MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Streptomyces coelicolor A3(2) plasmid SCP2

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003904	CGGC	2	8	817	824	0 %	0 %	50 %	50 %	21233965
2	NC_003904	GGGC	2	8	1045	1052	0 %	0 %	75 %	25 %	21233966
3	NC_003904	CCGG	2	8	3392	3399	0 %	0 %	50 %	50 %	21233967
4	NC_003904	ACCG	2	8	4596	4603	25 %	0 %	25 %	50 %	21233968
5	NC_003904	GGCC	2	8	4699	4706	0 %	0 %	50 %	50 %	21233968
6	NC_003904	GCCG	2	8	5712	5719	0 %	0 %	50 %	50 %	21233969
7	NC_003904	TCCG	2	8	6174	6181	0 %	25 %	25 %	50 %	21233970
8	NC_003904	CGGT	2	8	6854	6861	0 %	25 %	50 %	25 %	21233970
9	NC_003904	GCCG	2	8	6964	6971	0 %	0 %	50 %	50 %	21233970
10	NC_003904	AGCA	2	8	7210	7217	50 %	0 %	25 %	25 %	21233971
11	NC_003904	GTTC	2	8	8595	8602	0 %	50 %	25 %	25 %	21233973
12	NC_003904	CGGT	2	8	8793	8800	0 %	25 %	50 %	25 %	21233973
13	NC_003904	CCGG	2	8	9169	9176	0 %	0 %	50 %	50 %	21233973
14	NC_003904	GCCG	2	8	9429	9436	0 %	0 %	50 %	50 %	21233974
15	NC_003904	GGCC	2	8	9630	9637	0 %	0 %	50 %	50 %	21233974
16	NC_003904	GCTC	2	8	9681	9688	0 %	25 %	25 %	50 %	21233974
17	NC_003904	CCAG	2	8	9799	9806	25 %	0 %	25 %	50 %	21233975
18	NC_003904	GGCG	2	8	10072	10079	0 %	0 %	75 %	25 %	21233975
19	NC_003904	GTGG	2	8	10112	10119	0 %	25 %	75 %	0 %	21233975
20	NC_003904	CCGG	2	8	10285	10292	0 %	0 %	50 %	50 %	21233975
21	NC_003904	CCGT	2	8	10323	10330	0 %	25 %	25 %	50 %	21233975
22	NC_003904	GCCG	2	8	10457	10464	0 %	0 %	50 %	50 %	21233975
23	NC_003904	CTGC	2	8	11465	11472	0 %	25 %	25 %	50 %	21233976
24	NC_003904	CGTG	2	8	13469	13476	0 %	25 %	50 %	25 %	21233977
25	NC_003904	GCCC	2	8	13674	13681	0 %	0 %	25 %	75 %	21233977
26	NC_003904	CAGG	2	8	13746	13753	25 %	0 %	50 %	25 %	21233977
27	NC_003904	GGCC	2	8	13910	13917	0 %	0 %	50 %	50 %	21233977
28	NC_003904	CGGA	2	8	13934	13941	25 %	0 %	50 %	25 %	21233977
29	NC_003904	GGCG	2	8	13973	13980	0 %	0 %	75 %	25 %	21233977
30	NC_003904	GCAG	2	8	14212	14219	25 %	0 %	50 %	25 %	21233977
31	NC_003904	CGGG	2	8	14355	14362	0 %	0 %	75 %	25 %	21233977
32	NC_003904	GCAG	2	8	14514	14521	25 %	0 %	50 %	25 %	21233977
33	NC_003904	CGGC	2	8	14640	14647	0 %	0 %	50 %	50 %	21233977
34	NC_003904	TCGG	2	8	15104	15111	0 %	25 %	50 %	25 %	21233978
35	NC_003904	CGGG	2	8	15593	15600	0 %	0 %	75 %	25 %	21233979
