MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 73780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51501	NC_004337	AAT	2	6	3257489	3257494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24114411
51502	NC_004337	ATC	2	6	3257495	3257500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24114411
51503	NC_004337	CCA	2	6	3257697	3257702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24114412
51504	NC_004337	TGC	2	6	3257710	3257715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114412
51505	NC_004337	T	6	6	3257716	3257721	0 %	100 %	0 %	0 %	24114412
51506	NC_004337	TTC	2	6	3257773	3257778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24114412
51507	NC_004337	TAA	2	6	3257790	3257795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24114412
51508	NC_004337	GTA	2	6	3257933	3257938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24114412
51509	NC_004337	GTA	2	6	3257950	3257955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24114412
51510	NC_004337	GTTC	2	8	3257985	3257992	0 %	50 %	25 %	25 %	24114412
51511	NC_004337	GTG	3	9	3258008	3258016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24114412
51512	NC_004337	CATA	2	8	3258177	3258184	50 %	25 %	0 %	25 %	24114412
51513	NC_004337	TTG	2	6	3258218	3258223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24114412
51514	NC_004337	ATC	2	6	3258224	3258229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24114412
51515	NC_004337	CAAT	2	8	3258249	3258256	50 %	25 %	0 %	25 %	24114412
51516	NC_004337	CCA	2	6	3258279	3258284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24114412
51517	NC_004337	AGA	2	6	3258292	3258297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24114412
51518	NC_004337	TTTCA	2	10	3258325	3258334	20 %	60 %	0 %	20 %	24114412
51519	NC_004337	CAC	2	6	3258406	3258411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24114412
51520	NC_004337	AAT	2	6	3258426	3258431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24114412
51521	NC_004337	AGCCG	2	10	3258490	3258499	20 %	0 %	40 %	40 %	24114412
51522	NC_004337	TGC	2	6	3258539	3258544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114412
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51524	NC_004337	A	9	9	3258752	3258760	100 %	0 %	0 %	0 %	24114413
51525	NC_004337	CAT	2	6	3258792	3258797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24114413
51526	NC_004337	A	6	6	3258816	3258821	100 %	0 %	0 %	0 %	24114413
51527	NC_004337	TAT	2	6	3258906	3258911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24114413
51528	NC_004337	T	6	6	3258953	3258958	0 %	100 %	0 %	0 %	24114413
51529	NC_004337	TTG	2	6	3258967	3258972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24114413
51530	NC_004337	AACA	2	8	3258976	3258983	75 %	0 %	0 %	25 %	24114413
51531	NC_004337	TTTAT	2	10	3258984	3258993	20 %	80 %	0 %	0 %	24114413
51532	NC_004337	ATC	2	6	3259025	3259030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24114413
51533	NC_004337	TCT	2	6	3259060	3259065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24114413
51534	NC_004337	AT	3	6	3261256	3261261	50 %	50 %	0 %	0 %	532141295
51535	NC_004337	GCA	2	6	3261301	3261306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532141295
51536	NC_004337	CAT	2	6	3262276	3262281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344915324
51537	NC_004337	CTT	2	6	3262322	3262327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344915324
51538	NC_004337	TCC	2	6	3262425	3262430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344915324
51539	NC_004337	CCGC	2	8	3262509	3262516	0 %	0 %	25 %	75 %	344915324
51540	NC_004337	T	6	6	3262559	3262564	0 %	100 %	0 %	0 %	344915324
51541	NC_004337	GA	3	6	3262582	3262587	50 %	0 %	50 %	0 %	344915324
51542	NC_004337	CAA	2	6	3262603	3262608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344915324
51543	NC_004337	CCA	2	6	3262666	3262671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344915324
51544	NC_004337	ATATCA	2	12	3262737	3262748	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	344915324
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51546	NC_004337	GCC	2	6	3262838	3262843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344915324
51547	NC_004337	ATA	2	6	3262872	3262877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344915324
51548	NC_004337	CGC	2	6	3262888	3262893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344915324
51549	NC_004337	GCC	3	9	3262986	3262994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344915324
51550	NC_004337	ATC	2	6	3263106	3263111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344915324
51551	NC_004337	CTTT	2	8	3263226	3263233	0 %	75 %	0 %	25 %	344915324
51552	NC_004337	GTA	2	6	3263393	3263398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344915325
51553	NC_004337	CCG	2	6	3263419	3263424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344915325
51554	NC_004337	CAT	2	6	3263453	3263458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344915325
51555	NC_004337	GC	3	6	3263488	3263493	0 %	0 %	50 %	50 %	344915325
51556	NC_004337	CAC	2	6	3263771	3263776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344915325
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51558	NC_004337	CGC	2	6	3263830	3263835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344915325
51559	NC_004337	CCA	2	6	3263836	3263841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344915325
51560	NC_004337	CCG	2	6	3263877	3263882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344915325
51561	NC_004337	AAT	2	6	3264002	3264007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344915325
51562	NC_004337	GCA	2	6	3264052	3264057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344915325
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51564	NC_004337	GCA	2	6	3264120	3264125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344915325
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51567	NC_004337	TC	3	6	3264259	3264264	0 %	50 %	0 %	50 %	344915325
51568	NC_004337	TGC	2	6	3265156	3265161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24114416
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51572	NC_004337	ACC	2	6	3265349	3265354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24114416
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51591	NC_004337	CCTTT	2	10	3266366	3266375	0 %	60 %	0 %	40 %	24114416
51592	NC_004337	T	6	6	3266373	3266378	0 %	100 %	0 %	0 %	24114416
51593	NC_004337	TA	3	6	3266817	3266822	50 %	50 %	0 %	0 %	56480267
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51601	NC_004337	AC	3	6	3267071	3267076	50 %	0 %	0 %	50 %	56480267
51602	NC_004337	CCG	2	6	3267111	3267116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56480267
51603	NC_004337	CAC	2	6	3267188	3267193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56480267
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51608	NC_004337	TGGCG	2	10	3267311	3267320	0 %	20 %	60 %	20 %	56480267
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51618	NC_004337	GGA	2	6	3267812	3267817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56480267
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51632	NC_004337	CGC	2	6	3268637	3268642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24114418
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