MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 72058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_004347	CAA	2	6	296297	296302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371886
4502	NC_004347	GGC	2	6	296362	296367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371886
4503	NC_004347	ATGA	2	8	296423	296430	50 %	25 %	25 %	0 %	24371886
4504	NC_004347	AAC	2	6	296433	296438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371886
4505	NC_004347	AGA	2	6	296470	296475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371886
4506	NC_004347	GCG	2	6	296701	296706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371886
4507	NC_004347	A	6	6	296927	296932	100 %	0 %	0 %	0 %	24371887
4508	NC_004347	CGG	2	6	296956	296961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371887
4509	NC_004347	TGG	2	6	296973	296978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371887
4510	NC_004347	ACT	2	6	296991	296996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371887
4511	NC_004347	TTG	2	6	297027	297032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371887
4512	NC_004347	ATCA	2	8	297086	297093	50 %	25 %	0 %	25 %	24371887
4513	NC_004347	ACA	2	6	297111	297116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371887
4514	NC_004347	AAAG	2	8	297122	297129	75 %	0 %	25 %	0 %	24371887
4515	NC_004347	AT	3	6	297139	297144	50 %	50 %	0 %	0 %	24371887
4516	NC_004347	GCT	2	6	297149	297154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371887
4517	NC_004347	AAG	2	6	297155	297160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371887
4518	NC_004347	TGTT	2	8	297162	297169	0 %	75 %	25 %	0 %	24371887
4519	NC_004347	GATGA	2	10	297170	297179	40 %	20 %	40 %	0 %	24371887
4520	NC_004347	CTA	2	6	297193	297198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371887
4521	NC_004347	GACT	2	8	297208	297215	25 %	25 %	25 %	25 %	24371887
4522	NC_004347	GGC	2	6	297308	297313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371887
4523	NC_004347	A	6	6	297338	297343	100 %	0 %	0 %	0 %	24371887
4524	NC_004347	AAAG	2	8	297379	297386	75 %	0 %	25 %	0 %	24371887
4525	NC_004347	GC	3	6	297391	297396	0 %	0 %	50 %	50 %	24371887
4526	NC_004347	GTGAT	2	10	297447	297456	20 %	40 %	40 %	0 %	24371887
4527	NC_004347	GAT	2	6	297533	297538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371887
4528	NC_004347	GC	3	6	297551	297556	0 %	0 %	50 %	50 %	24371887
4529	NC_004347	TGT	2	6	297592	297597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371887
4530	NC_004347	CGA	2	6	297709	297714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371887
4531	NC_004347	GGC	2	6	297934	297939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414561744
4532	NC_004347	TCA	2	6	298012	298017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371889
4533	NC_004347	TGA	2	6	298030	298035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371889
4534	NC_004347	AGT	2	6	298042	298047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24371889
4535	NC_004347	AAGT	2	8	298050	298057	50 %	25 %	25 %	0 %	24371889
4536	NC_004347	GCT	2	6	298152	298157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371889
4537	NC_004347	TTGC	2	8	298213	298220	0 %	50 %	25 %	25 %	24371889
4538	NC_004347	GTT	2	6	298226	298231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371889
4539	NC_004347	CAT	2	6	298278	298283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371889
4540	NC_004347	TG	3	6	298313	298318	0 %	50 %	50 %	0 %	24371889
4541	NC_004347	CCG	2	6	298640	298645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371890
4542	NC_004347	TGATG	2	10	298710	298719	20 %	40 %	40 %	0 %	24371890
4543	NC_004347	CCG	2	6	298790	298795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371890
4544	NC_004347	TAT	2	6	298866	298871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371890
4545	NC_004347	CTG	2	6	299014	299019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371890
4546	NC_004347	TGG	2	6	299040	299045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371890
4547	NC_004347	TGG	2	6	299136	299141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371890
4548	NC_004347	GCT	2	6	299170	299175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371890
4549	NC_004347	AAT	2	6	299279	299284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24371890
4550	NC_004347	GGC	2	6	299366	299371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371891
4551	NC_004347	TGGG	2	8	299421	299428	0 %	25 %	75 %	0 %	24371891
4552	NC_004347	GCGCC	2	10	299450	299459	0 %	0 %	40 %	60 %	24371891
4553	NC_004347	GCC	2	6	299505	299510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24371891
4554	NC_004347	CAC	2	6	299526	299531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371891
4555	NC_004347	GTG	2	6	299622	299627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371891
4556	NC_004347	GCT	2	6	299657	299662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371891
