MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 73780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_004337	CAGG	2	8	141173	141180	25 %	0 %	50 %	25 %	24111570
2502	NC_004337	TAC	2	6	141182	141187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111570
2503	NC_004337	AGC	2	6	141234	141239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111570
2504	NC_004337	AACG	2	8	141260	141267	50 %	0 %	25 %	25 %	24111570
2505	NC_004337	ACT	2	6	141337	141342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111570
2506	NC_004337	CGA	2	6	141349	141354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111570
2507	NC_004337	ACCG	2	8	141355	141362	25 %	0 %	25 %	50 %	24111570
2508	NC_004337	CGC	2	6	141383	141388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111570
2509	NC_004337	CAC	2	6	141427	141432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111570
2510	NC_004337	CAT	2	6	141433	141438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111570
2511	NC_004337	CA	3	6	141445	141450	50 %	0 %	0 %	50 %	24111570
2512	NC_004337	GAA	2	6	141458	141463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111570
2513	NC_004337	ATT	2	6	141491	141496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111570
2514	NC_004337	TGG	2	6	141510	141515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111570
2515	NC_004337	GCT	2	6	141535	141540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111570
2516	NC_004337	TGTT	2	8	141753	141760	0 %	75 %	25 %	0 %	24111570
2517	NC_004337	ATG	2	6	141793	141798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111570
2518	NC_004337	GCC	2	6	141879	141884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111571
2519	NC_004337	TCA	2	6	141887	141892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111571
2520	NC_004337	CTTTA	2	10	141901	141910	20 %	60 %	0 %	20 %	24111571
2521	NC_004337	ATG	2	6	141994	141999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111571
2522	NC_004337	TCA	2	6	142033	142038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111571
2523	NC_004337	T	6	6	142039	142044	0 %	100 %	0 %	0 %	24111571
2524	NC_004337	GCT	2	6	142074	142079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111571
2525	NC_004337	ATT	2	6	142105	142110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111571
2526	NC_004337	CGG	2	6	142122	142127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111571
2527	NC_004337	TGGCG	2	10	142128	142137	0 %	20 %	60 %	20 %	24111571
2528	NC_004337	TGTT	2	8	142145	142152	0 %	75 %	25 %	0 %	24111571
2529	NC_004337	T	6	6	142180	142185	0 %	100 %	0 %	0 %	24111571
2530	NC_004337	CGG	2	6	142238	142243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111571
2531	NC_004337	GCC	2	6	142374	142379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111571
2532	NC_004337	ATG	2	6	142457	142462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111571
2533	NC_004337	TGG	2	6	142490	142495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111571
2534	NC_004337	ACGTGG	2	12	142539	142550	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	24111571
2535	NC_004337	A	6	6	142731	142736	100 %	0 %	0 %	0 %	24111572
2536	NC_004337	CTT	2	6	142746	142751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111572
2537	NC_004337	ATG	2	6	142806	142811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111572
2538	NC_004337	TCT	2	6	142852	142857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111572
2539	NC_004337	ATT	2	6	142898	142903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111572
2540	NC_004337	GAT	2	6	142964	142969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111572
2541	NC_004337	TGGG	2	8	143023	143030	0 %	25 %	75 %	0 %	24111572
2542	NC_004337	AGT	2	6	143040	143045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111572
2543	NC_004337	CAA	3	9	143055	143063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111572
2544	NC_004337	A	7	7	143062	143068	100 %	0 %	0 %	0 %	24111572
2545	NC_004337	CTG	2	6	143196	143201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479609
2546	NC_004337	TGC	2	6	143264	143269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479609
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2548	NC_004337	GAC	2	6	143425	143430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479609
2549	NC_004337	CAA	2	6	143459	143464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56479609
2550	NC_004337	GC	3	6	143650	143655	0 %	0 %	50 %	50 %	56479609
2551	NC_004337	CGA	2	6	143711	143716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479609
2552	NC_004337	CGA	2	6	143743	143748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479609
2553	NC_004337	GAA	2	6	143840	143845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56479609
2554	NC_004337	GGT	2	6	143870	143875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479609
2555	NC_004337	TGA	2	6	143885	143890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479609
2556	NC_004337	T	6	6	144080	144085	0 %	100 %	0 %	0 %	56479609
2557	NC_004337	CGC	2	6	144165	144170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56479609
2558	NC_004337	GGC	2	6	144219	144224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479609
2559	NC_004337	GCA	2	6	144246	144251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479609
2560	NC_004337	GTT	2	6	144317	144322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56479609
2561	NC_004337	TTTCA	2	10	144441	144450	20 %	60 %	0 %	20 %	56479610
2562	NC_004337	CTT	2	6	144494	144499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56479610
2563	NC_004337	GAT	2	6	144525	144530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479610
2564	NC_004337	GCC	2	6	144559	144564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56479610
2565	NC_004337	AAT	2	6	144579	144584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56479610
2566	NC_004337	GCA	2	6	144767	144772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479610
