MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 73780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_004337	CAG	2	6	54402	54407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111500
1002	NC_004337	AT	3	6	54437	54442	50 %	50 %	0 %	0 %	24111500
1003	NC_004337	GTC	2	6	54625	54630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111500
1004	NC_004337	ATGTT	2	10	54639	54648	20 %	60 %	20 %	0 %	24111500
1005	NC_004337	TAG	2	6	54677	54682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111500
1006	NC_004337	GCA	2	6	54716	54721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111500
1007	NC_004337	TCA	2	6	54722	54727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111500
1008	NC_004337	GTC	2	6	54749	54754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111500
1009	NC_004337	CCG	2	6	54785	54790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111500
1010	NC_004337	AGT	2	6	54816	54821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111500
1011	NC_004337	GCA	2	6	54828	54833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111500
1012	NC_004337	GC	4	8	54891	54898	0 %	0 %	50 %	50 %	24111500
1013	NC_004337	CTTCG	2	10	55072	55081	0 %	40 %	20 %	40 %	24111500
1014	NC_004337	TGC	2	6	55089	55094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111500
1015	NC_004337	TTA	2	6	55100	55105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111500
1016	NC_004337	GTC	2	6	55159	55164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111500
1017	NC_004337	CAT	2	6	55221	55226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111500
1018	NC_004337	GTA	2	6	55231	55236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111500
1019	NC_004337	TGCGT	2	10	55358	55367	0 %	40 %	40 %	20 %	24111500
1020	NC_004337	ACG	2	6	55498	55503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111500
1021	NC_004337	ATG	2	6	55616	55621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111500
1022	NC_004337	ACG	2	6	55627	55632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111500
1023	NC_004337	GCG	2	6	55644	55649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111500
1024	NC_004337	TGG	2	6	55653	55658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111500
1025	NC_004337	AGT	2	6	55707	55712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111500
1026	NC_004337	TGG	3	9	55713	55721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111500
1027	NC_004337	CACC	2	8	55764	55771	25 %	0 %	0 %	75 %	24111500
1028	NC_004337	TTC	2	6	55849	55854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111500
1029	NC_004337	AAT	2	6	55864	55869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111500
1030	NC_004337	CTAC	2	8	55874	55881	25 %	25 %	0 %	50 %	24111500
1031	NC_004337	AGG	2	6	55911	55916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24111500
1032	NC_004337	GTT	2	6	55959	55964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111500
1033	NC_004337	TCA	2	6	55965	55970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111500
1034	NC_004337	CCA	2	6	55998	56003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111500
1035	NC_004337	TCG	2	6	56087	56092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111500
1036	NC_004337	GTAC	2	8	56120	56127	25 %	25 %	25 %	25 %	24111500
1037	NC_004337	TCG	2	6	56171	56176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111500
1038	NC_004337	TGG	2	6	56394	56399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111500
1039	NC_004337	T	6	6	56419	56424	0 %	100 %	0 %	0 %	24111500
1040	NC_004337	AT	3	6	56678	56683	50 %	50 %	0 %	0 %	56479591
1041	NC_004337	CGTGGC	2	12	56708	56719	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	56479591
1042	NC_004337	GCG	2	6	56731	56736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479591
1043	NC_004337	T	6	6	56841	56846	0 %	100 %	0 %	0 %	56479591
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1045	NC_004337	GCCA	2	8	56919	56926	25 %	0 %	25 %	50 %	56479591
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1047	NC_004337	GGC	2	6	57095	57100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479591
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1049	NC_004337	ATG	2	6	57201	57206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479591
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1051	NC_004337	CAG	2	6	57237	57242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479591
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1053	NC_004337	GCA	2	6	57263	57268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479591
1054	NC_004337	GAT	2	6	57327	57332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479591
1055	NC_004337	ACC	2	6	57336	57341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56479591
1056	NC_004337	TGA	2	6	57364	57369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479591
1057	NC_004337	TGG	2	6	57391	57396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479591
1058	NC_004337	GCC	2	6	57407	57412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56479591
1059	NC_004337	GAT	2	6	57416	57421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479591
1060	NC_004337	CAG	2	6	57453	57458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479591
1061	NC_004337	AGC	2	6	57475	57480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479591
1062	NC_004337	CAA	2	6	57692	57697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111502
1063	NC_004337	CCG	2	6	57836	57841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111502
1064	NC_004337	CCA	2	6	57848	57853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111502
1065	NC_004337	CCA	2	6	57941	57946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111502
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1067	NC_004337	GCTCGC	2	12	58001	58012	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	24111502
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1069	NC_004337	CTGC	2	8	58103	58110	0 %	25 %	25 %	50 %	24111502
1070	NC_004337	TCA	2	6	58133	58138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111502
1071	NC_004337	GAC	2	6	58160	58165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111502
1072	NC_004337	ACA	2	6	58175	58180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111502
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1075	NC_004337	ATA	2	6	58204	58209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111502
1076	NC_004337	AACC	2	8	58230	58237	50 %	0 %	0 %	50 %	24111502
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1082	NC_004337	CTG	2	6	58547	58552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111503
1083	NC_004337	TGC	2	6	58570	58575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111503
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1086	NC_004337	CAG	2	6	58658	58663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111503
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1088	NC_004337	TACC	2	8	58756	58763	25 %	25 %	0 %	50 %	24111503
1089	NC_004337	T	6	6	58776	58781	0 %	100 %	0 %	0 %	24111503
1090	NC_004337	TGC	2	6	58795	58800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111503
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1092	NC_004337	GGTGAT	2	12	58907	58918	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	24111503
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1095	NC_004337	TGAT	2	8	59004	59011	25 %	50 %	25 %	0 %	24111503
1096	NC_004337	ATA	2	6	59016	59021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111503
1097	NC_004337	CAG	2	6	59126	59131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111503
1098	NC_004337	GAC	2	6	59404	59409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111503
1099	NC_004337	GCT	2	6	59416	59421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111503
1100	NC_004337	CAG	2	6	59510	59515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111503
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1109	NC_004337	CAG	2	6	60200	60205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111503
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1121	NC_004337	GGC	2	6	60688	60693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111503
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1124	NC_004337	TCT	2	6	60963	60968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111503
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1126	NC_004337	TGCG	2	8	61057	61064	0 %	25 %	50 %	25 %	24111503
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1249	NC_004337	CGAT	2	8	69686	69693	25 %	25 %	25 %	25 %	24111508
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