MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus mutans UA159 chromosome

Total Repeats: 37727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004350	TGC	2	6	29020	29025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24378553
502	NC_004350	ATG	2	6	29043	29048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378553
503	NC_004350	T	6	6	29062	29067	0 %	100 %	0 %	0 %	24378553
504	NC_004350	GATG	2	8	29086	29093	25 %	25 %	50 %	0 %	24378553
505	NC_004350	T	6	6	29181	29186	0 %	100 %	0 %	0 %	24378553
506	NC_004350	TGA	2	6	29389	29394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378553
507	NC_004350	A	6	6	29432	29437	100 %	0 %	0 %	0 %	24378553
508	NC_004350	TGA	2	6	29443	29448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378553
509	NC_004350	GAA	2	6	29689	29694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378554
510	NC_004350	TGA	2	6	29800	29805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378554
511	NC_004350	GT	3	6	29841	29846	0 %	50 %	50 %	0 %	24378554
512	NC_004350	TAT	2	6	29848	29853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378554
513	NC_004350	A	6	6	29865	29870	100 %	0 %	0 %	0 %	24378554
514	NC_004350	GAT	2	6	29879	29884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378554
515	NC_004350	GAAA	2	8	29904	29911	75 %	0 %	25 %	0 %	24378554
516	NC_004350	A	6	6	29909	29914	100 %	0 %	0 %	0 %	24378554
517	NC_004350	TTCT	2	8	29970	29977	0 %	75 %	0 %	25 %	24378554
518	NC_004350	GCT	2	6	30002	30007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24378554
519	NC_004350	CTT	2	6	30011	30016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24378554
520	NC_004350	GTT	2	6	30017	30022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378554
521	NC_004350	TCA	2	6	30059	30064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24378554
522	NC_004350	TCA	2	6	30130	30135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24378554
523	NC_004350	TAA	2	6	30214	30219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24378554
524	NC_004350	AAC	2	6	30229	30234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24378554
525	NC_004350	AGC	2	6	30274	30279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378554
526	NC_004350	GC	3	6	30314	30319	0 %	0 %	50 %	50 %	24378554
527	NC_004350	TGA	2	6	30324	30329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378554
528	NC_004350	TGT	3	9	30343	30351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378554
529	NC_004350	AAGC	2	8	30437	30444	50 %	0 %	25 %	25 %	24378554
530	NC_004350	ATT	2	6	30513	30518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378554
531	NC_004350	TGT	2	6	30559	30564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378554
532	NC_004350	TAC	2	6	30599	30604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24378554
533	NC_004350	TGT	2	6	30640	30645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378554
534	NC_004350	TAG	2	6	30654	30659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378554
535	NC_004350	G	6	6	30675	30680	0 %	0 %	100 %	0 %	24378554
536	NC_004350	A	6	6	30748	30753	100 %	0 %	0 %	0 %	24378555
537	NC_004350	TGA	2	6	30860	30865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378555
538	NC_004350	TAT	2	6	31214	31219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378556
539	NC_004350	TAG	2	6	31225	31230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378556
540	NC_004350	ATT	2	6	31263	31268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378556
541	NC_004350	CAG	2	6	31301	31306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378556
542	NC_004350	CTT	2	6	31343	31348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24378556
543	NC_004350	GAT	2	6	31370	31375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378556
544	NC_004350	AGA	2	6	31456	31461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378556
545	NC_004350	CGG	2	6	31462	31467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24378556
546	NC_004350	TGG	2	6	31474	31479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24378556
547	NC_004350	CT	3	6	31509	31514	0 %	50 %	0 %	50 %	24378556
548	NC_004350	TGA	2	6	31540	31545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378556
549	NC_004350	GAA	2	6	31574	31579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378556
550	NC_004350	ATT	2	6	31616	31621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378556
551	NC_004350	TTA	2	6	31648	31653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378556
552	NC_004350	TTG	2	6	31665	31670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378556
553	NC_004350	GA	3	6	31683	31688	50 %	0 %	50 %	0 %	24378556
554	NC_004350	ATC	2	6	31707	31712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24378556
555	NC_004350	TGA	3	9	31728	31736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378556
556	NC_004350	TTAT	2	8	31880	31887	25 %	75 %	0 %	0 %	24378557
557	NC_004350	GAC	2	6	31911	31916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378557
558	NC_004350	AGA	2	6	31917	31922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378557
559	NC_004350	ATT	2	6	31933	31938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378557
560	NC_004350	A	6	6	31978	31983	100 %	0 %	0 %	0 %	24378557
561	NC_004350	TAA	2	6	32010	32015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24378557
562	NC_004350	TTA	2	6	32072	32077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378557
563	NC_004350	A	6	6	32107	32112	100 %	0 %	0 %	0 %	24378557
564	NC_004350	ATT	2	6	32119	32124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378557
565	NC_004350	GTT	2	6	32134	32139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378557
