MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 83562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_004631	A	6	6	60294	60299	100 %	0 %	0 %	0 %	29140595
1002	NC_004631	CGC	2	6	60369	60374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140595
1003	NC_004631	TGC	2	6	60375	60380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140595
1004	NC_004631	TGA	2	6	60498	60503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140595
1005	NC_004631	TGG	2	6	60525	60530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140595
1006	NC_004631	TG	3	6	60720	60725	0 %	50 %	50 %	0 %	29140595
1007	NC_004631	CTGC	2	8	60776	60783	0 %	25 %	25 %	50 %	29140595
1008	NC_004631	GTA	2	6	60837	60842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140595
1009	NC_004631	CTGG	2	8	60883	60890	0 %	25 %	50 %	25 %	29140595
1010	NC_004631	ACG	2	6	60962	60967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140595
1011	NC_004631	TGGCGC	2	12	61014	61025	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	29140595
1012	NC_004631	GTGG	2	8	61048	61055	0 %	25 %	75 %	0 %	29140595
1013	NC_004631	TC	3	6	61124	61129	0 %	50 %	0 %	50 %	29140596
1014	NC_004631	CTG	2	6	61218	61223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140596
1015	NC_004631	CTG	2	6	61246	61251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140596
1016	NC_004631	CTGC	2	8	61258	61265	0 %	25 %	25 %	50 %	29140596
1017	NC_004631	TCA	2	6	61305	61310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140596
1018	NC_004631	TGC	2	6	61446	61451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140596
1019	NC_004631	CGG	2	6	61534	61539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140596
1020	NC_004631	AAT	2	6	61547	61552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29140596
1021	NC_004631	A	6	6	61614	61619	100 %	0 %	0 %	0 %	29140596
1022	NC_004631	CTT	2	6	61661	61666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140596
1023	NC_004631	CGA	2	6	61693	61698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140596
1024	NC_004631	CCA	2	6	61729	61734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140596
1025	NC_004631	TTC	2	6	61794	61799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140597
1026	NC_004631	ATT	2	6	61842	61847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140597
1027	NC_004631	CGA	2	6	61853	61858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140597
1028	NC_004631	ACCA	2	8	61894	61901	50 %	0 %	0 %	50 %	29140597
1029	NC_004631	GTT	2	6	61923	61928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140597
1030	NC_004631	GTGG	2	8	61929	61936	0 %	25 %	75 %	0 %	29140597
1031	NC_004631	AAT	2	6	62004	62009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29140597
1032	NC_004631	CAA	2	6	62105	62110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140597
1033	NC_004631	CATT	2	8	62119	62126	25 %	50 %	0 %	25 %	29140597
1034	NC_004631	CAA	2	6	62153	62158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140597
1035	NC_004631	ATA	2	6	62205	62210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29140597
1036	NC_004631	GGT	3	9	62234	62242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140597
1037	NC_004631	TGG	2	6	62278	62283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140597
1038	NC_004631	CTG	3	9	62292	62300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140597
1039	NC_004631	CAGCGC	2	12	62304	62315	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	29140597
1040	NC_004631	CAG	2	6	62337	62342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140597
1041	NC_004631	TGG	2	6	62351	62356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140597
1042	NC_004631	TGC	2	6	62377	62382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140597
1043	NC_004631	GC	3	6	62386	62391	0 %	0 %	50 %	50 %	29140597
1044	NC_004631	TTG	2	6	62452	62457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140597
1045	NC_004631	TAA	2	6	62465	62470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29140597
1046	NC_004631	AAT	2	6	62493	62498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29140597
1047	NC_004631	T	6	6	62553	62558	0 %	100 %	0 %	0 %	29140597
1048	NC_004631	T	7	7	62560	62566	0 %	100 %	0 %	0 %	29140597
1049	NC_004631	GCG	2	6	62567	62572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140597
1050	NC_004631	AAG	2	6	62581	62586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140597
1051	NC_004631	TGG	2	6	62605	62610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140597
1052	NC_004631	GCG	2	6	62658	62663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140597
1053	NC_004631	GCT	2	6	62768	62773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140597
1054	NC_004631	GCG	2	6	62817	62822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140597
1055	NC_004631	ACA	2	6	62831	62836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140597
1056	NC_004631	CGT	2	6	63038	63043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140597
1057	NC_004631	CGC	2	6	63050	63055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140597
1058	NC_004631	AT	3	6	63061	63066	50 %	50 %	0 %	0 %	29140597
1059	NC_004631	TGG	2	6	63326	63331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140597
