MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 plasmid megaplasmid

Total Repeats: 1974

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_004349	CA	3	6	126411	126416	50 %	0 %	0 %	50 %	24376349
1502	NC_004349	TGCT	2	8	126483	126490	0 %	50 %	25 %	25 %	24376349
1503	NC_004349	TAA	2	6	126598	126603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24376349
1504	NC_004349	GAT	2	6	126622	126627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376349
1505	NC_004349	AC	3	6	126650	126655	50 %	0 %	0 %	50 %	24376349
1506	NC_004349	ATG	2	6	126657	126662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376349
1507	NC_004349	TAT	2	6	126703	126708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376349
1508	NC_004349	TGA	2	6	126798	126803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376349
1509	NC_004349	A	6	6	127089	127094	100 %	0 %	0 %	0 %	24376349
1510	NC_004349	GGCT	2	8	127127	127134	0 %	25 %	50 %	25 %	24376349
1511	NC_004349	GAC	2	6	127173	127178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376349
1512	NC_004349	ATC	2	6	127185	127190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376349
1513	NC_004349	ATT	2	6	127232	127237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376349
1514	NC_004349	ATG	2	6	127257	127262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376349
1515	NC_004349	CAT	2	6	127378	127383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376349
1516	NC_004349	TGA	2	6	127501	127506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376349
1517	NC_004349	CGG	2	6	127567	127572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24376349
1518	NC_004349	A	7	7	127677	127683	100 %	0 %	0 %	0 %	24376349
1519	NC_004349	TGG	2	6	127735	127740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24376349
1520	NC_004349	CTG	2	6	127806	127811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24376349
1521	NC_004349	TAT	2	6	127923	127928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376349
1522	NC_004349	TTA	2	6	127973	127978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376349
1523	NC_004349	CTGA	2	8	127982	127989	25 %	25 %	25 %	25 %	24376349
1524	NC_004349	CA	3	6	128042	128047	50 %	0 %	0 %	50 %	24376349
1525	NC_004349	ACT	2	6	128076	128081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376349
1526	NC_004349	CAA	2	6	128100	128105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24376349
1527	NC_004349	AG	3	6	128123	128128	50 %	0 %	50 %	0 %	24376349
1528	NC_004349	T	6	6	128134	128139	0 %	100 %	0 %	0 %	24376349
1529	NC_004349	GAAA	2	8	128173	128180	75 %	0 %	25 %	0 %	24376349
1530	NC_004349	GAT	2	6	128213	128218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376349
1531	NC_004349	ATC	2	6	128352	128357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376349
1532	NC_004349	A	7	7	128396	128402	100 %	0 %	0 %	0 %	24376349
1533	NC_004349	GCA	2	6	128440	128445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376349
1534	NC_004349	TTG	2	6	128478	128483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24376349
1535	NC_004349	GT	3	6	128652	128657	0 %	50 %	50 %	0 %	24376349
1536	NC_004349	GCT	2	6	128663	128668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24376349
1537	NC_004349	AATGCT	2	12	128806	128817	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	24376350
1538	NC_004349	GTC	2	6	128848	128853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24376350
1539	NC_004349	A	6	6	128860	128865	100 %	0 %	0 %	0 %	24376350
1540	NC_004349	ATT	3	9	128873	128881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376350
1541	NC_004349	TAT	2	6	128929	128934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376350
1542	NC_004349	GAT	2	6	129037	129042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376350
1543	NC_004349	CAA	2	6	129055	129060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24376350
1544	NC_004349	A	6	6	129100	129105	100 %	0 %	0 %	0 %	24376350
1545	NC_004349	G	6	6	129187	129192	0 %	0 %	100 %	0 %	24376350
1546	NC_004349	AAC	2	6	129207	129212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24376350
1547	NC_004349	AAG	2	6	129227	129232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24376350
1548	NC_004349	ACG	2	6	129287	129292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376350
1549	NC_004349	AGC	2	6	129515	129520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376350
1550	NC_004349	AGAAA	2	10	129550	129559	80 %	0 %	20 %	0 %	24376350
1551	NC_004349	GAA	2	6	129631	129636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24376350
1552	NC_004349	CAAG	2	8	129681	129688	50 %	0 %	25 %	25 %	24376350
1553	NC_004349	TCA	2	6	129695	129700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376350
1554	NC_004349	GAA	2	6	129709	129714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24376350
1555	NC_004349	GAG	2	6	129742	129747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24376350
1556	NC_004349	AAT	2	6	129790	129795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24376350
1557	NC_004349	T	7	7	129825	129831	0 %	100 %	0 %	0 %	24376350
1558	NC_004349	CTCA	2	8	129847	129854	25 %	25 %	0 %	50 %	24376350
1559	NC_004349	CTG	2	6	130078	130083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24376350
1560	NC_004349	AAT	2	6	130129	130134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24376350
1561	NC_004349	ATTGG	2	10	130241	130250	20 %	40 %	40 %	0 %	24376350
