MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 72058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_004347	AGTTG	2	10	258617	258626	20 %	40 %	40 %	0 %	24371854
4002	NC_004347	AAG	2	6	258648	258653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371854
4003	NC_004347	GAC	2	6	258741	258746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371854
4004	NC_004347	GTC	2	6	258812	258817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371855
4005	NC_004347	CAG	2	6	258831	258836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371855
4006	NC_004347	ATC	2	6	258889	258894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371855
4007	NC_004347	CGT	2	6	258979	258984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371855
4008	NC_004347	TGG	2	6	259065	259070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371855
4009	NC_004347	TAG	2	6	259136	259141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371855
4010	NC_004347	GTC	2	6	259142	259147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371855
4011	NC_004347	GCT	2	6	259153	259158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371855
4012	NC_004347	TGTTGA	2	12	259164	259175	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	24371855
4013	NC_004347	GCT	2	6	259177	259182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371855
4014	NC_004347	ATC	2	6	260733	260738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371857
4015	NC_004347	GCC	2	6	260835	260840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371857
4016	NC_004347	ACA	2	6	260945	260950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371857
4017	NC_004347	TGA	2	6	261118	261123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371858
4018	NC_004347	AGA	2	6	261139	261144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371858
4019	NC_004347	CATA	2	8	261165	261172	50 %	25 %	0 %	25 %	24371858
4020	NC_004347	A	6	6	261195	261200	100 %	0 %	0 %	0 %	24371858
4021	NC_004347	ATT	2	6	261222	261227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371858
4022	NC_004347	CCT	2	6	261231	261236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24371859
4023	NC_004347	ACA	2	6	261363	261368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371859
4024	NC_004347	CCA	2	6	261430	261435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371859
4025	NC_004347	TAA	2	6	261450	261455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371859
4026	NC_004347	CGA	2	6	261474	261479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371859
4027	NC_004347	GCA	2	6	261494	261499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371859
4028	NC_004347	AAG	2	6	261525	261530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371859
4029	NC_004347	GC	3	6	261586	261591	0 %	0 %	50 %	50 %	24371859
4030	NC_004347	CACC	2	8	261598	261605	25 %	0 %	0 %	75 %	24371859
4031	NC_004347	AG	3	6	261645	261650	50 %	0 %	50 %	0 %	24371859
4032	NC_004347	TGA	2	6	261660	261665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371859
4033	NC_004347	GCC	2	6	261737	261742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371859
4034	NC_004347	AGC	2	6	261760	261765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371859
4035	NC_004347	CATTGA	2	12	261766	261777	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	24371859
4036	NC_004347	CGGC	2	8	261780	261787	0 %	0 %	50 %	50 %	24371859
4037	NC_004347	ATA	2	6	261800	261805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371859
4038	NC_004347	AAT	2	6	261905	261910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371859
4039	NC_004347	TAGT	2	8	261972	261979	25 %	50 %	25 %	0 %	24371860
4040	NC_004347	ACTC	2	8	261980	261987	25 %	25 %	0 %	50 %	24371860
4041	NC_004347	ATTC	2	8	262076	262083	25 %	50 %	0 %	25 %	24371860
4042	NC_004347	CTG	2	6	262084	262089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371860
4043	NC_004347	CGC	2	6	262159	262164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371860
4044	NC_004347	ACA	2	6	262213	262218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371860
4045	NC_004347	GTG	2	6	262294	262299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371860
4046	NC_004347	AGC	2	6	262383	262388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371860
4047	NC_004347	AAT	2	6	262472	262477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371860
4048	NC_004347	ATA	2	6	262545	262550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371860
4049	NC_004347	A	6	6	262622	262627	100 %	0 %	0 %	0 %	24371860
4050	NC_004347	ATC	2	6	262708	262713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371861
4051	NC_004347	CCA	2	6	262757	262762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371861
4052	NC_004347	TAA	2	6	262776	262781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371861
4053	NC_004347	TTC	2	6	262795	262800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371861
4054	NC_004347	TATC	2	8	262812	262819	25 %	50 %	0 %	25 %	24371861
4055	NC_004347	CTT	2	6	262923	262928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371861
4056	NC_004347	ATC	2	6	262975	262980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371861
4057	NC_004347	CAG	2	6	263019	263024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371861
4058	NC_004347	CAG	2	6	263062	263067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371861
4059	NC_004347	TAA	2	6	263161	263166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371861
4060	NC_004347	TCA	2	6	263237	263242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371861
4061	NC_004347	TTC	2	6	263254	263259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371861
4062	NC_004347	GT	3	6	263292	263297	0 %	50 %	50 %	0 %	24371861
4063	NC_004347	A	6	6	263648	263653	100 %	0 %	0 %	0 %	24371862
4064	NC_004347	CGC	2	6	263674	263679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371862
4065	NC_004347	GTCA	2	8	263689	263696	25 %	25 %	25 %	25 %	24371862
4066	NC_004347	TAA	2	6	263728	263733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371862
4067	NC_004347	CTG	2	6	263790	263795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371862
4068	NC_004347	CCA	2	6	263867	263872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371862
4069	NC_004347	GGT	2	6	263873	263878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371862
4070	NC_004347	C	6	6	264182	264187	0 %	0 %	0 %	100 %	24371863
4071	NC_004347	ATC	2	6	264199	264204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371863
4072	NC_004347	GCT	2	6	264248	264253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371863
4073	NC_004347	CGC	2	6	264319	264324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371863
4074	NC_004347	CAT	2	6	264390	264395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371863
4075	NC_004347	TCA	2	6	264453	264458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371863
