MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 73780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_004337	TGG	2	6	232611	232616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111649
4002	NC_004337	CGG	2	6	232628	232633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111649
4003	NC_004337	CAG	2	6	232643	232648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111649
4004	NC_004337	CGCCA	2	10	232661	232670	20 %	0 %	20 %	60 %	24111649
4005	NC_004337	A	6	6	232713	232718	100 %	0 %	0 %	0 %	24111649
4006	NC_004337	GCA	2	6	232750	232755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111649
4007	NC_004337	GCA	2	6	232789	232794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111649
4008	NC_004337	GC	3	6	232852	232857	0 %	0 %	50 %	50 %	24111649
4009	NC_004337	GCCA	2	8	232877	232884	25 %	0 %	25 %	50 %	24111649
4010	NC_004337	CTC	2	6	232937	232942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24111649
4011	NC_004337	CTGA	2	8	232982	232989	25 %	25 %	25 %	25 %	24111649
4012	NC_004337	GCAGG	2	10	233065	233074	20 %	0 %	60 %	20 %	24111649
4013	NC_004337	GCG	2	6	233088	233093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111649
4014	NC_004337	GCT	2	6	233141	233146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111649
4015	NC_004337	GGCA	2	8	233155	233162	25 %	0 %	50 %	25 %	24111649
4016	NC_004337	CG	3	6	233203	233208	0 %	0 %	50 %	50 %	24111649
4017	NC_004337	CTT	2	6	233236	233241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111649
4018	NC_004337	CAG	2	6	233312	233317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111649
4019	NC_004337	TGCG	2	8	233358	233365	0 %	25 %	50 %	25 %	24111649
4020	NC_004337	GCG	2	6	233445	233450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111649
4021	NC_004337	GGC	2	6	233465	233470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111649
4022	NC_004337	GTA	2	6	233513	233518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111649
4023	NC_004337	A	7	7	233557	233563	100 %	0 %	0 %	0 %	56479627
4024	NC_004337	GC	3	6	233590	233595	0 %	0 %	50 %	50 %	56479627
4025	NC_004337	CGC	2	6	233638	233643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56479627
4026	NC_004337	GGC	2	6	233677	233682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479627
4027	NC_004337	GAT	2	6	233699	233704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479627
4028	NC_004337	GGC	2	6	233811	233816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479627
4029	NC_004337	GCA	2	6	233859	233864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479627
4030	NC_004337	ATC	2	6	233870	233875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56479627
4031	NC_004337	CGG	2	6	233913	233918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479627
4032	NC_004337	CGT	2	6	233980	233985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479627
4033	NC_004337	CA	3	6	233986	233991	50 %	0 %	0 %	50 %	56479627
4034	NC_004337	GCA	2	6	234010	234015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479627
4035	NC_004337	ATT	2	6	235875	235880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111654
4036	NC_004337	CA	3	6	235916	235921	50 %	0 %	0 %	50 %	24111654
4037	NC_004337	CAG	2	6	235941	235946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111654
4038	NC_004337	AGC	2	6	235997	236002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111654
4039	NC_004337	AGGA	2	8	236035	236042	50 %	0 %	50 %	0 %	24111654
4040	NC_004337	CTG	2	6	236050	236055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111654
4041	NC_004337	GCC	2	6	236058	236063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111654
4042	NC_004337	GTT	2	6	236073	236078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111654
4043	NC_004337	TGC	2	6	236093	236098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111654
4044	NC_004337	CTC	2	6	236160	236165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24111654
4045	NC_004337	AAG	2	6	236167	236172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111654
4046	NC_004337	A	6	6	236192	236197	100 %	0 %	0 %	0 %	24111654
4047	NC_004337	TGGA	2	8	236309	236316	25 %	25 %	50 %	0 %	24111655
4048	NC_004337	GCC	2	6	236319	236324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111655
4049	NC_004337	GTC	2	6	236328	236333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111655
4050	NC_004337	TGA	2	6	236338	236343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111655
4051	NC_004337	TCG	2	6	236401	236406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111655
4052	NC_004337	GCT	2	6	236416	236421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111655
4053	NC_004337	CTG	2	6	236517	236522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111655
4054	NC_004337	GAAA	2	8	236563	236570	75 %	0 %	25 %	0 %	24111655
4055	NC_004337	CTG	2	6	236605	236610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111655
4056	NC_004337	GA	4	8	236619	236626	50 %	0 %	50 %	0 %	24111655
4057	NC_004337	CTG	2	6	236650	236655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111655
4058	NC_004337	GCACT	2	10	236666	236675	20 %	20 %	20 %	40 %	24111655
4059	NC_004337	CGG	2	6	236689	236694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111655
4060	NC_004337	CGC	2	6	236741	236746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111655
4061	NC_004337	CGT	2	6	236763	236768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111655
4062	NC_004337	AGTGG	2	10	236773	236782	20 %	20 %	60 %	0 %	24111655
4063	NC_004337	GAA	2	6	236854	236859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111655
4064	NC_004337	CGG	2	6	236862	236867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111655
4065	NC_004337	AG	3	6	236896	236901	50 %	0 %	50 %	0 %	24111655
4066	NC_004337	GCA	2	6	236963	236968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111655
4067	NC_004337	TCGC	2	8	237031	237038	0 %	25 %	25 %	50 %	24111655
4068	NC_004337	CTT	2	6	237163	237168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111656
4069	NC_004337	TCT	2	6	237218	237223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111656