36	NC_003904	CGGA	2	8	15752	15759	25 %	0 %	50 %	25 %	21233980
37	NC_003904	GCGG	2	8	17157	17164	0 %	0 %	75 %	25 %	21233983
38	NC_003904	CGGG	2	8	17317	17324	0 %	0 %	75 %	25 %	21233983
39	NC_003904	CCCG	2	8	17602	17609	0 %	0 %	25 %	75 %	21233983
40	NC_003904	TGGA	2	8	17673	17680	25 %	25 %	50 %	0 %	21233983
41	NC_003904	GCCG	2	8	18145	18152	0 %	0 %	50 %	50 %	21233983
42	NC_003904	CCGT	2	8	18273	18280	0 %	25 %	25 %	50 %	21233983
43	NC_003904	CCGG	2	8	18541	18548	0 %	0 %	50 %	50 %	21233984
44	NC_003904	GCGG	2	8	19668	19675	0 %	0 %	75 %	25 %	21233985
45	NC_003904	GCGG	2	8	19769	19776	0 %	0 %	75 %	25 %	21233986
46	NC_003904	CGTC	2	8	20119	20126	0 %	25 %	25 %	50 %	21233986
47	NC_003904	CCCG	2	8	20144	20151	0 %	0 %	25 %	75 %	21233986
48	NC_003904	GCGG	2	8	20273	20280	0 %	0 %	75 %	25 %	21233986
49	NC_003904	GGGT	2	8	20321	20328	0 %	25 %	75 %	0 %	21233986
50	NC_003904	GCCG	2	8	20780	20787	0 %	0 %	50 %	50 %	21233986
51	NC_003904	GCGG	2	8	20885	20892	0 %	0 %	75 %	25 %	21233986
52	NC_003904	CCGG	2	8	21254	21261	0 %	0 %	50 %	50 %	21233986
53	NC_003904	GCCG	2	8	21506	21513	0 %	0 %	50 %	50 %	21233986
54	NC_003904	CGGT	2	8	21766	21773	0 %	25 %	50 %	25 %	21233986
55	NC_003904	CGGC	2	8	22417	22424	0 %	0 %	50 %	50 %	21233988
56	NC_003904	GGAC	2	8	22712	22719	25 %	0 %	50 %	25 %	21233988
57	NC_003904	GGCG	2	8	23806	23813	0 %	0 %	75 %	25 %	21233989
58	NC_003904	GCCG	2	8	24284	24291	0 %	0 %	50 %	50 %	21233989
59	NC_003904	GGTC	2	8	24869	24876	0 %	25 %	50 %	25 %	21233990
60	NC_003904	ACGG	2	8	24966	24973	25 %	0 %	50 %	25 %	21233990
61	NC_003904	GCCA	2	8	24990	24997	25 %	0 %	25 %	50 %	21233990
62	NC_003904	CGGT	2	8	26045	26052	0 %	25 %	50 %	25 %	21233993
63	NC_003904	GTAC	2	8	26918	26925	25 %	25 %	25 %	25 %	21233994
64	NC_003904	CCGG	2	8	27177	27184	0 %	0 %	50 %	50 %	21233994
65	NC_003904	GTGG	2	8	27193	27200	0 %	25 %	75 %	0 %	21233994
66	NC_003904	ACGA	2	8	27462	27469	50 %	0 %	25 %	25 %	21233994
67	NC_003904	CACG	2	8	27560	27567	25 %	0 %	25 %	50 %	21233995
68	NC_003904	CCGT	2	8	27737	27744	0 %	25 %	25 %	50 %	21233995
69	NC_003904	GGCC	2	8	27794	27801	0 %	0 %	50 %	50 %	21233995
70	NC_003904	GGCG	2	8	28758	28765	0 %	0 %	75 %	25 %	21233997
71	NC_003904	CTCC	2	8	29105	29112	0 %	25 %	0 %	75 %	21233998

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.