MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 72058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_004347	GTA	2	6	231360	231365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371820
3502	NC_004347	TCG	2	6	231380	231385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371820
3503	NC_004347	TGC	2	6	231470	231475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371820
3504	NC_004347	GAA	2	6	231597	231602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371820
3505	NC_004347	ATG	2	6	231618	231623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371820
3506	NC_004347	AAG	2	6	231631	231636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371820
3507	NC_004347	CTG	2	6	231640	231645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371820
3508	NC_004347	GTTC	2	8	231650	231657	0 %	50 %	25 %	25 %	24371820
3509	NC_004347	GCC	2	6	231666	231671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371820
3510	NC_004347	AAG	2	6	231688	231693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371820
3511	NC_004347	GTT	2	6	231813	231818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371821
3512	NC_004347	GCT	3	9	231861	231869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371821
3513	NC_004347	GTT	2	6	231870	231875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371821
3514	NC_004347	TGG	3	9	231878	231886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371821
3515	NC_004347	GCT	4	12	231891	231902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371821
3516	NC_004347	ACA	2	6	231949	231954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371821
3517	NC_004347	TTA	2	6	231964	231969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371821
3518	NC_004347	GTG	2	6	231979	231984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371821
3519	NC_004347	AAG	2	6	232003	232008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371821
3520	NC_004347	GCT	2	6	232026	232031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371821
3521	NC_004347	AAG	2	6	232045	232050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371821
3522	NC_004347	AGA	2	6	232061	232066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371821
3523	NC_004347	GAA	2	6	232079	232084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371821
3524	NC_004347	AAG	2	6	232388	232393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371822
3525	NC_004347	AAG	2	6	232472	232477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371822
3526	NC_004347	GCC	2	6	232517	232522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371822
3527	NC_004347	GTG	2	6	232629	232634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371822
3528	NC_004347	AGC	2	6	232690	232695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371822
3529	NC_004347	AAG	2	6	232725	232730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371822
3530	NC_004347	TGA	2	6	232752	232757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371822
3531	NC_004347	TTC	2	6	232832	232837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371822
3532	NC_004347	TCA	2	6	232862	232867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371822
3533	NC_004347	ATC	2	6	232892	232897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371822
3534	NC_004347	CGTA	2	8	232951	232958	25 %	25 %	25 %	25 %	24371822
3535	NC_004347	CAT	2	6	232987	232992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371822
3536	NC_004347	TACTC	2	10	233009	233018	20 %	40 %	0 %	40 %	24371822
3537	NC_004347	TTC	2	6	233036	233041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371822
3538	NC_004347	TCAAGA	2	12	233055	233066	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	24371822
3539	NC_004347	CGT	2	6	233168	233173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371822
3540	NC_004347	A	6	6	233202	233207	100 %	0 %	0 %	0 %	24371822
3541	NC_004347	TGC	2	6	233257	233262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371822
3542	NC_004347	AGA	2	6	233326	233331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371822
3543	NC_004347	ATG	2	6	233474	233479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371822
3544	NC_004347	CCA	2	6	233492	233497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371822
3545	NC_004347	GCA	2	6	233507	233512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371822
3546	NC_004347	TTC	2	6	233534	233539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371822
3547	NC_004347	GAA	2	6	233543	233548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371822
3548	NC_004347	GTCG	2	8	233567	233574	0 %	25 %	50 %	25 %	24371822
3549	NC_004347	CGT	2	6	233588	233593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371822
3550	NC_004347	TGA	2	6	233605	233610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371822
3551	NC_004347	AGA	2	6	233635	233640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371822
3552	NC_004347	GAA	2	6	233656	233661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371822
3553	NC_004347	ATT	2	6	233663	233668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371822
3554	NC_004347	CGA	2	6	233686	233691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371822
3555	NC_004347	CGT	2	6	233720	233725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371822
3556	NC_004347	TGGTC	2	10	233767	233776	0 %	40 %	40 %	20 %	24371822
3557	NC_004347	GC	3	6	233785	233790	0 %	0 %	50 %	50 %	24371822
3558	NC_004347	CGTG	2	8	233791	233798	0 %	25 %	50 %	25 %	24371822
3559	NC_004347	CTG	2	6	233865	233870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371822
3560	NC_004347	TTC	2	6	233882	233887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371822
3561	NC_004347	TTC	2	6	233890	233895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371822
3562	NC_004347	AAC	2	6	233921	233926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371822
3563	NC_004347	CGT	2	6	233951	233956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371822
3564	NC_004347	GGT	2	6	233975	233980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371822
3565	NC_004347	CTT	2	6	234124	234129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371822
3566	NC_004347	GAA	2	6	234197	234202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371822
3567	NC_004347	GTC	2	6	234276	234281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371822
3568	NC_004347	GC	3	6	234304	234309	0 %	0 %	50 %	50 %	24371822
3569	NC_004347	ATT	2	6	234347	234352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371822
3570	NC_004347	TGC	2	6	234358	234363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371822
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3572	NC_004347	TAG	2	6	234465	234470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371822
3573	NC_004347	ACGC	2	8	234484	234491	25 %	0 %	25 %	50 %	24371822
3574	NC_004347	GTT	2	6	234512	234517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371822
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3577	NC_004347	CAAC	2	8	234664	234671	50 %	0 %	0 %	50 %	24371822
3578	NC_004347	GTG	2	6	234705	234710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371822
