MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 73780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004337	ACG	2	6	30162	30167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56479588
502	NC_004337	GTT	2	6	30175	30180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56479588
503	NC_004337	ACT	2	6	30326	30331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111479
504	NC_004337	GC	3	6	30335	30340	0 %	0 %	50 %	50 %	24111479
505	NC_004337	CAT	2	6	30405	30410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111479
506	NC_004337	GACC	2	8	30411	30418	25 %	0 %	25 %	50 %	24111479
507	NC_004337	ATT	2	6	30475	30480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111479
508	NC_004337	TGC	2	6	30503	30508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111479
509	NC_004337	GC	3	6	30539	30544	0 %	0 %	50 %	50 %	24111479
510	NC_004337	AGA	2	6	30624	30629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111479
511	NC_004337	CCG	2	6	30630	30635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111479
512	NC_004337	GAA	2	6	30654	30659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111479
513	NC_004337	CG	3	6	30675	30680	0 %	0 %	50 %	50 %	24111479
514	NC_004337	CA	3	6	30692	30697	50 %	0 %	0 %	50 %	24111479
515	NC_004337	GAA	2	6	30703	30708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111479
516	NC_004337	GCTG	2	8	30711	30718	0 %	25 %	50 %	25 %	24111479
517	NC_004337	ATT	2	6	30745	30750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111479
518	NC_004337	GCG	3	9	30776	30784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111479
519	NC_004337	GAA	2	6	30811	30816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111479
520	NC_004337	TC	4	8	30837	30844	0 %	50 %	0 %	50 %	24111479
521	NC_004337	TGAT	2	8	30860	30867	25 %	50 %	25 %	0 %	24111479
522	NC_004337	GTG	2	6	30904	30909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111479
523	NC_004337	CAT	2	6	30930	30935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111479
524	NC_004337	TGC	2	6	31058	31063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111479
525	NC_004337	GGT	2	6	31084	31089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111479
526	NC_004337	TTC	2	6	31164	31169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111479
527	NC_004337	GGC	2	6	31212	31217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111479
528	NC_004337	TGA	2	6	31250	31255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111479
529	NC_004337	CCT	2	6	31283	31288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24111479
530	NC_004337	CGCA	2	8	31411	31418	25 %	0 %	25 %	50 %	24111479
531	NC_004337	CG	3	6	31576	31581	0 %	0 %	50 %	50 %	24111479
532	NC_004337	CTGT	2	8	31585	31592	0 %	50 %	25 %	25 %	24111479
533	NC_004337	GAA	2	6	31645	31650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111479
534	NC_004337	GC	3	6	31744	31749	0 %	0 %	50 %	50 %	24111479
535	NC_004337	GGCG	2	8	31761	31768	0 %	0 %	75 %	25 %	24111479
536	NC_004337	GAA	2	6	31888	31893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111479
537	NC_004337	GCGAA	2	10	31898	31907	40 %	0 %	40 %	20 %	24111479
538	NC_004337	ACCG	2	8	31915	31922	25 %	0 %	25 %	50 %	24111479
539	NC_004337	A	6	6	31925	31930	100 %	0 %	0 %	0 %	24111479
540	NC_004337	GGC	2	6	31942	31947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111479
541	NC_004337	ACT	2	6	31982	31987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111479
542	NC_004337	CGG	2	6	32172	32177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111479
543	NC_004337	CTGAAA	2	12	32299	32310	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	24111479
544	NC_004337	TGG	2	6	32381	32386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111479
545	NC_004337	CGTC	2	8	32389	32396	0 %	25 %	25 %	50 %	24111479
546	NC_004337	CGG	2	6	32406	32411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111479
547	NC_004337	CGG	2	6	32465	32470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111479
548	NC_004337	TGA	2	6	32514	32519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111479
549	NC_004337	GGC	2	6	32572	32577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111479
550	NC_004337	CAG	2	6	32677	32682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111479
551	NC_004337	TGA	2	6	32720	32725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111479
552	NC_004337	AAC	2	6	32746	32751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111479
553	NC_004337	GCG	2	6	32782	32787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111479
554	NC_004337	GGC	2	6	32838	32843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111479
555	NC_004337	TGGC	2	8	32852	32859	0 %	25 %	50 %	25 %	24111479
556	NC_004337	GCTG	2	8	32865	32872	0 %	25 %	50 %	25 %	24111479
557	NC_004337	AAG	2	6	32888	32893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111479
558	NC_004337	CCG	2	6	32899	32904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111479
559	NC_004337	TAC	2	6	32905	32910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111479
560	NC_004337	GTG	2	6	32923	32928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111479
561	NC_004337	GCA	2	6	33047	33052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111479
562	NC_004337	CCA	2	6	33056	33061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111479
563	NC_004337	GAA	2	6	33063	33068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111479
564	NC_004337	GCT	2	6	33081	33086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111479
