MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 73780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_004337	GAC	2	6	263517	263522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111685
4502	NC_004337	TTA	2	6	263582	263587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111685
4503	NC_004337	CAGAC	2	10	263686	263695	40 %	0 %	20 %	40 %	24111685
4504	NC_004337	GTG	2	6	263749	263754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111685
4505	NC_004337	TG	3	6	263903	263908	0 %	50 %	50 %	0 %	24111685
4506	NC_004337	CAG	2	6	263971	263976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111685
4507	NC_004337	GGTTCG	2	12	264000	264011	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	24111685
4508	NC_004337	GAT	2	6	264091	264096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111685
4509	NC_004337	GCC	2	6	264123	264128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111685
4510	NC_004337	TCA	2	6	264188	264193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111685
4511	NC_004337	TCTG	2	8	264202	264209	0 %	50 %	25 %	25 %	24111685
4512	NC_004337	TAA	2	6	264233	264238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24111685
4513	NC_004337	T	7	7	264351	264357	0 %	100 %	0 %	0 %	24111686
4514	NC_004337	AT	3	6	264359	264364	50 %	50 %	0 %	0 %	24111686
4515	NC_004337	GGC	2	6	264465	264470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111686
4516	NC_004337	ATT	2	6	264607	264612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111686
4517	NC_004337	CAT	2	6	264894	264899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111687
4518	NC_004337	AACC	2	8	265001	265008	50 %	0 %	0 %	50 %	24111687
4519	NC_004337	AGT	2	6	265009	265014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111687
4520	NC_004337	TCA	2	6	265019	265024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111687
4521	NC_004337	TTA	2	6	265070	265075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111687
4522	NC_004337	GCT	2	6	265084	265089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111687
4523	NC_004337	GTC	2	6	265114	265119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111687
4524	NC_004337	TTA	2	6	265172	265177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111687
4525	NC_004337	TGT	2	6	265224	265229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111687
4526	NC_004337	ACA	2	6	265238	265243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111687
4527	NC_004337	ATT	2	6	265258	265263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24111687
4528	NC_004337	GTC	2	6	265297	265302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111687
4529	NC_004337	GTA	2	6	265342	265347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111687
4530	NC_004337	ATC	2	6	265348	265353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111687
4531	NC_004337	GCGA	2	8	265450	265457	25 %	0 %	50 %	25 %	24111688
4532	NC_004337	TGC	2	6	265520	265525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111688
4533	NC_004337	CT	3	6	265587	265592	0 %	50 %	0 %	50 %	24111688
4534	NC_004337	CCG	2	6	265621	265626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111688
4535	NC_004337	TTC	2	6	265629	265634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111688
4536	NC_004337	CCACT	2	10	265706	265715	20 %	20 %	0 %	60 %	24111688
4537	NC_004337	GAC	2	6	265719	265724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111688
4538	NC_004337	GCG	2	6	265742	265747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111688
4539	NC_004337	GCC	2	6	265793	265798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111688
4540	NC_004337	CAGTG	2	10	265812	265821	20 %	20 %	40 %	20 %	24111688
4541	NC_004337	CAG	2	6	265833	265838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111688
4542	NC_004337	TC	4	8	265862	265869	0 %	50 %	0 %	50 %	24111688
4543	NC_004337	CAG	2	6	265878	265883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111688
4544	NC_004337	CTTT	2	8	265917	265924	0 %	75 %	0 %	25 %	24111688
4545	NC_004337	CAG	2	6	265966	265971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111688
4546	NC_004337	AGC	2	6	266067	266072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111688
4547	NC_004337	CGA	2	6	266082	266087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111688
4548	NC_004337	ATC	2	6	266144	266149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111688
4549	NC_004337	GAC	2	6	266155	266160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111688
4550	NC_004337	GCG	2	6	266162	266167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111688
4551	NC_004337	CCAT	2	8	266169	266176	25 %	25 %	0 %	50 %	24111688
4552	NC_004337	T	6	6	266291	266296	0 %	100 %	0 %	0 %	344915217
4553	NC_004337	CTT	2	6	266316	266321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344915217
4554	NC_004337	GAG	2	6	266323	266328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344915217
4555	NC_004337	GGC	2	6	266386	266391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344915217
4556	NC_004337	AAC	2	6	266410	266415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344915217
4557	NC_004337	CGG	2	6	266424	266429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344915217
4558	NC_004337	CAG	2	6	266433	266438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344915217
4559	NC_004337	CTTC	2	8	266444	266451	0 %	50 %	0 %	50 %	344915217
4560	NC_004337	CTGG	2	8	266479	266486	0 %	25 %	50 %	25 %	344915217
