MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 72058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_004347	CTT	2	6	361698	361703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371952
5502	NC_004347	ATGA	2	8	361772	361779	50 %	25 %	25 %	0 %	24371952
5503	NC_004347	TAA	2	6	361780	361785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371952
5504	NC_004347	ATCA	2	8	361795	361802	50 %	25 %	0 %	25 %	24371952
5505	NC_004347	GCC	2	6	362146	362151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371952
5506	NC_004347	ATT	2	6	362345	362350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371953
5507	NC_004347	T	6	6	362349	362354	0 %	100 %	0 %	0 %	24371953
5508	NC_004347	CAC	2	6	362384	362389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371953
5509	NC_004347	ACT	2	6	362491	362496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371953
5510	NC_004347	GC	3	6	362566	362571	0 %	0 %	50 %	50 %	24371953
5511	NC_004347	CTT	2	6	362573	362578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371953
5512	NC_004347	ACCCG	2	10	362746	362755	20 %	0 %	20 %	60 %	24371953
5513	NC_004347	A	6	6	362806	362811	100 %	0 %	0 %	0 %	24371953
5514	NC_004347	ATA	2	6	362853	362858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371953
5515	NC_004347	TGA	2	6	362882	362887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371953
5516	NC_004347	ATG	2	6	362977	362982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371953
5517	NC_004347	GCT	2	6	363141	363146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371953
5518	NC_004347	AGT	2	6	363163	363168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371953
5519	NC_004347	CTCG	2	8	363347	363354	0 %	25 %	25 %	50 %	24371953
5520	NC_004347	TAGC	2	8	363442	363449	25 %	25 %	25 %	25 %	24371953
5521	NC_004347	AAT	2	6	363619	363624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371953
5522	NC_004347	CAC	2	6	363689	363694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371953
5523	NC_004347	GGTAG	2	10	363732	363741	20 %	20 %	60 %	0 %	24371953
5524	NC_004347	GCC	2	6	363759	363764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371953
5525	NC_004347	TGGC	2	8	363927	363934	0 %	25 %	50 %	25 %	24371953
5526	NC_004347	AAAT	2	8	363937	363944	75 %	25 %	0 %	0 %	24371953
5527	NC_004347	AGC	2	6	364615	364620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371954
5528	NC_004347	TCCG	2	8	364682	364689	0 %	25 %	25 %	50 %	24371954
5529	NC_004347	A	6	6	365051	365056	100 %	0 %	0 %	0 %	24371954
5530	NC_004347	TAA	2	6	365126	365131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371954
5531	NC_004347	GTG	2	6	365134	365139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371954
5532	NC_004347	CCA	2	6	365237	365242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371954
5533	NC_004347	A	6	6	365273	365278	100 %	0 %	0 %	0 %	24371954
5534	NC_004347	AAG	2	6	365329	365334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371954
5535	NC_004347	ATT	2	6	365431	365436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371954
5536	NC_004347	ACCAAA	2	12	365517	365528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371954
5537	NC_004347	TTG	2	6	365553	365558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371954
5538	NC_004347	ATTT	2	8	365646	365653	25 %	75 %	0 %	0 %	24371954
5539	NC_004347	TTCA	2	8	367955	367962	25 %	50 %	0 %	25 %	24371956
5540	NC_004347	GCC	2	6	368024	368029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371956
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5542	NC_004347	ATC	2	6	368087	368092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371956
5543	NC_004347	T	6	6	368218	368223	0 %	100 %	0 %	0 %	24371956
5544	NC_004347	CGG	2	6	368413	368418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371957
5545	NC_004347	TGG	2	6	368451	368456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371957
5546	NC_004347	AT	3	6	368523	368528	50 %	50 %	0 %	0 %	24371957
5547	NC_004347	GCTC	2	8	368536	368543	0 %	25 %	25 %	50 %	24371957
5548	NC_004347	CAC	2	6	368579	368584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371957
5549	NC_004347	GCA	2	6	368639	368644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371957
5550	NC_004347	TGG	2	6	368691	368696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371957
5551	NC_004347	GGC	2	6	368890	368895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371957
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5553	NC_004347	AGC	2	6	368987	368992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371957
5554	NC_004347	GC	4	8	368999	369006	0 %	0 %	50 %	50 %	24371957
5555	NC_004347	TGGC	2	8	369047	369054	0 %	25 %	50 %	25 %	24371957
5556	NC_004347	CGG	2	6	369136	369141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371957
5557	NC_004347	AGG	2	6	369238	369243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24371957
5558	NC_004347	GTT	2	6	369303	369308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371957
5559	NC_004347	GCC	2	6	369329	369334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371957
5560	NC_004347	CATG	2	8	369517	369524	25 %	25 %	25 %	25 %	24371957
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5562	NC_004347	TTG	2	6	369624	369629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371957
5563	NC_004347	T	7	7	369645	369651	0 %	100 %	0 %	0 %	24371957
5564	NC_004347	GGC	2	6	369746	369751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371957
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5571	NC_004347	TCT	2	6	370110	370115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371957
5572	NC_004347	GCA	2	6	370147	370152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371957
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5574	NC_004347	CGC	2	6	370234	370239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371957
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5583	NC_004347	GTA	2	6	371119	371124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371959
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5589	NC_004347	CAC	2	6	371319	371324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371959
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5591	NC_004347	TTG	2	6	372055	372060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414561754
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5594	NC_004347	CTGCG	2	10	372169	372178	0 %	20 %	40 %	40 %	414561754
5595	NC_004347	GTG	3	9	372213	372221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414561754
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5599	NC_004347	CGC	2	6	372414	372419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414561754
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5601	NC_004347	GCG	2	6	372465	372470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414561754
5602	NC_004347	TGA	2	6	372794	372799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414561754
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5604	NC_004347	CGT	2	6	372870	372875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561754
5605	NC_004347	CGC	2	6	372876	372881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414561754
5606	NC_004347	TCG	2	6	372950	372955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561754
5607	NC_004347	GGC	2	6	373011	373016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414561754
5608	NC_004347	GCCG	2	8	373079	373086	0 %	0 %	50 %	50 %	414561754
5609	NC_004347	AAG	2	6	373087	373092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414561754
5610	NC_004347	TTCC	2	8	373096	373103	0 %	50 %	0 %	50 %	414561754
5611	NC_004347	TGC	2	6	373121	373126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561754
5612	NC_004347	ATT	2	6	373191	373196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414561754
5613	NC_004347	TAA	2	6	373283	373288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414561754
5614	NC_004347	TTGC	2	8	373320	373327	0 %	50 %	25 %	25 %	414561754
5615	NC_004347	CGC	2	6	373354	373359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414561754
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5619	NC_004347	TGG	2	6	373705	373710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371961
5620	NC_004347	GC	3	6	373795	373800	0 %	0 %	50 %	50 %	24371961
5621	NC_004347	GAT	2	6	374024	374029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371961
5622	NC_004347	GAT	2	6	374092	374097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371961
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5995	NC_004347	CTG	2	6	400205	400210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561759
5996	NC_004347	CTTT	2	8	400416	400423	0 %	75 %	0 %	25 %	414561760
5997	NC_004347	TCG	2	6	400428	400433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561760
5998	NC_004347	GTT	2	6	400441	400446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414561760
5999	NC_004347	ATT	2	6	400486	400491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414561760
6000	NC_004347	GCT	2	6	400505	400510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561760

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