MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes SSI-1 chromosome

Total Repeats: 33376

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_004606	TCAG	2	8	320005	320012	25 %	25 %	25 %	25 %	28895203
5502	NC_004606	TTA	2	6	320034	320039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28895203
5503	NC_004606	TTA	2	6	320115	320120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28895203
5504	NC_004606	T	6	6	320155	320160	0 %	100 %	0 %	0 %	28895203
5505	NC_004606	CAT	2	6	320196	320201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28895203
5506	NC_004606	AG	3	6	320278	320283	50 %	0 %	50 %	0 %	28895203
5507	NC_004606	TAC	2	6	320306	320311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28895203
5508	NC_004606	TGA	2	6	320362	320367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28895203
5509	NC_004606	TGC	2	6	320395	320400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28895203
5510	NC_004606	TAA	2	6	320401	320406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28895203
5511	NC_004606	TCA	2	6	320472	320477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28895203
5512	NC_004606	CA	3	6	320503	320508	50 %	0 %	0 %	50 %	28895203
5513	NC_004606	T	6	6	320552	320557	0 %	100 %	0 %	0 %	28895203
5514	NC_004606	TGG	2	6	320589	320594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28895203
5515	NC_004606	GAC	2	6	320648	320653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28895203
5516	NC_004606	AATT	2	8	320703	320710	50 %	50 %	0 %	0 %	28895203
5517	NC_004606	ATT	2	6	320868	320873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28895204
5518	NC_004606	AATG	2	8	320972	320979	50 %	25 %	25 %	0 %	28895204
5519	NC_004606	AAG	2	6	320998	321003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28895204
5520	NC_004606	ACGG	2	8	321012	321019	25 %	0 %	50 %	25 %	28895204
5521	NC_004606	A	6	6	321147	321152	100 %	0 %	0 %	0 %	28895204
5522	NC_004606	ATG	2	6	321172	321177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28895204
5523	NC_004606	AGG	2	6	321194	321199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28895204
5524	NC_004606	TAA	3	9	321303	321311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28895205
5525	NC_004606	CCA	2	6	321388	321393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28895205
5526	NC_004606	CAT	2	6	321499	321504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28895205
5527	NC_004606	GAAGT	2	10	321660	321669	40 %	20 %	40 %	0 %	28895205
5528	NC_004606	CAA	2	6	321687	321692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28895205
5529	NC_004606	TTG	2	6	321783	321788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28895205
5530	NC_004606	AT	3	6	321925	321930	50 %	50 %	0 %	0 %	28895206
5531	NC_004606	CAC	2	6	321948	321953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28895206
5532	NC_004606	TTA	2	6	321966	321971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28895206
5533	NC_004606	CACT	2	8	322004	322011	25 %	25 %	0 %	50 %	28895206
5534	NC_004606	CAGA	2	8	322073	322080	50 %	0 %	25 %	25 %	28895206
5535	NC_004606	AGA	3	9	322078	322086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28895206
5536	NC_004606	CAG	2	6	322098	322103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28895206
5537	NC_004606	A	6	6	322161	322166	100 %	0 %	0 %	0 %	28895206
5538	NC_004606	CTG	2	6	322176	322181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28895206
5539	NC_004606	TTG	2	6	322236	322241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28895206
5540	NC_004606	TGA	2	6	322279	322284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28895206
5541	NC_004606	GGA	2	6	322427	322432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28895207
5542	NC_004606	T	7	7	322456	322462	0 %	100 %	0 %	0 %	28895207
5543	NC_004606	AAT	2	6	322485	322490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28895207
5544	NC_004606	AGA	2	6	322496	322501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28895207
5545	NC_004606	A	6	6	322530	322535	100 %	0 %	0 %	0 %	28895207
5546	NC_004606	TTA	2	6	322575	322580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28895207
5547	NC_004606	A	6	6	322659	322664	100 %	0 %	0 %	0 %	28895207
5548	NC_004606	TGA	2	6	322670	322675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28895207
5549	NC_004606	TTA	2	6	322690	322695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28895207
5550	NC_004606	CTTA	2	8	322700	322707	25 %	50 %	0 %	25 %	28895207
5551	NC_004606	AAAT	2	8	322736	322743	75 %	25 %	0 %	0 %	28895207
5552	NC_004606	ATA	2	6	322745	322750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28895207
5553	NC_004606	T	6	6	322942	322947	0 %	100 %	0 %	0 %	28895208
