MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS315 chromosome

Total Repeats: 33753

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_004070	TCT	2	6	100480	100485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21909612
1502	NC_004070	AAG	2	6	100509	100514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909612
1503	NC_004070	AC	3	6	100551	100556	50 %	0 %	0 %	50 %	21909612
1504	NC_004070	TTG	2	6	100638	100643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21909612
1505	NC_004070	GAA	2	6	100655	100660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909612
1506	NC_004070	TGC	2	6	100777	100782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909612
1507	NC_004070	GTG	2	6	100836	100841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21909612
1508	NC_004070	GTC	2	6	100946	100951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909612
1509	NC_004070	GAA	2	6	100958	100963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909612
1510	NC_004070	CGA	2	6	101062	101067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909612
1511	NC_004070	CTT	2	6	101156	101161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21909612
1512	NC_004070	CCT	2	6	101278	101283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21909612
1513	NC_004070	TGG	2	6	101344	101349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21909612
1514	NC_004070	CTT	2	6	101413	101418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21909612
1515	NC_004070	AAC	2	6	101440	101445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21909612
1516	NC_004070	TGC	2	6	101461	101466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909612
1517	NC_004070	AAGA	2	8	101477	101484	75 %	0 %	25 %	0 %	21909612
1518	NC_004070	ACTT	2	8	101487	101494	25 %	50 %	0 %	25 %	21909612
1519	NC_004070	ATC	2	6	101525	101530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909612
1520	NC_004070	CAG	2	6	101532	101537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909612
1521	NC_004070	GC	3	6	101549	101554	0 %	0 %	50 %	50 %	21909612
1522	NC_004070	ATGA	2	8	101579	101586	50 %	25 %	25 %	0 %	21909612
1523	NC_004070	TGAT	2	8	101595	101602	25 %	50 %	25 %	0 %	21909612
1524	NC_004070	CAG	2	6	101616	101621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909612
1525	NC_004070	AAT	2	6	101628	101633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21909612
1526	NC_004070	TGG	2	6	101823	101828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21909613
1527	NC_004070	GATG	2	8	101835	101842	25 %	25 %	50 %	0 %	21909613
1528	NC_004070	CAA	2	6	101865	101870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21909613
1529	NC_004070	AAG	2	6	101884	101889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909613
1530	NC_004070	ATT	2	6	101896	101901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909613
1531	NC_004070	AGA	2	6	101984	101989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909613
1532	NC_004070	GCA	2	6	102023	102028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909613
1533	NC_004070	AAT	2	6	102075	102080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21909613
1534	NC_004070	AAC	2	6	102097	102102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21909613
1535	NC_004070	CAC	2	6	102112	102117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21909613
1536	NC_004070	ATATTT	2	12	102300	102311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909614
1537	NC_004070	T	7	7	102336	102342	0 %	100 %	0 %	0 %	21909614
1538	NC_004070	CTC	2	6	102396	102401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21909614
1539	NC_004070	TTA	2	6	102402	102407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909614
1540	NC_004070	TCA	3	9	102565	102573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909614
1541	NC_004070	ATT	2	6	102588	102593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909614
1542	NC_004070	TATT	2	8	102644	102651	25 %	75 %	0 %	0 %	21909614
1543	NC_004070	ATC	2	6	102708	102713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909614
1544	NC_004070	AAG	2	6	102714	102719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909614
1545	NC_004070	TTA	2	6	102726	102731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909614
1546	NC_004070	AGA	2	6	102736	102741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909614
1547	NC_004070	ATG	2	6	102786	102791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909614
1548	NC_004070	TTA	2	6	102894	102899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909614
1549	NC_004070	T	6	6	102924	102929	0 %	100 %	0 %	0 %	21909614
1550	NC_004070	GGA	2	6	103046	103051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21909614
1551	NC_004070	ATTG	2	8	103054	103061	25 %	50 %	25 %	0 %	21909614
1552	NC_004070	ATT	2	6	103086	103091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909614
1553	NC_004070	CAA	2	6	103109	103114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21909614
1554	NC_004070	CTT	2	6	103124	103129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21909614
1555	NC_004070	CAAG	2	8	103150	103157	50 %	0 %	25 %	25 %	21909614
1556	NC_004070	A	6	6	103167	103172	100 %	0 %	0 %	0 %	21909614
1557	NC_004070	ATTC	2	8	103196	103203	25 %	50 %	0 %	25 %	21909615
1558	NC_004070	T	6	6	103256	103261	0 %	100 %	0 %	0 %	21909615
1559	NC_004070	AAG	2	6	103265	103270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909615
1560	NC_004070	TTA	2	6	103314	103319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909615
1561	NC_004070	TGT	2	6	103342	103347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21909615
1562	NC_004070	ACA	2	6	103416	103421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21909615
