MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes SSI-1 chromosome

Total Repeats: 33376

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004606	GCG	2	6	32033	32038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28894933
502	NC_004606	TTC	2	6	32047	32052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28894933
503	NC_004606	CTTG	2	8	32206	32213	0 %	50 %	25 %	25 %	28894933
504	NC_004606	CGG	2	6	32239	32244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28894933
505	NC_004606	TCA	2	6	32373	32378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894933
506	NC_004606	A	6	6	32378	32383	100 %	0 %	0 %	0 %	28894933
507	NC_004606	TGG	2	6	32401	32406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28894933
508	NC_004606	GTT	2	6	32534	32539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28894933
509	NC_004606	ATG	2	6	32547	32552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894933
510	NC_004606	CAA	2	6	32575	32580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28894933
511	NC_004606	GTT	2	6	32705	32710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28894933
512	NC_004606	GCAC	2	8	32750	32757	25 %	0 %	25 %	50 %	28894933
513	NC_004606	CAG	2	6	32763	32768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894933
514	NC_004606	ACC	2	6	32874	32879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28894933
515	NC_004606	GGT	2	6	32885	32890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28894933
516	NC_004606	ACA	2	6	32951	32956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28894933
517	NC_004606	TGC	2	6	33019	33024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28894933
518	NC_004606	CTT	2	6	33158	33163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28894933
519	NC_004606	CGG	2	6	33205	33210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28894933
520	NC_004606	ACC	2	6	33250	33255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28894933
521	NC_004606	ACA	2	6	33278	33283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28894933
522	NC_004606	TC	4	8	33301	33308	0 %	50 %	0 %	50 %	28894933
523	NC_004606	TGGC	2	8	33321	33328	0 %	25 %	50 %	25 %	28894933
524	NC_004606	AGA	2	6	33364	33369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894933
525	NC_004606	GGT	2	6	33461	33466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28894933
526	NC_004606	CAG	2	6	33538	33543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894933
527	NC_004606	AGC	2	6	33676	33681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894933
528	NC_004606	GAA	2	6	33740	33745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894933
529	NC_004606	CTG	2	6	33750	33755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28894933
530	NC_004606	ATC	2	6	33968	33973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894933
531	NC_004606	CAG	2	6	33993	33998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894933
532	NC_004606	ATC	2	6	34097	34102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894933
533	NC_004606	TCT	2	6	34141	34146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28894933
534	NC_004606	GAA	2	6	34163	34168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894933
535	NC_004606	CT	3	6	34188	34193	0 %	50 %	0 %	50 %	28894933
536	NC_004606	CCAA	2	8	34206	34213	50 %	0 %	0 %	50 %	28894933
537	NC_004606	TTGG	2	8	34261	34268	0 %	50 %	50 %	0 %	28894933
538	NC_004606	TGT	2	6	34327	34332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28894933
539	NC_004606	ATC	2	6	34481	34486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894933
540	NC_004606	GAA	2	6	34858	34863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894934
541	NC_004606	ACTT	2	8	34909	34916	25 %	50 %	0 %	25 %	28894934
542	NC_004606	AAG	2	6	34946	34951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894934
543	NC_004606	AATC	2	8	35029	35036	50 %	25 %	0 %	25 %	28894934
544	NC_004606	CCT	2	6	35234	35239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28894934
545	NC_004606	TCG	2	6	35268	35273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28894934
546	NC_004606	AAG	2	6	35306	35311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894934
547	NC_004606	TGA	2	6	35348	35353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894934
548	NC_004606	TGC	2	6	35370	35375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28894934
549	NC_004606	GGT	2	6	35463	35468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28894934
550	NC_004606	TGA	2	6	35550	35555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894934
551	NC_004606	A	6	6	35643	35648	100 %	0 %	0 %	0 %	28894934
552	NC_004606	GCT	2	6	35725	35730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28894934
553	NC_004606	GAA	2	6	35743	35748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894934
554	NC_004606	A	6	6	35778	35783	100 %	0 %	0 %	0 %	28894934
555	NC_004606	GTT	2	6	35887	35892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28894934
556	NC_004606	TGAT	2	8	35894	35901	25 %	50 %	25 %	0 %	28894934
557	NC_004606	ATT	2	6	35943	35948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894934
558	NC_004606	AATT	2	8	36044	36051	50 %	50 %	0 %	0 %	28894934
559	NC_004606	GT	3	6	36076	36081	0 %	50 %	50 %	0 %	28894934
560	NC_004606	ATT	2	6	36085	36090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894934
561	NC_004606	TC	3	6	36111	36116	0 %	50 %	0 %	50 %	28894934
562	NC_004606	TTGA	2	8	36127	36134	25 %	50 %	25 %	0 %	28894934
563	NC_004606	TGG	2	6	36165	36170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28894934
564	NC_004606	GAA	3	9	36223	36231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894934
