MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 plasmid megaplasmid

Total Repeats: 1974

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_004349	TGT	2	6	79695	79700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24376320
1002	NC_004349	GAG	2	6	79718	79723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24376320
1003	NC_004349	ACC	2	6	79734	79739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24376320
1004	NC_004349	TTGT	2	8	79757	79764	0 %	75 %	25 %	0 %	24376320
1005	NC_004349	CTT	2	6	79793	79798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24376320
1006	NC_004349	CT	3	6	79909	79914	0 %	50 %	0 %	50 %	24376320
1007	NC_004349	GCC	2	6	79933	79938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24376320
1008	NC_004349	CT	3	6	80100	80105	0 %	50 %	0 %	50 %	24376320
1009	NC_004349	CTTT	2	8	80137	80144	0 %	75 %	0 %	25 %	24376320
1010	NC_004349	GAAA	2	8	80195	80202	75 %	0 %	25 %	0 %	24376320
1011	NC_004349	AT	3	6	80295	80300	50 %	50 %	0 %	0 %	24376320
1012	NC_004349	TAG	2	6	80325	80330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376320
1013	NC_004349	AT	3	6	80398	80403	50 %	50 %	0 %	0 %	24376320
1014	NC_004349	TCA	2	6	80416	80421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376320
1015	NC_004349	G	6	6	80463	80468	0 %	0 %	100 %	0 %	24376320
1016	NC_004349	TAAG	2	8	80472	80479	50 %	25 %	25 %	0 %	24376320
1017	NC_004349	GTT	2	6	80553	80558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24376320
1018	NC_004349	GAG	2	6	80579	80584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24376320
1019	NC_004349	GCG	2	6	80620	80625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24376320
1020	NC_004349	TTG	2	6	80643	80648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24376320
1021	NC_004349	CTT	2	6	80696	80701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24376320
1022	NC_004349	GCA	2	6	80792	80797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376320
1023	NC_004349	A	6	6	80805	80810	100 %	0 %	0 %	0 %	24376320
1024	NC_004349	CCT	2	6	80869	80874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24376320
1025	NC_004349	TGG	2	6	80950	80955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24376320
1026	NC_004349	ATG	2	6	81055	81060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376320
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1028	NC_004349	GCC	2	6	81369	81374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24376320
1029	NC_004349	G	6	6	81403	81408	0 %	0 %	100 %	0 %	24376320
1030	NC_004349	ACA	2	6	81445	81450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24376320
1031	NC_004349	TC	3	6	82927	82932	0 %	50 %	0 %	50 %	118725036
1032	NC_004349	TCA	2	6	82997	83002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118725036
1033	NC_004349	GGC	2	6	83033	83038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118725036
1034	NC_004349	ATT	2	6	83091	83096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118725036
1035	NC_004349	GCT	2	6	83154	83159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118725036
1036	NC_004349	TGG	2	6	83186	83191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118725036
1037	NC_004349	TAC	2	6	83294	83299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118725036
1038	NC_004349	CA	3	6	83304	83309	50 %	0 %	0 %	50 %	118725036
1039	NC_004349	TGAA	2	8	83330	83337	50 %	25 %	25 %	0 %	118725036
1040	NC_004349	AGC	2	6	83420	83425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118725036
1041	NC_004349	GTC	2	6	83525	83530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118725036
1042	NC_004349	ACA	2	6	83638	83643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118725036
1043	NC_004349	AGA	2	6	83775	83780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118725036
1044	NC_004349	GCG	2	6	83845	83850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118725036
1045	NC_004349	ATT	2	6	83877	83882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118725036
1046	NC_004349	TGG	2	6	83899	83904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118725036
1047	NC_004349	CAA	2	6	83981	83986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118725036
1048	NC_004349	CTG	2	6	84004	84009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118725036
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1051	NC_004349	GAA	2	6	84060	84065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118725036
1052	NC_004349	GTT	2	6	84092	84097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118725036
1053	NC_004349	ATC	2	6	84491	84496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376323
