MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 73780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_004337	TAAG	2	8	292278	292285	50 %	25 %	25 %	0 %	56479637
5003	NC_004337	GTG	3	9	292563	292571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479638
5004	NC_004337	GGT	2	6	292708	292713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56479638
5005	NC_004337	CGGT	2	8	292860	292867	0 %	25 %	50 %	25 %	56479638
5006	NC_004337	GCTG	2	8	292893	292900	0 %	25 %	50 %	25 %	56479638
5007	NC_004337	GGC	2	6	292945	292950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56479638
5008	NC_004337	AT	3	6	292960	292965	50 %	50 %	0 %	0 %	56479638
5009	NC_004337	TGC	2	6	293010	293015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56479638
5010	NC_004337	CGC	2	6	293072	293077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56479638
5011	NC_004337	GC	3	6	293076	293081	0 %	0 %	50 %	50 %	56479638
5012	NC_004337	ATG	2	6	293148	293153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56479638
5013	NC_004337	A	6	6	293202	293207	100 %	0 %	0 %	0 %	56479638
5014	NC_004337	CAC	2	6	293273	293278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111717
5015	NC_004337	CGGT	2	8	293329	293336	0 %	25 %	50 %	25 %	24111717
5016	NC_004337	AGT	2	6	293356	293361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111717
5017	NC_004337	GCT	2	6	293377	293382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111717
5018	NC_004337	TCA	2	6	293511	293516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111717
5019	NC_004337	AGC	2	6	293539	293544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111717
5020	NC_004337	ATC	2	6	293568	293573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111717
5021	NC_004337	GTA	2	6	293639	293644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111717
5022	NC_004337	GCC	2	6	293732	293737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111717
5023	NC_004337	TTC	2	6	293813	293818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111717
5024	NC_004337	CTG	2	6	293855	293860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111717
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5026	NC_004337	AAACG	2	10	293915	293924	60 %	0 %	20 %	20 %	24111717
5027	NC_004337	CAA	2	6	293933	293938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111717
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5029	NC_004337	TTA	2	6	295066	295071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111718
5030	NC_004337	G	6	6	295078	295083	0 %	0 %	100 %	0 %	24111718
5031	NC_004337	TCG	2	6	295114	295119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111718
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5033	NC_004337	ACC	2	6	295133	295138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111718
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5035	NC_004337	TGCAT	2	10	295227	295236	20 %	40 %	20 %	20 %	24111718
5036	NC_004337	GAT	3	9	295256	295264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111718
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5038	NC_004337	TTATAT	2	12	295390	295401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111718
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5040	NC_004337	CG	3	6	295471	295476	0 %	0 %	50 %	50 %	24111718
5041	NC_004337	AAC	2	6	295842	295847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111719
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5044	NC_004337	CAG	2	6	295889	295894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111719
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5049	NC_004337	TGC	2	6	296107	296112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111719
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5053	NC_004337	CGA	2	6	296306	296311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111719
5054	NC_004337	TCA	2	6	296337	296342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111719
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5057	NC_004337	TGA	2	6	296593	296598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111719
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5059	NC_004337	GCA	3	9	296653	296661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111719
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5089	NC_004337	ACA	2	6	297943	297948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56479639
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5109	NC_004337	CG	3	6	299247	299252	0 %	0 %	50 %	50 %	24111721
5110	NC_004337	CGC	2	6	299269	299274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111721
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5117	NC_004337	GC	3	6	299599	299604	0 %	0 %	50 %	50 %	24111722
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5382	NC_004337	CAT	2	6	316558	316563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111745
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5402	NC_004337	GTT	2	6	318406	318411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111748
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5484	NC_004337	TTGGG	2	10	322740	322749	0 %	40 %	60 %	0 %	24111751
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5487	NC_004337	A	8	8	322826	322833	100 %	0 %	0 %	0 %	24111751
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5491	NC_004337	ATATA	2	10	322974	322983	60 %	40 %	0 %	0 %	24111751
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5494	NC_004337	ATGT	2	8	323224	323231	25 %	50 %	25 %	0 %	24111751
5495	NC_004337	T	6	6	323255	323260	0 %	100 %	0 %	0 %	24111751
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