MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus agalactiae 2603V/R chromosome

Total Repeats: 41052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_004116	AT	3	6	171770	171775	50 %	50 %	0 %	0 %	22536340
3002	NC_004116	GCT	2	6	171882	171887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536340
3003	NC_004116	TAA	2	6	171898	171903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536340
3004	NC_004116	A	7	7	171971	171977	100 %	0 %	0 %	0 %	22536340
3005	NC_004116	TGGT	2	8	172076	172083	0 %	50 %	50 %	0 %	22536340
3006	NC_004116	AGA	2	6	172086	172091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536340
3007	NC_004116	ATG	2	6	172102	172107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536340
3008	NC_004116	CAA	2	6	172255	172260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536340
3009	NC_004116	ACT	2	6	172278	172283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536340
3010	NC_004116	CAT	2	6	172305	172310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536340
3011	NC_004116	TGA	2	6	172339	172344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536340
3012	NC_004116	TGA	2	6	172358	172363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536340
3013	NC_004116	GTT	2	6	172423	172428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536340
3014	NC_004116	CGT	2	6	172567	172572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536341
3015	NC_004116	TGA	2	6	172580	172585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536341
3016	NC_004116	GTT	2	6	172630	172635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536341
3017	NC_004116	GTT	2	6	172669	172674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536341
3018	NC_004116	GGC	2	6	172680	172685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22536341
3019	NC_004116	TATT	2	8	172825	172832	25 %	75 %	0 %	0 %	22536341
3020	NC_004116	TAT	2	6	172839	172844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536341
3021	NC_004116	GGAA	2	8	172853	172860	50 %	0 %	50 %	0 %	22536341
3022	NC_004116	TTTG	2	8	172872	172879	0 %	75 %	25 %	0 %	22536341
3023	NC_004116	TTTTA	2	10	172896	172905	20 %	80 %	0 %	0 %	22536341
3024	NC_004116	TATT	2	8	172913	172920	25 %	75 %	0 %	0 %	22536341
3025	NC_004116	TA	3	6	172930	172935	50 %	50 %	0 %	0 %	22536341
3026	NC_004116	TGA	2	6	172944	172949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536341
3027	NC_004116	TGT	2	6	173004	173009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536341
3028	NC_004116	TATTGC	2	12	173016	173027	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	22536341
3029	NC_004116	TAT	2	6	173067	173072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536341
3030	NC_004116	TAT	2	6	173182	173187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536341
3031	NC_004116	CAA	2	6	173207	173212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536341
3032	NC_004116	GAT	2	6	173217	173222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536341
3033	NC_004116	TTAG	2	8	173242	173249	25 %	50 %	25 %	0 %	22536341
3034	NC_004116	TAG	2	6	173252	173257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536341
3035	NC_004116	GCTT	2	8	173258	173265	0 %	50 %	25 %	25 %	22536341
3036	NC_004116	TAAA	2	8	173275	173282	75 %	25 %	0 %	0 %	22536341
3037	NC_004116	T	6	6	175121	175126	0 %	100 %	0 %	0 %	22536342
3038	NC_004116	ACG	2	6	175133	175138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536342
3039	NC_004116	TCT	2	6	175239	175244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536342
3040	NC_004116	CCT	2	6	175417	175422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22536342
3041	NC_004116	T	6	6	175471	175476	0 %	100 %	0 %	0 %	22536342
3042	NC_004116	TCT	2	6	175521	175526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536342
3043	NC_004116	T	7	7	175670	175676	0 %	100 %	0 %	0 %	22536342
3044	NC_004116	TAA	2	6	175738	175743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536342
3045	NC_004116	CAG	2	6	175753	175758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536342
3046	NC_004116	ACC	2	6	175781	175786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22536342
3047	NC_004116	T	6	6	175889	175894	0 %	100 %	0 %	0 %	22536342
3048	NC_004116	TCA	2	6	175909	175914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536342
3049	NC_004116	ATT	2	6	175988	175993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536342
3050	NC_004116	TTA	2	6	176058	176063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536342
3051	NC_004116	AACT	2	8	176068	176075	50 %	25 %	0 %	25 %	22536342
3052	NC_004116	TTTG	2	8	176085	176092	0 %	75 %	25 %	0 %	22536342
3053	NC_004116	CGA	2	6	176187	176192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536342
3054	NC_004116	CTT	2	6	176272	176277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536342
3055	NC_004116	TCA	2	6	176340	176345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536342
3056	NC_004116	TAA	2	6	176478	176483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536343
3057	NC_004116	AC	3	6	176513	176518	50 %	0 %	0 %	50 %	22536343
3058	NC_004116	T	7	7	176537	176543	0 %	100 %	0 %	0 %	22536343
3059	NC_004116	TTA	2	6	176579	176584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536343
3060	NC_004116	ATA	2	6	176795	176800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536343
3061	NC_004116	TAC	2	6	176870	176875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536343
3062	NC_004116	TGC	2	6	176877	176882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536343
3063	NC_004116	GA	3	6	176906	176911	50 %	0 %	50 %	0 %	22536343
3064	NC_004116	GGT	2	6	176917	176922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22536343
