MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 83562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004631	AGC	2	6	31935	31940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140571
502	NC_004631	ATG	2	6	31951	31956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140571
503	NC_004631	CTC	2	6	31959	31964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29140571
504	NC_004631	GCA	2	6	31982	31987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140571
505	NC_004631	GTC	2	6	32016	32021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140571
506	NC_004631	TGCGT	2	10	32172	32181	0 %	40 %	40 %	20 %	29140572
507	NC_004631	ACCG	2	8	32230	32237	25 %	0 %	25 %	50 %	29140572
508	NC_004631	GTT	2	6	32261	32266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140572
509	NC_004631	AGGC	2	8	32268	32275	25 %	0 %	50 %	25 %	29140572
510	NC_004631	TAA	2	6	32314	32319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29140572
511	NC_004631	TAT	2	6	32338	32343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140572
512	NC_004631	ATT	2	6	32397	32402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140572
513	NC_004631	AAAAG	2	10	32566	32575	80 %	0 %	20 %	0 %	29140573
514	NC_004631	A	7	7	32586	32592	100 %	0 %	0 %	0 %	29140573
515	NC_004631	TTA	2	6	32619	32624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140573
516	NC_004631	CAG	2	6	32665	32670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140573
517	NC_004631	CCTG	2	8	32704	32711	0 %	25 %	25 %	50 %	29140573
518	NC_004631	TGT	2	6	32745	32750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140573
519	NC_004631	TCG	2	6	32756	32761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140573
520	NC_004631	CAG	2	6	32762	32767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140573
521	NC_004631	AAG	2	6	32771	32776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140573
522	NC_004631	ATC	2	6	32835	32840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140573
523	NC_004631	CGCA	2	8	32894	32901	25 %	0 %	25 %	50 %	29140573
524	NC_004631	T	6	6	32921	32926	0 %	100 %	0 %	0 %	29140573
525	NC_004631	ATT	2	6	32940	32945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140573
526	NC_004631	TAAA	2	8	32964	32971	75 %	25 %	0 %	0 %	29140573
527	NC_004631	TTA	2	6	32976	32981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140573
528	NC_004631	A	6	6	33379	33384	100 %	0 %	0 %	0 %	29140574
529	NC_004631	A	7	7	33389	33395	100 %	0 %	0 %	0 %	29140574
530	NC_004631	TTA	2	6	33429	33434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140574
531	NC_004631	GCG	2	6	33482	33487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140574
532	NC_004631	TC	3	6	33489	33494	0 %	50 %	0 %	50 %	29140574
533	NC_004631	CTT	2	6	33500	33505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140574
534	NC_004631	TTAT	2	8	33533	33540	25 %	75 %	0 %	0 %	29140574
535	NC_004631	TGA	2	6	33729	33734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140574
536	NC_004631	AT	3	6	33739	33744	50 %	50 %	0 %	0 %	29140574
537	NC_004631	A	7	7	33764	33770	100 %	0 %	0 %	0 %	29140574
538	NC_004631	ATC	2	6	33818	33823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140574
539	NC_004631	GAT	2	6	33850	33855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140574
540	NC_004631	TGTTTG	2	12	33889	33900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140574
541	NC_004631	A	6	6	33906	33911	100 %	0 %	0 %	0 %	29140574
542	NC_004631	TTGG	2	8	33917	33924	0 %	50 %	50 %	0 %	29140574
543	NC_004631	A	6	6	33930	33935	100 %	0 %	0 %	0 %	29140574
544	NC_004631	TA	3	6	33942	33947	50 %	50 %	0 %	0 %	29140574
545	NC_004631	TGC	2	6	33955	33960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140574
546	NC_004631	TCT	2	6	33992	33997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140574
547	NC_004631	TTA	2	6	34063	34068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140574
548	NC_004631	GTT	2	6	34097	34102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140574
549	NC_004631	A	6	6	34104	34109	100 %	0 %	0 %	0 %	29140574
550	NC_004631	GCG	2	6	34162	34167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140574
551	NC_004631	TATAA	2	10	34169	34178	60 %	40 %	0 %	0 %	29140574
552	NC_004631	TAC	2	6	34182	34187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140574
553	NC_004631	TGA	2	6	34195	34200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140574
554	NC_004631	AAT	2	6	34201	34206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29140574
555	NC_004631	A	6	6	34268	34273	100 %	0 %	0 %	0 %	29140574
556	NC_004631	CTTT	2	8	34297	34304	0 %	75 %	0 %	25 %	29140574
557	NC_004631	GAAG	2	8	34337	34344	50 %	0 %	50 %	0 %	29140574
558	NC_004631	A	6	6	34541	34546	100 %	0 %	0 %	0 %	29140575
559	NC_004631	CGC	2	6	34575	34580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140575
560	NC_004631	CTT	2	6	34626	34631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140575
561	NC_004631	C	6	6	34633	34638	0 %	0 %	0 %	100 %	29140575
562	NC_004631	GTT	2	6	34654	34659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140575
563	NC_004631	T	6	6	34658	34663	0 %	100 %	0 %	0 %	29140575
564	NC_004631	ATAA	2	8	34664	34671	75 %	25 %	0 %	0 %	29140575
565	NC_004631	TTG	2	6	34676	34681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140575
566	NC_004631	AT	3	6	34695	34700	50 %	50 %	0 %	0 %	29140575
