MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS315 chromosome

Total Repeats: 33753

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004070	ACC	2	6	38875	38880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21909556
502	NC_004070	GGT	2	6	38886	38891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21909556
503	NC_004070	ACA	2	6	38952	38957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21909556
504	NC_004070	TGC	2	6	39020	39025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909556
505	NC_004070	CTT	2	6	39159	39164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21909556
506	NC_004070	CGG	2	6	39206	39211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21909556
507	NC_004070	ACC	2	6	39251	39256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21909556
508	NC_004070	ACA	2	6	39279	39284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21909556
509	NC_004070	TC	4	8	39302	39309	0 %	50 %	0 %	50 %	21909556
510	NC_004070	TGGC	2	8	39322	39329	0 %	25 %	50 %	25 %	21909556
511	NC_004070	AGA	2	6	39365	39370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909556
512	NC_004070	GGT	2	6	39462	39467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21909556
513	NC_004070	CAG	2	6	39539	39544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909556
514	NC_004070	AGC	2	6	39677	39682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909556
515	NC_004070	GAA	2	6	39741	39746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909556
516	NC_004070	CTG	2	6	39751	39756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909556
517	NC_004070	ATC	2	6	39969	39974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909556
518	NC_004070	CAG	2	6	39994	39999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909556
519	NC_004070	ATC	2	6	40098	40103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909556
520	NC_004070	TCT	2	6	40142	40147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21909556
521	NC_004070	GAA	2	6	40164	40169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909556
522	NC_004070	CT	3	6	40189	40194	0 %	50 %	0 %	50 %	21909556
523	NC_004070	CCAA	2	8	40207	40214	50 %	0 %	0 %	50 %	21909556
524	NC_004070	TTGG	2	8	40262	40269	0 %	50 %	50 %	0 %	21909556
525	NC_004070	TGT	2	6	40328	40333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21909556
526	NC_004070	ATC	2	6	40482	40487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909556
527	NC_004070	GAA	2	6	40859	40864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909557
528	NC_004070	ACTT	2	8	40910	40917	25 %	50 %	0 %	25 %	21909557
529	NC_004070	AAG	2	6	40947	40952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909557
530	NC_004070	AATC	2	8	41030	41037	50 %	25 %	0 %	25 %	21909557
531	NC_004070	CCT	2	6	41235	41240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21909557
532	NC_004070	TCG	2	6	41269	41274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909557
533	NC_004070	AAG	2	6	41307	41312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909557
534	NC_004070	TGA	2	6	41349	41354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909557
535	NC_004070	TGC	2	6	41371	41376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909557
536	NC_004070	GGT	2	6	41464	41469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21909557
537	NC_004070	TGA	2	6	41551	41556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909557
538	NC_004070	A	6	6	41644	41649	100 %	0 %	0 %	0 %	21909557
539	NC_004070	GCT	2	6	41726	41731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909557
540	NC_004070	GAA	2	6	41744	41749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909557
541	NC_004070	A	6	6	41779	41784	100 %	0 %	0 %	0 %	21909557
542	NC_004070	GTT	2	6	41888	41893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21909557
543	NC_004070	TGAT	2	8	41895	41902	25 %	50 %	25 %	0 %	21909557
544	NC_004070	ATT	2	6	41944	41949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909557
545	NC_004070	AATT	2	8	42045	42052	50 %	50 %	0 %	0 %	21909557
546	NC_004070	GT	3	6	42077	42082	0 %	50 %	50 %	0 %	21909557
547	NC_004070	ATT	2	6	42086	42091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909557
548	NC_004070	TC	3	6	42112	42117	0 %	50 %	0 %	50 %	21909557
549	NC_004070	TTGA	2	8	42128	42135	25 %	50 %	25 %	0 %	21909557
550	NC_004070	TGG	2	6	42166	42171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21909557
551	NC_004070	GAA	3	9	42224	42232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909557
552	NC_004070	AGA	2	6	42247	42252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909557
553	NC_004070	A	7	7	42321	42327	100 %	0 %	0 %	0 %	21909558
554	NC_004070	A	7	7	42385	42391	100 %	0 %	0 %	0 %	21909558
555	NC_004070	TGG	2	6	42442	42447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21909558
556	NC_004070	TGCT	2	8	42525	42532	0 %	50 %	25 %	25 %	21909558
557	NC_004070	TG	3	6	42579	42584	0 %	50 %	50 %	0 %	21909558
558	NC_004070	ATT	2	6	42593	42598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909558
559	NC_004070	GCA	2	6	42599	42604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909558
560	NC_004070	T	6	6	42622	42627	0 %	100 %	0 %	0 %	21909558
561	NC_004070	A	6	6	42646	42651	100 %	0 %	0 %	0 %	21909558
562	NC_004070	GAA	2	6	42668	42673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909558
