MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus agalactiae 2603V/R chromosome

Total Repeats: 753

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004116	ATTTAC	2	12	352	363	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	22536186
2	NC_004116	TGCTTA	2	12	9007	9018	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	22536193
3	NC_004116	AGAAAA	2	12	10770	10781	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	22536197
4	NC_004116	GTATTG	2	12	12233	12244	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	22536199
5	NC_004116	GGCGGT	2	12	14409	14420	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	22536201
6	NC_004116	GAAAGA	2	12	15255	15266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536201
7	NC_004116	CTACAG	2	12	29782	29793	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	22536202
8	NC_004116	AGGTCA	2	12	36917	36928	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	22536210
9	NC_004116	ACTGAG	2	12	37213	37224	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	22536210
10	NC_004116	TGATGC	2	12	45490	45501	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	22536215
11	NC_004116	AATGAA	2	12	47520	47531	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	22536217
12	NC_004116	TTTTTG	2	12	51300	51311	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	22536220
13	NC_004116	ATTTAG	2	12	53013	53024	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	22536222
14	NC_004116	ACCAAA	2	12	56171	56182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536226
15	NC_004116	CGTGGT	2	12	59696	59707	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	22536229
16	NC_004116	TTTTGT	2	12	61771	61782	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	22536231
17	NC_004116	GAACTT	2	12	62168	62179	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	22536231
18	NC_004116	ATACAT	2	12	62413	62424	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	22536231
19	NC_004116	CGTACC	2	12	66158	66169	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	22536234
20	NC_004116	GGTAAA	2	12	66993	67004	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	22536236
21	NC_004116	CAGTAT	2	12	74374	74385	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	22536240
22	NC_004116	AAAGGT	2	12	77037	77048	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	22536243
23	NC_004116	CGCAAT	2	12	79618	79629	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	22536248
24	NC_004116	ATTGAA	2	12	80030	80041	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	22536249
25	NC_004116	ACATCA	2	12	80166	80177	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	22536249
26	NC_004116	ATCGTT	2	12	82707	82718	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	22536255
27	NC_004116	TAAAGG	2	12	84123	84134	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	22536258
28	NC_004116	ATAAAA	2	12	84306	84317	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	22536259
29	NC_004116	TTTCTG	2	12	85137	85148	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	22536260
30	NC_004116	AAATTA	2	12	85181	85192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536261
31	NC_004116	ATTGAA	2	12	88110	88121	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	22536265
32	NC_004116	GTAAAG	2	12	88795	88806	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	22536267
33	NC_004116	AATTAC	2	12	102244	102255	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	22536278
34	NC_004116	TTTTCT	2	12	102876	102887	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	22536279
35	NC_004116	ACTGAA	2	12	104672	104683	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	22536281
36	NC_004116	AACTCA	2	12	106075	106086	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	22536282
37	NC_004116	TTGTCA	2	12	106232	106243	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	22536282
38	NC_004116	GATATT	2	12	110285	110296	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	22536285
39	NC_004116	TAACGA	2	12	113332	113343	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	22536289
40	NC_004116	TGACCT	2	12	116123	116134	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	22536292
41	NC_004116	CACCGT	2	12	117297	117308	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	22536292
42	NC_004116	GAGGAA	2	12	122101	122112	50 %	0 %	50 %	0 %	22536297
43	NC_004116	ATGAAG	2	12	122192	122203	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	22536297
44	NC_004116	CAATGG	2	12	122732	122743	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	22536297
45	NC_004116	GCTTTT	2	12	124992	125003	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	22536299
46	NC_004116	TCAGGT	2	12	131652	131663	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	22536307
47	NC_004116	CAAAGA	2	12	131754	131765	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	22536307
48	NC_004116	TAGTAT	2	12	133104	133115	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	22536309
49	NC_004116	GTTAAC	2	12	137553	137564	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	22536312
50	NC_004116	GTTCAT	2	12	140536	140547	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	22536316
51	NC_004116	GTTGAA	2	12	140653	140664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536316
52	NC_004116	ACAAAA	2	12	141706	141717	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	22536317
53	NC_004116	CAGAAG	2	12	142094	142105	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	22536317
54	NC_004116	TTGATA	2	12	144543	144554	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	22536321
55	NC_004116	TTTGAT	2	12	149383	149394	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	22536324
56	NC_004116	TTTAGA	2	12	153505	153516	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	22536328
57	NC_004116	TTTCTA	2	12	154201	154212	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	22536328
58	NC_004116	TTTGGT	2	12	156464	156475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536331
59	NC_004116	TCTGTT	2	12	157188	157199	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	22536331
60	NC_004116	AAATCA	2	12	164281	164292	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	22536337
61	NC_004116	GACAAC	2	12	164381	164392	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	22536337
62	NC_004116	ATAATG	2	12	170569	170580	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	22536338
63	NC_004116	TATTGC	2	12	173016	173027	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	22536341
