MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 72058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004347	TGC	2	6	29493	29498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371624
502	NC_004347	ATC	2	6	29519	29524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371624
503	NC_004347	ATCT	2	8	29657	29664	25 %	50 %	0 %	25 %	24371624
504	NC_004347	TTGG	2	8	29695	29702	0 %	50 %	50 %	0 %	24371624
505	NC_004347	CCATCG	2	12	29745	29756	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	24371624
506	NC_004347	ATG	2	6	29772	29777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371624
507	NC_004347	TG	3	6	29819	29824	0 %	50 %	50 %	0 %	24371624
508	NC_004347	CAATT	2	10	29937	29946	40 %	40 %	0 %	20 %	24371624
509	NC_004347	T	7	7	29965	29971	0 %	100 %	0 %	0 %	24371624
510	NC_004347	GAA	2	6	30008	30013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371624
511	NC_004347	ACC	2	6	30053	30058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371624
512	NC_004347	ATT	2	6	30094	30099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371624
513	NC_004347	TTA	2	6	30110	30115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371624
514	NC_004347	TGG	2	6	30133	30138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371624
515	NC_004347	TGG	2	6	30142	30147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371624
516	NC_004347	G	7	7	30157	30163	0 %	0 %	100 %	0 %	24371624
517	NC_004347	TTG	3	9	30188	30196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371624
518	NC_004347	TTCGA	2	10	30244	30253	20 %	40 %	20 %	20 %	24371624
519	NC_004347	T	7	7	30302	30308	0 %	100 %	0 %	0 %	24371624
520	NC_004347	GCTT	2	8	30395	30402	0 %	50 %	25 %	25 %	24371624
521	NC_004347	TGG	2	6	30477	30482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371624
522	NC_004347	GCTAT	2	10	30485	30494	20 %	40 %	20 %	20 %	24371624
523	NC_004347	TTG	2	6	30518	30523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371624
524	NC_004347	TAA	2	6	30568	30573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371625
525	NC_004347	GCGG	2	8	30635	30642	0 %	0 %	75 %	25 %	24371625
526	NC_004347	ATTG	2	8	30710	30717	25 %	50 %	25 %	0 %	24371625
527	NC_004347	T	7	7	30806	30812	0 %	100 %	0 %	0 %	24371625
528	NC_004347	TGG	2	6	30823	30828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371625
529	NC_004347	GATT	2	8	30932	30939	25 %	50 %	25 %	0 %	24371625
530	NC_004347	GACT	2	8	31292	31299	25 %	25 %	25 %	25 %	24371626
531	NC_004347	GAG	2	6	31687	31692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24371627
532	NC_004347	TGG	2	6	31813	31818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371627
533	NC_004347	T	6	6	31898	31903	0 %	100 %	0 %	0 %	24371627
534	NC_004347	T	6	6	31913	31918	0 %	100 %	0 %	0 %	24371627
535	NC_004347	AATA	2	8	31968	31975	75 %	25 %	0 %	0 %	24371627
536	NC_004347	ATT	2	6	32025	32030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371627
537	NC_004347	CTG	2	6	32175	32180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371627
538	NC_004347	TAA	2	6	32208	32213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371627
539	NC_004347	AG	3	6	32327	32332	50 %	0 %	50 %	0 %	24371628
540	NC_004347	AAT	2	6	32381	32386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371628
541	NC_004347	CGG	2	6	32416	32421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371628
542	NC_004347	CAA	2	6	32485	32490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371628
543	NC_004347	AT	3	6	32499	32504	50 %	50 %	0 %	0 %	24371628
544	NC_004347	AGC	2	6	32505	32510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371628
545	NC_004347	AGCG	2	8	32523	32530	25 %	0 %	50 %	25 %	24371628
546	NC_004347	GTT	2	6	32555	32560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371628
547	NC_004347	AGC	2	6	32674	32679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371628
548	NC_004347	AGCGC	2	10	32794	32803	20 %	0 %	40 %	40 %	24371628
549	NC_004347	AAAC	2	8	32857	32864	75 %	0 %	0 %	25 %	24371628
550	NC_004347	AAG	2	6	32877	32882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371628
551	NC_004347	ATC	2	6	32928	32933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371628
552	NC_004347	CAG	2	6	32945	32950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371628
553	NC_004347	ACC	2	6	32957	32962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371628
554	NC_004347	TGC	2	6	32963	32968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371628
555	NC_004347	ACA	2	6	32976	32981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371628
556	NC_004347	CGC	2	6	33008	33013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371628
