MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 73780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_004337	TGGC	2	8	82992	82999	0 %	25 %	50 %	25 %	344915207
1502	NC_004337	AAAAC	2	10	83048	83057	80 %	0 %	0 %	20 %	344915207
1503	NC_004337	TC	3	6	83072	83077	0 %	50 %	0 %	50 %	344915207
1504	NC_004337	TGGA	2	8	83115	83122	25 %	25 %	50 %	0 %	344915207
1505	NC_004337	T	6	6	83443	83448	0 %	100 %	0 %	0 %	344915208
1506	NC_004337	AGGC	2	8	83462	83469	25 %	0 %	50 %	25 %	344915208
1507	NC_004337	TGT	2	6	83478	83483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344915208
1508	NC_004337	GTC	2	6	83498	83503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344915208
1509	NC_004337	TGCAT	2	10	83575	83584	20 %	40 %	20 %	20 %	344915208
1510	NC_004337	GTGG	2	8	83588	83595	0 %	25 %	75 %	0 %	344915208
1511	NC_004337	GGC	2	6	83626	83631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344915208
1512	NC_004337	CGT	2	6	83677	83682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344915208
1513	NC_004337	ATTCC	2	10	83745	83754	20 %	40 %	0 %	40 %	344915208
1514	NC_004337	TGG	2	6	83823	83828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344915208
1515	NC_004337	GGT	2	6	83842	83847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344915208
1516	NC_004337	CTGG	2	8	83908	83915	0 %	25 %	50 %	25 %	344915208
1517	NC_004337	ACT	2	6	84032	84037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344915208
1518	NC_004337	A	7	7	84088	84094	100 %	0 %	0 %	0 %	344915208
1519	NC_004337	CAG	2	6	84140	84145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344915208
1520	NC_004337	GAAA	2	8	84148	84155	75 %	0 %	25 %	0 %	344915208
1521	NC_004337	GTT	2	6	84179	84184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344915208
1522	NC_004337	TGA	2	6	84319	84324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344915208
1523	NC_004337	ACG	2	6	84329	84334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344915208
1524	NC_004337	TGG	2	6	84518	84523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344915208
1525	NC_004337	CAG	2	6	84524	84529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344915208
1526	NC_004337	GC	3	6	84541	84546	0 %	0 %	50 %	50 %	344915208
1527	NC_004337	GCA	2	6	84658	84663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344915208
1528	NC_004337	TGC	2	6	84673	84678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344915208
1529	NC_004337	TAT	2	6	84683	84688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344915208
1530	NC_004337	CGG	2	6	84721	84726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344915208
1531	NC_004337	AGA	2	6	84784	84789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344915208
1532	NC_004337	TGG	2	6	84876	84881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344915208
1533	NC_004337	CGTC	2	8	84982	84989	0 %	25 %	25 %	50 %	344915208
1534	NC_004337	TC	3	6	85023	85028	0 %	50 %	0 %	50 %	344915208
1535	NC_004337	AAT	2	6	85079	85084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344915208
1536	NC_004337	TTG	2	6	85095	85100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344915208
1537	NC_004337	GA	3	6	85184	85189	50 %	0 %	50 %	0 %	344915208
1538	NC_004337	T	6	6	85262	85267	0 %	100 %	0 %	0 %	56479597
1539	NC_004337	ACA	2	6	85280	85285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56479597
1540	NC_004337	CGA	2	6	85311	85316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479597
1541	NC_004337	GTGA	2	8	85414	85421	25 %	25 %	50 %	0 %	56479597
1542	NC_004337	GC	3	6	85433	85438	0 %	0 %	50 %	50 %	56479597
1543	NC_004337	GCTC	2	8	85639	85646	0 %	25 %	25 %	50 %	56479597
1544	NC_004337	CG	3	6	85664	85669	0 %	0 %	50 %	50 %	56479597
1545	NC_004337	AAT	2	6	85677	85682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56479597
1546	NC_004337	T	7	7	85736	85742	0 %	100 %	0 %	0 %	24111522
1547	NC_004337	TTA	2	6	85927	85932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111523
1548	NC_004337	ACC	2	6	86008	86013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111523
1549	NC_004337	CTG	2	6	86148	86153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111523
1550	NC_004337	AGA	2	6	86165	86170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111523
1551	NC_004337	ATT	2	6	86229	86234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111523
1552	NC_004337	CGT	2	6	86242	86247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111523
1553	NC_004337	TGGT	2	8	86344	86351	0 %	50 %	50 %	0 %	24111523
1554	NC_004337	GAT	2	6	86361	86366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111523
1555	NC_004337	CCG	2	6	86401	86406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111523
1556	NC_004337	GC	3	6	86425	86430	0 %	0 %	50 %	50 %	24111523
1557	NC_004337	GAT	2	6	86487	86492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111523
1558	NC_004337	CG	3	6	86494	86499	0 %	0 %	50 %	50 %	24111523
1559	NC_004337	GGC	2	6	86537	86542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111523
1560	NC_004337	CGT	2	6	86602	86607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111523
1561	NC_004337	GTT	2	6	86612	86617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111523
1562	NC_004337	GATG	2	8	86627	86634	25 %	25 %	50 %	0 %	24111523
1563	NC_004337	CTT	2	6	86708	86713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111523
