MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 73780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_004337	ATC	2	6	352490	352495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111781
6002	NC_004337	GGCG	2	8	352528	352535	0 %	0 %	75 %	25 %	24111781
6003	NC_004337	GGC	2	6	352550	352555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111781
6004	NC_004337	TGC	2	6	352710	352715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111781
6005	NC_004337	GCA	2	6	352732	352737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111781
6006	NC_004337	G	6	6	352822	352827	0 %	0 %	100 %	0 %	24111781
6007	NC_004337	TGA	2	6	352876	352881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111781
6008	NC_004337	TGGCT	2	10	352898	352907	0 %	40 %	40 %	20 %	24111781
6009	NC_004337	TGAA	2	8	352950	352957	50 %	25 %	25 %	0 %	24111781
6010	NC_004337	GGC	2	6	353022	353027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111781
6011	NC_004337	GC	3	6	353063	353068	0 %	0 %	50 %	50 %	24111781
6012	NC_004337	AAT	2	6	353069	353074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111781
6013	NC_004337	GCA	2	6	353077	353082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111781
6014	NC_004337	GCG	2	6	353102	353107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111781
6015	NC_004337	TGC	2	6	353188	353193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111781
6016	NC_004337	GCA	2	6	353263	353268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111781
6017	NC_004337	TGGA	2	8	353294	353301	25 %	25 %	50 %	0 %	24111781
6018	NC_004337	TCA	2	6	353323	353328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111781
6019	NC_004337	ACA	2	6	353329	353334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111781
6020	NC_004337	GCT	2	6	353386	353391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111781
6021	NC_004337	GC	3	6	353405	353410	0 %	0 %	50 %	50 %	24111781
6022	NC_004337	GGT	2	6	353422	353427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111781
6023	NC_004337	CCTGG	2	10	353439	353448	0 %	20 %	40 %	40 %	24111781
6024	NC_004337	TTA	2	6	353461	353466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111781
6025	NC_004337	TGA	2	6	353470	353475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111781
6026	NC_004337	TGC	2	6	353580	353585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111781
6027	NC_004337	CGT	2	6	353606	353611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111781
6028	NC_004337	GGC	2	6	353612	353617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111781
6029	NC_004337	TGG	2	6	353685	353690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111781
6030	NC_004337	GTG	2	6	353717	353722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111781
6031	NC_004337	GCAATG	2	12	353752	353763	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	24111781
6032	NC_004337	AAG	2	6	353766	353771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111781
6033	NC_004337	ACTG	2	8	353782	353789	25 %	25 %	25 %	25 %	24111781
6034	NC_004337	TGCC	2	8	353805	353812	0 %	25 %	25 %	50 %	24111781
6035	NC_004337	GC	3	6	354616	354621	0 %	0 %	50 %	50 %	24111783
6036	NC_004337	TCT	2	6	354671	354676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111783
6037	NC_004337	TAA	2	6	354683	354688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111783
6038	NC_004337	GCG	2	6	354730	354735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111783
6039	NC_004337	CGA	2	6	354767	354772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111783
6040	NC_004337	CAA	2	6	354859	354864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111783
6041	NC_004337	CG	3	6	354869	354874	0 %	0 %	50 %	50 %	24111783
6042	NC_004337	ATG	2	6	354904	354909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111783
6043	NC_004337	TGCCGC	2	12	354949	354960	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	24111783
6044	NC_004337	ATCG	2	8	354966	354973	25 %	25 %	25 %	25 %	24111783
6045	NC_004337	CAT	2	6	355178	355183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111783
6046	NC_004337	GGC	2	6	355232	355237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111783
6047	NC_004337	GC	3	6	355242	355247	0 %	0 %	50 %	50 %	24111783
6048	NC_004337	CAC	2	6	355271	355276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111783
6049	NC_004337	GGC	2	6	355307	355312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111783
6050	NC_004337	A	6	6	355313	355318	100 %	0 %	0 %	0 %	24111783
6051	NC_004337	TATC	2	8	355358	355365	25 %	50 %	0 %	25 %	24111783
6052	NC_004337	AC	3	6	355463	355468	50 %	0 %	0 %	50 %	24111783
6053	NC_004337	GCG	2	6	355485	355490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111783
6054	NC_004337	AGA	2	6	355493	355498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111783
6055	NC_004337	T	6	6	355509	355514	0 %	100 %	0 %	0 %	24111783
6056	NC_004337	A	6	6	355630	355635	100 %	0 %	0 %	0 %	24111784
6057	NC_004337	ACC	2	6	355653	355658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111784
6058	NC_004337	GCC	2	6	355678	355683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111784
6059	NC_004337	GAA	2	6	355764	355769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111784
6060	NC_004337	GC	3	6	355783	355788	0 %	0 %	50 %	50 %	24111784
6061	NC_004337	CGG	2	6	355904	355909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111784
6062	NC_004337	TGA	2	6	356060	356065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111784
6063	NC_004337	CTG	2	6	356080	356085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111784
6064	NC_004337	AT	3	6	356221	356226	50 %	50 %	0 %	0 %	24111784
6065	NC_004337	CGG	2	6	356270	356275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111784
6066	NC_004337	TG	3	6	356324	356329	0 %	50 %	50 %	0 %	24111784
6067	NC_004337	GTG	2	6	356481	356486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111784
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6069	NC_004337	CAT	2	6	356580	356585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111784
6070	NC_004337	GC	3	6	356611	356616	0 %	0 %	50 %	50 %	24111784
6071	NC_004337	TAC	2	6	356643	356648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111784
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6074	NC_004337	ATTAAT	2	12	356758	356769	50 %	50 %	0 %	0 %	24111784
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6088	NC_004337	GC	3	6	357370	357375	0 %	0 %	50 %	50 %	24111786
6089	NC_004337	GC	3	6	357399	357404	0 %	0 %	50 %	50 %	24111786
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6099	NC_004337	GCA	2	6	357825	357830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111786
6100	NC_004337	TGGCG	2	10	357867	357876	0 %	20 %	60 %	20 %	24111786
6101	NC_004337	GGT	2	6	357882	357887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111786
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6108	NC_004337	CGAA	2	8	358385	358392	50 %	0 %	25 %	25 %	24111786
6109	NC_004337	CTG	3	9	358408	358416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111786
6110	NC_004337	TTG	2	6	358448	358453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111786
6111	NC_004337	CTTGC	2	10	358511	358520	0 %	40 %	20 %	40 %	24111786
6112	NC_004337	CTG	2	6	358525	358530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111786
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6118	NC_004337	AGA	2	6	358731	358736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111786
6119	NC_004337	TGA	2	6	358770	358775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111786
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6122	NC_004337	TAC	2	6	358884	358889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111786
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6124	NC_004337	AAG	2	6	358975	358980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111786
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6241	NC_004337	TCT	2	6	365457	365462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111795
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6494	NC_004337	CAT	2	6	380521	380526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56479656
6495	NC_004337	GAT	2	6	380548	380553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479656
6496	NC_004337	GC	3	6	380572	380577	0 %	0 %	50 %	50 %	56479656
6497	NC_004337	TCA	2	6	380588	380593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56479656
6498	NC_004337	ACC	2	6	380625	380630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56479656
6499	NC_004337	CCG	2	6	380640	380645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56479656
6500	NC_004337	ACC	2	6	380651	380656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56479656

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