MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 83562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_004631	CCG	2	6	303703	303708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140800
5503	NC_004631	TGG	2	6	303715	303720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140800
5504	NC_004631	GCCA	2	8	303732	303739	25 %	0 %	25 %	50 %	29140800
5505	NC_004631	ATGA	2	8	303773	303780	50 %	25 %	25 %	0 %	29140800
5506	NC_004631	CAG	2	6	303824	303829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140800
5507	NC_004631	GAC	2	6	303833	303838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140800
5508	NC_004631	TGC	2	6	303899	303904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140800
5509	NC_004631	ATC	2	6	305005	305010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140801
5510	NC_004631	GCTTG	2	10	305045	305054	0 %	40 %	40 %	20 %	29140801
5511	NC_004631	T	6	6	305070	305075	0 %	100 %	0 %	0 %	29140801
5512	NC_004631	CG	3	6	305098	305103	0 %	0 %	50 %	50 %	29140801
5513	NC_004631	T	6	6	305123	305128	0 %	100 %	0 %	0 %	29140801
5514	NC_004631	T	6	6	305153	305158	0 %	100 %	0 %	0 %	29140801
5515	NC_004631	TCA	2	6	305211	305216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140801
5516	NC_004631	CG	3	6	305221	305226	0 %	0 %	50 %	50 %	29140801
5517	NC_004631	CAG	2	6	305261	305266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140801
5518	NC_004631	GTCG	2	8	305426	305433	0 %	25 %	50 %	25 %	29140801
5519	NC_004631	TTG	2	6	305520	305525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140801
5520	NC_004631	GTA	2	6	305663	305668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140801
5521	NC_004631	CAG	2	6	305732	305737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140801
5522	NC_004631	ATCGC	2	10	305757	305766	20 %	20 %	20 %	40 %	29140801
5523	NC_004631	TCT	2	6	305913	305918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140801
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5530	NC_004631	TGC	2	6	306150	306155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140801
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5538	NC_004631	CTG	2	6	306641	306646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140802
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5544	NC_004631	T	7	7	306962	306968	0 %	100 %	0 %	0 %	29140802
5545	NC_004631	GCA	2	6	307006	307011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140802
5546	NC_004631	GC	3	6	307067	307072	0 %	0 %	50 %	50 %	29140802
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5550	NC_004631	CAT	2	6	307300	307305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140803
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5552	NC_004631	TTG	2	6	307402	307407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140803
5553	NC_004631	GC	3	6	307430	307435	0 %	0 %	50 %	50 %	29140803
5554	NC_004631	TCG	2	6	307446	307451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140803
5555	NC_004631	CAG	2	6	307480	307485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140803
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5558	NC_004631	GAC	2	6	307741	307746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140803
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5561	NC_004631	ATC	2	6	307835	307840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140803
5562	NC_004631	CG	3	6	307947	307952	0 %	0 %	50 %	50 %	29140803
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5574	NC_004631	GAT	2	6	308466	308471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140803
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5596	NC_004631	CCGC	2	8	310015	310022	0 %	0 %	25 %	75 %	29140805
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5605	NC_004631	AGC	2	6	310313	310318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140805
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5748	NC_004631	GGC	2	6	318130	318135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140813
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5863	NC_004631	TCG	2	6	324623	324628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140821
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5992	NC_004631	CTA	2	6	330686	330691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140825
5993	NC_004631	GC	4	8	330716	330723	0 %	0 %	50 %	50 %	29140825
5994	NC_004631	GCT	2	6	330731	330736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140825
5995	NC_004631	GCC	2	6	330744	330749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140825
5996	NC_004631	GGC	2	6	330842	330847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140825
5997	NC_004631	TCGATG	2	12	330951	330962	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	29140825
5998	NC_004631	CGC	2	6	331006	331011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140825
5999	NC_004631	CGC	2	6	331066	331071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140825
6000	NC_004631	TGC	2	6	331096	331101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140825

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