64	NC_004116	TACGGT	2	12	183463	183474	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	22536345
65	NC_004116	GTGAAG	2	12	184508	184519	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	22536345
66	NC_004116	TTATTT	2	12	189102	189113	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	22536348
67	NC_004116	GTGTAT	2	12	191533	191544	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	22536352
68	NC_004116	TATTAG	2	12	192790	192801	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	22536354
69	NC_004116	GCTTGT	2	12	195014	195025	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	22536358
70	NC_004116	CAGTTT	2	12	198023	198034	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	22536363
71	NC_004116	GCTTTG	2	12	199779	199790	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	22536365
72	NC_004116	TGGTAG	2	12	202882	202893	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	22536368
73	NC_004116	TCAAAA	2	12	204038	204049	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	22536371
74	NC_004116	AGCTAA	2	12	205001	205012	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	22536371
75	NC_004116	GTCATG	2	12	205531	205542	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	22536371
76	NC_004116	AAGGTA	2	12	209337	209348	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	22536376
77	NC_004116	GTTGAA	2	12	216770	216781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536381
78	NC_004116	AAATCA	2	12	217574	217585	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	22536382
79	NC_004116	ATTGAT	2	12	223982	223993	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	22536387
80	NC_004116	GCACAA	2	12	231279	231290	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	22536399
81	NC_004116	AAAATG	2	12	235759	235770	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	22536408
82	NC_004116	GATAAA	2	12	236395	236406	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	22536408
83	NC_004116	AGCTAA	2	12	242450	242461	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	22536417
84	NC_004116	ATGTGA	2	12	244779	244790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536423
85	NC_004116	AGGATT	2	12	246489	246500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536424
86	NC_004116	TTCCAA	2	12	248571	248582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536427
87	NC_004116	TTCTTT	2	12	263967	263978	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	22536439
88	NC_004116	TTTTCC	2	12	264785	264796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536439
89	NC_004116	TTAAAT	2	12	267416	267427	50 %	50 %	0 %	0 %	22536443
90	NC_004116	CATAAG	2	12	270420	270431	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	22536448
91	NC_004116	CAGAAG	2	12	281219	281230	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	22536458
92	NC_004116	TTAGAC	2	12	284138	284149	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	22536461
93	NC_004116	GTTCAG	2	12	295680	295691	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	22536471
94	NC_004116	ATTTTA	2	12	298586	298597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536473
95	NC_004116	AACGTA	2	12	299411	299422	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	22536473
96	NC_004116	TATTGA	2	12	299487	299498	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	22536473
97	NC_004116	GAAAAA	3	18	299775	299792	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	22536473
98	NC_004116	AATTGA	2	12	301934	301945	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	22536476
99	NC_004116	TGAAAT	2	12	305157	305168	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	22536479
100	NC_004116	ACTTAT	2	12	305179	305190	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	22536479
101	NC_004116	TAGTAA	2	12	307717	307728	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	22536481
102	NC_004116	TTACCA	4	24	307793	307816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536482
103	NC_004116	AGTACC	2	12	308374	308385	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	22536482
104	NC_004116	TTTTCT	2	12	310540	310551	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	22536483
105	NC_004116	CAAGAA	2	12	313667	313678	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	22536488
106	NC_004116	AGTTCT	2	12	313904	313915	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	22536488
107	NC_004116	AATGGT	2	12	314630	314641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536488
108	NC_004116	AATGAA	2	12	315713	315724	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	22536490
109	NC_004116	AAAGAA	2	12	322536	322547	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	22536497
110	NC_004116	GAGCTA	2	12	323915	323926	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	22536498
111	NC_004116	AATTGG	2	12	326854	326865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536500
112	NC_004116	GTATCG	2	12	327719	327730	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	22536501
113	NC_004116	TTTTAT	2	12	330300	330311	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	22536503
114	NC_004116	ATATTA	2	12	330602	330613	50 %	50 %	0 %	0 %	22536503
115	NC_004116	TAGATG	2	12	334178	334189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536507
116	NC_004116	CAAATT	2	12	334876	334887	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	22536508
117	NC_004116	AAATCA	2	12	337893	337904	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	22536512
118	NC_004116	TGCTTA	2	12	338289	338300	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	22536513
119	NC_004116	AAAGCT	2	12	340111	340122	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	22536514
120	NC_004116	TTAGTT	2	12	343148	343159	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	22536516
121	NC_004116	GAATAC	2	12	345197	345208	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	22536518
122	NC_004116	AATTTA	2	12	361685	361696	50 %	50 %	0 %	0 %	22536532
123	NC_004116	GACTGT	2	12	362900	362911	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	22536533
124	NC_004116	CGGTGG	2	12	364091	364102	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	22536535
125	NC_004116	TTAGCT	2	12	366315	366326	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	22536537
126	NC_004116	TGGTAT	2	12	370056	370067	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	22536540
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128	NC_004116	ATATTA	2	12	370406	370417	50 %	50 %	0 %	0 %	22536540
129	NC_004116	ATTGAA	2	12	378556	378567	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	22536550