5554	NC_004606	T	6	6	322949	322954	0 %	100 %	0 %	0 %	28895208
5555	NC_004606	T	7	7	322957	322963	0 %	100 %	0 %	0 %	28895208
5556	NC_004606	TCA	2	6	322995	323000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28895208
5557	NC_004606	CAT	2	6	323056	323061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28895208
5558	NC_004606	GTT	2	6	323101	323106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28895208
5559	NC_004606	ATC	2	6	323138	323143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28895208
5560	NC_004606	TGA	2	6	323233	323238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28895208
5561	NC_004606	ACC	2	6	323372	323377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28895208
5562	NC_004606	GAA	2	6	323391	323396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28895208
5563	NC_004606	GAA	2	6	323487	323492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28895208
5564	NC_004606	ATA	2	6	323571	323576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28895208
5565	NC_004606	CAATT	2	10	323597	323606	40 %	40 %	0 %	20 %	28895208
5566	NC_004606	AATT	2	8	323618	323625	50 %	50 %	0 %	0 %	28895208
5567	NC_004606	T	6	6	323758	323763	0 %	100 %	0 %	0 %	28895208
5568	NC_004606	T	6	6	323777	323782	0 %	100 %	0 %	0 %	28895208
5569	NC_004606	GTT	2	6	323802	323807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28895208
5570	NC_004606	ATA	2	6	323874	323879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28895209
5571	NC_004606	CTA	2	6	323900	323905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28895209
5572	NC_004606	TTGGG	2	10	323925	323934	0 %	40 %	60 %	0 %	28895209
5573	NC_004606	TAA	2	6	323969	323974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28895209
5574	NC_004606	TGT	2	6	324111	324116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28895209
5575	NC_004606	T	7	7	324175	324181	0 %	100 %	0 %	0 %	28895209
5576	NC_004606	TAT	2	6	324230	324235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28895209
5577	NC_004606	CTG	2	6	324245	324250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28895209
5578	NC_004606	ACTAA	2	10	324322	324331	60 %	20 %	0 %	20 %	28895209
5579	NC_004606	ACT	2	6	324417	324422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28895209
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5583	NC_004606	CAT	2	6	324818	324823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28895209
5584	NC_004606	TCAA	2	8	324832	324839	50 %	25 %	0 %	25 %	28895209
5585	NC_004606	ATCC	2	8	324873	324880	25 %	25 %	0 %	50 %	28895209
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5588	NC_004606	A	6	6	325115	325120	100 %	0 %	0 %	0 %	28895209
5589	NC_004606	T	6	6	325220	325225	0 %	100 %	0 %	0 %	28895209
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5594	NC_004606	GTT	2	6	325768	325773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28895210
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5596	NC_004606	ATT	2	6	325882	325887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28895210
5597	NC_004606	CAGC	2	8	325939	325946	25 %	0 %	25 %	50 %	28895210
5598	NC_004606	TAT	2	6	325947	325952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28895210
5599	NC_004606	ATTT	2	8	325955	325962	25 %	75 %	0 %	0 %	28895210
5600	NC_004606	TGG	2	6	326042	326047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28895210
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5604	NC_004606	TGT	2	6	326193	326198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28895210
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5606	NC_004606	TAT	2	6	326325	326330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28895210
5607	NC_004606	CTGG	2	8	326389	326396	0 %	25 %	50 %	25 %	28895210
5608	NC_004606	TTG	2	6	326441	326446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28895210
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5612	NC_004606	CAA	2	6	326612	326617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28895210
5613	NC_004606	TGG	2	6	326730	326735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28895210
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5616	NC_004606	CAGC	2	8	326959	326966	25 %	0 %	25 %	50 %	28895210
5617	NC_004606	TA	3	6	326984	326989	50 %	50 %	0 %	0 %	28895210
5618	NC_004606	T	6	6	327038	327043	0 %	100 %	0 %	0 %	28895210
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5620	NC_004606	GTCAA	2	10	327159	327168	40 %	20 %	20 %	20 %	28895210
5621	NC_004606	A	6	6	327259	327264	100 %	0 %	0 %	0 %	28895210
5622	NC_004606	TCT	2	6	327270	327275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28895210
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