1054	NC_004349	CATT	2	8	84571	84578	25 %	50 %	0 %	25 %	24376323
1055	NC_004349	GAA	2	6	84643	84648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24376323
1056	NC_004349	TAT	2	6	84719	84724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376323
1057	NC_004349	TGAT	2	8	84750	84757	25 %	50 %	25 %	0 %	24376323
1058	NC_004349	TGA	2	6	84778	84783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376323
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1060	NC_004349	ATCA	2	8	84815	84822	50 %	25 %	0 %	25 %	24376323
1061	NC_004349	GGT	2	6	84841	84846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24376323
1062	NC_004349	TGC	2	6	84868	84873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24376323
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1065	NC_004349	TTCT	2	8	85373	85380	0 %	75 %	0 %	25 %	24376324
1066	NC_004349	GTT	2	6	85411	85416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24376324
1067	NC_004349	TTCG	2	8	85475	85482	0 %	50 %	25 %	25 %	24376324
1068	NC_004349	CTTG	2	8	85503	85510	0 %	50 %	25 %	25 %	24376324
1069	NC_004349	TGA	2	6	85547	85552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376324
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1095	NC_004349	GAA	2	6	86946	86951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24376324
1096	NC_004349	AT	3	6	88799	88804	50 %	50 %	0 %	0 %	24376326
1097	NC_004349	ATGCA	2	10	88819	88828	40 %	20 %	20 %	20 %	24376326
1098	NC_004349	CTG	2	6	88836	88841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24376326
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1101	NC_004349	TCA	2	6	89004	89009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376326
1102	NC_004349	TTG	2	6	89027	89032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24376326
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1104	NC_004349	ACTA	2	8	89140	89147	50 %	25 %	0 %	25 %	24376326
1105	NC_004349	TAAA	2	8	89192	89199	75 %	25 %	0 %	0 %	24376327
1106	NC_004349	ATA	2	6	89207	89212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24376327
1107	NC_004349	A	6	6	89237	89242	100 %	0 %	0 %	0 %	24376327
1108	NC_004349	A	9	9	89301	89309	100 %	0 %	0 %	0 %	24376327
1109	NC_004349	ATG	2	6	89335	89340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376327
1110	NC_004349	TAA	2	6	89415	89420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24376327
1111	NC_004349	TTA	2	6	89426	89431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376327
1112	NC_004349	TAA	2	6	89474	89479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24376327
1113	NC_004349	A	6	6	89492	89497	100 %	0 %	0 %	0 %	24376327
1114	NC_004349	ACA	2	6	89507	89512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24376327
1115	NC_004349	GA	3	6	89536	89541	50 %	0 %	50 %	0 %	24376327
1116	NC_004349	TTG	2	6	89558	89563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24376327
1117	NC_004349	GAT	2	6	89617	89622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24376327
1118	NC_004349	A	7	7	89632	89638	100 %	0 %	0 %	0 %	24376327
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1121	NC_004349	T	7	7	89732	89738	0 %	100 %	0 %	0 %	24376327
1122	NC_004349	TTG	2	6	89762	89767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24376327
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1125	NC_004349	AAC	2	6	89887	89892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24376327
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1127	NC_004349	TA	3	6	90100	90105	50 %	50 %	0 %	0 %	24376328
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1257	NC_004349	T	6	6	99434	99439	0 %	100 %	0 %	0 %	24376330
1258	NC_004349	CATTTT	2	12	99442	99453	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	24376330
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1260	NC_004349	TGCAGG	2	12	99506	99517	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	24376330
1261	NC_004349	GCGT	2	8	99568	99575	0 %	25 %	50 %	25 %	24376330
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1265	NC_004349	GGTG	2	8	99767	99774	0 %	25 %	75 %	0 %	24376330
1266	NC_004349	GGTT	2	8	99780	99787	0 %	50 %	50 %	0 %	24376330
1267	NC_004349	TC	3	6	99829	99834	0 %	50 %	0 %	50 %	24376330
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1276	NC_004349	CGT	2	6	100383	100388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24376330
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1354	NC_004349	CAATC	2	10	106568	106577	40 %	20 %	0 %	40 %	24376334
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1356	NC_004349	A	6	6	106720	106725	100 %	0 %	0 %	0 %	24376334