565	NC_004606	AGA	2	6	36246	36251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894934
566	NC_004606	A	7	7	36320	36326	100 %	0 %	0 %	0 %	28894935
567	NC_004606	A	7	7	36384	36390	100 %	0 %	0 %	0 %	28894935
568	NC_004606	TGG	2	6	36441	36446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28894935
569	NC_004606	TGCT	2	8	36524	36531	0 %	50 %	25 %	25 %	28894935
570	NC_004606	TG	3	6	36578	36583	0 %	50 %	50 %	0 %	28894935
571	NC_004606	ATT	2	6	36592	36597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894935
572	NC_004606	GCA	2	6	36598	36603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894935
573	NC_004606	T	6	6	36621	36626	0 %	100 %	0 %	0 %	28894935
574	NC_004606	A	6	6	36645	36650	100 %	0 %	0 %	0 %	28894935
575	NC_004606	GAA	2	6	36667	36672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894935
576	NC_004606	GTT	2	6	36673	36678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28894935
577	NC_004606	GAT	2	6	36763	36768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894935
578	NC_004606	ATC	2	6	36814	36819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894935
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580	NC_004606	CGT	2	6	36901	36906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28894935
581	NC_004606	AAC	2	6	36956	36961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28894935
582	NC_004606	CTT	2	6	36973	36978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28894935
583	NC_004606	AGC	2	6	37002	37007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894935
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585	NC_004606	GTG	2	6	37058	37063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28894935
586	NC_004606	GAT	2	6	37096	37101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894935
587	NC_004606	GAA	2	6	37183	37188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894935
588	NC_004606	ATC	2	6	37297	37302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894935
589	NC_004606	GTG	2	6	37321	37326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28894935
590	NC_004606	AGCAG	2	10	37553	37562	40 %	0 %	40 %	20 %	28894936
591	NC_004606	AGTT	2	8	37568	37575	25 %	50 %	25 %	0 %	28894936
592	NC_004606	ATC	2	6	37588	37593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894936
593	NC_004606	GGC	2	6	37673	37678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28894936
594	NC_004606	TTG	2	6	37701	37706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28894936
595	NC_004606	GATT	2	8	37718	37725	25 %	50 %	25 %	0 %	28894936
596	NC_004606	GTCT	2	8	37728	37735	0 %	50 %	25 %	25 %	28894936
597	NC_004606	TTG	2	6	37753	37758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28894936
598	NC_004606	TAT	2	6	37790	37795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894936
599	NC_004606	CCTG	2	8	37814	37821	0 %	25 %	25 %	50 %	28894936
600	NC_004606	GGTCA	2	10	37917	37926	20 %	20 %	40 %	20 %	28894936
601	NC_004606	CAA	2	6	37929	37934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28894936
602	NC_004606	TTG	2	6	38284	38289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28894937
603	NC_004606	TTGGG	2	10	38313	38322	0 %	40 %	60 %	0 %	28894937
604	NC_004606	TGG	2	6	38336	38341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28894937
605	NC_004606	CGA	2	6	38387	38392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894937
606	NC_004606	GAT	2	6	38411	38416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894937
607	NC_004606	TCG	2	6	38468	38473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28894937
608	NC_004606	GCT	2	6	38496	38501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28894937
609	NC_004606	ACA	2	6	38506	38511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28894937
610	NC_004606	ACATCG	2	12	38605	38616	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	28894937
611	NC_004606	GAC	2	6	38726	38731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894937
612	NC_004606	CA	3	6	38772	38777	50 %	0 %	0 %	50 %	28894937
613	NC_004606	ACG	2	6	38785	38790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894937
614	NC_004606	CAA	2	6	38895	38900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28894937
615	NC_004606	ACT	2	6	38935	38940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894937
616	NC_004606	AAT	2	6	38985	38990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28894937
617	NC_004606	GCA	2	6	39006	39011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894937
618	NC_004606	TAT	2	6	39017	39022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894937
619	NC_004606	TGT	3	9	39047	39055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28894937
620	NC_004606	TGA	2	6	39092	39097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894937
621	NC_004606	TGG	2	6	39149	39154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28894937
622	NC_004606	GTC	2	6	39159	39164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28894937
623	NC_004606	AAG	2	6	39195	39200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894937
624	NC_004606	TCT	2	6	39211	39216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28894937
625	NC_004606	ATC	3	9	39222	39230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894937
626	NC_004606	CAT	2	6	39235	39240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894937
627	NC_004606	AGA	2	6	39245	39250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894937
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629	NC_004606	TGG	2	6	39356	39361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28894937
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