MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 73780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_004337	CG	3	6	166501	166506	0 %	0 %	50 %	50 %	24111592
3002	NC_004337	CG	3	6	166800	166805	0 %	0 %	50 %	50 %	24111593
3003	NC_004337	CTT	2	6	166834	166839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111593
3004	NC_004337	GGC	2	6	166875	166880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111593
3005	NC_004337	GTC	2	6	166882	166887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111593
3006	NC_004337	GCTG	2	8	166902	166909	0 %	25 %	50 %	25 %	24111593
3007	NC_004337	CTG	2	6	166973	166978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111593
3008	NC_004337	CGG	2	6	167018	167023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111593
3009	NC_004337	TGG	2	6	167131	167136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111593
3010	NC_004337	CGG	2	6	167178	167183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111593
3011	NC_004337	CGG	2	6	167223	167228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111593
3012	NC_004337	TGA	2	6	167271	167276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111593
3013	NC_004337	GCT	2	6	167289	167294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111593
3014	NC_004337	TGC	3	9	167304	167312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111593
3015	NC_004337	GCTG	2	8	167316	167323	0 %	25 %	50 %	25 %	24111593
3016	NC_004337	CGC	2	6	167336	167341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111593
3017	NC_004337	TAT	2	6	167358	167363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111593
3018	NC_004337	TATT	2	8	167414	167421	25 %	75 %	0 %	0 %	24111593
3019	NC_004337	TTGA	2	8	167473	167480	25 %	50 %	25 %	0 %	24111593
3020	NC_004337	TAT	2	6	167538	167543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111593
3021	NC_004337	TAA	2	6	167568	167573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111593
3022	NC_004337	TGC	2	6	167597	167602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111593
3023	NC_004337	CGG	2	6	167613	167618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111593
3024	NC_004337	G	6	6	167643	167648	0 %	0 %	100 %	0 %	24111593
3025	NC_004337	TG	3	6	167663	167668	0 %	50 %	50 %	0 %	24111593
3026	NC_004337	GCG	2	6	167702	167707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111593
3027	NC_004337	TCG	2	6	167771	167776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111593
3028	NC_004337	ACC	2	6	167788	167793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111593
3029	NC_004337	GC	3	6	167813	167818	0 %	0 %	50 %	50 %	24111593
3030	NC_004337	GGC	2	6	167955	167960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111593
3031	NC_004337	CG	3	6	167968	167973	0 %	0 %	50 %	50 %	24111593
3032	NC_004337	TTCTGG	2	12	167990	168001	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	24111593
3033	NC_004337	ATT	2	6	168037	168042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111593
3034	NC_004337	CGG	2	6	168078	168083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111593
3035	NC_004337	GC	3	6	168109	168114	0 %	0 %	50 %	50 %	24111593
3036	NC_004337	CAGC	2	8	168164	168171	25 %	0 %	25 %	50 %	24111593
3037	NC_004337	TGA	2	6	168270	168275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479616
3038	NC_004337	GCA	2	6	168304	168309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479616
3039	NC_004337	CAA	2	6	168312	168317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56479616
3040	NC_004337	TGA	2	6	168417	168422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479616
3041	NC_004337	TGG	2	6	168470	168475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479616
3042	NC_004337	CGG	2	6	168504	168509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479616
3043	NC_004337	TGCGGT	2	12	168580	168591	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	56479616
3044	NC_004337	GCC	2	6	168711	168716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111595
3045	NC_004337	CAT	2	6	168746	168751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111595
3046	NC_004337	TAA	2	6	168783	168788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111595
3047	NC_004337	CCG	2	6	168807	168812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111595
3048	NC_004337	ATA	2	6	168813	168818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111595
3049	NC_004337	CGC	2	6	168889	168894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111595
3050	NC_004337	TGGC	2	8	169034	169041	0 %	25 %	50 %	25 %	24111595
3051	NC_004337	TGT	2	6	169348	169353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111596
3052	NC_004337	ATA	2	6	169363	169368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111596
3053	NC_004337	GGTCC	2	10	169460	169469	0 %	20 %	40 %	40 %	24111596
3054	NC_004337	T	6	6	169650	169655	0 %	100 %	0 %	0 %	24111596
3055	NC_004337	CAG	2	6	169698	169703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111596
3056	NC_004337	GGA	2	6	169954	169959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24111596
3057	NC_004337	GCT	2	6	169971	169976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111596
3058	NC_004337	CGG	2	6	169997	170002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111596
3059	NC_004337	TGA	2	6	170036	170041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111596
3060	NC_004337	CG	3	6	170042	170047	0 %	0 %	50 %	50 %	24111596
3061	NC_004337	GCG	2	6	170050	170055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111596
3062	NC_004337	ACA	2	6	170237	170242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111597
3063	NC_004337	TGA	2	6	170352	170357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111597
3064	NC_004337	CGC	2	6	170364	170369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111597
3065	NC_004337	CGT	2	6	170511	170516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111597