2567	NC_004337	GATG	2	8	145058	145065	25 %	25 %	50 %	0 %	24111575
2568	NC_004337	ATGC	2	8	145110	145117	25 %	25 %	25 %	25 %	24111575
2569	NC_004337	TGT	2	6	145289	145294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111575
2570	NC_004337	AAGC	2	8	145307	145314	50 %	0 %	25 %	25 %	24111575
2571	NC_004337	ATG	2	6	145338	145343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111575
2572	NC_004337	TGC	2	6	145355	145360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111575
2573	NC_004337	TGG	2	6	145402	145407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111575
2574	NC_004337	TGG	2	6	145522	145527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111575
2575	NC_004337	CGG	2	6	145566	145571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111575
2576	NC_004337	ACT	2	6	145586	145591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111575
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2578	NC_004337	TGC	2	6	145702	145707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111575
2579	NC_004337	GA	3	6	145751	145756	50 %	0 %	50 %	0 %	24111575
2580	NC_004337	GGGA	2	8	145766	145773	25 %	0 %	75 %	0 %	24111575
2581	NC_004337	ATG	2	6	145779	145784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111575
2582	NC_004337	CAG	2	6	145830	145835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111575
2583	NC_004337	AGG	2	6	145843	145848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24111575
2584	NC_004337	TCT	2	6	145871	145876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111575
2585	NC_004337	TGT	2	6	146055	146060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111576
2586	NC_004337	GGC	2	6	146086	146091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111576
2587	NC_004337	ATC	2	6	146161	146166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111576
2588	NC_004337	TTCA	2	8	146182	146189	25 %	50 %	0 %	25 %	24111576
2589	NC_004337	TAA	2	6	146208	146213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111576
2590	NC_004337	GTT	2	6	146295	146300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111576
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2592	NC_004337	GC	3	6	146348	146353	0 %	0 %	50 %	50 %	24111576
2593	NC_004337	CGC	2	6	146499	146504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111576
2594	NC_004337	GTTT	2	8	146634	146641	0 %	75 %	25 %	0 %	24111576
2595	NC_004337	TCC	2	6	146654	146659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24111576
2596	NC_004337	GAC	3	9	146728	146736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111576
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2598	NC_004337	TAG	2	6	146799	146804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111576
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2601	NC_004337	TTC	2	6	146913	146918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111577
2602	NC_004337	CG	3	6	146967	146972	0 %	0 %	50 %	50 %	24111577
2603	NC_004337	CCG	2	6	147022	147027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111577
2604	NC_004337	CGT	2	6	147041	147046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111577
2605	NC_004337	ACCAAT	2	12	147084	147095	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	24111577
2606	NC_004337	CCAGCA	2	12	147152	147163	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	24111577
2607	NC_004337	AGT	2	6	147202	147207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111577
2608	NC_004337	TCGC	2	8	147211	147218	0 %	25 %	25 %	50 %	24111577
2609	NC_004337	ACTG	2	8	147262	147269	25 %	25 %	25 %	25 %	24111577
2610	NC_004337	GCG	2	6	147391	147396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111577
2611	NC_004337	GCAG	2	8	147452	147459	25 %	0 %	50 %	25 %	24111577
2612	NC_004337	CGG	2	6	147479	147484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111577
2613	NC_004337	TCA	2	6	147586	147591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111577
2614	NC_004337	TGAAG	2	10	147664	147673	40 %	20 %	40 %	0 %	24111577
2615	NC_004337	TGG	2	6	147677	147682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111577
2616	NC_004337	A	6	6	148437	148442	100 %	0 %	0 %	0 %	24111579
2617	NC_004337	GTGAT	2	10	148483	148492	20 %	40 %	40 %	0 %	24111579
2618	NC_004337	GCTG	2	8	148549	148556	0 %	25 %	50 %	25 %	24111579
2619	NC_004337	GGA	2	6	148579	148584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24111579
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2621	NC_004337	CTG	2	6	148644	148649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111579
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2623	NC_004337	AATCTG	2	12	148764	148775	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	24111579
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2863	NC_004337	TATGCG	2	12	160500	160511	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	24111588
2864	NC_004337	TGGTT	2	10	160528	160537	0 %	60 %	40 %	0 %	24111588
2865	NC_004337	ACG	2	6	160538	160543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111588
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2867	NC_004337	GAC	2	6	160758	160763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111588
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2989	NC_004337	GAT	2	6	165830	165835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111592
2990	NC_004337	TCG	2	6	165852	165857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111592
2991	NC_004337	GCG	2	6	165892	165897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111592
2992	NC_004337	TGCC	2	8	165913	165920	0 %	25 %	25 %	50 %	24111592
2993	NC_004337	CGA	2	6	165928	165933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111592
2994	NC_004337	TGGC	2	8	166049	166056	0 %	25 %	50 %	25 %	24111592
2995	NC_004337	CAG	2	6	166088	166093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111592
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