563	NC_004070	GTT	2	6	42674	42679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21909558
564	NC_004070	GAT	2	6	42764	42769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909558
565	NC_004070	ATC	2	6	42815	42820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909558
566	NC_004070	AAG	2	6	42837	42842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909558
567	NC_004070	CGT	2	6	42902	42907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909558
568	NC_004070	AAC	2	6	42957	42962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21909558
569	NC_004070	CTT	2	6	42974	42979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21909558
570	NC_004070	AGC	2	6	43003	43008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909558
571	NC_004070	GAA	2	6	43025	43030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909558
572	NC_004070	GTG	2	6	43059	43064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21909558
573	NC_004070	GAT	2	6	43097	43102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909558
574	NC_004070	GAA	2	6	43184	43189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909558
575	NC_004070	ATC	2	6	43298	43303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909558
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577	NC_004070	AGCAG	2	10	43554	43563	40 %	0 %	40 %	20 %	21909559
578	NC_004070	AGTT	2	8	43569	43576	25 %	50 %	25 %	0 %	21909559
579	NC_004070	ATC	2	6	43589	43594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909559
580	NC_004070	GGC	2	6	43674	43679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21909559
581	NC_004070	TTG	2	6	43702	43707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21909559
582	NC_004070	GATT	2	8	43719	43726	25 %	50 %	25 %	0 %	21909559
583	NC_004070	GTCT	2	8	43729	43736	0 %	50 %	25 %	25 %	21909559
584	NC_004070	TTG	2	6	43754	43759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21909559
585	NC_004070	TAT	2	6	43791	43796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909559
586	NC_004070	CCTG	2	8	43815	43822	0 %	25 %	25 %	50 %	21909559
587	NC_004070	GGTCA	2	10	43918	43927	20 %	20 %	40 %	20 %	21909559
588	NC_004070	CAA	2	6	43930	43935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21909559
589	NC_004070	TTG	2	6	44285	44290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21909560
590	NC_004070	TTGGG	2	10	44314	44323	0 %	40 %	60 %	0 %	21909560
591	NC_004070	TGG	2	6	44337	44342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21909560
592	NC_004070	CGA	2	6	44388	44393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909560
593	NC_004070	GAT	2	6	44412	44417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21909560
594	NC_004070	TCG	2	6	44469	44474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909560
595	NC_004070	GCT	2	6	44497	44502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909560
596	NC_004070	ACA	2	6	44507	44512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21909560
597	NC_004070	ACATCG	2	12	44606	44617	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	21909560
598	NC_004070	GAC	2	6	44727	44732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909560
599	NC_004070	CA	3	6	44773	44778	50 %	0 %	0 %	50 %	21909560
600	NC_004070	ACG	2	6	44786	44791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21909560
601	NC_004070	CAA	2	6	44896	44901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21909560
602	NC_004070	ACT	2	6	44936	44941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909560
603	NC_004070	AAT	2	6	44986	44991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21909560
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608	NC_004070	TGG	2	6	45150	45155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21909560
609	NC_004070	GTC	2	6	45160	45165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21909560
610	NC_004070	AAG	2	6	45196	45201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909560
611	NC_004070	TCT	2	6	45212	45217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21909560
612	NC_004070	ATC	3	9	45223	45231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909560
613	NC_004070	CAT	2	6	45236	45241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909560
614	NC_004070	AGA	2	6	45246	45251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909560
615	NC_004070	GCTA	2	8	45255	45262	25 %	25 %	25 %	25 %	21909560
616	NC_004070	TGG	2	6	45357	45362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21909560
617	NC_004070	GTG	2	6	45415	45420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21909560
618	NC_004070	CCAA	2	8	45429	45436	50 %	0 %	0 %	50 %	21909560
619	NC_004070	ATT	3	9	45502	45510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21909560
620	NC_004070	AACC	2	8	45549	45556	50 %	0 %	0 %	50 %	21909560
621	NC_004070	ACC	2	6	45596	45601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21909560
622	NC_004070	CTT	2	6	45630	45635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21909560
623	NC_004070	ACA	2	6	45647	45652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21909560
624	NC_004070	GAA	2	6	45655	45660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21909560
625	NC_004070	ATC	2	6	45685	45690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21909560
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