4076	NC_004347	GAA	2	6	264538	264543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371863
4077	NC_004347	CTA	2	6	264555	264560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371863
4078	NC_004347	AAT	2	6	264563	264568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371863
4079	NC_004347	CTA	2	6	264696	264701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371863
4080	NC_004347	GCG	2	6	264722	264727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371863
4081	NC_004347	CAT	2	6	264820	264825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371863
4082	NC_004347	AGC	2	6	264877	264882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371863
4083	NC_004347	TTGAT	2	10	264989	264998	20 %	60 %	20 %	0 %	24371863
4084	NC_004347	GA	3	6	265003	265008	50 %	0 %	50 %	0 %	24371863
4085	NC_004347	ATC	2	6	265009	265014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371863
4086	NC_004347	GCTT	2	8	265015	265022	0 %	50 %	25 %	25 %	24371863
4087	NC_004347	TTCT	2	8	265054	265061	0 %	75 %	0 %	25 %	24371863
4088	NC_004347	TTCT	2	8	265105	265112	0 %	75 %	0 %	25 %	24371863
4089	NC_004347	GTTT	2	8	265151	265158	0 %	75 %	25 %	0 %	24371863
4090	NC_004347	CTT	2	6	265170	265175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371863
4091	NC_004347	CAA	2	6	265183	265188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371863
4092	NC_004347	GTC	2	6	265265	265270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371863
4093	NC_004347	ATA	2	6	265701	265706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371864
4094	NC_004347	CTT	2	6	265721	265726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371864
4095	NC_004347	T	6	6	265812	265817	0 %	100 %	0 %	0 %	24371864
4096	NC_004347	GTA	2	6	265830	265835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371864
4097	NC_004347	TGA	2	6	265859	265864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371864
4098	NC_004347	TCT	2	6	265912	265917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371864
4099	NC_004347	GCT	2	6	265955	265960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371864
4100	NC_004347	AGA	2	6	266021	266026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371864
4101	NC_004347	ATTG	2	8	266060	266067	25 %	50 %	25 %	0 %	24371864
4102	NC_004347	CTG	2	6	266131	266136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371864
4103	NC_004347	TGC	2	6	266158	266163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371864
4104	NC_004347	TCAG	2	8	266220	266227	25 %	25 %	25 %	25 %	24371864
4105	NC_004347	TGA	2	6	266251	266256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371864
4106	NC_004347	TGG	2	6	266327	266332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371864
4107	NC_004347	TGG	2	6	266349	266354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371864
4108	NC_004347	TGG	2	6	266382	266387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371864
4109	NC_004347	GT	3	6	266557	266562	0 %	50 %	50 %	0 %	24371864
4110	NC_004347	CATT	2	8	266574	266581	25 %	50 %	0 %	25 %	24371864
4111	NC_004347	TAT	2	6	266614	266619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371864
4112	NC_004347	GGT	2	6	266637	266642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371864
4113	NC_004347	TTTG	2	8	266651	266658	0 %	75 %	25 %	0 %	24371864
4114	NC_004347	AGC	2	6	266679	266684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371864
4115	NC_004347	CTGTT	2	10	266761	266770	0 %	60 %	20 %	20 %	24371864
4116	NC_004347	CTG	2	6	266787	266792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371864
4117	NC_004347	A	6	6	266910	266915	100 %	0 %	0 %	0 %	24371864
4118	NC_004347	TCG	2	6	266995	267000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371864
4119	NC_004347	TTGC	2	8	267022	267029	0 %	50 %	25 %	25 %	24371864
4120	NC_004347	CGC	2	6	267035	267040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371864
4121	NC_004347	ATT	2	6	267051	267056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371864
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4123	NC_004347	ATC	2	6	267147	267152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371864
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4245	NC_004347	CAAGC	2	10	281461	281470	40 %	0 %	20 %	40 %	24371873
4246	NC_004347	CAA	2	6	281544	281549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371874
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4248	NC_004347	GCT	2	6	281580	281585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371874
4249	NC_004347	CCG	2	6	281621	281626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371874
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4252	NC_004347	GCC	2	6	281698	281703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371874
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4258	NC_004347	TAG	2	6	282269	282274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371874
4259	NC_004347	CA	3	6	282300	282305	50 %	0 %	0 %	50 %	24371874
4260	NC_004347	CAG	3	9	282364	282372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371875
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4274	NC_004347	GTG	2	6	283124	283129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371875
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4309	NC_004347	ATG	2	6	285346	285351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371877
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4358	NC_004347	GCG	2	6	287907	287912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371878
4359	NC_004347	TAAA	2	8	288066	288073	75 %	25 %	0 %	0 %	24371878
4360	NC_004347	AAC	2	6	288112	288117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371878
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4363	NC_004347	ATGGTA	2	12	288205	288216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371878
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4365	NC_004347	GC	3	6	288306	288311	0 %	0 %	50 %	50 %	24371878
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4490	NC_004347	GAT	2	6	295787	295792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371886
4491	NC_004347	CAT	2	6	295828	295833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371886
4492	NC_004347	TC	3	6	295928	295933	0 %	50 %	0 %	50 %	24371886
4493	NC_004347	GAC	2	6	295935	295940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371886
4494	NC_004347	GC	3	6	296050	296055	0 %	0 %	50 %	50 %	24371886
4495	NC_004347	CTC	2	6	296079	296084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24371886
4496	NC_004347	AGG	2	6	296085	296090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24371886
4497	NC_004347	AGTC	2	8	296136	296143	25 %	25 %	25 %	25 %	24371886
4498	NC_004347	TTG	2	6	296183	296188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371886
4499	NC_004347	TTTGG	2	10	296202	296211	0 %	60 %	40 %	0 %	24371886
4500	NC_004347	CTTA	2	8	296252	296259	25 %	50 %	0 %	25 %	24371886

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