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3581	NC_004347	CGA	2	6	234964	234969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371822
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3583	NC_004347	TGGT	2	8	235017	235024	0 %	50 %	50 %	0 %	24371822
3584	NC_004347	ACTC	2	8	235051	235058	25 %	25 %	0 %	50 %	24371822
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3587	NC_004347	CAT	2	6	235150	235155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371822
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3589	NC_004347	GAA	2	6	235271	235276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371822
3590	NC_004347	TTA	3	9	235301	235309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371822
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3592	NC_004347	CAAA	2	8	235387	235394	75 %	0 %	0 %	25 %	24371822
3593	NC_004347	AAG	2	6	235448	235453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371822
3594	NC_004347	CGC	2	6	235466	235471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371822
3595	NC_004347	TGA	2	6	235486	235491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371822
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3600	NC_004347	GCA	2	6	235840	235845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371822
3601	NC_004347	ATTC	2	8	235860	235867	25 %	50 %	0 %	25 %	24371822
3602	NC_004347	AAC	2	6	235895	235900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371822
3603	NC_004347	AAAGAG	2	12	235946	235957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371822
3604	NC_004347	TACATG	2	12	236060	236071	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	24371822
3605	NC_004347	GAC	2	6	236093	236098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371822
3606	NC_004347	CAA	2	6	236141	236146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371822
3607	NC_004347	GGT	2	6	236171	236176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371822
3608	NC_004347	TCG	2	6	236298	236303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371822
3609	NC_004347	TTA	2	6	236497	236502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371823
3610	NC_004347	AGCAA	2	10	236516	236525	60 %	0 %	20 %	20 %	24371823
3611	NC_004347	GAA	2	6	236530	236535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371823
3612	NC_004347	CTGAT	2	10	236567	236576	20 %	40 %	20 %	20 %	24371823
3613	NC_004347	AAG	2	6	236602	236607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371823
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3616	NC_004347	AGA	2	6	236970	236975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371823
3617	NC_004347	AGA	2	6	236994	236999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371823
3618	NC_004347	ATCA	2	8	237105	237112	50 %	25 %	0 %	25 %	24371823
3619	NC_004347	TCG	2	6	237123	237128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371823
3620	NC_004347	CAA	2	6	237180	237185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371823
3621	NC_004347	GAT	2	6	237195	237200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371823
3622	NC_004347	ACC	2	6	237222	237227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371823
3623	NC_004347	TGG	2	6	237255	237260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371823
3624	NC_004347	CGC	2	6	237295	237300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371823
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3626	NC_004347	GTC	2	6	237416	237421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371823
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3644	NC_004347	GAT	2	6	238575	238580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371823
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3649	NC_004347	TCG	2	6	238878	238883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371823
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3651	NC_004347	GCT	2	6	239073	239078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371823
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3654	NC_004347	GT	4	8	239165	239172	0 %	50 %	50 %	0 %	24371823
3655	NC_004347	GCT	2	6	239173	239178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371823
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3663	NC_004347	TTC	2	6	239421	239426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371823
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3686	NC_004347	A	6	6	241011	241016	100 %	0 %	0 %	0 %	24371824
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3718	NC_004347	GTA	2	6	242732	242737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371826
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3724	NC_004347	TGC	2	6	243028	243033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371826
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3729	NC_004347	CAT	2	6	243283	243288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371826
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3731	NC_004347	ATTC	2	8	243514	243521	25 %	50 %	0 %	25 %	24371826
3732	NC_004347	GAA	2	6	243553	243558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371826
3733	NC_004347	ATG	2	6	243621	243626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371826
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3736	NC_004347	TTGA	2	8	243791	243798	25 %	50 %	25 %	0 %	24371826
3737	NC_004347	GAT	2	6	243806	243811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371826
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3739	NC_004347	AAT	2	6	243829	243834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371826
3740	NC_004347	AGT	2	6	243841	243846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371826
3741	NC_004347	CTT	2	6	243906	243911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371826
3742	NC_004347	ATT	2	6	243965	243970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371826
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3988	NC_004347	AAGG	2	8	257973	257980	50 %	0 %	50 %	0 %	24371854
3989	NC_004347	AAG	2	6	257986	257991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371854
3990	NC_004347	GCA	2	6	258096	258101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371854
3991	NC_004347	ATG	2	6	258112	258117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371854
3992	NC_004347	CGTGGT	2	12	258201	258212	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	24371854
3993	NC_004347	CAGA	2	8	258237	258244	50 %	0 %	25 %	25 %	24371854
3994	NC_004347	GAT	2	6	258249	258254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371854
3995	NC_004347	CTT	2	6	258283	258288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371854
3996	NC_004347	AGC	2	6	258323	258328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371854
3997	NC_004347	CGT	2	6	258411	258416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371854
3998	NC_004347	CGTGA	2	10	258462	258471	20 %	20 %	40 %	20 %	24371854
3999	NC_004347	AGA	2	6	258488	258493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371854
4000	NC_004347	CGA	2	6	258530	258535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371854

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