MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 73780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_004337	AAT	2	6	323458	323463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111751
5503	NC_004337	GAA	2	6	323493	323498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111751
5504	NC_004337	ATT	2	6	323536	323541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111751
5505	NC_004337	AT	3	6	323606	323611	50 %	50 %	0 %	0 %	24111751
5506	NC_004337	TATT	2	8	324466	324473	25 %	75 %	0 %	0 %	24111752
5507	NC_004337	TAC	2	6	324498	324503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111752
5508	NC_004337	AGC	2	6	324517	324522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111752
5509	NC_004337	T	6	6	324531	324536	0 %	100 %	0 %	0 %	24111752
5510	NC_004337	GTTTC	2	10	324551	324560	0 %	60 %	20 %	20 %	24111752
5511	NC_004337	ATC	2	6	324561	324566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111752
5512	NC_004337	TCA	2	6	324646	324651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111752
5513	NC_004337	TTA	2	6	324653	324658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111752
5514	NC_004337	CAA	2	6	324692	324697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111752
5515	NC_004337	CAC	2	6	324716	324721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111752
5516	NC_004337	CAT	2	6	324791	324796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111752
5517	NC_004337	CAG	2	6	324900	324905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111753
5518	NC_004337	GCA	2	6	325133	325138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111753
5519	NC_004337	GCT	2	6	325214	325219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111753
5520	NC_004337	CAG	2	6	325300	325305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111753
5521	NC_004337	CG	3	6	325306	325311	0 %	0 %	50 %	50 %	24111753
5522	NC_004337	GCC	2	6	325335	325340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111753
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5525	NC_004337	AGT	2	6	325404	325409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111753
5526	NC_004337	CAT	2	6	325410	325415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111753
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5535	NC_004337	CAG	2	6	326093	326098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111754
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5539	NC_004337	TCA	2	6	326310	326315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111754
5540	NC_004337	TCTG	2	8	326324	326331	0 %	50 %	25 %	25 %	24111754
5541	NC_004337	TAA	2	6	326355	326360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111754
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5543	NC_004337	AT	3	6	326481	326486	50 %	50 %	0 %	0 %	24111755
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5549	NC_004337	CGGAT	2	10	327159	327168	20 %	20 %	40 %	20 %	24111756
5550	NC_004337	A	7	7	327296	327302	100 %	0 %	0 %	0 %	24111756
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5554	NC_004337	TGAT	2	8	327496	327503	25 %	50 %	25 %	0 %	24111756
5555	NC_004337	TGT	2	6	327527	327532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111756
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5559	NC_004337	A	6	6	327693	327698	100 %	0 %	0 %	0 %	24111756
5560	NC_004337	ATC	2	6	327709	327714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111756
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5562	NC_004337	TGA	2	6	327839	327844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111756
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5597	NC_004337	CAAT	2	8	329591	329598	50 %	25 %	0 %	25 %	24111757
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5993	NC_004337	AGC	2	6	352179	352184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111781
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