4070	NC_004337	GTT	2	6	237241	237246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111656
4071	NC_004337	TCT	2	6	237333	237338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111656
4072	NC_004337	ACG	2	6	237390	237395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111656
4073	NC_004337	TTC	2	6	237436	237441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111656
4074	NC_004337	CCA	2	6	238859	238864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111660
4075	NC_004337	CAA	2	6	238897	238902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111660
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4078	NC_004337	CGA	2	6	239035	239040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111660
4079	NC_004337	ATC	2	6	239054	239059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111660
4080	NC_004337	CAT	2	6	239061	239066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111660
4081	NC_004337	GA	4	8	239078	239085	50 %	0 %	50 %	0 %	24111660
4082	NC_004337	GGAT	2	8	239199	239206	25 %	25 %	50 %	0 %	24111660
4083	NC_004337	TGG	2	6	239243	239248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111660
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4085	NC_004337	GAAA	2	8	239293	239300	75 %	0 %	25 %	0 %	24111660
4086	NC_004337	A	6	6	239298	239303	100 %	0 %	0 %	0 %	24111660
4087	NC_004337	ATG	2	6	239367	239372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111660
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4090	NC_004337	ATG	2	6	239435	239440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111660
4091	NC_004337	ATG	2	6	239510	239515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111660
4092	NC_004337	GAG	2	6	239561	239566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24111660
4093	NC_004337	TGA	2	6	239584	239589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111660
4094	NC_004337	ACG	3	9	239613	239621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111660
4095	NC_004337	CCG	2	6	239628	239633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111660
4096	NC_004337	ATG	2	6	239648	239653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111660
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4100	NC_004337	CGA	2	6	239749	239754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479629
4101	NC_004337	GCGA	2	8	239801	239808	25 %	0 %	50 %	25 %	56479629
4102	NC_004337	ACTAC	2	10	239880	239889	40 %	20 %	0 %	40 %	56479629
4103	NC_004337	TGT	2	6	239914	239919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56479629
4104	NC_004337	CAA	2	6	240150	240155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56479629
4105	NC_004337	CAA	2	6	240157	240162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56479629
4106	NC_004337	AGCA	2	8	240224	240231	50 %	0 %	25 %	25 %	56479629
4107	NC_004337	ATG	2	6	240384	240389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479629
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4109	NC_004337	GGAGAA	2	12	240424	240435	50 %	0 %	50 %	0 %	56479629
4110	NC_004337	CAG	2	6	240485	240490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479629
4111	NC_004337	CGA	2	6	240508	240513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479629
4112	NC_004337	GT	3	6	240567	240572	0 %	50 %	50 %	0 %	56479629
4113	NC_004337	ATC	2	6	240581	240586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56479629
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4115	NC_004337	TTG	2	6	240762	240767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56479629
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4117	NC_004337	CTT	2	6	240793	240798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56479629
4118	NC_004337	CGG	2	6	240832	240837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479629
4119	NC_004337	ATG	2	6	240840	240845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479629
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4121	NC_004337	CCA	2	6	240966	240971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56479629
4122	NC_004337	AAG	2	6	240981	240986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56479629
4123	NC_004337	GGC	2	6	241012	241017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479629
4124	NC_004337	TCAA	2	8	241044	241051	50 %	25 %	0 %	25 %	56479629
4125	NC_004337	GATGCT	2	12	241390	241401	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	56479629
4126	NC_004337	GCT	2	6	241414	241419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479629
4127	NC_004337	GAT	2	6	241438	241443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479629
4128	NC_004337	TGA	2	6	241470	241475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479629
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4131	NC_004337	GCA	2	6	241519	241524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479629
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4151	NC_004337	GGC	2	6	242414	242419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111662
4152	NC_004337	GCC	2	6	242498	242503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111662
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4155	NC_004337	ACTC	2	8	242630	242637	25 %	25 %	0 %	50 %	24111662
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4491	NC_004337	CAGC	2	8	262810	262817	25 %	0 %	25 %	50 %	24111684
4492	NC_004337	TCA	2	6	262859	262864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111684
4493	NC_004337	TCA	2	6	262977	262982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111684
4494	NC_004337	TGT	2	6	263009	263014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111684
4495	NC_004337	CCAG	2	8	263070	263077	25 %	0 %	25 %	50 %	24111684
4496	NC_004337	CTGTC	2	10	263089	263098	0 %	40 %	20 %	40 %	24111684
4497	NC_004337	GCT	2	6	263133	263138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111684
4498	NC_004337	T	7	7	263447	263453	0 %	100 %	0 %	0 %	24111685
4499	NC_004337	AGC	2	6	263455	263460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111685
4500	NC_004337	TGA	2	6	263465	263470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111685

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