565	NC_004337	GTG	2	6	33115	33120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111479
566	NC_004337	GGC	2	6	33126	33131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111479
567	NC_004337	CTG	2	6	33136	33141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111479
568	NC_004337	CACGG	2	10	33169	33178	20 %	0 %	40 %	40 %	24111479
569	NC_004337	CAT	2	6	33282	33287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111479
570	NC_004337	ACC	2	6	33292	33297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111479
571	NC_004337	CGT	2	6	33304	33309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111479
572	NC_004337	ACC	2	6	33370	33375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111479
573	NC_004337	GGT	2	6	33382	33387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111479
574	NC_004337	GCAC	2	8	33450	33457	25 %	0 %	25 %	50 %	24111479
575	NC_004337	ATA	2	6	33465	33470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111479
576	NC_004337	TG	3	6	33731	33736	0 %	50 %	50 %	0 %	532141204
577	NC_004337	GAT	2	6	33780	33785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532141204
578	NC_004337	GGTG	2	8	33797	33804	0 %	25 %	75 %	0 %	532141204
579	NC_004337	AG	3	6	33811	33816	50 %	0 %	50 %	0 %	532141204
580	NC_004337	GAT	2	6	33909	33914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532141204
581	NC_004337	TAA	2	6	33918	33923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532141204
582	NC_004337	CG	3	6	33990	33995	0 %	0 %	50 %	50 %	532141204
583	NC_004337	AAGA	2	8	34032	34039	75 %	0 %	25 %	0 %	532141204
584	NC_004337	GAT	2	6	34095	34100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532141204
585	NC_004337	CGT	2	6	34117	34122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532141204
586	NC_004337	CGT	2	6	34232	34237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111481
587	NC_004337	TCC	2	6	34260	34265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24111481
588	NC_004337	TCG	2	6	34359	34364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111481
589	NC_004337	CAA	2	6	34403	34408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111481
590	NC_004337	CAA	2	6	34456	34461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111481
591	NC_004337	CT	3	6	34464	34469	0 %	50 %	0 %	50 %	24111481
592	NC_004337	CCAT	2	8	34485	34492	25 %	25 %	0 %	50 %	24111481
593	NC_004337	CA	3	6	34532	34537	50 %	0 %	0 %	50 %	24111481
594	NC_004337	CAC	2	6	34666	34671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111481
595	NC_004337	ACC	2	6	34764	34769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111481
596	NC_004337	GTT	2	6	34803	34808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111481
597	NC_004337	CGC	2	6	34905	34910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111482
598	NC_004337	CTT	2	6	34929	34934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111482
599	NC_004337	TGG	2	6	34950	34955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111482
600	NC_004337	GCT	2	6	35007	35012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111482
601	NC_004337	TCA	2	6	35112	35117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111482
602	NC_004337	GGC	2	6	35138	35143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111482
603	NC_004337	GCA	2	6	35160	35165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111482
604	NC_004337	CCG	2	6	35168	35173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111482
605	NC_004337	GCC	2	6	35246	35251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111482
606	NC_004337	CCG	2	6	35267	35272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111482
607	NC_004337	ACC	2	6	35344	35349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111482
608	NC_004337	CTG	2	6	35382	35387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111482
609	NC_004337	TC	3	6	35421	35426	0 %	50 %	0 %	50 %	24111482
610	NC_004337	TAA	2	6	35436	35441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111482
611	NC_004337	T	6	6	35612	35617	0 %	100 %	0 %	0 %	24111482
612	NC_004337	GAC	2	6	35621	35626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111482
613	NC_004337	A	6	6	35638	35643	100 %	0 %	0 %	0 %	24111482
614	NC_004337	ATT	2	6	35665	35670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111482
615	NC_004337	ATTT	2	8	35699	35706	25 %	75 %	0 %	0 %	24111482
616	NC_004337	TTCT	2	8	35711	35718	0 %	75 %	0 %	25 %	24111483
617	NC_004337	ATT	2	6	35720	35725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111483
618	NC_004337	A	6	6	35812	35817	100 %	0 %	0 %	0 %	24111483
619	NC_004337	TTCA	2	8	35842	35849	25 %	50 %	0 %	25 %	24111483
620	NC_004337	CAC	2	6	35851	35856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111483
621	NC_004337	CGAAT	2	10	35879	35888	40 %	20 %	20 %	20 %	24111483
622	NC_004337	GAT	2	6	35935	35940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111483
623	NC_004337	GCG	2	6	35995	36000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111483
624	NC_004337	CGA	2	6	36003	36008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111483
625	NC_004337	A	7	7	36012	36018	100 %	0 %	0 %	0 %	24111483
626	NC_004337	CTT	2	6	36021	36026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111483
627	NC_004337	AGCC	2	8	36056	36063	25 %	0 %	25 %	50 %	24111483
628	NC_004337	TCG	2	6	36188	36193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111483
629	NC_004337	CCCG	2	8	36218	36225	0 %	0 %	25 %	75 %	24111483
630	NC_004337	CGT	2	6	36242	36247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111483
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