1060	NC_004631	GT	3	6	63387	63392	0 %	50 %	50 %	0 %	29140597
1061	NC_004631	CGG	2	6	63577	63582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140598
1062	NC_004631	CAG	2	6	63632	63637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140598
1063	NC_004631	GCC	2	6	63684	63689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140598
1064	NC_004631	CAG	2	6	63755	63760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140598
1065	NC_004631	GCC	2	6	63780	63785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140598
1066	NC_004631	CAG	3	9	63812	63820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140598
1067	NC_004631	CCA	2	6	63939	63944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140598
1068	NC_004631	CAG	2	6	63985	63990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140598
1069	NC_004631	CGGCG	2	10	63991	64000	0 %	0 %	60 %	40 %	29140598
1070	NC_004631	GCA	3	9	64005	64013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140598
1071	NC_004631	CCA	2	6	64017	64022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140598
1072	NC_004631	CAC	2	6	64033	64038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140598
1073	NC_004631	T	6	6	64050	64055	0 %	100 %	0 %	0 %	29140598
1074	NC_004631	GC	4	8	64116	64123	0 %	0 %	50 %	50 %	29140598
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1082	NC_004631	GCC	3	9	64349	64357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140598
1083	NC_004631	CAG	3	9	64360	64368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140598
1084	NC_004631	CAG	2	6	64384	64389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140598
1085	NC_004631	GCG	2	6	64434	64439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140598
1086	NC_004631	GCCAGC	2	12	64544	64555	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	29140598
1087	NC_004631	GC	3	6	64581	64586	0 %	0 %	50 %	50 %	29140598
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1090	NC_004631	GCC	2	6	64693	64698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140598
1091	NC_004631	GCA	3	9	64710	64718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140598
1092	NC_004631	GCCA	2	8	64745	64752	25 %	0 %	25 %	50 %	29140598
1093	NC_004631	CAG	2	6	64759	64764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140598
1094	NC_004631	CAG	2	6	64771	64776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140598
1095	NC_004631	ATG	2	6	64778	64783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140598
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1097	NC_004631	GCGCG	2	10	64938	64947	0 %	0 %	60 %	40 %	29140599
1098	NC_004631	CAG	2	6	64981	64986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140599
1099	NC_004631	GCG	2	6	65049	65054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140599
1100	NC_004631	GGC	2	6	65083	65088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140599
1101	NC_004631	GCC	2	6	65111	65116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140599
1102	NC_004631	GTA	2	6	65126	65131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140599
1103	NC_004631	GCTG	2	8	65133	65140	0 %	25 %	50 %	25 %	29140599
1104	NC_004631	CGC	2	6	65145	65150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140599
1105	NC_004631	CAC	2	6	65164	65169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140599
1106	NC_004631	CTTCCA	2	12	65181	65192	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	29140599
1107	NC_004631	GGC	2	6	65209	65214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140599
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1109	NC_004631	CGT	2	6	65340	65345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140599
1110	NC_004631	CAGC	2	8	65412	65419	25 %	0 %	25 %	50 %	29140599
1111	NC_004631	CAG	2	6	65428	65433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140599
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1114	NC_004631	CGG	2	6	65538	65543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140599
1115	NC_004631	CCG	2	6	65694	65699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140599
1116	NC_004631	CTG	2	6	65704	65709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140599
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1118	NC_004631	CCA	2	6	65757	65762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140599
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1120	NC_004631	CAG	2	6	65989	65994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140599
1121	NC_004631	GGT	2	6	66013	66018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140599
1122	NC_004631	GTGCAG	2	12	66028	66039	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	29140599
1123	NC_004631	T	6	6	66055	66060	0 %	100 %	0 %	0 %	29140599
1124	NC_004631	AAC	2	6	66146	66151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140599
1125	NC_004631	CCAG	2	8	66165	66172	25 %	0 %	25 %	50 %	29140599
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1247	NC_004631	TTGAT	2	10	71530	71539	20 %	60 %	20 %	0 %	29140605
1248	NC_004631	A	6	6	71569	71574	100 %	0 %	0 %	0 %	29140605
1249	NC_004631	GGC	2	6	71633	71638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140605
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