4561	NC_004337	CTG	2	6	266542	266547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344915217
4562	NC_004337	TG	3	6	266567	266572	0 %	50 %	50 %	0 %	344915217
4563	NC_004337	ATCA	2	8	266605	266612	50 %	25 %	0 %	25 %	344915217
4564	NC_004337	TTCCAT	2	12	266742	266753	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	24111690
4565	NC_004337	TCCT	2	8	266760	266767	0 %	50 %	0 %	50 %	24111690
4566	NC_004337	GTG	2	6	266785	266790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111690
4567	NC_004337	A	6	6	266988	266993	100 %	0 %	0 %	0 %	24111690
4568	NC_004337	GTGAT	2	10	267034	267043	20 %	40 %	40 %	0 %	24111691
4569	NC_004337	GCTG	2	8	267100	267107	0 %	25 %	50 %	25 %	24111691
4570	NC_004337	GGA	2	6	267130	267135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24111691
4571	NC_004337	TCT	2	6	267185	267190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24111691
4572	NC_004337	CTG	2	6	267195	267200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111691
4573	NC_004337	TGGC	2	8	267233	267240	0 %	25 %	50 %	25 %	24111691
4574	NC_004337	AATCTG	2	12	267315	267326	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	24111691
4575	NC_004337	ACA	2	6	267329	267334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111691
4576	NC_004337	TTGGTA	2	12	267552	267563	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	24111692
4577	NC_004337	CGT	2	6	267571	267576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111692
4578	NC_004337	TAG	2	6	267582	267587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111692
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4580	NC_004337	GTT	2	6	267665	267670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24111692
4581	NC_004337	CAT	2	6	267685	267690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111692
4582	NC_004337	TCA	2	6	267699	267704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111692
4583	NC_004337	CGT	2	6	267715	267720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111692
4584	NC_004337	TAC	2	6	267821	267826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24111692
4585	NC_004337	TCG	2	6	268397	268402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111693
4586	NC_004337	CTGCG	2	10	268417	268426	0 %	20 %	40 %	40 %	24111693
4587	NC_004337	ACA	2	6	268443	268448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24111693
4588	NC_004337	GAA	3	9	268485	268493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111693
4589	NC_004337	GAC	2	6	268497	268502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111693
4590	NC_004337	TCCGT	2	10	268591	268600	0 %	40 %	20 %	40 %	24111693
4591	NC_004337	TC	3	6	268615	268620	0 %	50 %	0 %	50 %	24111693
4592	NC_004337	TGG	2	6	268666	268671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24111693
4593	NC_004337	ACG	2	6	268792	268797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111693
4594	NC_004337	GCAA	2	8	268816	268823	50 %	0 %	25 %	25 %	24111693
4595	NC_004337	GCT	2	6	268836	268841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111693
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4597	NC_004337	CTG	2	6	269073	269078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111693
4598	NC_004337	CTG	2	6	269116	269121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111693
4599	NC_004337	CGTG	2	8	269138	269145	0 %	25 %	50 %	25 %	24111693
4600	NC_004337	GAT	2	6	269204	269209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111693
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4602	NC_004337	GTGCGG	2	12	269281	269292	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	24111693
4603	NC_004337	GAA	2	6	269330	269335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24111693
4604	NC_004337	CCCG	2	8	269458	269465	0 %	0 %	25 %	75 %	24111694
4605	NC_004337	TCG	2	6	269489	269494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111694
4606	NC_004337	CCG	2	6	269508	269513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111694
4607	NC_004337	CT	3	6	269653	269658	0 %	50 %	0 %	50 %	24111694
4608	NC_004337	GTA	2	6	269683	269688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111694
4609	NC_004337	TTCA	2	8	269694	269701	25 %	50 %	0 %	25 %	24111694
4610	NC_004337	CAC	2	6	269739	269744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24111694
4611	NC_004337	GGA	2	6	269758	269763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24111694
4612	NC_004337	TCC	2	6	269797	269802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24111694
4613	NC_004337	CGCA	2	8	269853	269860	25 %	0 %	25 %	50 %	24111694
4614	NC_004337	CAG	2	6	269868	269873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24111694
4615	NC_004337	AG	3	6	269889	269894	50 %	0 %	50 %	0 %	24111694
4616	NC_004337	CCG	2	6	269935	269940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24111694
4617	NC_004337	CGG	2	6	270027	270032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24111694
4618	NC_004337	GAT	2	6	270057	270062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24111694
4619	NC_004337	GC	3	6	270128	270133	0 %	0 %	50 %	50 %	24111694
4620	NC_004337	TGC	3	9	270136	270144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24111694
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4623	NC_004337	CG	3	6	270344	270349	0 %	0 %	50 %	50 %	24111695
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4992	NC_004337	ATC	2	6	291459	291464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344915219
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