557	NC_004347	ACC	2	6	33038	33043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371628
558	NC_004347	GA	3	6	33048	33053	50 %	0 %	50 %	0 %	24371628
559	NC_004347	AT	3	6	33133	33138	50 %	50 %	0 %	0 %	24371628
560	NC_004347	A	6	6	33143	33148	100 %	0 %	0 %	0 %	24371628
561	NC_004347	TG	3	6	33168	33173	0 %	50 %	50 %	0 %	24371628
562	NC_004347	CCA	2	6	33228	33233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371628
563	NC_004347	AAG	2	6	33240	33245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371628
564	NC_004347	CCA	2	6	33282	33287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371628
565	NC_004347	AACG	2	8	33300	33307	50 %	0 %	25 %	25 %	24371628
566	NC_004347	TGG	2	6	33364	33369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371628
567	NC_004347	CTTTG	2	10	33511	33520	0 %	60 %	20 %	20 %	24371628
568	NC_004347	ATAA	2	8	33666	33673	75 %	25 %	0 %	0 %	24371628
569	NC_004347	AGA	3	9	33708	33716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371629
570	NC_004347	CTT	2	6	33757	33762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371629
571	NC_004347	CTT	2	6	33828	33833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371629
572	NC_004347	CTA	2	6	33897	33902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371629
573	NC_004347	TGG	2	6	34020	34025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371629
574	NC_004347	CGATAT	2	12	34044	34055	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	24371629
575	NC_004347	CTT	2	6	34059	34064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371629
576	NC_004347	CTT	2	6	34108	34113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371629
577	NC_004347	TCG	2	6	34160	34165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371629
578	NC_004347	AATA	2	8	34177	34184	75 %	25 %	0 %	0 %	24371629
579	NC_004347	TTC	2	6	34204	34209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371629
580	NC_004347	CAC	2	6	34236	34241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371629
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582	NC_004347	AG	3	6	34270	34275	50 %	0 %	50 %	0 %	24371629
583	NC_004347	AGCC	2	8	34339	34346	25 %	0 %	25 %	50 %	24371629
584	NC_004347	GGC	2	6	34434	34439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371629
585	NC_004347	CGA	2	6	34446	34451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371629
586	NC_004347	TCA	3	9	34460	34468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371629
587	NC_004347	ACC	2	6	34735	34740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371629
588	NC_004347	GC	3	6	35003	35008	0 %	0 %	50 %	50 %	24371629
589	NC_004347	GTT	2	6	35044	35049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371629
590	NC_004347	CACC	2	8	35052	35059	25 %	0 %	0 %	75 %	24371629
591	NC_004347	TAA	2	6	35159	35164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371630
592	NC_004347	TGT	2	6	35175	35180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371630
593	NC_004347	CTG	2	6	35224	35229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371630
594	NC_004347	CAG	2	6	35354	35359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371630
595	NC_004347	CAGC	2	8	35385	35392	25 %	0 %	25 %	50 %	24371630
596	NC_004347	TCT	2	6	35393	35398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371630
597	NC_004347	CGG	2	6	35438	35443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371630
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599	NC_004347	TGT	2	6	35573	35578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371630
600	NC_004347	ACC	2	6	35659	35664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371630
601	NC_004347	G	6	6	35703	35708	0 %	0 %	100 %	0 %	24371630
602	NC_004347	TGC	2	6	35719	35724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371630
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608	NC_004347	G	6	6	35914	35919	0 %	0 %	100 %	0 %	24371630
609	NC_004347	AACC	2	8	35987	35994	50 %	0 %	0 %	50 %	24371630
610	NC_004347	GCG	2	6	36033	36038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371630
611	NC_004347	GCA	2	6	36060	36065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371630
612	NC_004347	AGC	2	6	36171	36176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371630
613	NC_004347	TGG	2	6	36191	36196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371630
614	NC_004347	TTTG	2	8	36204	36211	0 %	75 %	25 %	0 %	24371630
615	NC_004347	CAGC	2	8	36291	36298	25 %	0 %	25 %	50 %	24371630
616	NC_004347	ATT	2	6	36419	36424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371631
617	NC_004347	GTT	2	6	36432	36437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371631
618	NC_004347	TTTC	2	8	36501	36508	0 %	75 %	0 %	25 %	24371631
