MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 52307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004337	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111451
2	NC_004337	ACC	3	9	214	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111451
3	NC_004337	CGG	2	6	353	358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479580
4	NC_004337	TGG	2	6	475	480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479580
5	NC_004337	GAT	2	6	482	487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479580
6	NC_004337	CGC	3	9	569	577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56479580
7	NC_004337	TCG	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479580
8	NC_004337	TTG	2	6	663	668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56479580
9	NC_004337	CTG	2	6	795	800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479580
10	NC_004337	CCG	2	6	848	853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56479580
11	NC_004337	CCG	2	6	907	912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56479580
12	NC_004337	TGG	2	6	931	936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479580
13	NC_004337	ACT	2	6	958	963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56479580
14	NC_004337	CGG	2	6	967	972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479580
15	NC_004337	TTG	2	6	998	1003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56479580
16	NC_004337	GTT	2	6	1067	1072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56479580
17	NC_004337	TTC	2	6	1126	1131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56479580
18	NC_004337	TGA	2	6	1232	1237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479580
19	NC_004337	GGC	2	6	1328	1333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479580
20	NC_004337	TGC	2	6	1343	1348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479580
21	NC_004337	GTG	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479580
22	NC_004337	ATC	2	6	1388	1393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56479580
23	NC_004337	AAG	2	6	1483	1488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56479580
24	NC_004337	GGT	2	6	1535	1540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479580
25	NC_004337	TCT	2	6	1635	1640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56479580
26	NC_004337	GAT	2	6	1671	1676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479580
27	NC_004337	TCA	2	6	1700	1705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56479580
28	NC_004337	GCT	2	6	1772	1777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479580
29	NC_004337	GCG	2	6	1837	1842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479580
30	NC_004337	GAA	2	6	1902	1907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56479580
31	NC_004337	ATC	2	6	1966	1971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56479580
32	NC_004337	TTG	2	6	1987	1992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56479580
33	NC_004337	TCG	2	6	2085	2090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479580
34	NC_004337	ATC	2	6	2101	2106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56479580
35	NC_004337	GCG	2	6	2118	2123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479580
36	NC_004337	TGA	2	6	2213	2218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479580
37	NC_004337	GAT	2	6	2349	2354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479580
38	NC_004337	TGC	2	6	2446	2451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479580
39	NC_004337	CGA	2	6	2510	2515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479580
40	NC_004337	TGA	2	6	2546	2551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479580
41	NC_004337	TGA	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479580
42	NC_004337	TAT	2	6	2685	2690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56479580
43	NC_004337	TGC	2	6	2707	2712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479580
44	NC_004337	GCG	2	6	2863	2868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111453
45	NC_004337	GGC	2	6	2916	2921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111453
46	NC_004337	CAA	2	6	2937	2942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111453
47	NC_004337	GGT	2	6	3105	3110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111453
48	NC_004337	GCA	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111453
49	NC_004337	TGG	2	6	3243	3248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111453
50	NC_004337	TGA	2	6	3257	3262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111453
51	NC_004337	GAA	2	6	3265	3270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111453
52	NC_004337	CAT	2	6	3276	3281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111453
53	NC_004337	TGA	2	6	3303	3308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111453
54	NC_004337	CGC	2	6	3385	3390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111453
55	NC_004337	TGA	2	6	3473	3478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111453
56	NC_004337	CGG	2	6	3704	3709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111453
57	NC_004337	TGA	2	6	3861	3866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111454
58	NC_004337	TGA	2	6	3924	3929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111454
59	NC_004337	CGG	2	6	4059	4064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111454
60	NC_004337	GAT	2	6	4099	4104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111454
61	NC_004337	GGC	2	6	4252	4257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111454
62	NC_004337	TGA	3	9	4323	4331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111454
63	NC_004337	CTA	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111454
64	NC_004337	AGG	2	6	4436	4441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24111454
65	NC_004337	CGG	2	6	4493	4498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111454
66	NC_004337	CTG	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111454
67	NC_004337	TGC	2	6	4542	4547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111454
68	NC_004337	ACG	2	6	4583	4588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111454
69	NC_004337	AAC	2	6	4651	4656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111454
70	NC_004337	GTT	2	6	4674	4679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111454
