MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes SSI-1 chromosome

Total Repeats: 33376

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_004606	TAC	2	6	119787	119792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28895018
2003	NC_004606	TGA	2	6	119856	119861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28895018
2004	NC_004606	TAATT	2	10	119874	119883	40 %	60 %	0 %	0 %	28895018
2005	NC_004606	GAA	2	6	119911	119916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28895018
2006	NC_004606	TAA	2	6	119931	119936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28895018
2007	NC_004606	GAA	2	6	119941	119946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28895018
2008	NC_004606	GAA	2	6	120022	120027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28895018
2009	NC_004606	GCA	2	6	120199	120204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28895018
2010	NC_004606	TCAGG	2	10	120337	120346	20 %	20 %	40 %	20 %	28895018
2011	NC_004606	TATTGA	2	12	120348	120359	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	28895018
2012	NC_004606	ACT	2	6	120397	120402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28895018
2013	NC_004606	AGA	2	6	120408	120413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28895018
2014	NC_004606	GTT	2	6	120454	120459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28895018
2015	NC_004606	ACA	2	6	120463	120468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28895018
2016	NC_004606	AC	3	6	120473	120478	50 %	0 %	0 %	50 %	28895018
2017	NC_004606	ACT	2	6	120508	120513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28895018
2018	NC_004606	AGA	2	6	120519	120524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28895018
2019	NC_004606	TGG	2	6	120549	120554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28895018
2020	NC_004606	ACA	2	6	120574	120579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28895018
2021	NC_004606	A	6	6	120700	120705	100 %	0 %	0 %	0 %	28895018
2022	NC_004606	CTT	2	6	120779	120784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28895018
2023	NC_004606	TTA	2	6	120791	120796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28895018
2024	NC_004606	A	6	6	120826	120831	100 %	0 %	0 %	0 %	28895018
2025	NC_004606	ATC	2	6	120837	120842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28895018
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2040	NC_004606	A	7	7	122151	122157	100 %	0 %	0 %	0 %	28895020
2041	NC_004606	TTTTA	2	10	122219	122228	20 %	80 %	0 %	0 %	28895020
2042	NC_004606	TGA	2	6	122257	122262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28895020
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2044	NC_004606	TGT	2	6	122335	122340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28895020
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2046	NC_004606	GTA	2	6	122472	122477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28895020
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2050	NC_004606	TGC	2	6	122645	122650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28895020
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2052	NC_004606	GTT	2	6	122712	122717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28895020
2053	NC_004606	GTG	2	6	122775	122780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28895020
2054	NC_004606	GCTTT	3	15	122795	122809	0 %	60 %	20 %	20 %	28895020
2055	NC_004606	TGA	3	9	122849	122857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28895020
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2058	NC_004606	CTG	2	6	122914	122919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28895020
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2061	NC_004606	TTTTTA	2	12	123036	123047	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	28895020
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2118	NC_004606	ATG	2	6	125994	125999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28895023
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2121	NC_004606	TGG	2	6	126030	126035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28895023
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2123	NC_004606	TAAA	2	8	126078	126085	75 %	25 %	0 %	0 %	28895023
2124	NC_004606	ACG	2	6	126116	126121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28895023
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2128	NC_004606	TGA	2	6	126316	126321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28895023
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2132	NC_004606	AAG	2	6	126483	126488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28895023
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2242	NC_004606	CTTA	2	8	131988	131995	25 %	50 %	0 %	25 %	28895029
2243	NC_004606	TTG	2	6	132072	132077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28895029
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2249	NC_004606	GAA	2	6	132281	132286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28895029
2250	NC_004606	GGA	2	6	132295	132300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28895029
2251	NC_004606	ATT	2	6	132325	132330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28895030
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2493	NC_004606	TTA	2	6	145375	145380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28895042
2494	NC_004606	A	7	7	145420	145426	100 %	0 %	0 %	0 %	28895042
2495	NC_004606	AGA	2	6	145482	145487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28895042
2496	NC_004606	TCATG	2	10	145491	145500	20 %	40 %	20 %	20 %	28895042
2497	NC_004606	CA	3	6	145501	145506	50 %	0 %	0 %	50 %	28895042
2498	NC_004606	GGA	2	6	145533	145538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28895042
2499	NC_004606	TGG	3	9	145548	145556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28895042
2500	NC_004606	TAC	2	6	145648	145653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28895042

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