619	NC_004347	T	6	6	36567	36572	0 %	100 %	0 %	0 %	24371631
620	NC_004347	TGC	2	6	36597	36602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371631
621	NC_004347	TGC	2	6	36605	36610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371631
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626	NC_004347	CGCC	2	8	36986	36993	0 %	0 %	25 %	75 %	24371631
627	NC_004347	GC	3	6	36998	37003	0 %	0 %	50 %	50 %	24371631
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629	NC_004347	GCG	2	6	37070	37075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371631
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761	NC_004347	GAA	2	6	44813	44818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371641
762	NC_004347	TGA	2	6	44851	44856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371641
763	NC_004347	T	6	6	45004	45009	0 %	100 %	0 %	0 %	24371642
764	NC_004347	CGG	2	6	45126	45131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371642
765	NC_004347	CAT	2	6	45158	45163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371642
766	NC_004347	AAT	2	6	45186	45191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371642
767	NC_004347	GCA	2	6	45236	45241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371642
768	NC_004347	CAT	2	6	45263	45268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371642
769	NC_004347	AAT	2	6	45273	45278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371642
770	NC_004347	GTC	2	6	51735	51740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371644
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772	NC_004347	CAG	2	6	51775	51780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371644
773	NC_004347	TG	3	6	51824	51829	0 %	50 %	50 %	0 %	24371644
774	NC_004347	TGA	2	6	51838	51843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371644
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779	NC_004347	CGAT	2	8	52272	52279	25 %	25 %	25 %	25 %	24371645
780	NC_004347	GCA	2	6	52281	52286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371645
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782	NC_004347	CAA	2	6	52488	52493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371646
783	NC_004347	AAG	2	6	52552	52557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371646
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785	NC_004347	CAT	2	6	52661	52666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371646
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791	NC_004347	GCT	2	6	52887	52892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371646
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803	NC_004347	CTGATG	2	12	53519	53530	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	24371647
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835	NC_004347	TAT	2	6	55325	55330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414561722
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837	NC_004347	CTT	2	6	55388	55393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414561722
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841	NC_004347	CAT	2	6	55539	55544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414561722
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845	NC_004347	TTG	2	6	55671	55676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371649
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865	NC_004347	AT	3	6	57417	57422	50 %	50 %	0 %	0 %	24371650
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869	NC_004347	TCA	2	6	57531	57536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371650
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873	NC_004347	AAT	2	6	57655	57660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371650
874	NC_004347	GGT	2	6	57787	57792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371650
875	NC_004347	GGCA	2	8	57803	57810	25 %	0 %	50 %	25 %	24371650
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877	NC_004347	TTTC	2	8	58175	58182	0 %	75 %	0 %	25 %	24371652
878	NC_004347	AAGTT	2	10	58229	58238	40 %	40 %	20 %	0 %	24371652
879	NC_004347	TGACTG	2	12	58298	58309	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	24371652
880	NC_004347	CGG	2	6	58317	58322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371652
881	NC_004347	TG	3	6	58337	58342	0 %	50 %	50 %	0 %	24371652
882	NC_004347	AGCA	2	8	58349	58356	50 %	0 %	25 %	25 %	24371652
883	NC_004347	TCT	2	6	58361	58366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371652
884	NC_004347	CTGA	2	8	58378	58385	25 %	25 %	25 %	25 %	24371652
885	NC_004347	CTCA	2	8	58397	58404	25 %	25 %	0 %	50 %	24371652
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