004631	GC	3	6	99746	99751	0 %	0 %	50 %	50 %	29140631
1756	NC_004631	CGA	2	6	99766	99771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140631
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1775	NC_004631	TAAA	2	8	100749	100756	75 %	25 %	0 %	0 %	29140632
1776	NC_004631	GTC	2	6	100760	100765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140632
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1783	NC_004631	CTTCGC	2	12	101232	101243	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	29140633
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1856	NC_004631	ACG	2	6	105441	105446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140637
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1867	NC_004631	GCT	4	12	106036	106047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140638
1868	NC_004631	GTC	2	6	106156	106161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140638
1869	NC_004631	TGT	2	6	106176	106181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140638
1870	NC_004631	TAG	2	6	106208	106213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140638
1871	NC_004631	CGG	2	6	106245	106250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140638
1872	NC_004631	CAT	3	9	106251	106259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140638
1873	NC_004631	GCA	2	6	106359	106364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140638
1874	NC_004631	AAG	2	6	106365	106370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140638
1875	NC_004631	T	6	6	106540	106545	0 %	100 %	0 %	0 %	29140638
1876	NC_004631	CTG	2	6	106579	106584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140638
1877	NC_004631	GCTTC	2	10	106602	106611	0 %	40 %	20 %	40 %	29140638
1878	NC_004631	GTA	2	6	106762	106767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140638
1879	NC_004631	GCT	2	6	106798	106803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140638
1880	NC_004631	TGCGT	2	10	106889	106898	0 %	40 %	40 %	20 %	29140638
1881	NC_004631	TACT	2	8	106919	106926	25 %	50 %	0 %	25 %	29140638
1882	NC_004631	TGC	2	6	107009	107014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140638
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1986	NC_004631	GTT	2	6	111946	111951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140641
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1991	NC_004631	ATA	2	6	112108	112113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29140641
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1995	NC_004631	CGA	2	6	112194	112199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140641
1996	NC_004631	CAT	2	6	112204	112209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140641
1997	NC_004631	GCTC	2	8	112282	112289	0 %	25 %	25 %	50 %	29140641
1998	NC_004631	AGCGC	2	10	112309	112318	20 %	0 %	40 %	40 %	29140641
1999	NC_004631	TCGA	2	8	112331	112338	25 %	25 %	25 %	25 %	29140641
2000	NC_004631	TTC	2	6	112421	112426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140641

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