MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 72058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_004347	TGGT	2	8	130770	130777	0 %	50 %	50 %	0 %	414561731
2003	NC_004347	TGA	2	6	130783	130788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561731
2004	NC_004347	CGC	2	6	130851	130856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414561731
2005	NC_004347	GTT	2	6	130880	130885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414561731
2006	NC_004347	GTT	2	6	130889	130894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414561731
2007	NC_004347	GCG	2	6	131043	131048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414561731
2008	NC_004347	GGA	2	6	131111	131116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414561731
2009	NC_004347	CGGG	2	8	131227	131234	0 %	0 %	75 %	25 %	414561731
2010	NC_004347	CGT	2	6	131235	131240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561731
2011	NC_004347	ATG	2	6	131394	131399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561731
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2013	NC_004347	GACT	2	8	131710	131717	25 %	25 %	25 %	25 %	24371722
2014	NC_004347	CGC	3	9	131743	131751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371722
2015	NC_004347	TTG	2	6	131775	131780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371722
2016	NC_004347	ATC	2	6	131826	131831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371722
2017	NC_004347	CGA	2	6	131845	131850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371722
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2022	NC_004347	GCG	2	6	132177	132182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371722
2023	NC_004347	T	6	6	132215	132220	0 %	100 %	0 %	0 %	24371722
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2050	NC_004347	TCTGGC	2	12	133530	133541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371726
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2057	NC_004347	CAT	2	6	133867	133872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371726
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2114	NC_004347	CG	3	6	137411	137416	0 %	0 %	50 %	50 %	24371730
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2124	NC_004347	ATGGTA	2	12	137949	137960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371730
2125	NC_004347	ATT	2	6	137981	137986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371730
2126	NC_004347	TGA	2	6	137994	137999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371730
2127	NC_004347	GAA	2	6	138020	138025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371730
2128	NC_004347	GGT	2	6	138029	138034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371730
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2131	NC_004347	A	6	6	138119	138124	100 %	0 %	0 %	0 %	24371730
2132	NC_004347	GCG	2	6	138155	138160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371730
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2140	NC_004347	TGC	2	6	139080	139085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371730
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2143	NC_004347	TGC	2	6	139213	139218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371730
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2230	NC_004347	TGA	2	6	143494	143499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371737
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2232	NC_004347	CGA	2	6	143539	143544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371737
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2234	NC_004347	CACG	2	8	143725	143732	25 %	0 %	25 %	50 %	24371737
2235	NC_004347	ATC	2	6	143795	143800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371737
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2237	NC_004347	GATT	2	8	143818	143825	25 %	50 %	25 %	0 %	24371737
2238	NC_004347	TTTG	2	8	143854	143861	0 %	75 %	25 %	0 %	24371737
2239	NC_004347	AG	3	6	143924	143929	50 %	0 %	50 %	0 %	24371737
2240	NC_004347	GCAGC	2	10	143994	144003	20 %	0 %	40 %	40 %	24371737
2241	NC_004347	ATC	2	6	144021	144026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371737
2242	NC_004347	TTGA	2	8	144075	144082	25 %	50 %	25 %	0 %	24371737
2243	NC_004347	GGC	2	6	144088	144093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371737
2244	NC_004347	TCGCTG	2	12	144108	144119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371737
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2246	NC_004347	GTC	2	6	144374	144379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371738
2247	NC_004347	GCG	2	6	144399	144404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371738
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2250	NC_004347	ACCG	2	8	144613	144620	25 %	0 %	25 %	50 %	24371738
2251	NC_004347	ACC	2	6	144625	144630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371738
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2253	NC_004347	TCG	2	6	144695	144700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371738
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2259	NC_004347	TTC	2	6	145033	145038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371738
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2339	NC_004347	TGTTA	2	10	151548	151557	20 %	60 %	20 %	0 %	414561735
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2360	NC_004347	AAGA	2	8	152914	152921	75 %	0 %	25 %	0 %	414561735
2361	NC_004347	ATGGTT	2	12	152945	152956	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	414561735
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2369	NC_004347	CTG	2	6	153808	153813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561736
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2491	NC_004347	AGCC	2	8	162475	162482	25 %	0 %	25 %	50 %	24371754
2492	NC_004347	AGAGGT	2	12	162525	162536	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	24371754
2493	NC_004347	TGT	2	6	162577	162582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371754
2494	NC_004347	CAA	2	6	162635	162640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371754
2495	NC_004347	CGG	2	6	162674	162679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371754
2496	NC_004347	TGG	2	6	162694	162699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371754
2497	NC_004347	CCT	2	6	162716	162721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24371754
2498	NC_004347	TGTT	2	8	162769	162776	0 %	75 %	25 %	0 %	24371754
2499	NC_004347	CAG	2	6	162789	162794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371754
2500	NC_004347	T	6	6	162805	162810	0 %	100 %	0 %	0 %	24371754

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