MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 72058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_004347	ATT	2	6	99504	99509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371691
1502	NC_004347	CTT	2	6	99541	99546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371691
1503	NC_004347	ATTA	2	8	99557	99564	50 %	50 %	0 %	0 %	24371691
1504	NC_004347	GTT	2	6	99582	99587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371691
1505	NC_004347	TTC	2	6	99632	99637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371691
1506	NC_004347	TAAT	2	8	99742	99749	50 %	50 %	0 %	0 %	24371691
1507	NC_004347	AGTT	2	8	99799	99806	25 %	50 %	25 %	0 %	24371691
1508	NC_004347	ATTT	2	8	99832	99839	25 %	75 %	0 %	0 %	24371691
1509	NC_004347	TA	3	6	99950	99955	50 %	50 %	0 %	0 %	24371691
1510	NC_004347	AGTA	2	8	100017	100024	50 %	25 %	25 %	0 %	24371691
1511	NC_004347	ATC	2	6	100082	100087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371691
1512	NC_004347	CAG	2	6	100386	100391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371692
1513	NC_004347	TCATTT	2	12	100460	100471	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	24371692
1514	NC_004347	ATTT	2	8	100609	100616	25 %	75 %	0 %	0 %	24371692
1515	NC_004347	CAA	2	6	100641	100646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371692
1516	NC_004347	CTAC	2	8	100688	100695	25 %	25 %	0 %	50 %	24371692
1517	NC_004347	AAAT	2	8	100739	100746	75 %	25 %	0 %	0 %	24371692
1518	NC_004347	ATA	2	6	100904	100909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371692
1519	NC_004347	ACC	2	6	101100	101105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371693
1520	NC_004347	ACA	2	6	101155	101160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371693
1521	NC_004347	AAG	2	6	101200	101205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371693
1522	NC_004347	T	6	6	101237	101242	0 %	100 %	0 %	0 %	24371693
1523	NC_004347	AAT	2	6	101247	101252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371693
1524	NC_004347	GCT	2	6	101257	101262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371693
1525	NC_004347	TAG	2	6	101310	101315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371693
1526	NC_004347	AAT	2	6	101322	101327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371693
1527	NC_004347	TAAA	2	8	101354	101361	75 %	25 %	0 %	0 %	24371693
1528	NC_004347	TAC	2	6	101369	101374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371693
1529	NC_004347	ATG	2	6	101377	101382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371693
1530	NC_004347	TAA	2	6	101388	101393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371693
1531	NC_004347	AAT	2	6	101397	101402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371693
1532	NC_004347	TAA	2	6	101418	101423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371693
1533	NC_004347	TAA	2	6	101481	101486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371693
1534	NC_004347	ATT	2	6	101523	101528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371693
1535	NC_004347	CTG	2	6	101579	101584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371693
1536	NC_004347	AT	3	6	101611	101616	50 %	50 %	0 %	0 %	24371693
1537	NC_004347	AT	3	6	101638	101643	50 %	50 %	0 %	0 %	24371693
1538	NC_004347	CCA	2	6	101645	101650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371693
1539	NC_004347	C	6	6	101656	101661	0 %	0 %	0 %	100 %	24371693
1540	NC_004347	AG	3	6	101817	101822	50 %	0 %	50 %	0 %	24371693
1541	NC_004347	CCA	3	9	101824	101832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371693
1542	NC_004347	GTA	2	6	101865	101870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371693
1543	NC_004347	ATG	2	6	102028	102033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371693
1544	NC_004347	CTG	2	6	102041	102046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371693
1545	NC_004347	TTG	2	6	102185	102190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371693
1546	NC_004347	TTC	2	6	102556	102561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371695
1547	NC_004347	TAA	2	6	102843	102848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371695
1548	NC_004347	GGT	2	6	102856	102861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371695
1549	NC_004347	GCA	2	6	102896	102901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371695
1550	NC_004347	GCC	2	6	103005	103010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371695
1551	NC_004347	GGC	2	6	103062	103067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371695
1552	NC_004347	CTG	2	6	103154	103159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371695
1553	NC_004347	GCA	2	6	103160	103165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371695
1554	NC_004347	GGC	2	6	103216	103221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371695
1555	NC_004347	GGT	2	6	103242	103247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371695
1556	NC_004347	TTCGGT	2	12	103305	103316	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	24371695
1557	NC_004347	CTT	2	6	103358	103363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371695
1558	NC_004347	TGC	2	6	103404	103409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371695
1559	NC_004347	GGCA	2	8	103424	103431	25 %	0 %	50 %	25 %	24371695
1560	NC_004347	GCC	2	6	103449	103454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371695
1561	NC_004347	ATCA	2	8	103548	103555	50 %	25 %	0 %	25 %	24371695
1562	NC_004347	ACA	2	6	103601	103606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371695
1563	NC_004347	TTG	2	6	103718	103723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371695
1564	NC_004347	GAA	2	6	104033	104038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371696
1565	NC_004347	GCTG	2	8	104065	104072	0 %	25 %	50 %	25 %	24371696
1566	NC_004347	TCC	2	6	104189	104194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24371696
1567	NC_004347	GCA	2	6	104254	104259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371696
1568	NC_004347	TTCA	2	8	104334	104341	25 %	50 %	0 %	25 %	24371696