566	NC_004350	CAG	2	6	32153	32158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378557
567	NC_004350	AAGG	2	8	32185	32192	50 %	0 %	50 %	0 %	24378557
568	NC_004350	TTG	2	6	32213	32218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378557
569	NC_004350	ATG	2	6	32234	32239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378557
570	NC_004350	GAT	2	6	32245	32250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378557
571	NC_004350	ATG	2	6	32261	32266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378557
572	NC_004350	AAAC	2	8	32337	32344	75 %	0 %	0 %	25 %	24378557
573	NC_004350	AATT	2	8	32378	32385	50 %	50 %	0 %	0 %	24378557
574	NC_004350	GTC	2	6	32459	32464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24378557
575	NC_004350	TAAG	2	8	32568	32575	50 %	25 %	25 %	0 %	24378557
576	NC_004350	A	6	6	32608	32613	100 %	0 %	0 %	0 %	24378558
577	NC_004350	CCT	2	6	32675	32680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24378558
578	NC_004350	AGA	2	6	32724	32729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378558
579	NC_004350	T	7	7	32829	32835	0 %	100 %	0 %	0 %	24378558
580	NC_004350	GCA	2	6	32872	32877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378558
581	NC_004350	AAG	2	6	32885	32890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378558
582	NC_004350	TAA	2	6	32952	32957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24378558
583	NC_004350	GAT	2	6	33163	33168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378558
584	NC_004350	ATT	2	6	33185	33190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24378558
585	NC_004350	AT	3	6	33348	33353	50 %	50 %	0 %	0 %	24378558
586	NC_004350	GTAGAT	2	12	33502	33513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378558
587	NC_004350	GCT	2	6	33531	33536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24378558
588	NC_004350	TGG	2	6	33606	33611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24378558
589	NC_004350	CAGGTG	2	12	33668	33679	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	24378558
590	NC_004350	CAA	2	6	33724	33729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24378558
591	NC_004350	CGG	2	6	33743	33748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24378558
592	NC_004350	TCCA	2	8	33812	33819	25 %	25 %	0 %	50 %	24378558
593	NC_004350	TGT	2	6	33852	33857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378558
594	NC_004350	GCA	2	6	33862	33867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378558
595	NC_004350	CGTG	2	8	33882	33889	0 %	25 %	50 %	25 %	24378558
596	NC_004350	CTT	2	6	33919	33924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24378558
597	NC_004350	GGT	2	6	33952	33957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24378558
598	NC_004350	CAG	2	6	34001	34006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378558
599	NC_004350	GAA	2	6	34036	34041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378558
600	NC_004350	GCAATG	2	12	34064	34075	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	24378558
601	NC_004350	TCA	2	6	34085	34090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24378558
602	NC_004350	GGC	2	6	34114	34119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24378558
603	NC_004350	TG	3	6	34123	34128	0 %	50 %	50 %	0 %	24378558
604	NC_004350	TGT	3	9	34242	34250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378558
605	NC_004350	GCA	2	6	34279	34284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378558
606	NC_004350	GTT	2	6	34309	34314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378558
607	NC_004350	AAACC	2	10	34333	34342	60 %	0 %	0 %	40 %	24378558
608	NC_004350	CCTT	2	8	34388	34395	0 %	50 %	0 %	50 %	24378558
609	NC_004350	GTT	2	6	34417	34422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24378558
610	NC_004350	ACA	2	6	34468	34473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24378558
611	NC_004350	CAG	2	6	34475	34480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378558
612	NC_004350	TCTG	2	8	34509	34516	0 %	50 %	25 %	25 %	24378558
613	NC_004350	ATC	2	6	34586	34591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24378558
614	NC_004350	CGG	2	6	34596	34601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24378558
615	NC_004350	GCT	2	6	34864	34869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24378558
616	NC_004350	TCGA	2	8	34879	34886	25 %	25 %	25 %	25 %	24378558
617	NC_004350	GGT	2	6	34918	34923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24378558
618	NC_004350	GAA	2	6	34948	34953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378558
619	NC_004350	ACA	2	6	34990	34995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24378558
620	NC_004350	GTC	2	6	35003	35008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24378558
621	NC_004350	TAC	2	6	35050	35055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24378558
622	NC_004350	AGA	2	6	35076	35081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378558
623	NC_004350	CAG	2	6	35150	35155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378558
624	NC_004350	CGG	2	6	35172	35177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24378558
625	NC_004350	CAG	2	6	35250	35255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24378558
626	NC_004350	TGG	2	6	35271	35276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24378558
627	NC_004350	TGA	2	6	35292	35297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24378558
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629	NC_004350	GAA	2	6	35452	35457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24378558
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