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132	NC_004116	GTATTA	2	12	382882	382893	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	22536557
133	NC_004116	AAATGA	2	12	388955	388966	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	22536564
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138	NC_004116	ATATTG	2	12	400070	400081	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	22536573
139	NC_004116	GCTATG	2	12	406447	406458	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	22536579
140	NC_004116	TTGGAT	2	12	407734	407745	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	22536582
141	NC_004116	TATTGG	2	12	409374	409385	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	22536585
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147	NC_004116	TGCTTT	2	12	437912	437923	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	22536604
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225	NC_004116	TTTTTC	2	12	676146	676157	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	22536850
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229	NC_004116	ATTACA	2	12	689599	689610	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	22536862
230	NC_004116	ATGAAT	2	12	690966	690977	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	22536863
231	NC_004116	TATTCT	2	12	697645	697656	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	22536869
232	NC_004116	ACGATT	2	12	699866	699877	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	22536871
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351	NC_004116	TAACAT	2	12	1024970	1024981	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	22537175
352	NC_004116	ACCTAA	2	12	1027965	1027976	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	22537177
353	NC_004116	ATCTTT	2	12	1032617	1032628	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	22537184
354	NC_004116	GTTTTT	2	12	1032766	1032777	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	22537184
355	NC_004116	ATTTCT	2	12	1032796	1032807	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	22537185
356	NC_004116	CACCTA	2	12	1036269	1036280	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	22537188
357	NC_004116	CTTTTT	2	12	1042451	1042462	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	22537193
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359	NC_004116	TCTACT	2	12	1043305	1043316	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	22537194
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363	NC_004116	TGCCTC	2	12	1045952	1045963	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	22537197
364	NC_004116	TATGAT	2	12	1046692	1046703	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	22537197
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369	NC_004116	CATCTA	2	12	1058991	1059002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22537208
370	NC_004116	TCATTT	2	12	1061453	1061464	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	22537209
371	NC_004116	TGCTTT	2	12	1064226	1064237	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	545902391
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375	NC_004116	CGTAAG	2	12	1077191	1077202	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	22537225
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379	NC_004116	CAGTTG	2	12	1086762	1086773	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	22537235
380	NC_004116	CAATTA	2	12	1089757	1089768	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	22537240
381	NC_004116	ATCCAG	2	12	1090834	1090845	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	22537241
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387	NC_004116	CTGCTT	2	12	1121184	1121195	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	22537270
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446	NC_004116	TCTTCC	2	12	1308728	1308739	0 %	50 %	0 %	50 %	22537444
447	NC_004116	GCTTCT	2	12	1311452	1311463	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	22537448
448	NC_004116	TAGCTT	2	12	1311504	1311515	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	22537448
449	NC_004116	AGCCTC	2	12	1315365	1315376	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	22537452
450	NC_004116	CGATGG	2	12	1315441	1315452	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	22537452
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452	NC_004116	TGCAAA	2	12	1318379	1318390	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	22537455
453	NC_004116	TCTTCA	2	12	1321933	1321944	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	22537461
454	NC_004116	ATTGGA	2	12	1322702	1322713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22537462
455	NC_004116	TATTGC	2	12	1326318	1326329	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	22537466
456	NC_004116	ATCTTT	2	12	1328767	1328778	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	22537469
457	NC_004116	CTAAAT	2	12	1331395	1331406	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	22537472
458	NC_004116	TAAATG	2	12	1332879	1332890	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	22537474
459	NC_004116	TAAAAT	2	12	1345739	1345750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22537484
460	NC_004116	TGCTAA	2	12	1356126	1356137	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	22537493
461	NC_004116	AAATGC	2	12	1356279	1356290	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	22537493
462	NC_004116	GCAATC	2	12	1356391	1356402	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	22537493
463	NC_004116	AGCAAT	2	12	1363604	1363615	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	22537499
464	NC_004116	TAACAA	2	12	1367577	1367588	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	22537503
465	NC_004116	TTGATA	2	12	1367727	1367738	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	22537503
466	NC_004116	TTTATA	2	12	1371658	1371669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22537508
467	NC_004116	TGCTTC	2	12	1371709	1371720	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	22537508
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469	NC_004116	TCAACT	2	12	1375824	1375835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22537511
470	NC_004116	TTTGTA	2	12	1379444	1379455	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	22537517
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492	NC_004116	TTGCAT	2	12	1430345	1430356	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	22537564
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