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1359	NC_004349	GTTT	2	8	106853	106860	0 %	75 %	25 %	0 %	24376334
1360	NC_004349	GTG	2	6	106867	106872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24376334
1361	NC_004349	AAG	2	6	106911	106916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24376334
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1363	NC_004349	A	6	6	106995	107000	100 %	0 %	0 %	0 %	24376334
1364	NC_004349	ACG	2	6	107002	107007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376334
1365	NC_004349	TATC	2	8	107099	107106	25 %	50 %	0 %	25 %	24376334
1366	NC_004349	TAC	2	6	107156	107161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376334
1367	NC_004349	CAG	2	6	107223	107228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376334
1368	NC_004349	TGC	2	6	107236	107241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24376334
1369	NC_004349	CGC	2	6	107350	107355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24376334
1370	NC_004349	GGA	2	6	107444	107449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24376334
1371	NC_004349	TAC	2	6	107481	107486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376334
1372	NC_004349	TCA	2	6	107501	107506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376334
1373	NC_004349	ATTG	2	8	107543	107550	25 %	50 %	25 %	0 %	24376334
1374	NC_004349	AATCT	2	10	107588	107597	40 %	40 %	0 %	20 %	24376334
1375	NC_004349	ATC	2	6	107947	107952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376335
1376	NC_004349	CCT	2	6	108001	108006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24376335
1377	NC_004349	GTT	2	6	108011	108016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24376335
1378	NC_004349	GCG	2	6	108048	108053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24376335
1379	NC_004349	T	6	6	108069	108074	0 %	100 %	0 %	0 %	24376335
1380	NC_004349	GCA	2	6	108148	108153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376335
1381	NC_004349	CGA	2	6	108190	108195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24376335
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1383	NC_004349	TTC	2	6	108403	108408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24376335
1384	NC_004349	GTCGA	2	10	108445	108454	20 %	20 %	40 %	20 %	24376335
1385	NC_004349	CG	3	6	108513	108518	0 %	0 %	50 %	50 %	24376335
1386	NC_004349	AAT	2	6	108661	108666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24376335
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1393	NC_004349	TAC	2	6	109185	109190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24376337
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1419	NC_004349	CTG	2	6	114094	114099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24376340
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1442	NC_004349	GCTATA	2	12	116310	116321	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118725038
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1445	NC_004349	TTG	2	6	116389	116394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118725038
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1453	NC_004349	ATT	2	6	116681	116686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24376343
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1455	NC_004349	A	7	7	116752	116758	100 %	0 %	0 %	0 %	24376343
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1459	NC_004349	A	6	6	116870	116875	100 %	0 %	0 %	0 %	24376343
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1486	NC_004349	TGA	3	9	125454	125462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118725040
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1490	NC_004349	TAAA	2	8	125642	125649	75 %	25 %	0 %	0 %	118725040
1491	NC_004349	T	7	7	125666	125672	0 %	100 %	0 %	0 %	118725040
1492	NC_004349	GTT	2	6	125673	125678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118725040
1493	NC_004349	TTAT	2	8	125759	125766	25 %	75 %	0 %	0 %	118725040
1494	NC_004349	CTT	2	6	125793	125798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118725040
1495	NC_004349	G	7	7	125828	125834	0 %	0 %	100 %	0 %	118725040
1496	NC_004349	TACT	2	8	125919	125926	25 %	50 %	0 %	25 %	118725040
1497	NC_004349	CAAGT	2	10	125951	125960	40 %	20 %	20 %	20 %	118725040
1498	NC_004349	CACC	2	8	126034	126041	25 %	0 %	0 %	75 %	118725040
1499	NC_004349	TTG	2	6	126118	126123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118725040
1500	NC_004349	TTC	2	6	126138	126143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118725040

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