1563	NC_004070	TAG	2	6	103423	103428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909615
1564	NC_004070	CTTTTT	2	12	103509	103520	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	21909615
1565	NC_004070	TGA	2	6	103522	103527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909615
1566	NC_004070	ACTT	2	8	103581	103588	25 %	50 %	0 %	25 %	21909615
1567	NC_004070	CTT	2	6	103607	103612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21909615
1568	NC_004070	TGT	2	6	103639	103644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21909615
1569	NC_004070	T	6	6	103715	103720	0 %	100 %	0 %	0 %	21909615
1570	NC_004070	TTA	2	6	103751	103756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909615
1571	NC_004070	TTGAT	2	10	103792	103801	20 %	60 %	20 %	0 %	21909615
1572	NC_004070	CTAC	2	8	103909	103916	25 %	25 %	0 %	50 %	21909615
1573	NC_004070	T	7	7	103919	103925	0 %	100 %	0 %	0 %	21909615
1574	NC_004070	A	6	6	103926	103931	100 %	0 %	0 %	0 %	21909615
1575	NC_004070	AAATC	2	10	103960	103969	60 %	20 %	0 %	20 %	21909615
1576	NC_004070	T	6	6	104019	104024	0 %	100 %	0 %	0 %	21909615
1577	NC_004070	T	7	7	104065	104071	0 %	100 %	0 %	0 %	21909615
1578	NC_004070	AGT	2	6	104072	104077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909615
1579	NC_004070	T	6	6	104143	104148	0 %	100 %	0 %	0 %	21909615
1580	NC_004070	GAT	2	6	104151	104156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909616
1581	NC_004070	AAC	2	6	104167	104172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21909616
1582	NC_004070	AAG	2	6	104182	104187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909616
1583	NC_004070	TCA	2	6	104231	104236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909616
1584	NC_004070	TAT	2	6	104249	104254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909616
1585	NC_004070	AAGC	2	8	104268	104275	50 %	0 %	25 %	25 %	21909616
1586	NC_004070	TGT	2	6	104310	104315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21909616
1587	NC_004070	GTA	2	6	104396	104401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909616
1588	NC_004070	TAT	2	6	104434	104439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909616
1589	NC_004070	TGA	2	6	104517	104522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909617
1590	NC_004070	AGA	2	6	104575	104580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909617
1591	NC_004070	T	6	6	104588	104593	0 %	100 %	0 %	0 %	21909617
1592	NC_004070	CAA	2	6	104673	104678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21909617
1593	NC_004070	ATC	2	6	104730	104735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909617
1594	NC_004070	GTTA	2	8	104743	104750	25 %	50 %	25 %	0 %	21909617
1595	NC_004070	ATT	2	6	104786	104791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909617
1596	NC_004070	A	6	6	104850	104855	100 %	0 %	0 %	0 %	21909617
1597	NC_004070	CAG	2	6	104940	104945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909618
1598	NC_004070	GCT	2	6	104952	104957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909618
1599	NC_004070	AGC	2	6	104974	104979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909618
1600	NC_004070	TACG	2	8	105061	105068	25 %	25 %	25 %	25 %	21909618
1601	NC_004070	GATA	2	8	105069	105076	50 %	25 %	25 %	0 %	21909618
1602	NC_004070	TGA	2	6	105106	105111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909618
1603	NC_004070	CCT	2	6	105222	105227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21909619
1604	NC_004070	TCA	2	6	105282	105287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909619
1605	NC_004070	GAG	2	6	105295	105300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21909619
1606	NC_004070	ATA	2	6	105332	105337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21909619
1607	NC_004070	GAAA	2	8	105356	105363	75 %	0 %	25 %	0 %	21909619
1608	NC_004070	TAT	2	6	105529	105534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909619
1609	NC_004070	T	7	7	105594	105600	0 %	100 %	0 %	0 %	21909620
1610	NC_004070	T	6	6	105737	105742	0 %	100 %	0 %	0 %	21909620
1611	NC_004070	GGT	2	6	105746	105751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21909620
1612	NC_004070	AG	3	6	105775	105780	50 %	0 %	50 %	0 %	21909620
1613	NC_004070	AATA	2	8	105855	105862	75 %	25 %	0 %	0 %	21909620
1614	NC_004070	A	6	6	105967	105972	100 %	0 %	0 %	0 %	21909621
1615	NC_004070	GAA	2	6	105975	105980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909621
1616	NC_004070	GCT	2	6	105989	105994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909621
1617	NC_004070	AT	3	6	106036	106041	50 %	50 %	0 %	0 %	21909621
1618	NC_004070	TTG	2	6	106051	106056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21909621
1619	NC_004070	TTTA	2	8	106069	106076	25 %	75 %	0 %	0 %	21909621
1620	NC_004070	AGA	2	6	106145	106150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909621
1621	NC_004070	TTA	2	6	106177	106182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909621
1622	NC_004070	CTG	2	6	106248	106253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909621
1623	NC_004070	CAA	2	6	106340	106345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21909621
1624	NC_004070	TGA	2	6	106382	106387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909621
1625	NC_004070	TTGA	2	8	106392	106399	25 %	50 %	25 %	0 %	21909621
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1998	NC_004070	TCAGG	2	10	126317	126326	20 %	20 %	40 %	20 %	21909640
1999	NC_004070	TATTGA	2	12	126328	126339	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	21909640
2000	NC_004070	ACT	2	6	126377	126382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909640

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