3065	NC_004116	ACA	2	6	176934	176939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536343
3066	NC_004116	ATT	2	6	176940	176945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536343
3067	NC_004116	AGC	2	6	176948	176953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536343
3068	NC_004116	GAT	2	6	176965	176970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536343
3069	NC_004116	ATT	2	6	176998	177003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536343
3070	NC_004116	ATT	2	6	177053	177058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536343
3071	NC_004116	GAA	2	6	177112	177117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536343
3072	NC_004116	GCA	2	6	177118	177123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536343
3073	NC_004116	A	7	7	177275	177281	100 %	0 %	0 %	0 %	22536343
3074	NC_004116	A	6	6	177355	177360	100 %	0 %	0 %	0 %	22536343
3075	NC_004116	ACA	2	6	177385	177390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536343
3076	NC_004116	ATC	2	6	177392	177397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536343
3077	NC_004116	TAC	2	6	177409	177414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536343
3078	NC_004116	A	6	6	177489	177494	100 %	0 %	0 %	0 %	22536343
3079	NC_004116	TGA	2	6	177495	177500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536343
3080	NC_004116	AGGG	2	8	177545	177552	25 %	0 %	75 %	0 %	22536343
3081	NC_004116	ACT	2	6	177565	177570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536343
3082	NC_004116	TGC	2	6	177603	177608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536343
3083	NC_004116	GTT	2	6	177624	177629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536343
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3086	NC_004116	TAT	2	6	177690	177695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536343
3087	NC_004116	TGG	2	6	177705	177710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22536343
3088	NC_004116	ATGC	2	8	177880	177887	25 %	25 %	25 %	25 %	22536343
3089	NC_004116	GAA	2	6	177892	177897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536343
3090	NC_004116	A	6	6	177996	178001	100 %	0 %	0 %	0 %	22536343
3091	NC_004116	TGG	3	9	178059	178067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22536343
3092	NC_004116	CAAA	2	8	178090	178097	75 %	0 %	0 %	25 %	22536343
3093	NC_004116	TGG	2	6	178119	178124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22536343
3094	NC_004116	CTA	2	6	178229	178234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536343
3095	NC_004116	CAG	2	6	178240	178245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536343
3096	NC_004116	GATTG	2	10	178330	178339	20 %	40 %	40 %	0 %	22536343
3097	NC_004116	TAC	2	6	178350	178355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536343
3098	NC_004116	ATA	2	6	178427	178432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536343
3099	NC_004116	AAT	3	9	178462	178470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536343
3100	NC_004116	TAA	2	6	178503	178508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536343
3101	NC_004116	TGA	2	6	178551	178556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536343
3102	NC_004116	GTA	2	6	178606	178611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536343
3103	NC_004116	GTC	2	6	178622	178627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536343
3104	NC_004116	CAA	2	6	178652	178657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536343
3105	NC_004116	A	6	6	178668	178673	100 %	0 %	0 %	0 %	22536343
3106	NC_004116	CGT	2	6	179327	179332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536344
3107	NC_004116	ATTC	2	8	179391	179398	25 %	50 %	0 %	25 %	22536344
3108	NC_004116	AAG	2	6	179424	179429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536344
3109	NC_004116	TTG	2	6	179484	179489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536344
3110	NC_004116	GAA	2	6	179522	179527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536344
3111	NC_004116	ATG	2	6	179538	179543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536344
3112	NC_004116	TAA	2	6	179584	179589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536344
3113	NC_004116	AAG	2	6	179613	179618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536344
3114	NC_004116	TCA	3	9	179661	179669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536344
3115	NC_004116	TGG	2	6	179671	179676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22536344
3116	NC_004116	TTGG	2	8	179791	179798	0 %	50 %	50 %	0 %	22536344
3117	NC_004116	ACA	2	6	179864	179869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22536344
3118	NC_004116	TTG	2	6	179907	179912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536344
3119	NC_004116	CGT	2	6	180089	180094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536344
3120	NC_004116	TAA	2	6	180127	180132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536344
3121	NC_004116	A	6	6	180131	180136	100 %	0 %	0 %	0 %	22536344
3122	NC_004116	GA	3	6	180201	180206	50 %	0 %	50 %	0 %	22536344
3123	NC_004116	TTG	2	6	180210	180215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536344
3124	NC_004116	AC	3	6	180294	180299	50 %	0 %	0 %	50 %	22536344
3125	NC_004116	TTC	2	6	180333	180338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536344
3126	NC_004116	GTT	2	6	180350	180355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536344
3127	NC_004116	GTT	2	6	180377	180382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536344
3128	NC_004116	TTG	2	6	180387	180392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536344