567	NC_004631	TAT	2	6	34733	34738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140575
568	NC_004631	T	6	6	34755	34760	0 %	100 %	0 %	0 %	29140575
569	NC_004631	GTGC	2	8	34787	34794	0 %	25 %	50 %	25 %	29140575
570	NC_004631	TTAA	2	8	34797	34804	50 %	50 %	0 %	0 %	29140575
571	NC_004631	ATG	2	6	34815	34820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140575
572	NC_004631	AT	3	6	35441	35446	50 %	50 %	0 %	0 %	29140576
573	NC_004631	AAC	2	6	35448	35453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140576
574	NC_004631	TGA	2	6	35554	35559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140576
575	NC_004631	TGT	2	6	35581	35586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140576
576	NC_004631	AGCGA	2	10	35591	35600	40 %	0 %	40 %	20 %	29140576
577	NC_004631	ATG	2	6	35625	35630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140576
578	NC_004631	TG	4	8	35656	35663	0 %	50 %	50 %	0 %	29140576
579	NC_004631	AAT	2	6	35681	35686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29140576
580	NC_004631	TGAC	2	8	35736	35743	25 %	25 %	25 %	25 %	29140576
581	NC_004631	ATT	2	6	35789	35794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140576
582	NC_004631	TCCTG	2	10	35801	35810	0 %	40 %	20 %	40 %	29140576
583	NC_004631	GCA	2	6	35812	35817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140576
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585	NC_004631	GGT	2	6	35901	35906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140576
586	NC_004631	CTT	2	6	35925	35930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140576
587	NC_004631	TCT	2	6	36040	36045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140576
588	NC_004631	TTC	2	6	36069	36074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140576
589	NC_004631	TAT	2	6	36160	36165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140576
590	NC_004631	ATT	2	6	36219	36224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140576
591	NC_004631	CGC	2	6	36231	36236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140576
592	NC_004631	GC	3	6	36249	36254	0 %	0 %	50 %	50 %	29140576
593	NC_004631	CAA	2	6	36316	36321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140576
594	NC_004631	TAT	2	6	36394	36399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140576
595	NC_004631	TTA	2	6	36440	36445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140576
596	NC_004631	GAT	3	9	36455	36463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140576
597	NC_004631	GGGA	2	8	36493	36500	25 %	0 %	75 %	0 %	29140576
598	NC_004631	GCA	2	6	36535	36540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140576
599	NC_004631	TTG	2	6	36546	36551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140576
600	NC_004631	ATG	2	6	36561	36566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140576
601	NC_004631	TTG	2	6	36635	36640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140576
602	NC_004631	GTG	2	6	36662	36667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140576
603	NC_004631	CGA	2	6	36810	36815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140576
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608	NC_004631	TCT	2	6	37290	37295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140577
609	NC_004631	CAA	2	6	37321	37326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140577
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611	NC_004631	ATG	2	6	37419	37424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140577
612	NC_004631	ATAC	2	8	37478	37485	50 %	25 %	0 %	25 %	29140577
613	NC_004631	GCC	2	6	37535	37540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140577
614	NC_004631	GAAG	2	8	37550	37557	50 %	0 %	50 %	0 %	29140577
615	NC_004631	T	6	6	37781	37786	0 %	100 %	0 %	0 %	29140577
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617	NC_004631	GGTCA	2	10	38036	38045	20 %	20 %	40 %	20 %	29140577
618	NC_004631	T	6	6	38072	38077	0 %	100 %	0 %	0 %	29140577
619	NC_004631	CACG	2	8	38113	38120	25 %	0 %	25 %	50 %	29140577
620	NC_004631	TAAT	2	8	38215	38222	50 %	50 %	0 %	0 %	29140577
621	NC_004631	A	6	6	38242	38247	100 %	0 %	0 %	0 %	29140577
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627	NC_004631	TCGT	2	8	38559	38566	0 %	50 %	25 %	25 %	29140577
628	NC_004631	ATA	2	6	38567	38572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29140577
629	NC_004631	CCAT	2	8	38671	38678	25 %	25 %	0 %	50 %	29140577
630	NC_004631	TAT	2	6	38832	38837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140578
631	NC_004631	GTC	2	6	38915	38920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140578
632	NC_004631	TGT	2	6	38927	38932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140578
633	NC_004631	CAT	2	6	38943	38948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140578
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635	NC_004631	CAT	2	6	39163	39168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140578
636	NC_004631	TCA	2	6	39176	39181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140578
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657	NC_004631	GTG	2	6	40746	40751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140579
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664	NC_004631	GGC	2	6	41145	41150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140579
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