1562	NC_004349	ATA	2	6	130256	130261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24376350
1563	NC_004349	AAT	2	6	130300	130305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24376350
1564	NC_004349	ATG	2	6	130328	130333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376350
1565	NC_004349	GAA	2	6	130387	130392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24376350
1566	NC_004349	ATGG	2	8	130455	130462	25 %	25 %	50 %	0 %	24376350
1567	NC_004349	CAATC	2	10	130898	130907	40 %	20 %	0 %	40 %	24376351
1568	NC_004349	GT	3	6	130981	130986	0 %	50 %	50 %	0 %	24376351
1569	NC_004349	A	6	6	131050	131055	100 %	0 %	0 %	0 %	24376351
1570	NC_004349	GAA	2	6	131088	131093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24376351
1571	NC_004349	A	6	6	131172	131177	100 %	0 %	0 %	0 %	24376351
1572	NC_004349	GTTT	2	8	131183	131190	0 %	75 %	25 %	0 %	24376351
1573	NC_004349	GTG	2	6	131197	131202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24376351
1574	NC_004349	AAG	2	6	131241	131246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24376351
1575	NC_004349	TGA	2	6	131297	131302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376351
1576	NC_004349	A	6	6	131325	131330	100 %	0 %	0 %	0 %	24376351
1577	NC_004349	ACG	2	6	131332	131337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376351
1578	NC_004349	TATC	2	8	131429	131436	25 %	50 %	0 %	25 %	24376351
1579	NC_004349	TAC	2	6	131486	131491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376351
1580	NC_004349	CAG	2	6	131553	131558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376351
1581	NC_004349	TGC	2	6	131566	131571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24376351
1582	NC_004349	CGC	2	6	131680	131685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24376351
1583	NC_004349	GGA	2	6	131774	131779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24376351
1584	NC_004349	TAC	2	6	131811	131816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376351
1585	NC_004349	TCA	2	6	131831	131836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376351
1586	NC_004349	ATTG	2	8	131873	131880	25 %	50 %	25 %	0 %	24376351
1587	NC_004349	AATCT	2	10	131918	131927	40 %	40 %	0 %	20 %	24376351
1588	NC_004349	AGC	2	6	132460	132465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376352
1589	NC_004349	TCCG	2	8	132527	132534	0 %	25 %	25 %	50 %	24376352
1590	NC_004349	CAGT	2	8	132724	132731	25 %	25 %	25 %	25 %	24376352
1591	NC_004349	A	6	6	132896	132901	100 %	0 %	0 %	0 %	24376352
1592	NC_004349	TAA	2	6	132971	132976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24376352
1593	NC_004349	GTG	2	6	132979	132984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24376352
1594	NC_004349	CCA	2	6	133082	133087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24376352
1595	NC_004349	A	6	6	133118	133123	100 %	0 %	0 %	0 %	24376352
1596	NC_004349	AAG	2	6	133174	133179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24376352
1597	NC_004349	ATT	2	6	133276	133281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376352
1598	NC_004349	ACCAAA	2	12	133362	133373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24376352
1599	NC_004349	TTG	2	6	133398	133403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24376352
1600	NC_004349	ATTT	2	8	133491	133498	25 %	75 %	0 %	0 %	24376352
1601	NC_004349	AGC	2	6	133624	133629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376353
1602	NC_004349	TTA	2	6	133715	133720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376353
1603	NC_004349	CAC	2	6	133797	133802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24376353
1604	NC_004349	GTCAC	2	10	133840	133849	20 %	20 %	20 %	40 %	24376353
1605	NC_004349	GTC	2	6	133933	133938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24376353
1606	NC_004349	ACGA	2	8	133992	133999	50 %	0 %	25 %	25 %	24376353
1607	NC_004349	CCTT	2	8	134020	134027	0 %	50 %	0 %	50 %	24376353
1608	NC_004349	TTC	2	6	134035	134040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24376353
1609	NC_004349	TTCT	2	8	134827	134834	0 %	75 %	0 %	25 %	118725049
1610	NC_004349	GCA	2	6	134847	134852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118725049
1611	NC_004349	TAT	2	6	134900	134905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118725049
1612	NC_004349	AT	3	6	134976	134981	50 %	50 %	0 %	0 %	118725049
1613	NC_004349	GATT	2	8	135407	135414	25 %	50 %	25 %	0 %	24376355
1614	NC_004349	T	6	6	135446	135451	0 %	100 %	0 %	0 %	24376355
1615	NC_004349	GGC	2	6	135462	135467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24376355
1616	NC_004349	T	6	6	135469	135474	0 %	100 %	0 %	0 %	24376355
1617	NC_004349	A	7	7	135493	135499	100 %	0 %	0 %	0 %	118725050
1618	NC_004349	ATT	2	6	135544	135549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118725050
1619	NC_004349	TGA	2	6	135608	135613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118725050
1620	NC_004349	AT	3	6	135643	135648	50 %	50 %	0 %	0 %	118725050
1621	NC_004349	CTT	2	6	135661	135666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118725050
1622	NC_004349	T	7	7	135697	135703	0 %	100 %	0 %	0 %	118725050
1623	NC_004349	GAA	2	6	135731	135736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118725050
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1625	NC_004349	AGAA	2	8	136131	136138	75 %	0 %	25 %	0 %	118725051
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