71	NC_004337	CCG	2	6	4680	4685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111454
72	NC_004337	GAT	2	6	4726	4731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111454
73	NC_004337	CCG	2	6	4973	4978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111454
74	NC_004337	TGA	3	9	5000	5008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111454
75	NC_004337	ATC	2	6	5009	5014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111454
76	NC_004337	GCA	2	6	5290	5295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479581
77	NC_004337	TGG	2	6	5398	5403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479581
78	NC_004337	ACA	2	6	5406	5411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56479581
79	NC_004337	CCG	2	6	5449	5454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56479581
80	NC_004337	CCG	2	6	5458	5463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56479581
81	NC_004337	CCA	2	6	5466	5471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56479581
82	NC_004337	CTC	2	6	5480	5485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56479581
83	NC_004337	ATC	2	6	5489	5494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56479581
84	NC_004337	CGG	2	6	5496	5501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479581
85	NC_004337	GCT	2	6	5687	5692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111456
86	NC_004337	GGA	2	6	5724	5729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24111456
87	NC_004337	TCA	2	6	5734	5739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111456
88	NC_004337	AAG	2	6	5740	5745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111456
89	NC_004337	AAT	2	6	5799	5804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111456
90	NC_004337	TCA	2	6	5813	5818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111456
91	NC_004337	TGA	2	6	5846	5851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111456
92	NC_004337	TTC	2	6	5866	5871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111456
93	NC_004337	TTC	2	6	5911	5916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111456
94	NC_004337	CAC	2	6	5958	5963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111456
95	NC_004337	TGC	2	6	5976	5981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111456
96	NC_004337	TTG	2	6	5998	6003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111456
97	NC_004337	TGA	2	6	6005	6010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111456
98	NC_004337	CTG	2	6	6360	6365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111456
99	NC_004337	GTG	2	6	6400	6405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111456
100	NC_004337	TGG	2	6	8085	8090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111457
101	NC_004337	CGG	2	6	8150	8155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111457
102	NC_004337	CGT	2	6	8170	8175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111457
103	NC_004337	ATC	2	6	8179	8184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111457
104	NC_004337	ACC	2	6	8270	8275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111457
105	NC_004337	CAG	2	6	8417	8422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479582
106	NC_004337	CAG	2	6	8438	8443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479582
107	NC_004337	TGC	2	6	8659	8664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479582
108	NC_004337	AAG	2	6	8679	8684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56479582
109	NC_004337	CTG	2	6	8705	8710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479582
110	NC_004337	TTG	2	6	8769	8774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56479582
111	NC_004337	AGA	2	6	8830	8835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56479582
112	NC_004337	TAC	2	6	8870	8875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56479582
113	NC_004337	CTG	2	6	8978	8983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479582
114	NC_004337	GCA	2	6	9085	9090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479582
115	NC_004337	CTG	2	6	9182	9187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479582
116	NC_004337	TGA	2	6	9303	9308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479583
117	NC_004337	GCG	2	6	9354	9359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479583
118	NC_004337	GAA	2	6	9389	9394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56479583
119	NC_004337	ATC	2	6	9461	9466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56479583
120	NC_004337	TGG	2	6	9486	9491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479583
121	NC_004337	CAC	2	6	9517	9522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56479583
122	NC_004337	CGT	2	6	9542	9547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479583
123	NC_004337	TGC	2	6	9847	9852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479583
124	NC_004337	GAT	2	6	10044	10049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111460
125	NC_004337	CAG	2	6	10080	10085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111460
126	NC_004337	GAA	2	6	10149	10154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111460
127	NC_004337	CAG	2	6	10242	10247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111460
128	NC_004337	CAG	2	6	10326	10331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111460
129	NC_004337	GCC	2	6	10353	10358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111460
130	NC_004337	AAT	2	6	10380	10385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111460
131	NC_004337	TGG	2	6	10430	10435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111460
132	NC_004337	TGC	2	6	10716	10721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111461
133	NC_004337	TGC	2	6	10747	10752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111461
134	NC_004337	TGC	2	6	10810	10815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111461
135	NC_004337	AAT	2	6	10874	10879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111461
136	NC_004337	TCA	2	6	10887	10892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111461
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256	NC_004337	AAG	2	6	20405	20410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111470
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500	NC_004337	CCA	2	6	38829	38834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111485

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