3129	NC_004116	CTT	2	6	180460	180465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536344
3130	NC_004116	CGT	2	6	180518	180523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536344
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3132	NC_004116	GCC	2	6	180665	180670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22536344
3133	NC_004116	TCA	2	6	180689	180694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22536344
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3135	NC_004116	TGG	2	6	180772	180777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22536344
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3137	NC_004116	AATA	2	8	180911	180918	75 %	25 %	0 %	0 %	22536344
3138	NC_004116	AACG	2	8	180970	180977	50 %	0 %	25 %	25 %	22536344
3139	NC_004116	CTG	2	6	180993	180998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536344
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3145	NC_004116	TTG	2	6	181128	181133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536344
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3149	NC_004116	AGC	2	6	181294	181299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536344
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3154	NC_004116	TGAG	2	8	181605	181612	25 %	25 %	50 %	0 %	22536344
3155	NC_004116	AGA	2	6	181624	181629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536344
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3157	NC_004116	GAA	2	6	181694	181699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536344
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3166	NC_004116	GCT	2	6	182210	182215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536344
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3230	NC_004116	ATG	3	9	185164	185172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536345
3231	NC_004116	GCT	2	6	185236	185241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536345
3232	NC_004116	TTC	2	6	185311	185316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536345
3233	NC_004116	TCG	2	6	185385	185390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536345
3234	NC_004116	TTA	2	6	185414	185419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536345
3235	NC_004116	AAG	2	6	185527	185532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536345
3236	NC_004116	TCAA	2	8	185533	185540	50 %	25 %	0 %	25 %	22536345
3237	NC_004116	GCT	2	6	185599	185604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536345
3238	NC_004116	GTT	2	6	185608	185613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536345
3239	NC_004116	GTC	2	6	185678	185683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22536345
3240	NC_004116	GGT	2	6	185806	185811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22536345
3241	NC_004116	TTA	2	6	185894	185899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536345
3242	NC_004116	GAA	2	6	185929	185934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536345
3243	NC_004116	GTT	2	6	185995	186000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536345
3244	NC_004116	TGA	2	6	186033	186038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536345
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3246	NC_004116	CCAA	2	8	186075	186082	50 %	0 %	0 %	50 %	22536345
3247	NC_004116	TCT	2	6	186249	186254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536345
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3356	NC_004116	CAG	2	6	191479	191484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536352
3357	NC_004116	GCA	2	6	191487	191492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536352
3358	NC_004116	GTGTAT	2	12	191533	191544	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	22536352
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3361	NC_004116	AAG	2	6	191671	191676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536352
3362	NC_004116	AGA	2	6	191702	191707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22536352
3363	NC_004116	CAC	2	6	191797	191802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22536352
3364	NC_004116	ATG	2	6	191814	191819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536352
3365	NC_004116	GCA	2	6	191892	191897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22536352
3366	NC_004116	TGT	2	6	191900	191905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22536352
3367	NC_004116	AACA	2	8	191916	191923	75 %	0 %	0 %	25 %	22536352
3368	NC_004116	TAT	2	6	192086	192091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536352
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3370	NC_004116	TGA	2	6	192254	192259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536352
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3491	NC_004116	A	6	6	197950	197955	100 %	0 %	0 %	0 %	22536363
3492	NC_004116	AGCA	2	8	198000	198007	50 %	0 %	25 %	25 %	22536363
3493	NC_004116	CAGTTT	2	12	198023	198034	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	22536363
3494	NC_004116	TGGTT	2	10	198040	198049	0 %	60 %	40 %	0 %	22536363
3495	NC_004116	TAA	2	6	198090	198095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22536363
3496	NC_004116	TTC	2	6	198114	198119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22536363
3497	NC_004116	TAT	2	6	198242	198247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22536363
3498	NC_004116	TGA	2	6	198251	198256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536363
3499	NC_004116	GA	3	6	198255	198260	50 %	0 %	50 %	0 %	22536363
3500	NC_004116	GAT	2	6	198311	198316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22536363

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