3066	NC_004337	TAA	2	6	170592	170597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111597
3067	NC_004337	CAG	2	6	170623	170628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111597
3068	NC_004337	CCG	2	6	170720	170725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111597
3069	NC_004337	GCA	2	6	170760	170765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111597
3070	NC_004337	CTT	3	9	170772	170780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111597
3071	NC_004337	ATG	2	6	170792	170797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111597
3072	NC_004337	A	8	8	172546	172553	100 %	0 %	0 %	0 %	24111599
3073	NC_004337	CT	3	6	172606	172611	0 %	50 %	0 %	50 %	24111599
3074	NC_004337	CGG	2	6	172616	172621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111599
3075	NC_004337	CTT	2	6	172628	172633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111599
3076	NC_004337	CAG	2	6	172648	172653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111599
3077	NC_004337	CGC	2	6	172736	172741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111599
3078	NC_004337	CAG	2	6	172759	172764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111599
3079	NC_004337	TTC	2	6	172765	172770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111599
3080	NC_004337	TGA	2	6	172773	172778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111599
3081	NC_004337	G	6	6	172830	172835	0 %	0 %	100 %	0 %	24111599
3082	NC_004337	GGC	3	9	172849	172857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111599
3083	NC_004337	TCA	2	6	172892	172897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111599
3084	NC_004337	GTC	2	6	172918	172923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111599
3085	NC_004337	CAA	2	6	172926	172931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111599
3086	NC_004337	GTT	2	6	172936	172941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111599
3087	NC_004337	A	6	6	173053	173058	100 %	0 %	0 %	0 %	24111599
3088	NC_004337	GGT	2	6	173251	173256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111599
3089	NC_004337	CGG	2	6	173316	173321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111599
3090	NC_004337	ATCGGT	2	12	173326	173337	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	24111599
3091	NC_004337	TGG	2	6	173381	173386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111599
3092	NC_004337	TAT	2	6	173418	173423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111599
3093	NC_004337	TCC	2	6	173509	173514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24111599
3094	NC_004337	GTGAT	2	10	173540	173549	20 %	40 %	40 %	0 %	24111599
3095	NC_004337	CAG	2	6	173574	173579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111599
3096	NC_004337	GCA	2	6	173621	173626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111599
3097	NC_004337	GCA	2	6	173682	173687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111599
3098	NC_004337	AGC	2	6	173689	173694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111599
3099	NC_004337	CAA	2	6	173751	173756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111599
3100	NC_004337	AAC	2	6	173782	173787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111599
3101	NC_004337	GAA	2	6	173823	173828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111599
3102	NC_004337	GTGAT	2	10	173831	173840	20 %	40 %	40 %	0 %	24111599
3103	NC_004337	CAG	2	6	173854	173859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111599
3104	NC_004337	GCG	2	6	173933	173938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111599
3105	NC_004337	ATT	2	6	175366	175371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111600
3106	NC_004337	GACT	2	8	175424	175431	25 %	25 %	25 %	25 %	24111600
3107	NC_004337	GTC	2	6	175445	175450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111600
3108	NC_004337	TCA	2	6	175509	175514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111600
3109	NC_004337	CTT	2	6	175549	175554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111600
3110	NC_004337	CGA	2	6	175579	175584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111600
3111	NC_004337	GTT	2	6	175673	175678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111600
3112	NC_004337	TTC	2	6	175709	175714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111600
3113	NC_004337	GCA	2	6	176081	176086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111601
3114	NC_004337	AAC	2	6	176190	176195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111601
3115	NC_004337	CCG	2	6	176204	176209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111601
3116	NC_004337	CTT	2	6	176297	176302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111601
3117	NC_004337	AAT	2	6	176358	176363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111601
3118	NC_004337	CGC	2	6	176393	176398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111601
3119	NC_004337	TCA	2	6	176485	176490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111601
3120	NC_004337	CCG	2	6	176561	176566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111601
3121	NC_004337	TGG	2	6	176568	176573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111601
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3123	NC_004337	TCG	2	6	176608	176613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111601
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3242	NC_004337	TGCGC	2	10	183470	183479	0 %	20 %	40 %	40 %	24111606
3243	NC_004337	AAG	2	6	183499	183504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111606
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3492	NC_004337	GCA	2	6	198073	198078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111619
3493	NC_004337	TGC	2	6	198189	198194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111619
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