1569	NC_004347	GAG	2	6	104381	104386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24371696
1570	NC_004347	ACT	2	6	104415	104420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371696
1571	NC_004347	CAC	2	6	104489	104494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371696
1572	NC_004347	GCA	2	6	104527	104532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371696
1573	NC_004347	CGC	2	6	104576	104581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371696
1574	NC_004347	GTG	2	6	104600	104605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371696
1575	NC_004347	GGT	2	6	104648	104653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371696
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1577	NC_004347	GCC	2	6	104823	104828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371697
1578	NC_004347	TAT	2	6	104830	104835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371697
1579	NC_004347	AAC	2	6	104903	104908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371697
1580	NC_004347	CGG	2	6	104953	104958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371697
1581	NC_004347	CG	3	6	104966	104971	0 %	0 %	50 %	50 %	24371697
1582	NC_004347	GTCG	2	8	105259	105266	0 %	25 %	50 %	25 %	24371697
1583	NC_004347	GGC	2	6	105281	105286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371697
1584	NC_004347	GGC	2	6	105314	105319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371697
1585	NC_004347	GGT	2	6	105323	105328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371697
1586	NC_004347	GCG	2	6	105333	105338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371697
1587	NC_004347	TGGC	2	8	105360	105367	0 %	25 %	50 %	25 %	24371697
1588	NC_004347	A	6	6	105437	105442	100 %	0 %	0 %	0 %	24371697
1589	NC_004347	TGA	2	6	105454	105459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371697
1590	NC_004347	TTA	2	6	105515	105520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371697
1591	NC_004347	CGT	2	6	105679	105684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371697
1592	NC_004347	GCG	2	6	105689	105694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371697
1593	NC_004347	GCG	2	6	105740	105745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371697
1594	NC_004347	CCGTT	2	10	105875	105884	0 %	40 %	20 %	40 %	24371697
1595	NC_004347	GC	3	6	105986	105991	0 %	0 %	50 %	50 %	24371697
1596	NC_004347	CTGC	2	8	106013	106020	0 %	25 %	25 %	50 %	24371697
1597	NC_004347	CTG	2	6	106027	106032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371697
1598	NC_004347	GCT	2	6	106222	106227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371697
1599	NC_004347	GCG	2	6	106239	106244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371697
1600	NC_004347	CAC	2	6	106262	106267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371697
1601	NC_004347	GGC	3	9	106268	106276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371697
1602	NC_004347	GT	3	6	106316	106321	0 %	50 %	50 %	0 %	24371697
1603	NC_004347	CCG	2	6	106335	106340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371697
1604	NC_004347	GCC	2	6	106603	106608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371698
1605	NC_004347	ACATCA	2	12	106648	106659	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	24371698
1606	NC_004347	GC	3	6	106660	106665	0 %	0 %	50 %	50 %	24371698
1607	NC_004347	CTG	2	6	106728	106733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371698
1608	NC_004347	GCA	2	6	106797	106802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371698
1609	NC_004347	AT	3	6	106814	106819	50 %	50 %	0 %	0 %	24371698
1610	NC_004347	TGA	2	6	106840	106845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371698
1611	NC_004347	ATT	2	6	107049	107054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371698
1612	NC_004347	GCC	2	6	107058	107063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371698
1613	NC_004347	GAAG	2	8	107108	107115	50 %	0 %	50 %	0 %	24371698
1614	NC_004347	CGCTGG	2	12	107152	107163	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	24371698
1615	NC_004347	TGC	2	6	107192	107197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371698
1616	NC_004347	GGC	2	6	107228	107233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371698
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1618	NC_004347	TGCT	2	8	107417	107424	0 %	50 %	25 %	25 %	24371698
1619	NC_004347	CGG	2	6	107522	107527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371698
1620	NC_004347	GCC	2	6	107556	107561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371698
1621	NC_004347	GCGATT	2	12	107571	107582	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	24371698
1622	NC_004347	CGT	2	6	107607	107612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371698
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1624	NC_004347	CGG	2	6	107669	107674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371698
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1987	NC_004347	A	6	6	129574	129579	100 %	0 %	0 %	0 %	24371719
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1991	NC_004347	ATC	3	9	130007	130015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371720
1992	NC_004347	ATTT	2	8	130114	130121	25 %	75 %	0 %	0 %	24371720
1993	NC_004347	TCG	2	6	130135	130140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371720
1994	NC_004347	TAG	2	6	130181	130186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371720
1995	NC_004347	TGA	2	6	130211	130216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371720
1996	NC_004347	TGC	2	6	130528	130533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561731
1997	NC_004347	TGG	2	6	130546	130551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414561731
1998	NC_004347	TAT	2	6	130568	130573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414561731
1999	NC_004347	CG	3	6	130590	130595	0 %	0 %	50 %	50 %	414561731
2000	NC_004347	CTG	2	6	130701	130706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561731

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