4557	NC_004347	CTT	2	6	299684	299689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371891
4558	NC_004347	TTA	2	6	299754	299759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371891
4559	NC_004347	GTT	2	6	299786	299791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371891
4560	NC_004347	TGG	2	6	299794	299799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24371891
4561	NC_004347	GCG	2	6	299823	299828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371891
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4563	NC_004347	TG	3	6	300120	300125	0 %	50 %	50 %	0 %	24371892
4564	NC_004347	GCG	2	6	300211	300216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371892
4565	NC_004347	GCA	2	6	300260	300265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24371892
4566	NC_004347	TGAGC	2	10	300308	300317	20 %	20 %	40 %	20 %	24371892
4567	NC_004347	CAA	2	6	300356	300361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371892
4568	NC_004347	GGC	2	6	300398	300403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24371892
4569	NC_004347	CTG	2	6	300411	300416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371892
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4571	NC_004347	GAA	2	6	300581	300586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371892
4572	NC_004347	AAC	2	6	300612	300617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24371892
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4581	NC_004347	CCA	2	6	301225	301230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371893
4582	NC_004347	CCA	2	6	301255	301260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371893
4583	NC_004347	GGGCGA	2	12	301270	301281	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	24371893
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4588	NC_004347	TTG	2	6	301517	301522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371893
4589	NC_004347	TTGA	2	8	301535	301542	25 %	50 %	25 %	0 %	24371893
4590	NC_004347	GTT	2	6	301702	301707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371893
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4592	NC_004347	GAGT	2	8	301795	301802	25 %	25 %	50 %	0 %	24371893
4593	NC_004347	GCT	2	6	301831	301836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371893
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4596	NC_004347	AGGG	2	8	301963	301970	25 %	0 %	75 %	0 %	24371893
4597	NC_004347	GTT	2	6	302114	302119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371894
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4599	NC_004347	T	7	7	302340	302346	0 %	100 %	0 %	0 %	24371894
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4603	NC_004347	ATT	2	6	302414	302419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24371894
4604	NC_004347	CAC	2	6	302452	302457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24371894
4605	NC_004347	A	6	6	302588	302593	100 %	0 %	0 %	0 %	24371894
4606	NC_004347	CTG	2	6	302639	302644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371894
4607	NC_004347	ACT	2	6	302719	302724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371894
4608	NC_004347	TG	3	6	302759	302764	0 %	50 %	50 %	0 %	24371894
4609	NC_004347	TCG	2	6	302773	302778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24371894
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4611	NC_004347	TCT	2	6	302832	302837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24371894
4612	NC_004347	GGCT	2	8	302840	302847	0 %	25 %	50 %	25 %	24371894
4613	NC_004347	GTT	2	6	302848	302853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24371894
4614	NC_004347	GTTG	2	8	302877	302884	0 %	50 %	50 %	0 %	24371894
4615	NC_004347	GGCGC	2	10	302885	302894	0 %	0 %	60 %	40 %	24371894
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4618	NC_004347	AT	3	6	303051	303056	50 %	50 %	0 %	0 %	24371895
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4623	NC_004347	ATC	2	6	303479	303484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24371895
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4742	NC_004347	TAT	2	6	312195	312200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414561745
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4744	NC_004347	CAA	2	6	312216	312221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414561745
4745	NC_004347	TCG	2	6	312281	312286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414561745
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4995	NC_004347	CAGT	2	8	328158	328165	25 %	25 %	25 %	25 %	24371919
4996	NC_004347	TG	3	6	328172	328177	0 %	50 %	50 %	0 %	24371919
4997	NC_004347	GCCAT	2	10	328486	328495	20 %	20 %	20 %	40 %	24371920
4998	NC_004347	GATT	2	8	328516	328523	25 %	50 %	25 %	0 %	24371920
4999	NC_004347	AGA	2	6	328667	328672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24371920
5000	NC_004347	AT	3	6	328741	328746	50 %	50 %	0 %	0 %	24371920

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