1564	NC_004337	CGC	2	6	86847	86852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111523
1565	NC_004337	TTCCAT	2	12	87001	87012	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	24111524
1566	NC_004337	TCCT	2	8	87019	87026	0 %	50 %	0 %	50 %	24111524
1567	NC_004337	GTG	2	6	87044	87049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111524
1568	NC_004337	A	6	6	87247	87252	100 %	0 %	0 %	0 %	24111524
1569	NC_004337	GTGAT	2	10	87293	87302	20 %	40 %	40 %	0 %	24111525
1570	NC_004337	GCTG	2	8	87359	87366	0 %	25 %	50 %	25 %	24111525
1571	NC_004337	GGA	2	6	87389	87394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24111525
1572	NC_004337	TCT	2	6	87444	87449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111525
1573	NC_004337	CTG	2	6	87454	87459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111525
1574	NC_004337	TGGC	2	8	87492	87499	0 %	25 %	50 %	25 %	24111525
1575	NC_004337	AATCTG	2	12	87574	87585	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	24111525
1576	NC_004337	ACA	2	6	87588	87593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111525
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1580	NC_004337	CCTG	2	8	88398	88405	0 %	25 %	25 %	50 %	56479598
1581	NC_004337	GATG	2	8	88506	88513	25 %	25 %	50 %	0 %	56479598
1582	NC_004337	AAG	2	6	88568	88573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56479598
1583	NC_004337	CAA	2	6	88593	88598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56479598
1584	NC_004337	AAC	2	6	88617	88622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56479598
1585	NC_004337	ATG	2	6	88712	88717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111527
1586	NC_004337	TAC	2	6	88732	88737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111527
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1588	NC_004337	GGT	2	6	88814	88819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111527
1589	NC_004337	CGAT	2	8	88869	88876	25 %	25 %	25 %	25 %	24111527
1590	NC_004337	TGA	2	6	88912	88917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111527
1591	NC_004337	CAT	2	6	88930	88935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111527
1592	NC_004337	TGA	2	6	89038	89043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111527
1593	NC_004337	AGA	2	6	89140	89145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111527
1594	NC_004337	GCT	2	6	89273	89278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111527
1595	NC_004337	GGA	2	6	89359	89364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24111527
1596	NC_004337	GCTC	2	8	89385	89392	0 %	25 %	25 %	50 %	24111527
1597	NC_004337	GGC	2	6	89412	89417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111527
1598	NC_004337	ATC	2	6	89423	89428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111527
1599	NC_004337	AGC	2	6	89523	89528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111527
1600	NC_004337	A	6	6	89531	89536	100 %	0 %	0 %	0 %	24111527
1601	NC_004337	GAA	2	6	89582	89587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111527
1602	NC_004337	AGTTC	2	10	89615	89624	20 %	40 %	20 %	20 %	24111527
1603	NC_004337	AG	3	6	89635	89640	50 %	0 %	50 %	0 %	24111527
1604	NC_004337	CAG	2	6	89655	89660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111528
1605	NC_004337	ATT	2	6	89785	89790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111528
1606	NC_004337	CGG	2	6	89795	89800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111528
1607	NC_004337	AAC	2	6	89852	89857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111528
1608	NC_004337	GCA	2	6	89970	89975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111528
1609	NC_004337	AGC	2	6	90036	90041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111529
1610	NC_004337	GAA	2	6	90070	90075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111529
1611	NC_004337	GTT	2	6	90105	90110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111529
1612	NC_004337	AAG	2	6	90317	90322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111529
1613	NC_004337	TTTA	2	8	90436	90443	25 %	75 %	0 %	0 %	24111529
1614	NC_004337	A	6	6	90484	90489	100 %	0 %	0 %	0 %	24111529
1615	NC_004337	TCCG	2	8	90537	90544	0 %	25 %	25 %	50 %	24111529
1616	NC_004337	TCT	2	6	90694	90699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111529
1617	NC_004337	TGA	2	6	90738	90743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111529
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1621	NC_004337	TGA	2	6	90971	90976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111529
1622	NC_004337	CGTGG	2	10	90988	90997	0 %	20 %	60 %	20 %	24111529
1623	NC_004337	TAG	2	6	91157	91162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111529
1624	NC_004337	TACT	2	8	91164	91171	25 %	50 %	0 %	25 %	24111529
1625	NC_004337	GGT	2	6	91247	91252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111529
1626	NC_004337	AG	3	6	91260	91265	50 %	0 %	50 %	0 %	24111529
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1628	NC_004337	GTG	2	6	91429	91434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111529
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2000	NC_004337	GGTC	2	8	109982	109989	0 %	25 %	50 %	25 %	24111544

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